MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59502	NC_015966	CCG	2	6	2519689	2519694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304044
59503	NC_015966	CGGC	2	8	2519785	2519792	0 %	0 %	50 %	50 %	345304044
59504	NC_015966	CGCC	2	8	2519820	2519827	0 %	0 %	25 %	75 %	345304044
59505	NC_015966	CCA	2	6	2519841	2519846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304044
59506	NC_015966	GTCCG	2	10	2519850	2519859	0 %	20 %	40 %	40 %	345304044
59507	NC_015966	TTC	2	6	2519864	2519869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304044
59508	NC_015966	CGA	2	6	2519922	2519927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304044
59509	NC_015966	GCC	2	6	2520046	2520051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59510	NC_015966	CGC	2	6	2520052	2520057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59511	NC_015966	GAA	2	6	2520110	2520115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59512	NC_015966	AG	3	6	2520151	2520156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59513	NC_015966	ACGGT	2	10	2520177	2520186	20 %	20 %	40 %	20 %	345304045
59514	NC_015966	GC	4	8	2520292	2520299	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
59515	NC_015966	CGGC	2	8	2520353	2520360	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
59516	NC_015966	CCA	2	6	2520437	2520442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304045
59517	NC_015966	GTG	2	6	2520486	2520491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304045
59518	NC_015966	GGC	2	6	2520570	2520575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
59519	NC_015966	GGC	2	6	2520582	2520587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
59520	NC_015966	GGC	2	6	2520605	2520610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
59521	NC_015966	ACG	2	6	2520664	2520669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304045
59522	NC_015966	GCT	2	6	2520677	2520682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304045
59523	NC_015966	TCC	2	6	2520691	2520696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304045
59524	NC_015966	CGTC	2	8	2520700	2520707	0 %	25 %	25 %	50 %	345304045
59525	NC_015966	GAT	2	6	2520741	2520746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304045
59526	NC_015966	CGGC	2	8	2520748	2520755	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
59527	NC_015966	CCT	2	6	2520764	2520769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304045
59528	NC_015966	GGC	2	6	2520773	2520778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
59529	NC_015966	CG	3	6	2520791	2520796	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
59530	NC_015966	ACCC	2	8	2520828	2520835	25 %	0 %	0 %	75 %	345304045
59531	NC_015966	CAG	2	6	2520852	2520857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304045
59532	NC_015966	CCGC	2	8	2520868	2520875	0 %	0 %	25 %	75 %	345304045
59533	NC_015966	CGT	2	6	2520887	2520892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304045
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59535	NC_015966	CGGC	2	8	2520924	2520931	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
59536	NC_015966	CAC	2	6	2520954	2520959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304045
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59539	NC_015966	TCGGCC	2	12	2521110	2521121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304046
59540	NC_015966	CTC	2	6	2521193	2521198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304046
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59542	NC_015966	TGAGCA	2	12	2521288	2521299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345304046
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59550	NC_015966	CGT	2	6	2521636	2521641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
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59552	NC_015966	CGT	2	6	2521804	2521809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
59553	NC_015966	GCA	2	6	2521975	2521980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
59554	NC_015966	CGA	2	6	2522044	2522049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
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59558	NC_015966	GCG	2	6	2522158	2522163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304046
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59592	NC_015966	GA	3	6	2523766	2523771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59593	NC_015966	TTGT	2	8	2523772	2523779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59594	NC_015966	GGCG	2	8	2523860	2523867	0 %	0 %	75 %	25 %	345304047
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59598	NC_015966	GCCG	2	8	2523995	2524002	0 %	0 %	50 %	50 %	345304047
59599	NC_015966	CGG	2	6	2524091	2524096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304047
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59615	NC_015966	CAT	2	6	2524524	2524529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304047
59616	NC_015966	ACC	2	6	2524539	2524544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304048
59617	NC_015966	GTCG	2	8	2524559	2524566	0 %	25 %	50 %	25 %	345304048
59618	NC_015966	AC	3	6	2524648	2524653	50 %	0 %	0 %	50 %	345304048
59619	NC_015966	TTC	2	6	2524703	2524708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304048
59620	NC_015966	GCG	2	6	2524709	2524714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304048
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59622	NC_015966	GCC	2	6	2524855	2524860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304048
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59624	NC_015966	CCGGT	2	10	2524925	2524934	0 %	20 %	40 %	40 %	345304048
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59626	NC_015966	CCA	2	6	2524996	2525001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304048
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59632	NC_015966	TCCG	2	8	2525243	2525250	0 %	25 %	25 %	50 %	345304048
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59653	NC_015966	GTGG	2	8	2525992	2525999	0 %	25 %	75 %	0 %	345304048
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59656	NC_015966	GCTTC	2	10	2526235	2526244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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59727	NC_015966	GCCGTC	2	12	2529047	2529058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304051
59728	NC_015966	CGA	2	6	2529061	2529066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304051
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