MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_015966	GGA	2	6	2496775	2496780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304029
59002	NC_015966	CCG	2	6	2496874	2496879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59003	NC_015966	ACC	2	6	2496921	2496926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59004	NC_015966	GC	3	6	2497009	2497014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59005	NC_015966	CGGTGG	2	12	2497027	2497038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59006	NC_015966	CGG	2	6	2497043	2497048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59007	NC_015966	GC	3	6	2497127	2497132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59008	NC_015966	GCG	2	6	2497162	2497167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59009	NC_015966	CCA	2	6	2497213	2497218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59010	NC_015966	GTG	2	6	2497329	2497334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59011	NC_015966	GGT	2	6	2497370	2497375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59012	NC_015966	GCA	2	6	2497381	2497386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59013	NC_015966	GC	3	6	2497479	2497484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59014	NC_015966	TCG	2	6	2497662	2497667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59015	NC_015966	GCC	2	6	2497686	2497691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59016	NC_015966	CAG	2	6	2497697	2497702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59017	NC_015966	GTC	2	6	2497749	2497754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59018	NC_015966	CGC	2	6	2497770	2497775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59019	NC_015966	GCCA	2	8	2497797	2497804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59020	NC_015966	CAGAT	2	10	2497830	2497839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59021	NC_015966	CGG	2	6	2497951	2497956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59022	NC_015966	AAGG	2	8	2497998	2498005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59023	NC_015966	A	6	6	2498081	2498086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59024	NC_015966	GCC	2	6	2498087	2498092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59025	NC_015966	TCG	2	6	2498157	2498162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59026	NC_015966	CAG	2	6	2498237	2498242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59027	NC_015966	CGG	2	6	2498433	2498438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59028	NC_015966	GCCG	2	8	2498504	2498511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59029	NC_015966	CCA	2	6	2498539	2498544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59030	NC_015966	CCA	2	6	2498560	2498565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59031	NC_015966	CGGA	2	8	2498600	2498607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59032	NC_015966	ACGC	2	8	2498675	2498682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59033	NC_015966	GTC	2	6	2498696	2498701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59034	NC_015966	CTT	2	6	2498722	2498727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59035	NC_015966	GGCG	2	8	2498734	2498741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59036	NC_015966	GTC	2	6	2498787	2498792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59037	NC_015966	TGCG	2	8	2498823	2498830	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59038	NC_015966	CAG	2	6	2498861	2498866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59039	NC_015966	GTCG	2	8	2498872	2498879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59040	NC_015966	GCG	2	6	2498891	2498896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59041	NC_015966	ACC	2	6	2498923	2498928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59042	NC_015966	GCA	2	6	2498968	2498973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59043	NC_015966	CGT	2	6	2498983	2498988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59044	NC_015966	TGG	2	6	2499009	2499014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59045	NC_015966	GGCG	2	8	2499103	2499110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59046	NC_015966	GCA	2	6	2499145	2499150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59047	NC_015966	CAG	2	6	2499227	2499232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59048	NC_015966	GCTC	2	8	2499253	2499260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59049	NC_015966	ACGCGC	2	12	2499291	2499302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59050	NC_015966	AGT	2	6	2499304	2499309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59051	NC_015966	GGC	2	6	2499316	2499321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59052	NC_015966	CG	4	8	2499403	2499410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59053	NC_015966	TGG	2	6	2499424	2499429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59054	NC_015966	CCG	2	6	2499464	2499469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59055	NC_015966	CTC	2	6	2499595	2499600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59056	NC_015966	TTC	2	6	2499643	2499648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59057	NC_015966	GGT	2	6	2499660	2499665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304030
59058	NC_015966	GTT	2	6	2499689	2499694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304030
59059	NC_015966	AGC	2	6	2499726	2499731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304030
59060	NC_015966	CCGG	2	8	2499824	2499831	0 %	0 %	50 %	50 %	345304030
59061	NC_015966	AGC	2	6	2499837	2499842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304030
59062	NC_015966	GCT	2	6	2499880	2499885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304030
59063	NC_015966	TCC	2	6	2499909	2499914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304030
59064	NC_015966	GCG	2	6	2499931	2499936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304030
59065	NC_015966	GCCCG	2	10	2499940	2499949	0 %	0 %	40 %	60 %	345304030
59066	NC_015966	CCGCA	2	10	2499953	2499962	20 %	0 %	20 %	60 %	345304030
59067	NC_015966	CTT	2	6	2499994	2499999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304030
59068	NC_015966	AGC	3	9	2500020	2500028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304030
59069	NC_015966	TCGT	2	8	2500059	2500066	0 %	50 %	25 %	25 %	345304030
59070	NC_015966	CTT	2	6	2500097	2500102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304030
59071	NC_015966	ATGGA	2	10	2500108	2500117	40 %	20 %	40 %	0 %	345304030
59072	NC_015966	CGT	2	6	2500132	2500137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304030
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59074	NC_015966	CG	3	6	2500246	2500251	0 %	0 %	50 %	50 %	345304030
59075	NC_015966	GTT	2	6	2500337	2500342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304030
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59079	NC_015966	CGGC	2	8	2500533	2500540	0 %	0 %	50 %	50 %	345304030
59080	NC_015966	CCG	2	6	2500546	2500551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304030
59081	NC_015966	GCCC	2	8	2500626	2500633	0 %	0 %	25 %	75 %	345304030
59082	NC_015966	CGC	2	6	2500684	2500689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304030
59083	NC_015966	TAT	2	6	2500768	2500773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345304030
59084	NC_015966	TGC	2	6	2501003	2501008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304030
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59086	NC_015966	CAG	2	6	2501138	2501143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304030
59087	NC_015966	AGTCC	2	10	2501263	2501272	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59088	NC_015966	AGT	2	6	2501359	2501364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59089	NC_015966	GACG	2	8	2501387	2501394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59090	NC_015966	CGT	2	6	2501540	2501545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59091	NC_015966	TGC	2	6	2501586	2501591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59092	NC_015966	TGT	2	6	2501626	2501631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59093	NC_015966	CCCA	2	8	2501663	2501670	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59094	NC_015966	GAT	2	6	2501759	2501764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59095	NC_015966	TGT	2	6	2501854	2501859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59096	NC_015966	TACC	2	8	2501911	2501918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59097	NC_015966	ATC	2	6	2501928	2501933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59098	NC_015966	CGC	2	6	2501956	2501961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59099	NC_015966	GC	3	6	2501980	2501985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59100	NC_015966	GAC	2	6	2502005	2502010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59101	NC_015966	CTT	2	6	2502057	2502062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59102	NC_015966	GTC	2	6	2502072	2502077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59103	NC_015966	GTA	2	6	2502132	2502137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59104	NC_015966	AAG	2	6	2502167	2502172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59105	NC_015966	CGT	2	6	2502179	2502184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59106	NC_015966	CAG	2	6	2502227	2502232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59107	NC_015966	TCCCA	2	10	2502270	2502279	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59108	NC_015966	GCC	3	9	2502323	2502331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59109	NC_015966	TGT	3	9	2502382	2502390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59110	NC_015966	C	6	6	2502442	2502447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59111	NC_015966	TCCT	2	8	2502455	2502462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59112	NC_015966	GCCA	2	8	2502472	2502479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59113	NC_015966	GAA	2	6	2502557	2502562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59114	NC_015966	TATT	2	8	2502564	2502571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59115	NC_015966	GC	3	6	2502644	2502649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59116	NC_015966	TCG	2	6	2502672	2502677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59117	NC_015966	TTC	2	6	2502686	2502691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59118	NC_015966	GT	3	6	2502717	2502722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59119	NC_015966	CAG	2	6	2502740	2502745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59120	NC_015966	GCT	2	6	2502815	2502820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59121	NC_015966	GCG	2	6	2502838	2502843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59122	NC_015966	AGG	2	6	2502848	2502853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59123	NC_015966	TCG	2	6	2502874	2502879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59124	NC_015966	GA	3	6	2503044	2503049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59125	NC_015966	TCG	2	6	2503074	2503079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59126	NC_015966	ACC	2	6	2503160	2503165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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59128	NC_015966	GCCG	2	8	2503316	2503323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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59240	NC_015966	TCG	2	6	2508309	2508314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304033
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59244	NC_015966	CTG	2	6	2508713	2508718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304033
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59272	NC_015966	TGGG	2	8	2509997	2510004	0 %	25 %	75 %	0 %	345304034
59273	NC_015966	GTT	2	6	2510026	2510031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304034
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59324	NC_015966	GC	3	6	2511851	2511856	0 %	0 %	50 %	50 %	345304035
59325	NC_015966	CAG	2	6	2511874	2511879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304035
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59330	NC_015966	TGCT	2	8	2512126	2512133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59331	NC_015966	CG	3	6	2512163	2512168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59332	NC_015966	TCC	2	6	2512185	2512190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304036
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59335	NC_015966	GCA	2	6	2512340	2512345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304036
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59337	NC_015966	CCT	2	6	2512419	2512424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59338	NC_015966	CGCA	2	8	2512445	2512452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59339	NC_015966	T	6	6	2512470	2512475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59340	NC_015966	GGT	2	6	2512506	2512511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59341	NC_015966	TGA	2	6	2512550	2512555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304037
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59344	NC_015966	CGA	2	6	2512655	2512660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304037
59345	NC_015966	GTA	2	6	2512663	2512668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304037
59346	NC_015966	CGA	2	6	2512742	2512747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304037
59347	NC_015966	GC	3	6	2512759	2512764	0 %	0 %	50 %	50 %	345304037
59348	NC_015966	ATCAGC	2	12	2512801	2512812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345304037
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59350	NC_015966	CG	3	6	2512839	2512844	0 %	0 %	50 %	50 %	345304037
59351	NC_015966	A	6	6	2512902	2512907	100 %	0 %	0 %	0 %	345304037
59352	NC_015966	GCG	2	6	2512952	2512957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304037
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59354	NC_015966	TTC	2	6	2513199	2513204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304038
59355	NC_015966	GCA	2	6	2513213	2513218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304038
59356	NC_015966	CCG	2	6	2513268	2513273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304038
59357	NC_015966	CGT	2	6	2513348	2513353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304038
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59493	NC_015966	CAT	2	6	2519209	2519214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304043
59494	NC_015966	CGC	2	6	2519334	2519339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304043
59495	NC_015966	CGA	2	6	2519346	2519351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304043
59496	NC_015966	CAG	2	6	2519356	2519361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304043
59497	NC_015966	GGA	2	6	2519407	2519412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59498	NC_015966	CAC	2	6	2519473	2519478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304044
59499	NC_015966	TGA	2	6	2519490	2519495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304044
59500	NC_015966	CGTCTC	2	12	2519632	2519643	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345304044

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