MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62501	NC_015966	ATC	2	6	2640222	2640227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304142
62502	NC_015966	CTG	2	6	2640342	2640347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304142
62503	NC_015966	TG	3	6	2640346	2640351	0 %	50 %	50 %	0 %	345304142
62504	NC_015966	GCT	2	6	2640371	2640376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304142
62505	NC_015966	CCA	2	6	2640395	2640400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304142
62506	NC_015966	GGT	2	6	2640500	2640505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304142
62507	NC_015966	CGG	2	6	2640518	2640523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304142
62508	NC_015966	GC	3	6	2640544	2640549	0 %	0 %	50 %	50 %	345304142
62509	NC_015966	GTC	2	6	2640579	2640584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304142
62510	NC_015966	CTC	2	6	2640608	2640613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304142
62511	NC_015966	AGA	2	6	2640626	2640631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304142
62512	NC_015966	CGCC	2	8	2640632	2640639	0 %	0 %	25 %	75 %	345304142
62513	NC_015966	GCCG	2	8	2640686	2640693	0 %	0 %	50 %	50 %	345304142
62514	NC_015966	TGC	2	6	2640712	2640717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304142
62515	NC_015966	CGA	2	6	2640728	2640733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304142
62516	NC_015966	GGA	2	6	2640752	2640757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304142
62517	NC_015966	GC	3	6	2640768	2640773	0 %	0 %	50 %	50 %	345304142
62518	NC_015966	GCGTG	2	10	2640776	2640785	0 %	20 %	60 %	20 %	345304142
62519	NC_015966	CAA	2	6	2640836	2640841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304142
62520	NC_015966	CGG	2	6	2640887	2640892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304142
62521	NC_015966	CGGG	2	8	2640957	2640964	0 %	0 %	75 %	25 %	345304142
62522	NC_015966	GCC	2	6	2640998	2641003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304142
62523	NC_015966	GAG	2	6	2641098	2641103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304142
62524	NC_015966	GGC	2	6	2641118	2641123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304142
62525	NC_015966	TGG	2	6	2641144	2641149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304142
62526	NC_015966	GCG	2	6	2641187	2641192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304142
62527	NC_015966	CGC	2	6	2641242	2641247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304142
62528	NC_015966	GAG	2	6	2641284	2641289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304142
62529	NC_015966	CGG	2	6	2641306	2641311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304142
62530	NC_015966	AAG	2	6	2641373	2641378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304143
62531	NC_015966	GGT	3	9	2641387	2641395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304143
62532	NC_015966	TGC	2	6	2641449	2641454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304143
62533	NC_015966	CTG	2	6	2641478	2641483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304143
62534	NC_015966	TGC	2	6	2641512	2641517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304143
62535	NC_015966	TGC	2	6	2641560	2641565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304143
62536	NC_015966	GCTGGC	2	12	2641591	2641602	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304143
62537	NC_015966	CT	3	6	2641616	2641621	0 %	50 %	0 %	50 %	345304143
62538	NC_015966	CAC	2	6	2641645	2641650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304143
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62542	NC_015966	CGG	2	6	2641933	2641938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304143
62543	NC_015966	TGC	2	6	2641952	2641957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304144
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62545	NC_015966	GGC	2	6	2641984	2641989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304144
62546	NC_015966	GAT	2	6	2642011	2642016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304144
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62548	NC_015966	GGCT	2	8	2642042	2642049	0 %	25 %	50 %	25 %	345304144
62549	NC_015966	CG	3	6	2642127	2642132	0 %	0 %	50 %	50 %	345304144
62550	NC_015966	TTC	2	6	2642182	2642187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304144
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62552	NC_015966	CTT	2	6	2642265	2642270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304144
62553	NC_015966	GCT	2	6	2642356	2642361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304144
62554	NC_015966	GCG	2	6	2642397	2642402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304144
62555	NC_015966	TCG	2	6	2642408	2642413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304144
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62557	NC_015966	GGC	2	6	2642428	2642433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304144
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62559	NC_015966	CGCACG	2	12	2642456	2642467	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304144
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62561	NC_015966	AGC	2	6	2642516	2642521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304144
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62572	NC_015966	CCAGC	2	10	2642962	2642971	20 %	0 %	20 %	60 %	345304144
62573	NC_015966	GC	3	6	2642974	2642979	0 %	0 %	50 %	50 %	345304144
62574	NC_015966	GGA	2	6	2643074	2643079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304144
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62602	NC_015966	GC	3	6	2644233	2644238	0 %	0 %	50 %	50 %	345304146
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62850	NC_015966	GTT	2	6	2654820	2654825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304155
62851	NC_015966	CCG	2	6	2654833	2654838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304155
62852	NC_015966	GCG	2	6	2654856	2654861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
62853	NC_015966	GCG	2	6	2654913	2654918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
62854	NC_015966	GTCG	2	8	2654967	2654974	0 %	25 %	50 %	25 %	345304155
62855	NC_015966	CGA	2	6	2654975	2654980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
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62857	NC_015966	TCG	2	6	2654998	2655003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
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62859	NC_015966	GCG	2	6	2655122	2655127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
62860	NC_015966	CGT	2	6	2655158	2655163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
62861	NC_015966	GT	3	6	2655206	2655211	0 %	50 %	50 %	0 %	345304155
62862	NC_015966	GCCA	2	8	2655233	2655240	25 %	0 %	25 %	50 %	345304155
62863	NC_015966	CCGG	2	8	2655241	2655248	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
62864	NC_015966	GCT	2	6	2655296	2655301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
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62880	NC_015966	GCCA	2	8	2655725	2655732	25 %	0 %	25 %	50 %	345304155
62881	NC_015966	GGC	2	6	2655735	2655740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
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62883	NC_015966	CCGGA	2	10	2655783	2655792	20 %	0 %	40 %	40 %	345304155
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62891	NC_015966	A	6	6	2656060	2656065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62892	NC_015966	CCG	2	6	2656079	2656084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62893	NC_015966	ATG	2	6	2656093	2656098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62894	NC_015966	GAC	2	6	2656101	2656106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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62913	NC_015966	GCT	3	9	2656771	2656779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
62914	NC_015966	TGC	2	6	2656800	2656805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
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62931	NC_015966	GCT	2	6	2657425	2657430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
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62947	NC_015966	CGCCT	2	10	2657991	2658000	0 %	20 %	20 %	60 %	345304156
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62952	NC_015966	CGT	2	6	2658207	2658212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
62953	NC_015966	ATG	2	6	2658264	2658269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304156
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62955	NC_015966	GCA	2	6	2658397	2658402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304156
62956	NC_015966	ACG	2	6	2658440	2658445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304157
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62959	NC_015966	CTG	2	6	2658685	2658690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304157
62960	NC_015966	CTG	2	6	2658700	2658705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304157
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62963	NC_015966	CG	3	6	2658884	2658889	0 %	0 %	50 %	50 %	345304158
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