MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55502	NC_015966	ACC	2	6	2347212	2347217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303896
55503	NC_015966	GGATG	2	10	2347233	2347242	20 %	20 %	60 %	0 %	345303896
55504	NC_015966	GGT	2	6	2347247	2347252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303896
55505	NC_015966	CTC	2	6	2347261	2347266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303896
55506	NC_015966	CATA	2	8	2347273	2347280	50 %	25 %	0 %	25 %	345303896
55507	NC_015966	TAA	2	6	2347369	2347374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303896
55508	NC_015966	TGT	2	6	2347391	2347396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303896
55509	NC_015966	ATT	2	6	2347485	2347490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345303896
55510	NC_015966	TTATC	2	10	2347527	2347536	20 %	60 %	0 %	20 %	345303896
55511	NC_015966	CAC	2	6	2347562	2347567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303896
55512	NC_015966	AAGT	2	8	2347570	2347577	50 %	25 %	25 %	0 %	345303896
55513	NC_015966	AT	3	6	2347634	2347639	50 %	50 %	0 %	0 %	345303896
55514	NC_015966	AATC	2	8	2347688	2347695	50 %	25 %	0 %	25 %	345303896
55515	NC_015966	TGG	2	6	2347750	2347755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303896
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55517	NC_015966	GAT	2	6	2347920	2347925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303896
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55519	NC_015966	GGAA	2	8	2347976	2347983	50 %	0 %	50 %	0 %	345303896
55520	NC_015966	AAG	2	6	2347999	2348004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303896
55521	NC_015966	GGA	2	6	2348043	2348048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303896
55522	NC_015966	GTT	2	6	2348058	2348063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303896
55523	NC_015966	GAA	2	6	2348070	2348075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303896
55524	NC_015966	TCC	2	6	2348090	2348095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303896
55525	NC_015966	CT	3	6	2348204	2348209	0 %	50 %	0 %	50 %	345303896
55526	NC_015966	TAA	2	6	2348251	2348256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303896
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55532	NC_015966	AAT	2	6	2348359	2348364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303897
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55539	NC_015966	CA	3	6	2348544	2348549	50 %	0 %	0 %	50 %	345303897
55540	NC_015966	CAC	2	6	2348551	2348556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303897
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55542	NC_015966	TTCC	2	8	2348619	2348626	0 %	50 %	0 %	50 %	345303897
55543	NC_015966	AAT	2	6	2348627	2348632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303897
55544	NC_015966	TAT	2	6	2348656	2348661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345303897
55545	NC_015966	CAT	2	6	2348667	2348672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303897
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55552	NC_015966	AATA	2	8	2348901	2348908	75 %	25 %	0 %	0 %	345303897
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55562	NC_015966	CACGCC	2	12	2349343	2349354	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345303897
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55568	NC_015966	ACC	2	6	2349777	2349782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303898
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55585	NC_015966	AAGC	2	8	2350434	2350441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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55603	NC_015966	A	6	6	2351256	2351261	100 %	0 %	0 %	0 %	345303899
55604	NC_015966	ACG	2	6	2351337	2351342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303899
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55617	NC_015966	CGG	2	6	2351882	2351887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303899
55618	NC_015966	GCT	2	6	2351899	2351904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303899
55619	NC_015966	TTC	2	6	2351966	2351971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303899
55620	NC_015966	GAA	2	6	2351994	2351999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303900
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55625	NC_015966	GTC	2	6	2352154	2352159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
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55628	NC_015966	TGC	2	6	2352194	2352199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
55629	NC_015966	TCGGCC	2	12	2352212	2352223	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303900
55630	NC_015966	CAG	2	6	2352229	2352234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303900
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55642	NC_015966	CG	4	8	2352755	2352762	0 %	0 %	50 %	50 %	345303900
55643	NC_015966	CCG	2	6	2352782	2352787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303900
55644	NC_015966	TGC	2	6	2352824	2352829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
55645	NC_015966	TCG	2	6	2352845	2352850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
55646	NC_015966	ACCGT	2	10	2352908	2352917	20 %	20 %	20 %	40 %	345303900
55647	NC_015966	TGC	2	6	2352956	2352961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303900
55648	NC_015966	CAG	2	6	2353021	2353026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303900
55649	NC_015966	TTCG	2	8	2353033	2353040	0 %	50 %	25 %	25 %	345303900
55650	NC_015966	T	6	6	2353054	2353059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55651	NC_015966	GCA	2	6	2353136	2353141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55652	NC_015966	TCG	2	6	2353178	2353183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303901
55653	NC_015966	GAC	2	6	2353186	2353191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303901
55654	NC_015966	TTC	2	6	2353219	2353224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303901
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55664	NC_015966	CGA	2	6	2353856	2353861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303901
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55674	NC_015966	CAG	2	6	2354220	2354225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303902
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55678	NC_015966	GAT	2	6	2354403	2354408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303902
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55680	NC_015966	CAGCGC	2	12	2354499	2354510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303902
55681	NC_015966	CGT	2	6	2354525	2354530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303902
55682	NC_015966	CAG	2	6	2354541	2354546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303902
55683	NC_015966	CAG	2	6	2354591	2354596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55684	NC_015966	TTC	2	6	2354611	2354616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
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55686	NC_015966	CGT	2	6	2354681	2354686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303903
55687	NC_015966	ACG	2	6	2354701	2354706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303903
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55695	NC_015966	TCG	2	6	2355331	2355336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303903
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55698	NC_015966	GCC	2	6	2355406	2355411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303903
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55702	NC_015966	AGC	2	6	2355584	2355589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303903
55703	NC_015966	CTT	2	6	2355596	2355601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
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55711	NC_015966	TCT	2	6	2355749	2355754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303903
55712	NC_015966	GTT	2	6	2355764	2355769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55713	NC_015966	GCG	2	6	2355781	2355786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55714	NC_015966	TTC	2	6	2355978	2355983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303904
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55718	NC_015966	CGCC	2	8	2356124	2356131	0 %	0 %	25 %	75 %	345303904
55719	NC_015966	CG	3	6	2356132	2356137	0 %	0 %	50 %	50 %	345303904
55720	NC_015966	GCT	2	6	2356166	2356171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303904
55721	NC_015966	ATC	2	6	2356189	2356194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303904
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55725	NC_015966	GCCG	2	8	2356332	2356339	0 %	0 %	50 %	50 %	345303904
55726	NC_015966	CCG	2	6	2356345	2356350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303904
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55728	NC_015966	ATC	2	6	2356402	2356407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303904
55729	NC_015966	GAT	2	6	2356410	2356415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303904
55730	NC_015966	GCG	2	6	2356488	2356493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303904
55731	NC_015966	GCC	2	6	2356498	2356503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303904
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55997	NC_015966	CTA	2	6	2369990	2369995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303920
55998	NC_015966	CAG	2	6	2369997	2370002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303920
55999	NC_015966	GCG	2	6	2370080	2370085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56000	NC_015966	AATC	2	8	2370099	2370106	50 %	25 %	0 %	25 %	345303921

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