MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_015966	AGC	3	9	2742358	2742366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304231
65002	NC_015966	TGC	2	6	2742385	2742390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304231
65003	NC_015966	TGC	2	6	2742397	2742402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304231
65004	NC_015966	GTCG	2	8	2742461	2742468	0 %	25 %	50 %	25 %	345304231
65005	NC_015966	TGA	2	6	2742502	2742507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304231
65006	NC_015966	GCG	2	6	2742531	2742536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304231
65007	NC_015966	CTG	3	9	2742561	2742569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304231
65008	NC_015966	GCT	2	6	2742659	2742664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304231
65009	NC_015966	GCTG	2	8	2742748	2742755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65010	NC_015966	TGC	2	6	2742783	2742788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65011	NC_015966	GCCG	2	8	2742805	2742812	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65012	NC_015966	TAC	2	6	2742872	2742877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304232
65013	NC_015966	CTA	3	9	2742901	2742909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304232
65014	NC_015966	GGC	2	6	2742914	2742919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304232
65015	NC_015966	GCC	2	6	2742947	2742952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65016	NC_015966	GCC	2	6	2742956	2742961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65017	NC_015966	CCG	2	6	2743153	2743158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65018	NC_015966	GGT	2	6	2743159	2743164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304232
65019	NC_015966	CAC	2	6	2743166	2743171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304232
65020	NC_015966	CGG	2	6	2743207	2743212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304232
65021	NC_015966	AAC	2	6	2743235	2743240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304232
65022	NC_015966	TGC	2	6	2743251	2743256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65023	NC_015966	CGC	2	6	2743288	2743293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65024	NC_015966	GCTGG	2	10	2743294	2743303	0 %	20 %	60 %	20 %	345304232
65025	NC_015966	TCGAT	2	10	2743353	2743362	20 %	40 %	20 %	20 %	345304232
65026	NC_015966	GGC	2	6	2743394	2743399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304232
65027	NC_015966	TCC	2	6	2743455	2743460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304232
65028	NC_015966	GCGT	2	8	2743464	2743471	0 %	25 %	50 %	25 %	345304232
65029	NC_015966	CTA	2	6	2743564	2743569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304232
65030	NC_015966	CCGC	2	8	2743581	2743588	0 %	0 %	25 %	75 %	345304232
65031	NC_015966	AGC	2	6	2743590	2743595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65032	NC_015966	CGA	2	6	2743597	2743602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65033	NC_015966	GCT	2	6	2743615	2743620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65034	NC_015966	CCGC	2	8	2743623	2743630	0 %	0 %	25 %	75 %	345304232
65035	NC_015966	CTA	2	6	2743639	2743644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304232
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65037	NC_015966	ACG	2	6	2743737	2743742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65038	NC_015966	TGG	2	6	2743761	2743766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304232
65039	NC_015966	GC	3	6	2743905	2743910	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65040	NC_015966	GCC	2	6	2743971	2743976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65041	NC_015966	ACGA	2	8	2744057	2744064	50 %	0 %	25 %	25 %	345304232
65042	NC_015966	CG	3	6	2744193	2744198	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65043	NC_015966	CTG	2	6	2744213	2744218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65044	NC_015966	GAC	2	6	2744248	2744253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65045	NC_015966	GAC	2	6	2744267	2744272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65046	NC_015966	GCT	2	6	2744305	2744310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65047	NC_015966	CAG	2	6	2744405	2744410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65048	NC_015966	GCC	2	6	2744438	2744443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65049	NC_015966	GCC	2	6	2744502	2744507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304232
65050	NC_015966	GCG	2	6	2744545	2744550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304232
65051	NC_015966	CGGC	2	8	2744567	2744574	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65052	NC_015966	GGCGCT	2	12	2744578	2744589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304232
65053	NC_015966	ACG	2	6	2744642	2744647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65054	NC_015966	CTG	2	6	2744652	2744657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65055	NC_015966	GCT	2	6	2744662	2744667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
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65057	NC_015966	GCCG	2	8	2744680	2744687	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65058	NC_015966	GCA	2	6	2744688	2744693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65059	NC_015966	CGA	2	6	2744785	2744790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304232
65060	NC_015966	CTA	2	6	2744818	2744823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304232
65061	NC_015966	CGG	2	6	2744882	2744887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304232
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65065	NC_015966	GCCGC	2	10	2745070	2745079	0 %	0 %	40 %	60 %	345304232
65066	NC_015966	CTG	2	6	2745116	2745121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
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65069	NC_015966	GGCCT	2	10	2745218	2745227	0 %	20 %	40 %	40 %	345304232
65070	NC_015966	CG	3	6	2745312	2745317	0 %	0 %	50 %	50 %	345304232
65071	NC_015966	CTG	2	6	2745335	2745340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304232
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65076	NC_015966	TTCG	2	8	2745454	2745461	0 %	50 %	25 %	25 %	345304232
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65095	NC_015966	GAA	2	6	2746162	2746167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304233
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65103	NC_015966	CGC	2	6	2746574	2746579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304233
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65113	NC_015966	AGA	2	6	2746868	2746873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304233
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65115	NC_015966	CGA	2	6	2746893	2746898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304233
65116	NC_015966	GCT	2	6	2746962	2746967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304233
65117	NC_015966	GCT	2	6	2746989	2746994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304233
65118	NC_015966	TCG	2	6	2747051	2747056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304233
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65224	NC_015966	CA	3	6	2750934	2750939	50 %	0 %	0 %	50 %	345304237
65225	NC_015966	TCC	2	6	2750959	2750964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304237
65226	NC_015966	GCGT	2	8	2750990	2750997	0 %	25 %	50 %	25 %	345304237
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65231	NC_015966	CG	3	6	2751203	2751208	0 %	0 %	50 %	50 %	345304237
65232	NC_015966	GTA	2	6	2751273	2751278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304237
65233	NC_015966	TCG	2	6	2751286	2751291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304237
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65236	NC_015966	GCT	2	6	2751407	2751412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304237
65237	NC_015966	GTCAC	2	10	2751463	2751472	20 %	20 %	20 %	40 %	345304237
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65241	NC_015966	TCC	2	6	2751682	2751687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304237
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65274	NC_015966	GATC	2	8	2752685	2752692	25 %	25 %	25 %	25 %	345304238
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65317	NC_015966	CTG	2	6	2754480	2754485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65318	NC_015966	CAA	2	6	2754494	2754499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304239
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65329	NC_015966	GGT	2	6	2754885	2754890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304239
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65332	NC_015966	CAC	2	6	2754963	2754968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304239
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65334	NC_015966	ACG	2	6	2755006	2755011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304239
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65339	NC_015966	CAG	3	9	2755089	2755097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304239
65340	NC_015966	CCCGAT	2	12	2755098	2755109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304239
65341	NC_015966	A	6	6	2755141	2755146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65342	NC_015966	GCG	2	6	2755206	2755211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304240
65343	NC_015966	GCC	2	6	2755310	2755315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304240
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65461	NC_015966	A	6	6	2759668	2759673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65462	NC_015966	CCG	2	6	2759680	2759685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65464	NC_015966	GC	3	6	2759713	2759718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65465	NC_015966	TGC	2	6	2759722	2759727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65466	NC_015966	GGA	2	6	2759732	2759737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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65468	NC_015966	CGG	2	6	2759804	2759809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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65485	NC_015966	GT	3	6	2760687	2760692	0 %	50 %	50 %	0 %	345304244
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65488	NC_015966	CAG	2	6	2761006	2761011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304244
65489	NC_015966	AC	3	6	2761014	2761019	50 %	0 %	0 %	50 %	345304244
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65491	NC_015966	CGT	2	6	2761227	2761232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304245
65492	NC_015966	GTCG	2	8	2761338	2761345	0 %	25 %	50 %	25 %	345304245
65493	NC_015966	CGT	3	9	2761350	2761358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304245
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65499	NC_015966	CGCTGG	2	12	2761817	2761828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304245
65500	NC_015966	CG	3	6	2761915	2761920	0 %	0 %	50 %	50 %	345304246

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