MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_015966	GCC	2	6	2660283	2660288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304160
63002	NC_015966	TCG	2	6	2660293	2660298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304160
63003	NC_015966	CCA	2	6	2660306	2660311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304160
63004	NC_015966	CGA	2	6	2660312	2660317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304160
63005	NC_015966	CGA	2	6	2660319	2660324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304160
63006	NC_015966	TCGTC	2	10	2660558	2660567	0 %	40 %	20 %	40 %	345304160
63007	NC_015966	CGA	2	6	2660606	2660611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304160
63008	NC_015966	CTC	2	6	2660625	2660630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304160
63009	NC_015966	CGG	2	6	2660639	2660644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304160
63010	NC_015966	CCA	2	6	2660675	2660680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304160
63011	NC_015966	GCT	2	6	2660705	2660710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304160
63012	NC_015966	GCC	2	6	2660713	2660718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304160
63013	NC_015966	CGAG	2	8	2660751	2660758	25 %	0 %	50 %	25 %	345304160
63014	NC_015966	CCG	2	6	2660776	2660781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304160
63015	NC_015966	CCAT	2	8	2660809	2660816	25 %	25 %	0 %	50 %	345304160
63016	NC_015966	CAC	2	6	2660865	2660870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304160
63017	NC_015966	CAC	2	6	2660898	2660903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304160
63018	NC_015966	TTC	2	6	2660970	2660975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304160
63019	NC_015966	CGA	2	6	2661034	2661039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63020	NC_015966	GTT	2	6	2661084	2661089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304161
63021	NC_015966	ACGT	2	8	2661094	2661101	25 %	25 %	25 %	25 %	345304161
63022	NC_015966	GCA	2	6	2661146	2661151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63023	NC_015966	CAC	2	6	2661195	2661200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304161
63024	NC_015966	CCT	2	6	2661314	2661319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304161
63025	NC_015966	GCC	2	6	2661352	2661357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304161
63026	NC_015966	GCTC	2	8	2661380	2661387	0 %	25 %	25 %	50 %	345304161
63027	NC_015966	GCG	2	6	2661399	2661404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304161
63028	NC_015966	GCCG	2	8	2661413	2661420	0 %	0 %	50 %	50 %	345304161
63029	NC_015966	GTC	2	6	2661465	2661470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63030	NC_015966	CGT	2	6	2661567	2661572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63031	NC_015966	CAC	2	6	2661582	2661587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304161
63032	NC_015966	GCGCCA	2	12	2661593	2661604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304161
63033	NC_015966	CGA	2	6	2661614	2661619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63034	NC_015966	AGC	2	6	2661669	2661674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63035	NC_015966	CGG	2	6	2661686	2661691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304161
63036	NC_015966	GCCGC	2	10	2661746	2661755	0 %	0 %	40 %	60 %	345304161
63037	NC_015966	GCT	2	6	2661758	2661763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304161
63038	NC_015966	GTCCG	2	10	2661813	2661822	0 %	20 %	40 %	40 %	345304161
63039	NC_015966	CCA	2	6	2661824	2661829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304161
63040	NC_015966	GCG	2	6	2661906	2661911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304162
63041	NC_015966	GCC	2	6	2661922	2661927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304162
63042	NC_015966	TTC	2	6	2661950	2661955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304162
63043	NC_015966	CTG	2	6	2661965	2661970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304162
63044	NC_015966	CAG	2	6	2661998	2662003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304162
63045	NC_015966	CCA	2	6	2662030	2662035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304162
63046	NC_015966	GAA	2	6	2662091	2662096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304162
63047	NC_015966	CCG	2	6	2662101	2662106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304162
63048	NC_015966	TCCT	2	8	2662139	2662146	0 %	50 %	0 %	50 %	345304162
63049	NC_015966	GGC	2	6	2662244	2662249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304162
63050	NC_015966	CAC	2	6	2662250	2662255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304162
63051	NC_015966	TCG	2	6	2662257	2662262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304162
63052	NC_015966	CGC	2	6	2662291	2662296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304162
63053	NC_015966	GAA	2	6	2662345	2662350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304162
63054	NC_015966	CGTC	2	8	2662383	2662390	0 %	25 %	25 %	50 %	345304162
63055	NC_015966	GGC	2	6	2662427	2662432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304162
63056	NC_015966	TTC	2	6	2662454	2662459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304162
63057	NC_015966	ACC	2	6	2662468	2662473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304162
63058	NC_015966	CCG	2	6	2662474	2662479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304162
63059	NC_015966	TTC	2	6	2662482	2662487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304162
63060	NC_015966	GT	3	6	2662494	2662499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63061	NC_015966	CAG	2	6	2662514	2662519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63062	NC_015966	GAT	2	6	2662538	2662543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304163
63063	NC_015966	GCGG	2	8	2662546	2662553	0 %	0 %	75 %	25 %	345304163
63064	NC_015966	GCT	2	6	2662594	2662599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63065	NC_015966	GC	3	6	2662640	2662645	0 %	0 %	50 %	50 %	345304163
63066	NC_015966	TTC	2	6	2662760	2662765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304163
63067	NC_015966	GCT	2	6	2662873	2662878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63068	NC_015966	TTC	2	6	2662895	2662900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304163
63069	NC_015966	GCC	2	6	2662905	2662910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304163
63070	NC_015966	CGGT	2	8	2663013	2663020	0 %	25 %	50 %	25 %	345304163
63071	NC_015966	GCG	2	6	2663038	2663043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304163
63072	NC_015966	GCT	2	6	2663071	2663076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63073	NC_015966	GCG	2	6	2663077	2663082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304163
63074	NC_015966	GAA	2	6	2663114	2663119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304163
63075	NC_015966	TTC	2	6	2663147	2663152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304163
63076	NC_015966	GAA	2	6	2663156	2663161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304163
63077	NC_015966	CTG	2	6	2663207	2663212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63078	NC_015966	CCGG	2	8	2663224	2663231	0 %	0 %	50 %	50 %	345304163
63079	NC_015966	CCAG	2	8	2663236	2663243	25 %	0 %	25 %	50 %	345304163
63080	NC_015966	TGCGC	2	10	2663269	2663278	0 %	20 %	40 %	40 %	345304163
63081	NC_015966	CCG	2	6	2663286	2663291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304163
63082	NC_015966	CAA	2	6	2663306	2663311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304163
63083	NC_015966	CAG	2	6	2663318	2663323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304163
63084	NC_015966	CAC	2	6	2663325	2663330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304163
63085	NC_015966	GCC	3	9	2663417	2663425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304164
63086	NC_015966	CTG	2	6	2663507	2663512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63087	NC_015966	GTC	2	6	2663525	2663530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63088	NC_015966	TGG	2	6	2663549	2663554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304164
63089	NC_015966	CCA	3	9	2663644	2663652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304164
63090	NC_015966	TCG	2	6	2663673	2663678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63091	NC_015966	CGC	2	6	2663698	2663703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304164
63092	NC_015966	CAG	2	6	2663714	2663719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63093	NC_015966	CGG	2	6	2663731	2663736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304164
63094	NC_015966	CGCCAG	2	12	2663742	2663753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304164
63095	NC_015966	CGC	2	6	2663757	2663762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304164
63096	NC_015966	GCCG	2	8	2663772	2663779	0 %	0 %	50 %	50 %	345304164
63097	NC_015966	ACC	2	6	2663787	2663792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304164
63098	NC_015966	GCC	3	9	2663802	2663810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304164
63099	NC_015966	ACG	2	6	2663823	2663828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63100	NC_015966	CGG	2	6	2663841	2663846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304164
63101	NC_015966	CCAG	2	8	2663860	2663867	25 %	0 %	25 %	50 %	345304164
63102	NC_015966	CCT	2	6	2663875	2663880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304164
63103	NC_015966	CGCC	2	8	2663885	2663892	0 %	0 %	25 %	75 %	345304164
63104	NC_015966	GCC	2	6	2663898	2663903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304164
63105	NC_015966	GTC	2	6	2663981	2663986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304164
63106	NC_015966	GTT	2	6	2664039	2664044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304165
63107	NC_015966	GCA	2	6	2664054	2664059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63108	NC_015966	GCA	4	12	2664168	2664179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63109	NC_015966	GCT	2	6	2664186	2664191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63110	NC_015966	GGC	2	6	2664194	2664199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304165
63111	NC_015966	GGC	2	6	2664214	2664219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304165
63112	NC_015966	CAG	2	6	2664247	2664252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63113	NC_015966	TCG	2	6	2664254	2664259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63114	NC_015966	GCA	2	6	2664384	2664389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304165
63115	NC_015966	GCCA	2	8	2664395	2664402	25 %	0 %	25 %	50 %	345304165
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63223	NC_015966	TC	3	6	2668615	2668620	0 %	50 %	0 %	50 %	345304169
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63230	NC_015966	CGA	2	6	2668889	2668894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63231	NC_015966	TGG	2	6	2668906	2668911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304170
63232	NC_015966	ATC	2	6	2668950	2668955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304170
63233	NC_015966	GCTCGG	2	12	2668960	2668971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304170
63234	NC_015966	TGA	2	6	2668984	2668989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304170
63235	NC_015966	TCG	2	6	2669032	2669037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63236	NC_015966	GAG	2	6	2669067	2669072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304170
63237	NC_015966	TCG	2	6	2669084	2669089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63238	NC_015966	GCG	2	6	2669113	2669118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304170
63239	NC_015966	GAA	3	9	2669187	2669195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304170
63240	NC_015966	CGG	2	6	2669199	2669204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304170
63241	NC_015966	CGG	2	6	2669273	2669278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304170
63242	NC_015966	GAA	2	6	2669282	2669287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304170
63243	NC_015966	TGGCGC	2	12	2669293	2669304	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304170
63244	NC_015966	GC	4	8	2669301	2669308	0 %	0 %	50 %	50 %	345304170
63245	NC_015966	CAT	2	6	2669330	2669335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304170
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63247	NC_015966	CAC	2	6	2669348	2669353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304170
63248	NC_015966	CGA	2	6	2669384	2669389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63249	NC_015966	ACC	2	6	2669407	2669412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304170
63250	NC_015966	TCG	2	6	2669431	2669436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63251	NC_015966	CACG	2	8	2669438	2669445	25 %	0 %	25 %	50 %	345304170
63252	NC_015966	TGGG	2	8	2669508	2669515	0 %	25 %	75 %	0 %	345304170
63253	NC_015966	CGA	2	6	2669540	2669545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304170
63254	NC_015966	CTT	2	6	2669628	2669633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304171
63255	NC_015966	GCT	2	6	2669749	2669754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304171
63256	NC_015966	TGG	2	6	2669772	2669777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304171
63257	NC_015966	GTG	2	6	2669804	2669809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304171
63258	NC_015966	GTCG	2	8	2669810	2669817	0 %	25 %	50 %	25 %	345304171
63259	NC_015966	GACG	2	8	2669821	2669828	25 %	0 %	50 %	25 %	345304171
63260	NC_015966	CG	3	6	2669910	2669915	0 %	0 %	50 %	50 %	345304171
63261	NC_015966	CCG	2	6	2669967	2669972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304171
63262	NC_015966	CGC	2	6	2669979	2669984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304171
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63264	NC_015966	AC	3	6	2670072	2670077	50 %	0 %	0 %	50 %	345304171
63265	NC_015966	GCC	2	6	2670098	2670103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304171
63266	NC_015966	GCC	2	6	2670110	2670115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304171
63267	NC_015966	CTG	2	6	2670155	2670160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304171
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63270	NC_015966	TCCA	2	8	2670290	2670297	25 %	25 %	0 %	50 %	345304171
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63272	NC_015966	CTG	2	6	2670323	2670328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304171
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63279	NC_015966	CAG	3	9	2670880	2670888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
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63283	NC_015966	GCCC	2	8	2671050	2671057	0 %	0 %	25 %	75 %	345304172
63284	NC_015966	TGC	2	6	2671184	2671189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63285	NC_015966	TACGA	2	10	2671207	2671216	40 %	20 %	20 %	20 %	345304172
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63287	NC_015966	GGC	2	6	2671320	2671325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304172
63288	NC_015966	CGG	2	6	2671431	2671436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304172
63289	NC_015966	CAG	2	6	2671438	2671443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63290	NC_015966	TGCG	2	8	2671451	2671458	0 %	25 %	50 %	25 %	345304172
63291	NC_015966	CAGGC	2	10	2671482	2671491	20 %	0 %	40 %	40 %	345304172
63292	NC_015966	CAG	2	6	2671558	2671563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63293	NC_015966	GCC	2	6	2671661	2671666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
63294	NC_015966	GGTACG	2	12	2671675	2671686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345304172
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63297	NC_015966	GCA	2	6	2671794	2671799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63298	NC_015966	CGC	2	6	2671800	2671805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
63299	NC_015966	TCA	2	6	2671839	2671844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304172
63300	NC_015966	GCT	2	6	2671863	2671868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63301	NC_015966	GCATG	2	10	2671932	2671941	20 %	20 %	40 %	20 %	345304172
63302	NC_015966	GCC	2	6	2671942	2671947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
63303	NC_015966	AGC	2	6	2671958	2671963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63304	NC_015966	GCC	2	6	2671995	2672000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
63305	NC_015966	ATG	2	6	2672021	2672026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304172
63306	NC_015966	A	8	8	2672158	2672165	100 %	0 %	0 %	0 %	345304172
63307	NC_015966	AGC	2	6	2672171	2672176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
63308	NC_015966	GGC	2	6	2672214	2672219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304172
63309	NC_015966	CCAGC	2	10	2672278	2672287	20 %	0 %	20 %	60 %	345304172
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63312	NC_015966	CGGG	2	8	2672412	2672419	0 %	0 %	75 %	25 %	345304172
63313	NC_015966	CGGC	2	8	2672454	2672461	0 %	0 %	50 %	50 %	345304172
63314	NC_015966	AGC	2	6	2672471	2672476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
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63321	NC_015966	CG	3	6	2672704	2672709	0 %	0 %	50 %	50 %	345304173
63322	NC_015966	CAG	2	6	2672756	2672761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304173
63323	NC_015966	GCG	2	6	2672764	2672769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304173
63324	NC_015966	CAC	2	6	2672897	2672902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304173
63325	NC_015966	GCG	2	6	2672908	2672913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304173
63326	NC_015966	GCT	2	6	2672929	2672934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304173
63327	NC_015966	GA	3	6	2672949	2672954	50 %	0 %	50 %	0 %	345304173
63328	NC_015966	GTC	2	6	2673020	2673025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304173
63329	NC_015966	GA	3	6	2673130	2673135	50 %	0 %	50 %	0 %	345304173
63330	NC_015966	GATC	2	8	2673179	2673186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63331	NC_015966	TCG	2	6	2673309	2673314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
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63333	NC_015966	CTG	2	6	2673347	2673352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
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63336	NC_015966	GCCG	2	8	2673394	2673401	0 %	0 %	50 %	50 %	345304174
63337	NC_015966	GCC	2	6	2673421	2673426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304174
63338	NC_015966	GCA	2	6	2673448	2673453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304174
63339	NC_015966	TGC	2	6	2673510	2673515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
63340	NC_015966	GCC	2	6	2673552	2673557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304174
63341	NC_015966	CGG	2	6	2673569	2673574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304174
63342	NC_015966	CCGC	2	8	2673593	2673600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63343	NC_015966	G	7	7	2673611	2673617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63344	NC_015966	C	6	6	2673630	2673635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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63499	NC_015966	TTTTG	2	10	2680152	2680161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63500	NC_015966	C	6	6	2680164	2680169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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