MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_015966	CAAT	2	8	2680204	2680211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63502	NC_015966	AGG	2	6	2680263	2680268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63503	NC_015966	GCT	2	6	2680355	2680360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63504	NC_015966	A	6	6	2680376	2680381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63505	NC_015966	TGG	2	6	2680423	2680428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63506	NC_015966	CAG	2	6	2680429	2680434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63507	NC_015966	AGG	2	6	2680447	2680452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63508	NC_015966	AAC	2	6	2680453	2680458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63509	NC_015966	GCA	2	6	2680468	2680473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63510	NC_015966	T	6	6	2680511	2680516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63511	NC_015966	ACC	2	6	2680522	2680527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63512	NC_015966	G	6	6	2680538	2680543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63513	NC_015966	TGA	2	6	2680545	2680550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63514	NC_015966	TCCAC	2	10	2680556	2680565	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63515	NC_015966	GTTCC	2	10	2680570	2680579	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63516	NC_015966	C	6	6	2680603	2680608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63517	NC_015966	T	6	6	2680617	2680622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63518	NC_015966	AC	3	6	2680624	2680629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63519	NC_015966	GCG	2	6	2680786	2680791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63520	NC_015966	TGC	2	6	2680818	2680823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63521	NC_015966	CGC	2	6	2680857	2680862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63522	NC_015966	CTT	2	6	2680885	2680890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63523	NC_015966	CAC	2	6	2680901	2680906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304182
63524	NC_015966	CCTGTA	2	12	2680927	2680938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345304182
63525	NC_015966	TG	3	6	2681026	2681031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63526	NC_015966	GCG	2	6	2681100	2681105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63527	NC_015966	C	6	6	2681172	2681177	0 %	0 %	0 %	100 %	345304183
63528	NC_015966	CGT	2	6	2681184	2681189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63529	NC_015966	GAA	2	6	2681236	2681241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304183
63530	NC_015966	CGG	2	6	2681322	2681327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63531	NC_015966	CTG	2	6	2681329	2681334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63532	NC_015966	ACC	2	6	2681485	2681490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304183
63533	NC_015966	GAA	2	6	2681584	2681589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304183
63534	NC_015966	GCC	2	6	2681590	2681595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63535	NC_015966	TCT	2	6	2681600	2681605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304183
63536	NC_015966	ACT	2	6	2681618	2681623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304183
63537	NC_015966	CAG	2	6	2681655	2681660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63538	NC_015966	CCA	2	6	2681667	2681672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304183
63539	NC_015966	GGC	2	6	2681726	2681731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63540	NC_015966	CGC	2	6	2681771	2681776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63541	NC_015966	GCC	2	6	2681833	2681838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63542	NC_015966	TGG	2	6	2681906	2681911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304183
63543	NC_015966	GAG	2	6	2681947	2681952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304183
63544	NC_015966	CGG	2	6	2682000	2682005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63545	NC_015966	ACC	2	6	2682008	2682013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304183
63546	NC_015966	CATC	2	8	2682018	2682025	25 %	25 %	0 %	50 %	345304183
63547	NC_015966	TCGGG	2	10	2682070	2682079	0 %	20 %	60 %	20 %	345304183
63548	NC_015966	CGG	2	6	2682126	2682131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63549	NC_015966	CG	3	6	2682146	2682151	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
63550	NC_015966	CCA	2	6	2682276	2682281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304183
63551	NC_015966	ACT	2	6	2682290	2682295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304183
63552	NC_015966	CGA	2	6	2682321	2682326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63553	NC_015966	ATC	2	6	2682328	2682333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304183
63554	NC_015966	CGA	2	6	2682357	2682362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63555	NC_015966	TGGG	2	8	2682418	2682425	0 %	25 %	75 %	0 %	345304183
63556	NC_015966	CGGC	2	8	2682452	2682459	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
63557	NC_015966	ACG	2	6	2682485	2682490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63558	NC_015966	CGC	2	6	2682519	2682524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63559	NC_015966	CGGC	2	8	2682528	2682535	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
63560	NC_015966	CGC	2	6	2682544	2682549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63561	NC_015966	GAG	2	6	2682559	2682564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304183
63562	NC_015966	TGG	2	6	2682587	2682592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304183
63563	NC_015966	GCC	3	9	2682611	2682619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
63564	NC_015966	GAG	2	6	2682706	2682711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304183
63565	NC_015966	GGC	2	6	2682717	2682722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304183
63566	NC_015966	GCT	2	6	2682753	2682758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63567	NC_015966	CGT	2	6	2682780	2682785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63568	NC_015966	GGCC	2	8	2682825	2682832	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
63569	NC_015966	CGA	2	6	2682960	2682965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304183
63570	NC_015966	GGT	2	6	2682991	2682996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304183
63571	NC_015966	GCCA	2	8	2683037	2683044	25 %	0 %	25 %	50 %	345304184
63572	NC_015966	GAC	2	6	2683051	2683056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304184
63573	NC_015966	CGA	2	6	2683086	2683091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304184
63574	NC_015966	CGA	2	6	2683134	2683139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304184
63575	NC_015966	ATCGC	2	10	2683142	2683151	20 %	20 %	20 %	40 %	345304184
63576	NC_015966	TGA	2	6	2683226	2683231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304184
63577	NC_015966	GC	3	6	2683303	2683308	0 %	0 %	50 %	50 %	345304184
63578	NC_015966	GGA	2	6	2683341	2683346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304184
63579	NC_015966	GCC	2	6	2683355	2683360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304184
63580	NC_015966	CTGCT	2	10	2683399	2683408	0 %	40 %	20 %	40 %	345304184
63581	NC_015966	GCG	2	6	2683476	2683481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304184
63582	NC_015966	GGC	2	6	2683500	2683505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304184
63583	NC_015966	CGACCA	2	12	2683524	2683535	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345304184
63584	NC_015966	GATCAA	2	12	2683545	2683556	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	345304184
63585	NC_015966	AGG	2	6	2683577	2683582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304184
63586	NC_015966	GAA	2	6	2683600	2683605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304184
63587	NC_015966	GC	3	6	2683658	2683663	0 %	0 %	50 %	50 %	345304184
63588	NC_015966	GAC	2	6	2683693	2683698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304184
63589	NC_015966	GCCG	2	8	2683702	2683709	0 %	0 %	50 %	50 %	345304184
63590	NC_015966	TGG	3	9	2683711	2683719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304184
63591	NC_015966	TCG	2	6	2683796	2683801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304184
63592	NC_015966	AGC	2	6	2683872	2683877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304185
63593	NC_015966	GCC	2	6	2683912	2683917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304185
63594	NC_015966	CGG	2	6	2683951	2683956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304185
63595	NC_015966	CAG	2	6	2684053	2684058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304185
63596	NC_015966	GAA	2	6	2684071	2684076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304185
63597	NC_015966	C	6	6	2684198	2684203	0 %	0 %	0 %	100 %	345304185
63598	NC_015966	GTC	2	6	2684296	2684301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304185
63599	NC_015966	GCG	2	6	2684347	2684352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304186
63600	NC_015966	GAG	2	6	2684379	2684384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304186
63601	NC_015966	ACGGC	2	10	2684413	2684422	20 %	0 %	40 %	40 %	345304186
63602	NC_015966	CGA	2	6	2684480	2684485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63603	NC_015966	TCG	2	6	2684497	2684502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63604	NC_015966	CTG	2	6	2684550	2684555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63605	NC_015966	ACG	2	6	2684572	2684577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63606	NC_015966	GCAC	2	8	2684583	2684590	25 %	0 %	25 %	50 %	345304186
63607	NC_015966	GGC	3	9	2684624	2684632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304186
63608	NC_015966	CGT	2	6	2684642	2684647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63609	NC_015966	GC	3	6	2684656	2684661	0 %	0 %	50 %	50 %	345304186
63610	NC_015966	CCA	2	6	2684671	2684676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304186
63611	NC_015966	CCA	2	6	2684750	2684755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304186
63612	NC_015966	CAG	2	6	2684832	2684837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304186
63613	NC_015966	CCGCA	2	10	2684846	2684855	20 %	0 %	20 %	60 %	345304186
63614	NC_015966	CTC	2	6	2684874	2684879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304186
63615	NC_015966	CCGG	2	8	2684883	2684890	0 %	0 %	50 %	50 %	345304186
63616	NC_015966	T	6	6	2684912	2684917	0 %	100 %	0 %	0 %	345304186
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63618	NC_015966	CGGG	2	8	2685012	2685019	0 %	0 %	75 %	25 %	345304186
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