MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015966	TTG	2	6	2328736	2328741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303881
55002	NC_015966	AGA	2	6	2328791	2328796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303881
55003	NC_015966	GAGC	2	8	2328822	2328829	25 %	0 %	50 %	25 %	345303881
55004	NC_015966	GAT	2	6	2328870	2328875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303881
55005	NC_015966	GGT	2	6	2328924	2328929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303881
55006	NC_015966	CGC	2	6	2328930	2328935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303881
55007	NC_015966	CGTGAT	2	12	2328939	2328950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345303881
55008	NC_015966	TCCA	2	8	2328970	2328977	25 %	25 %	0 %	50 %	345303881
55009	NC_015966	GCC	2	6	2328988	2328993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303881
55010	NC_015966	CCCG	2	8	2329022	2329029	0 %	0 %	25 %	75 %	345303881
55011	NC_015966	GTC	2	6	2329051	2329056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303881
55012	NC_015966	ATG	2	6	2329084	2329089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303881
55013	NC_015966	TCT	2	6	2329142	2329147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55014	NC_015966	GTC	2	6	2329231	2329236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
55015	NC_015966	CTT	3	9	2329237	2329245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
55016	NC_015966	GCC	2	6	2329271	2329276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303882
55017	NC_015966	GC	3	6	2329318	2329323	0 %	0 %	50 %	50 %	345303882
55018	NC_015966	GAT	2	6	2329336	2329341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303882
55019	NC_015966	CCAC	2	8	2329406	2329413	25 %	0 %	0 %	75 %	345303882
55020	NC_015966	GCG	2	6	2329414	2329419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303882
55021	NC_015966	CAG	2	6	2329432	2329437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303882
55022	NC_015966	CGGCG	2	10	2329438	2329447	0 %	0 %	60 %	40 %	345303882
55023	NC_015966	CCGC	2	8	2329455	2329462	0 %	0 %	25 %	75 %	345303882
55024	NC_015966	CTC	2	6	2329495	2329500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303882
55025	NC_015966	TCT	2	6	2329527	2329532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
55026	NC_015966	CTT	2	6	2329543	2329548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303882
55027	NC_015966	GC	3	6	2329576	2329581	0 %	0 %	50 %	50 %	345303882
55028	NC_015966	TCG	2	6	2329589	2329594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
55029	NC_015966	GTC	2	6	2329620	2329625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303882
55030	NC_015966	CGTAC	2	10	2329725	2329734	20 %	20 %	20 %	40 %	345303883
55031	NC_015966	GC	3	6	2329778	2329783	0 %	0 %	50 %	50 %	345303883
55032	NC_015966	CTT	2	6	2329950	2329955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303883
55033	NC_015966	GTG	3	9	2329960	2329968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303883
55034	NC_015966	CG	3	6	2329973	2329978	0 %	0 %	50 %	50 %	345303883
55035	NC_015966	ACG	2	6	2329989	2329994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303883
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55037	NC_015966	GTT	2	6	2330100	2330105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55038	NC_015966	AGC	2	6	2330120	2330125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55039	NC_015966	CCA	2	6	2330175	2330180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55040	NC_015966	TA	3	6	2330245	2330250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55041	NC_015966	AGA	2	6	2330313	2330318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303884
55042	NC_015966	CGG	2	6	2330357	2330362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303884
55043	NC_015966	TCC	2	6	2330401	2330406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303884
55044	NC_015966	CCA	2	6	2330462	2330467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303884
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55049	NC_015966	TGA	2	6	2330573	2330578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303884
55050	NC_015966	CCT	2	6	2330588	2330593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303884
55051	NC_015966	GCCGT	2	10	2330603	2330612	0 %	20 %	40 %	40 %	345303884
55052	NC_015966	CTC	2	6	2330613	2330618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303884
55053	NC_015966	GAA	2	6	2330634	2330639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303884
55054	NC_015966	CGCT	2	8	2330689	2330696	0 %	25 %	25 %	50 %	345303884
55055	NC_015966	CCA	3	9	2330708	2330716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303884
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55058	NC_015966	CGCC	2	8	2330800	2330807	0 %	0 %	25 %	75 %	345303884
55059	NC_015966	AGC	2	6	2330830	2330835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303884
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55062	NC_015966	GAC	2	6	2330922	2330927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303884
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55066	NC_015966	TTC	3	9	2331019	2331027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303884
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55071	NC_015966	CGT	2	6	2331188	2331193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303884
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55073	NC_015966	CGG	2	6	2331244	2331249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303884
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55075	NC_015966	GCA	2	6	2331293	2331298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303884
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55082	NC_015966	CG	4	8	2331524	2331531	0 %	0 %	50 %	50 %	345303884
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55105	NC_015966	GC	3	6	2332067	2332072	0 %	0 %	50 %	50 %	345303884
55106	NC_015966	GGTC	2	8	2332082	2332089	0 %	25 %	50 %	25 %	345303884
55107	NC_015966	CGG	2	6	2332124	2332129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303884
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55110	NC_015966	TCT	2	6	2332416	2332421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55111	NC_015966	CCG	2	6	2332473	2332478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55112	NC_015966	CAG	2	6	2332519	2332524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303885
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55116	NC_015966	CCT	2	6	2332707	2332712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303885
55117	NC_015966	CAG	3	9	2332729	2332737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303885
55118	NC_015966	CGGA	2	8	2332754	2332761	25 %	0 %	50 %	25 %	345303885
55119	NC_015966	GGC	2	6	2332791	2332796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303885
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55121	NC_015966	CGG	3	9	2332855	2332863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303885
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55127	NC_015966	GCCC	2	8	2333081	2333088	0 %	0 %	25 %	75 %	345303885
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55130	NC_015966	CG	3	6	2333339	2333344	0 %	0 %	50 %	50 %	345303885
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55180	NC_015966	GGC	2	6	2335078	2335083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303885
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55185	NC_015966	GC	3	6	2335157	2335162	0 %	0 %	50 %	50 %	345303885
55186	NC_015966	TAT	2	6	2335209	2335214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345303885
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55191	NC_015966	CGG	2	6	2335385	2335390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55192	NC_015966	CCT	2	6	2335436	2335441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55196	NC_015966	CTG	2	6	2335628	2335633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303886
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55217	NC_015966	GGC	2	6	2336524	2336529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303887
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55219	NC_015966	CAGG	2	8	2336571	2336578	25 %	0 %	50 %	25 %	345303887
55220	NC_015966	TCG	2	6	2336653	2336658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303887
55221	NC_015966	GAT	2	6	2336730	2336735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303887
55222	NC_015966	CAC	2	6	2336751	2336756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303887
55223	NC_015966	TGA	2	6	2336900	2336905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303887
55224	NC_015966	GAT	2	6	2336934	2336939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303887
55225	NC_015966	CGGC	2	8	2336951	2336958	0 %	0 %	50 %	50 %	345303887
55226	NC_015966	CAGC	2	8	2336963	2336970	25 %	0 %	25 %	50 %	345303887
55227	NC_015966	CG	3	6	2336993	2336998	0 %	0 %	50 %	50 %	345303887
55228	NC_015966	CCA	2	6	2336999	2337004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303887
55229	NC_015966	GATC	2	8	2337032	2337039	25 %	25 %	25 %	25 %	345303887
55230	NC_015966	CTT	2	6	2337083	2337088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303887
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55232	NC_015966	GCGA	2	8	2337260	2337267	25 %	0 %	50 %	25 %	345303887
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55349	NC_015966	CTT	2	6	2341418	2341423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303891
55350	NC_015966	GTC	2	6	2341443	2341448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
55351	NC_015966	ACC	2	6	2341470	2341475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303891
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55353	NC_015966	CTG	2	6	2341485	2341490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
55354	NC_015966	CGG	2	6	2341535	2341540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303891
55355	NC_015966	TCG	3	9	2341591	2341599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
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55361	NC_015966	C	6	6	2341761	2341766	0 %	0 %	0 %	100 %	345303891
55362	NC_015966	GCT	2	6	2341772	2341777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
55363	NC_015966	CGA	2	6	2341790	2341795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303891
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55378	NC_015966	TGC	2	6	2342407	2342412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
55379	NC_015966	CTG	2	6	2342496	2342501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303891
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55402	NC_015966	GCT	2	6	2343288	2343293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303892
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55405	NC_015966	TTC	2	6	2343368	2343373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55407	NC_015966	GCT	2	6	2343426	2343431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303893
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55413	NC_015966	GCCG	2	8	2343651	2343658	0 %	0 %	50 %	50 %	345303893
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55441	NC_015966	TTCTT	2	10	2344868	2344877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55442	NC_015966	ATA	2	6	2344933	2344938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55444	NC_015966	GAAA	2	8	2344996	2345003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55445	NC_015966	TTCA	2	8	2345010	2345017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55446	NC_015966	T	6	6	2345068	2345073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55447	NC_015966	CA	3	6	2345080	2345085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55448	NC_015966	AGAA	2	8	2345116	2345123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55449	NC_015966	AG	3	6	2345135	2345140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55450	NC_015966	AAT	2	6	2345141	2345146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55451	NC_015966	ACAGA	2	10	2345150	2345159	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55452	NC_015966	CAA	3	9	2345217	2345225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55453	NC_015966	A	7	7	2345273	2345279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55454	NC_015966	A	7	7	2345289	2345295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55455	NC_015966	A	8	8	2345302	2345309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55456	NC_015966	TCC	2	6	2345314	2345319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55457	NC_015966	AAAC	2	8	2345333	2345340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55458	NC_015966	ACC	2	6	2345380	2345385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55459	NC_015966	ACAT	2	8	2345416	2345423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55460	NC_015966	A	6	6	2345583	2345588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55461	NC_015966	ATA	2	6	2345601	2345606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55462	NC_015966	AGC	2	6	2345614	2345619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55463	NC_015966	TAT	2	6	2345625	2345630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55464	NC_015966	ATC	2	6	2345635	2345640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55465	NC_015966	TCA	2	6	2345650	2345655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55466	NC_015966	TGC	2	6	2345800	2345805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303895
55467	NC_015966	TTC	2	6	2345820	2345825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303895
55468	NC_015966	TGT	2	6	2345863	2345868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303895
55469	NC_015966	GGC	2	6	2345895	2345900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303895
55470	NC_015966	AAC	2	6	2345901	2345906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303895
55471	NC_015966	C	6	6	2346017	2346022	0 %	0 %	0 %	100 %	345303895
55472	NC_015966	GCT	2	6	2346062	2346067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303895
55473	NC_015966	GCA	2	6	2346143	2346148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303895
55474	NC_015966	CCA	2	6	2346182	2346187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303895
55475	NC_015966	TGA	2	6	2346188	2346193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303895
55476	NC_015966	CTT	2	6	2346209	2346214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303895
55477	NC_015966	GGA	2	6	2346241	2346246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303895
55478	NC_015966	CAA	2	6	2346290	2346295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303895
55479	NC_015966	AAGC	2	8	2346308	2346315	50 %	0 %	25 %	25 %	345303895
55480	NC_015966	TGA	2	6	2346338	2346343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303895
55481	NC_015966	GCC	2	6	2346476	2346481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303895
55482	NC_015966	ATCC	2	8	2346484	2346491	25 %	25 %	0 %	50 %	345303895
55483	NC_015966	CCA	2	6	2346512	2346517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55484	NC_015966	GC	3	6	2346589	2346594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55485	NC_015966	A	6	6	2346598	2346603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55486	NC_015966	GAACAT	2	12	2346605	2346616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55487	NC_015966	GCC	2	6	2346628	2346633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55488	NC_015966	GCCA	2	8	2346663	2346670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55489	NC_015966	CCGC	2	8	2346749	2346756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55490	NC_015966	ACA	2	6	2346769	2346774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55491	NC_015966	TTC	2	6	2346788	2346793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55492	NC_015966	GCC	2	6	2346817	2346822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55493	NC_015966	TTCA	2	8	2346824	2346831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55494	NC_015966	AGCA	2	8	2346881	2346888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55495	NC_015966	TTCA	2	8	2346936	2346943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55496	NC_015966	CAG	2	6	2346983	2346988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55497	NC_015966	ATC	2	6	2347050	2347055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55498	NC_015966	TA	3	6	2347088	2347093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55499	NC_015966	AAAT	2	8	2347125	2347132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55500	NC_015966	TAA	2	6	2347162	2347167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303896

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