MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_015966	GCG	2	6	2412003	2412008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303964
57002	NC_015966	GTGC	2	8	2412063	2412070	0 %	25 %	50 %	25 %	345303964
57003	NC_015966	GC	3	6	2412069	2412074	0 %	0 %	50 %	50 %	345303964
57004	NC_015966	CACC	2	8	2412097	2412104	25 %	0 %	0 %	75 %	345303964
57005	NC_015966	CGA	2	6	2412109	2412114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303964
57006	NC_015966	CGC	2	6	2412127	2412132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303964
57007	NC_015966	TCC	2	6	2412189	2412194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303964
57008	NC_015966	CCGG	2	8	2412303	2412310	0 %	0 %	50 %	50 %	345303964
57009	NC_015966	TCG	2	6	2412342	2412347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303964
57010	NC_015966	CGTC	2	8	2412373	2412380	0 %	25 %	25 %	50 %	345303964
57011	NC_015966	GCCAGC	2	12	2412525	2412536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303964
57012	NC_015966	GAC	2	6	2412632	2412637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303964
57013	NC_015966	ATG	2	6	2412693	2412698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303964
57014	NC_015966	TGC	2	6	2412838	2412843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303965
57015	NC_015966	GGC	2	6	2412881	2412886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303965
57016	NC_015966	CAC	2	6	2413049	2413054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303965
57017	NC_015966	CGA	2	6	2413088	2413093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303965
57018	NC_015966	GGC	2	6	2413244	2413249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303965
57019	NC_015966	ACG	2	6	2413372	2413377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303965
57020	NC_015966	GC	4	8	2413409	2413416	0 %	0 %	50 %	50 %	345303965
57021	NC_015966	CCA	2	6	2413513	2413518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303965
57022	NC_015966	CAG	2	6	2413521	2413526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303965
57023	NC_015966	CAT	2	6	2413568	2413573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303965
57024	NC_015966	GACC	2	8	2413592	2413599	25 %	0 %	25 %	50 %	345303965
57025	NC_015966	CGT	2	6	2413691	2413696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303965
57026	NC_015966	CAT	2	6	2413718	2413723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303965
57027	NC_015966	CGG	2	6	2413760	2413765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303965
57028	NC_015966	GAT	2	6	2413819	2413824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57029	NC_015966	GGC	2	6	2413834	2413839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57030	NC_015966	TCG	2	6	2413886	2413891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57031	NC_015966	CGTTTC	2	12	2413902	2413913	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57032	NC_015966	TGG	2	6	2413918	2413923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57033	NC_015966	AGC	2	6	2414027	2414032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303966
57034	NC_015966	GCA	2	6	2414070	2414075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303966
57035	NC_015966	GCCAGC	2	12	2414117	2414128	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303966
57036	NC_015966	GGT	2	6	2414139	2414144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303966
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57038	NC_015966	GGT	2	6	2414304	2414309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303966
57039	NC_015966	CCA	2	6	2414358	2414363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303966
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57041	NC_015966	CGA	2	6	2414452	2414457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303966
57042	NC_015966	CGG	2	6	2414482	2414487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303966
57043	NC_015966	CGG	2	6	2414574	2414579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303966
57044	NC_015966	TCT	2	6	2414618	2414623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303966
57045	NC_015966	GCC	2	6	2414630	2414635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303966
57046	NC_015966	TTCC	2	8	2414644	2414651	0 %	50 %	0 %	50 %	345303966
57047	NC_015966	GCA	2	6	2414697	2414702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303966
57048	NC_015966	GCC	2	6	2414747	2414752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303966
57049	NC_015966	TGCCC	2	10	2414763	2414772	0 %	20 %	20 %	60 %	345303966
57050	NC_015966	CCTG	2	8	2414833	2414840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57051	NC_015966	TGC	2	6	2414867	2414872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57052	NC_015966	GGGA	2	8	2414886	2414893	25 %	0 %	75 %	0 %	345303967
57053	NC_015966	GCC	2	6	2414911	2414916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303967
57054	NC_015966	CAG	2	6	2414929	2414934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303967
57055	NC_015966	GCG	2	6	2414994	2414999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303967
57056	NC_015966	GCC	2	6	2415056	2415061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303967
57057	NC_015966	CGAT	2	8	2415122	2415129	25 %	25 %	25 %	25 %	345303967
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57061	NC_015966	GTC	2	6	2415353	2415358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303967
57062	NC_015966	CGG	2	6	2415387	2415392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303967
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57070	NC_015966	CTTC	2	8	2415728	2415735	0 %	50 %	0 %	50 %	345303967
57071	NC_015966	G	6	6	2415762	2415767	0 %	0 %	100 %	0 %	345303967
57072	NC_015966	TGG	2	6	2415813	2415818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303967
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57080	NC_015966	CGC	2	6	2416061	2416066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303968
57081	NC_015966	GC	3	6	2416065	2416070	0 %	0 %	50 %	50 %	345303968
57082	NC_015966	GCGG	2	8	2416077	2416084	0 %	0 %	75 %	25 %	345303968
57083	NC_015966	GTT	2	6	2416155	2416160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303968
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57088	NC_015966	GC	3	6	2416417	2416422	0 %	0 %	50 %	50 %	345303969
57089	NC_015966	GCG	2	6	2416476	2416481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303969
57090	NC_015966	CAA	2	6	2416509	2416514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303969
57091	NC_015966	GCC	2	6	2416556	2416561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303969
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57099	NC_015966	TGG	2	6	2417103	2417108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303969
57100	NC_015966	CGC	2	6	2417123	2417128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303969
57101	NC_015966	ACTC	2	8	2417192	2417199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57102	NC_015966	A	6	6	2417236	2417241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57103	NC_015966	CTT	2	6	2417260	2417265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57104	NC_015966	T	6	6	2417264	2417269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57105	NC_015966	TAG	2	6	2417290	2417295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57106	NC_015966	CCA	2	6	2417319	2417324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57107	NC_015966	GCC	3	9	2417501	2417509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303970
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57112	NC_015966	CGA	2	6	2417643	2417648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303970
57113	NC_015966	GCG	2	6	2417697	2417702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303970
57114	NC_015966	GCA	2	6	2417709	2417714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303970
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57117	NC_015966	ACG	2	6	2417760	2417765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303970
57118	NC_015966	GCC	2	6	2417789	2417794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303970
57119	NC_015966	CTG	2	6	2417828	2417833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303970
57120	NC_015966	CGA	2	6	2417872	2417877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303970
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57128	NC_015966	GCA	2	6	2418144	2418149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303970
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57133	NC_015966	GAT	5	15	2418331	2418345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303970
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57144	NC_015966	TGT	2	6	2418828	2418833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57145	NC_015966	T	6	6	2418947	2418952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57211	NC_015966	T	6	6	2421385	2421390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57222	NC_015966	GCC	3	9	2421902	2421910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303973
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57228	NC_015966	GCT	2	6	2422153	2422158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303973
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57230	NC_015966	CGC	2	6	2422208	2422213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303973
57231	NC_015966	GGCCGA	2	12	2422258	2422269	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345303973
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57233	NC_015966	CGC	2	6	2422343	2422348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57234	NC_015966	CTGG	2	8	2422351	2422358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57235	NC_015966	CGA	2	6	2422408	2422413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57236	NC_015966	CTG	2	6	2422452	2422457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303974
57237	NC_015966	C	6	6	2422498	2422503	0 %	0 %	0 %	100 %	345303974
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57337	NC_015966	GCCC	2	8	2427436	2427443	0 %	0 %	25 %	75 %	345303976
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57344	NC_015966	GC	3	6	2427628	2427633	0 %	0 %	50 %	50 %	345303976
57345	NC_015966	CGA	2	6	2427645	2427650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303976
57346	NC_015966	TGCAA	2	10	2427671	2427680	40 %	20 %	20 %	20 %	345303976
57347	NC_015966	CG	3	6	2427693	2427698	0 %	0 %	50 %	50 %	345303976
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57434	NC_015966	GGC	2	6	2431481	2431486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303979
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57451	NC_015966	GTC	2	6	2432121	2432126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303979
57452	NC_015966	CGG	2	6	2432146	2432151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303979
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57458	NC_015966	CG	3	6	2432489	2432494	0 %	0 %	50 %	50 %	345303980
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57463	NC_015966	CGA	2	6	2432567	2432572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303980
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57466	NC_015966	CCG	2	6	2432671	2432676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303980
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