MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_015966	GCA	2	6	2601197	2601202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304102
61502	NC_015966	GGC	2	6	2601278	2601283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61503	NC_015966	GCGCCC	2	12	2601294	2601305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61504	NC_015966	A	7	7	2601331	2601337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61505	NC_015966	GCG	2	6	2601368	2601373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61506	NC_015966	AG	3	6	2601385	2601390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61507	NC_015966	CCG	2	6	2601391	2601396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61508	NC_015966	TCA	2	6	2601449	2601454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304103
61509	NC_015966	GCGG	2	8	2601498	2601505	0 %	0 %	75 %	25 %	345304103
61510	NC_015966	ACT	2	6	2601518	2601523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304103
61511	NC_015966	ATC	2	6	2601544	2601549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304103
61512	NC_015966	GTG	2	6	2601709	2601714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304103
61513	NC_015966	CGA	2	6	2601735	2601740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61514	NC_015966	GAA	2	6	2601778	2601783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304103
61515	NC_015966	CGTC	2	8	2601792	2601799	0 %	25 %	25 %	50 %	345304103
61516	NC_015966	CCA	2	6	2601800	2601805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304103
61517	NC_015966	ATC	2	6	2601814	2601819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304103
61518	NC_015966	GTG	2	6	2601889	2601894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304103
61519	NC_015966	GAG	2	6	2601976	2601981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304103
61520	NC_015966	GAG	2	6	2601988	2601993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304103
61521	NC_015966	ACG	2	6	2602018	2602023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61522	NC_015966	AGCG	2	8	2602075	2602082	25 %	0 %	50 %	25 %	345304103
61523	NC_015966	CCAGAA	2	12	2602203	2602214	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345304103
61524	NC_015966	GCC	2	6	2602314	2602319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304103
61525	NC_015966	CCCA	2	8	2602330	2602337	25 %	0 %	0 %	75 %	345304103
61526	NC_015966	GGT	2	6	2602338	2602343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304103
61527	NC_015966	ATC	2	6	2602345	2602350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304103
61528	NC_015966	ACG	2	6	2602364	2602369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61529	NC_015966	ACGC	2	8	2602448	2602455	25 %	0 %	25 %	50 %	345304103
61530	NC_015966	CCGGC	2	10	2602464	2602473	0 %	0 %	40 %	60 %	345304103
61531	NC_015966	CGC	2	6	2602564	2602569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304103
61532	NC_015966	AGG	2	6	2602598	2602603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304103
61533	NC_015966	TGC	2	6	2602625	2602630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61534	NC_015966	CGA	2	6	2602632	2602637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61535	NC_015966	CAG	2	6	2602642	2602647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61536	NC_015966	CTG	2	6	2602651	2602656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61537	NC_015966	CGA	2	6	2602677	2602682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304103
61538	NC_015966	CG	3	6	2602691	2602696	0 %	0 %	50 %	50 %	345304103
61539	NC_015966	AAG	2	6	2602718	2602723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304103
61540	NC_015966	GAA	2	6	2602729	2602734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304103
61541	NC_015966	GGC	2	6	2602738	2602743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304103
61542	NC_015966	GC	3	6	2602783	2602788	0 %	0 %	50 %	50 %	345304103
61543	NC_015966	GAA	2	6	2602795	2602800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304103
61544	NC_015966	CG	3	6	2602856	2602861	0 %	0 %	50 %	50 %	345304103
61545	NC_015966	GCAC	2	8	2602959	2602966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61546	NC_015966	GCC	2	6	2602972	2602977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61547	NC_015966	GCCT	2	8	2602982	2602989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61548	NC_015966	TTG	2	6	2603005	2603010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61549	NC_015966	GGT	2	6	2603044	2603049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61550	NC_015966	TGT	2	6	2603078	2603083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304104
61551	NC_015966	CGG	2	6	2603087	2603092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61552	NC_015966	GC	3	6	2603150	2603155	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61553	NC_015966	GCC	2	6	2603161	2603166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61554	NC_015966	TCG	2	6	2603177	2603182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61555	NC_015966	ACGGC	2	10	2603195	2603204	20 %	0 %	40 %	40 %	345304104
61556	NC_015966	CGA	2	6	2603208	2603213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61557	NC_015966	GCCG	2	8	2603215	2603222	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61558	NC_015966	GCCG	2	8	2603238	2603245	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61559	NC_015966	CGA	2	6	2603313	2603318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61560	NC_015966	GAC	2	6	2603319	2603324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61561	NC_015966	GTC	2	6	2603353	2603358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61562	NC_015966	GCC	2	6	2603389	2603394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61563	NC_015966	CAG	2	6	2603457	2603462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61564	NC_015966	TGC	2	6	2603483	2603488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61565	NC_015966	CGT	2	6	2603493	2603498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61566	NC_015966	CAA	2	6	2603502	2603507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304104
61567	NC_015966	GCG	2	6	2603537	2603542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61568	NC_015966	CTG	2	6	2603629	2603634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61569	NC_015966	G	6	6	2603670	2603675	0 %	0 %	100 %	0 %	345304104
61570	NC_015966	GC	3	6	2603683	2603688	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61571	NC_015966	CGG	2	6	2603691	2603696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61572	NC_015966	CTC	2	6	2603703	2603708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304104
61573	NC_015966	GCT	2	6	2603772	2603777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61574	NC_015966	GGC	2	6	2603790	2603795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61575	NC_015966	CTC	2	6	2603799	2603804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304104
61576	NC_015966	GC	4	8	2603848	2603855	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61577	NC_015966	CCG	2	6	2603856	2603861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61578	NC_015966	CCGC	2	8	2603942	2603949	0 %	0 %	25 %	75 %	345304104
61579	NC_015966	GCT	2	6	2603961	2603966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304104
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61582	NC_015966	CG	3	6	2604097	2604102	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61583	NC_015966	CGG	2	6	2604120	2604125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61584	NC_015966	CG	3	6	2604126	2604131	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61585	NC_015966	GCTG	2	8	2604140	2604147	0 %	25 %	50 %	25 %	345304104
61586	NC_015966	GCC	2	6	2604175	2604180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
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61588	NC_015966	GC	3	6	2604280	2604285	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61589	NC_015966	CAG	2	6	2604286	2604291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61590	NC_015966	GCC	2	6	2604331	2604336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61591	NC_015966	AGGC	2	8	2604374	2604381	25 %	0 %	50 %	25 %	345304104
61592	NC_015966	ACCG	2	8	2604406	2604413	25 %	0 %	25 %	50 %	345304104
61593	NC_015966	CGA	2	6	2604417	2604422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
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61597	NC_015966	GCCCGC	2	12	2604493	2604504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
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61599	NC_015966	GCTCAC	2	12	2604666	2604677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304104
61600	NC_015966	CTA	2	6	2604693	2604698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304104
61601	NC_015966	GCC	2	6	2604702	2604707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61602	NC_015966	AGC	2	6	2604743	2604748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304104
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61604	NC_015966	GCTACG	2	12	2604935	2604946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304104
61605	NC_015966	GCG	2	6	2604971	2604976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61606	NC_015966	CG	3	6	2605025	2605030	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61607	NC_015966	GGC	2	6	2605073	2605078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61608	NC_015966	GCC	2	6	2605208	2605213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304104
61609	NC_015966	CCA	2	6	2605295	2605300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304104
61610	NC_015966	CGGC	2	8	2605329	2605336	0 %	0 %	50 %	50 %	345304104
61611	NC_015966	GCG	2	6	2605355	2605360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304104
61612	NC_015966	C	6	6	2605454	2605459	0 %	0 %	0 %	100 %	345304104
61613	NC_015966	CCTCCG	2	12	2605470	2605481	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345304104
61614	NC_015966	AGC	2	6	2605532	2605537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61615	NC_015966	GCG	2	6	2605548	2605553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61616	NC_015966	CAT	2	6	2605599	2605604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304105
61617	NC_015966	GCT	3	9	2605622	2605630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304105
61618	NC_015966	CGA	2	6	2605670	2605675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304105
61619	NC_015966	GCC	2	6	2605746	2605751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304105
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61622	NC_015966	CTG	2	6	2605870	2605875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304105
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61669	NC_015966	CGA	2	6	2607202	2607207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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61731	NC_015966	CGA	2	6	2609763	2609768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304109
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61733	NC_015966	CCCA	2	8	2609827	2609834	25 %	0 %	0 %	75 %	345304109
61734	NC_015966	GACCG	2	10	2609917	2609926	20 %	0 %	40 %	40 %	345304109
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61741	NC_015966	CG	3	6	2610299	2610304	0 %	0 %	50 %	50 %	345304110
61742	NC_015966	GCG	2	6	2610356	2610361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304110
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61801	NC_015966	GT	3	6	2612514	2612519	0 %	50 %	50 %	0 %	345304112
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61822	NC_015966	CGC	2	6	2613399	2613404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304113
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61834	NC_015966	CCA	2	6	2613741	2613746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304114
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61837	NC_015966	ACGCC	2	10	2613846	2613855	20 %	0 %	20 %	60 %	345304114
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61841	NC_015966	CAG	2	6	2613967	2613972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304114
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61843	NC_015966	CGC	2	6	2614059	2614064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304115
61844	NC_015966	CCAC	2	8	2614069	2614076	25 %	0 %	0 %	75 %	345304115
61845	NC_015966	GCC	2	6	2614130	2614135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304115
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61847	NC_015966	GGCC	2	8	2614156	2614163	0 %	0 %	50 %	50 %	345304115
61848	NC_015966	AGC	2	6	2614185	2614190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304115
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61963	NC_015966	GGC	2	6	2618240	2618245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304122
61964	NC_015966	GCC	2	6	2618261	2618266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304122
61965	NC_015966	GCA	2	6	2618267	2618272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304122
61966	NC_015966	GCC	2	6	2618301	2618306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304122
61967	NC_015966	CGC	2	6	2618307	2618312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304122
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61991	NC_015966	TCG	2	6	2619298	2619303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304124
61992	NC_015966	CG	3	6	2619313	2619318	0 %	0 %	50 %	50 %	345304124
61993	NC_015966	CGC	2	6	2619413	2619418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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61995	NC_015966	T	6	6	2619452	2619457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61996	NC_015966	CGGG	2	8	2619489	2619496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61997	NC_015966	GCG	2	6	2619513	2619518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61998	NC_015966	CTG	3	9	2619566	2619574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304125
61999	NC_015966	CGA	2	6	2619601	2619606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304125
62000	NC_015966	CGC	2	6	2619683	2619688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304125

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