MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_015966	CCT	2	6	2455238	2455243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303996
58003	NC_015966	CCT	2	6	2455334	2455339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303996
58004	NC_015966	CTG	2	6	2455416	2455421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303996
58005	NC_015966	GAT	2	6	2455425	2455430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303996
58006	NC_015966	CTC	2	6	2455440	2455445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303996
58007	NC_015966	GCC	2	6	2455658	2455663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303996
58008	NC_015966	GCG	2	6	2455676	2455681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303996
58009	NC_015966	CAT	2	6	2455683	2455688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303996
58010	NC_015966	GTCGG	2	10	2455707	2455716	0 %	20 %	60 %	20 %	345303996
58011	NC_015966	GTT	2	6	2455734	2455739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303996
58012	NC_015966	CAG	2	6	2455812	2455817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303996
58013	NC_015966	TCAGC	2	10	2455857	2455866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58014	NC_015966	TC	3	6	2455871	2455876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58015	NC_015966	CGG	2	6	2455901	2455906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58016	NC_015966	T	7	7	2455909	2455915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58017	NC_015966	TTG	2	6	2455953	2455958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58018	NC_015966	CTT	2	6	2455994	2455999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58019	NC_015966	GTT	2	6	2456055	2456060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58020	NC_015966	CGTGT	2	10	2456081	2456090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58021	NC_015966	ACCAA	2	10	2456094	2456103	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58022	NC_015966	CTG	3	9	2456149	2456157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303997
58023	NC_015966	CTG	2	6	2456161	2456166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303997
58024	NC_015966	CCGC	2	8	2456174	2456181	0 %	0 %	25 %	75 %	345303997
58025	NC_015966	CGA	2	6	2456184	2456189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303997
58026	NC_015966	GGAA	2	8	2456208	2456215	50 %	0 %	50 %	0 %	345303997
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58030	NC_015966	CCGG	2	8	2456418	2456425	0 %	0 %	50 %	50 %	345303997
58031	NC_015966	GAAC	2	8	2456571	2456578	50 %	0 %	25 %	25 %	345303997
58032	NC_015966	TGG	2	6	2456687	2456692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303997
58033	NC_015966	GAA	2	6	2456740	2456745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303997
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58055	NC_015966	CGA	2	6	2457722	2457727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303997
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58062	NC_015966	CCGG	2	8	2457949	2457956	0 %	0 %	50 %	50 %	345303997
58063	NC_015966	CCA	2	6	2457968	2457973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303997
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58119	NC_015966	TGCGC	2	10	2460033	2460042	0 %	20 %	40 %	40 %	345303999
58120	NC_015966	GAC	2	6	2460057	2460062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303999
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58122	NC_015966	CTG	2	6	2460103	2460108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303999
58123	NC_015966	AGG	2	6	2460176	2460181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303999
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58126	NC_015966	GCA	2	6	2460272	2460277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58127	NC_015966	T	6	6	2460312	2460317	0 %	100 %	0 %	0 %	345304000
58128	NC_015966	ATC	2	6	2460329	2460334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304000
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58165	NC_015966	ATT	2	6	2461871	2461876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58166	NC_015966	CAAC	2	8	2461881	2461888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58167	NC_015966	GGC	3	9	2461919	2461927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58168	NC_015966	GCA	2	6	2461934	2461939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58169	NC_015966	GCC	2	6	2461944	2461949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58170	NC_015966	TTCTG	2	10	2461952	2461961	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58171	NC_015966	C	6	6	2461973	2461978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58172	NC_015966	CGA	2	6	2462012	2462017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58208	NC_015966	GTC	2	6	2463241	2463246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304003
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58217	NC_015966	GCCG	2	8	2463695	2463702	0 %	0 %	50 %	50 %	345304003
58218	NC_015966	GC	3	6	2463706	2463711	0 %	0 %	50 %	50 %	345304003
58219	NC_015966	CGCAGG	2	12	2463719	2463730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304003
58220	NC_015966	CAG	2	6	2463797	2463802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304004
58221	NC_015966	T	6	6	2463851	2463856	0 %	100 %	0 %	0 %	345304004
58222	NC_015966	GCG	2	6	2463861	2463866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304004
58223	NC_015966	GCG	2	6	2463889	2463894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304004
58224	NC_015966	CGAGCA	2	12	2463976	2463987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304004
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58227	NC_015966	CAC	2	6	2464093	2464098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304004
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58230	NC_015966	CTG	2	6	2464139	2464144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304004
58231	NC_015966	CCG	2	6	2464165	2464170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304004
58232	NC_015966	TGC	2	6	2464191	2464196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304004
58233	NC_015966	GGT	2	6	2464243	2464248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304004
58234	NC_015966	GATCT	2	10	2464265	2464274	20 %	40 %	20 %	20 %	345304004
58235	NC_015966	CTG	2	6	2464313	2464318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304004
58236	NC_015966	GTG	2	6	2464343	2464348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304004
58237	NC_015966	GCC	2	6	2464361	2464366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304004
58238	NC_015966	CCG	2	6	2464433	2464438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304004
58239	NC_015966	GGT	2	6	2464460	2464465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304004
58240	NC_015966	CGC	2	6	2464481	2464486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304004
58241	NC_015966	TCT	2	6	2464584	2464589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304004
58242	NC_015966	GCA	2	6	2464633	2464638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304004
58243	NC_015966	CCG	2	6	2464663	2464668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304004
58244	NC_015966	CG	3	6	2464667	2464672	0 %	0 %	50 %	50 %	345304004
58245	NC_015966	GGT	2	6	2464702	2464707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304004
58246	NC_015966	GGC	2	6	2464709	2464714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304004
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58248	NC_015966	CTCCAC	2	12	2464853	2464864	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345304004
58249	NC_015966	CCG	2	6	2465012	2465017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58250	NC_015966	CCT	2	6	2465044	2465049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58251	NC_015966	ATATG	2	10	2465075	2465084	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58252	NC_015966	CA	3	6	2465092	2465097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58253	NC_015966	TCC	2	6	2465143	2465148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58254	NC_015966	CTG	2	6	2465217	2465222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304005
58255	NC_015966	CGGT	2	8	2465224	2465231	0 %	25 %	50 %	25 %	345304005
58256	NC_015966	TGC	2	6	2465263	2465268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304005
58257	NC_015966	CGA	2	6	2465294	2465299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304005
58258	NC_015966	CGGG	2	8	2465313	2465320	0 %	0 %	75 %	25 %	345304005
58259	NC_015966	GCG	2	6	2465408	2465413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304005
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58262	NC_015966	AGCG	2	8	2465545	2465552	25 %	0 %	50 %	25 %	345304005
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58264	NC_015966	ACG	2	6	2465602	2465607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304005
58265	NC_015966	CG	3	6	2465666	2465671	0 %	0 %	50 %	50 %	345304005
58266	NC_015966	CACCAG	2	12	2465700	2465711	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345304005
58267	NC_015966	GCC	2	6	2465775	2465780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304006
58268	NC_015966	GGCC	2	8	2465814	2465821	0 %	0 %	50 %	50 %	345304006
58269	NC_015966	TTG	2	6	2465915	2465920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304006
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58271	NC_015966	AGCC	2	8	2466035	2466042	25 %	0 %	25 %	50 %	345304006
58272	NC_015966	GGT	2	6	2466084	2466089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304006
58273	NC_015966	CGT	2	6	2466093	2466098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304006
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58275	NC_015966	TGC	2	6	2466176	2466181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304006
58276	NC_015966	CCTCGG	2	12	2466204	2466215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304006
58277	NC_015966	GC	4	8	2466237	2466244	0 %	0 %	50 %	50 %	345304006
58278	NC_015966	CCA	2	6	2466372	2466377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304006
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58280	NC_015966	GGT	2	6	2466405	2466410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304006
58281	NC_015966	TCG	2	6	2466425	2466430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304006
58282	NC_015966	CCT	2	6	2466498	2466503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304007
58283	NC_015966	GCA	2	6	2466531	2466536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
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58288	NC_015966	GCC	2	6	2466772	2466777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
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58290	NC_015966	CGC	2	6	2466795	2466800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
58291	NC_015966	CTG	2	6	2466826	2466831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58292	NC_015966	CGTG	2	8	2466837	2466844	0 %	25 %	50 %	25 %	345304007
58293	NC_015966	GCA	2	6	2466924	2466929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58294	NC_015966	TGG	2	6	2466963	2466968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304007
58295	NC_015966	CAC	2	6	2466976	2466981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304007
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58298	NC_015966	GCC	2	6	2467094	2467099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
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58300	NC_015966	GCC	2	6	2467139	2467144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
58301	NC_015966	CG	3	6	2467145	2467150	0 %	0 %	50 %	50 %	345304007
58302	NC_015966	CTG	2	6	2467223	2467228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58303	NC_015966	CGA	2	6	2467245	2467250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58304	NC_015966	GTCGT	2	10	2467259	2467268	0 %	40 %	40 %	20 %	345304007
58305	NC_015966	GCG	2	6	2467270	2467275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304007
58306	NC_015966	CAGCT	2	10	2467297	2467306	20 %	20 %	20 %	40 %	345304007
58307	NC_015966	CGT	2	6	2467318	2467323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58308	NC_015966	GTC	2	6	2467348	2467353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58309	NC_015966	GCT	2	6	2467380	2467385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58310	NC_015966	CGC	2	6	2467386	2467391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304007
58311	NC_015966	GCT	2	6	2467419	2467424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304007
58312	NC_015966	TCC	2	6	2467493	2467498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304007
58313	NC_015966	CTT	2	6	2467609	2467614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304007
58314	NC_015966	GGC	3	9	2467626	2467634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304007
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58316	NC_015966	CG	3	6	2467647	2467652	0 %	0 %	50 %	50 %	345304007
58317	NC_015966	GAT	2	6	2467654	2467659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304007
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58319	NC_015966	CTG	2	6	2467718	2467723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58320	NC_015966	ACCGG	2	10	2467751	2467760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58321	NC_015966	GGC	3	9	2467773	2467781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304008
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58323	NC_015966	CGG	2	6	2467838	2467843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304008
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58325	NC_015966	GCG	2	6	2467986	2467991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304008
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58329	NC_015966	CAG	2	6	2468119	2468124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304008
58330	NC_015966	GGCG	2	8	2468128	2468135	0 %	0 %	75 %	25 %	345304008
58331	NC_015966	CGG	2	6	2468166	2468171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304008
58332	NC_015966	GAA	2	6	2468172	2468177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304008
58333	NC_015966	CAC	2	6	2468185	2468190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304008
58334	NC_015966	CCA	2	6	2468193	2468198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304008
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58336	NC_015966	CACC	2	8	2468223	2468230	25 %	0 %	0 %	75 %	345304008
58337	NC_015966	CCG	2	6	2468237	2468242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304008
58338	NC_015966	CCA	2	6	2468268	2468273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304008
58339	NC_015966	CGC	2	6	2468291	2468296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304008
58340	NC_015966	CGC	2	6	2468310	2468315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304008
58341	NC_015966	GCGGT	2	10	2468355	2468364	0 %	20 %	60 %	20 %	345304008
58342	NC_015966	TGC	2	6	2468382	2468387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304008
58343	NC_015966	GCC	2	6	2468426	2468431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304008
58344	NC_015966	CGG	2	6	2468449	2468454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304008
58345	NC_015966	CAT	2	6	2468470	2468475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304008
58346	NC_015966	CTT	2	6	2468568	2468573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304008
58347	NC_015966	A	6	6	2468601	2468606	100 %	0 %	0 %	0 %	345304008
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58464	NC_015966	GCA	2	6	2473040	2473045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304013
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58494	NC_015966	CGG	2	6	2474685	2474690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304014
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