MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57502	NC_015966	ACG	2	6	2434025	2434030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57503	NC_015966	GTT	3	9	2434219	2434227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303982
57504	NC_015966	GAT	2	6	2434228	2434233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303982
57505	NC_015966	TCA	2	6	2434287	2434292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303982
57506	NC_015966	CGC	2	6	2434305	2434310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303982
57507	NC_015966	ACC	2	6	2434319	2434324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303982
57508	NC_015966	CCGC	2	8	2434336	2434343	0 %	0 %	25 %	75 %	345303982
57509	NC_015966	GGC	2	6	2434354	2434359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303982
57510	NC_015966	GGC	2	6	2434366	2434371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303982
57511	NC_015966	GCCC	2	8	2434398	2434405	0 %	0 %	25 %	75 %	345303982
57512	NC_015966	TGCG	2	8	2434415	2434422	0 %	25 %	50 %	25 %	345303982
57513	NC_015966	TGC	2	6	2434463	2434468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57514	NC_015966	ACC	2	6	2434481	2434486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303982
57515	NC_015966	GCC	2	6	2434495	2434500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303982
57516	NC_015966	GCCA	2	8	2434601	2434608	25 %	0 %	25 %	50 %	345303982
57517	NC_015966	CCA	2	6	2434629	2434634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303982
57518	NC_015966	TTC	2	6	2434697	2434702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303982
57519	NC_015966	GTCGAT	2	12	2434717	2434728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345303982
57520	NC_015966	GC	4	8	2434789	2434796	0 %	0 %	50 %	50 %	345303982
57521	NC_015966	GAT	2	6	2434804	2434809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303982
57522	NC_015966	TGC	2	6	2434820	2434825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57523	NC_015966	GTC	2	6	2434882	2434887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57524	NC_015966	CGT	2	6	2434915	2434920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57525	NC_015966	CAG	2	6	2434957	2434962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57526	NC_015966	CGCGTT	2	12	2434969	2434980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
57527	NC_015966	C	6	6	2434991	2434996	0 %	0 %	0 %	100 %	345303982
57528	NC_015966	AGC	2	6	2435003	2435008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303982
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57533	NC_015966	CCA	3	9	2435151	2435159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303982
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57537	NC_015966	TGG	2	6	2435388	2435393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303982
57538	NC_015966	GTACC	2	10	2435415	2435424	20 %	20 %	20 %	40 %	345303982
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57540	NC_015966	GGCG	2	8	2435514	2435521	0 %	0 %	75 %	25 %	345303982
57541	NC_015966	TCG	2	6	2435525	2435530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303982
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57544	NC_015966	AAT	2	6	2435868	2435873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57545	NC_015966	AGC	2	6	2435896	2435901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57546	NC_015966	GCT	2	6	2435922	2435927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57547	NC_015966	CTG	2	6	2435940	2435945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57548	NC_015966	CG	3	6	2435950	2435955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57549	NC_015966	ACG	2	6	2435984	2435989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57550	NC_015966	CGCA	2	8	2436011	2436018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57551	NC_015966	CAA	2	6	2436020	2436025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57552	NC_015966	TCC	2	6	2436029	2436034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57553	NC_015966	TAAA	2	8	2436192	2436199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57554	NC_015966	CTT	2	6	2436208	2436213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57555	NC_015966	T	7	7	2436223	2436229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57556	NC_015966	CTA	2	6	2436248	2436253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57557	NC_015966	ACA	2	6	2436262	2436267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57558	NC_015966	AAAG	2	8	2436285	2436292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57559	NC_015966	CAG	2	6	2436349	2436354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303983
57560	NC_015966	GGC	2	6	2436378	2436383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303983
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57562	NC_015966	CAG	2	6	2436514	2436519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303983
57563	NC_015966	CAG	2	6	2436559	2436564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303983
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57565	NC_015966	GCA	2	6	2436600	2436605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303983
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57571	NC_015966	A	6	6	2436757	2436762	100 %	0 %	0 %	0 %	345303983
57572	NC_015966	CAG	2	6	2436763	2436768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303983
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57584	NC_015966	GC	3	6	2437249	2437254	0 %	0 %	50 %	50 %	345303983
57585	NC_015966	CG	3	6	2437266	2437271	0 %	0 %	50 %	50 %	345303983
57586	NC_015966	GCC	2	6	2437324	2437329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303983
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57590	NC_015966	CGC	2	6	2437452	2437457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303983
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57600	NC_015966	CG	3	6	2438097	2438102	0 %	0 %	50 %	50 %	345303984
57601	NC_015966	AGC	2	6	2438177	2438182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303984
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57606	NC_015966	CTC	2	6	2438347	2438352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303984
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57613	NC_015966	CCA	2	6	2438701	2438706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57615	NC_015966	CGG	2	6	2438776	2438781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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57617	NC_015966	GATG	2	8	2438797	2438804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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