MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_015966	CGC	2	6	2307955	2307960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303849
54503	NC_015966	TCG	2	6	2307984	2307989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54504	NC_015966	GCA	2	6	2308004	2308009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54505	NC_015966	TGC	2	6	2308140	2308145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54506	NC_015966	GC	3	6	2308155	2308160	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
54507	NC_015966	CTG	2	6	2308217	2308222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54508	NC_015966	GC	3	6	2308294	2308299	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
54509	NC_015966	CCG	2	6	2308337	2308342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303849
54510	NC_015966	GAC	2	6	2308388	2308393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54511	NC_015966	CTT	2	6	2308424	2308429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303849
54512	NC_015966	TGA	2	6	2308435	2308440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303849
54513	NC_015966	CGC	2	6	2308453	2308458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303849
54514	NC_015966	TGCAG	2	10	2308510	2308519	20 %	20 %	40 %	20 %	345303849
54515	NC_015966	TCG	3	9	2308614	2308622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54516	NC_015966	CGC	2	6	2308768	2308773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303849
54517	NC_015966	TGCG	2	8	2308797	2308804	0 %	25 %	50 %	25 %	345303849
54518	NC_015966	CGT	2	6	2308844	2308849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54519	NC_015966	CAG	2	6	2308950	2308955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54520	NC_015966	TCC	2	6	2309019	2309024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303849
54521	NC_015966	GCCG	2	8	2309077	2309084	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
54522	NC_015966	CCT	2	6	2309107	2309112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303849
54523	NC_015966	GCT	2	6	2309119	2309124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54524	NC_015966	GTA	2	6	2309198	2309203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303849
54525	NC_015966	TCG	2	6	2309205	2309210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
54526	NC_015966	TCC	2	6	2309235	2309240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303849
54527	NC_015966	TGT	2	6	2309356	2309361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303849
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54536	NC_015966	CG	3	6	2309734	2309739	0 %	0 %	50 %	50 %	345303849
54537	NC_015966	GCT	2	6	2309779	2309784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303849
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54541	NC_015966	CAA	2	6	2309917	2309922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54542	NC_015966	A	7	7	2309921	2309927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54543	NC_015966	TCC	2	6	2310027	2310032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303850
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54553	NC_015966	CGGC	2	8	2310247	2310254	0 %	0 %	50 %	50 %	345303850
54554	NC_015966	CGT	2	6	2310259	2310264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303850
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54591	NC_015966	ATCG	2	8	2311653	2311660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54592	NC_015966	CCAT	2	8	2311691	2311698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54615	NC_015966	TTC	2	6	2312780	2312785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303853
54616	NC_015966	CGT	2	6	2312791	2312796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303853
54617	NC_015966	GCT	2	6	2312799	2312804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303853
54618	NC_015966	TGC	2	6	2312820	2312825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54619	NC_015966	CTT	2	6	2312833	2312838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303854
54620	NC_015966	CTT	3	9	2312845	2312853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303854
54621	NC_015966	GTGCGC	2	12	2312897	2312908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345303854
54622	NC_015966	AGC	2	6	2312952	2312957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303854
54623	NC_015966	CGA	2	6	2313012	2313017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303854
54624	NC_015966	GAT	2	6	2313031	2313036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303854
54625	NC_015966	CG	3	6	2313048	2313053	0 %	0 %	50 %	50 %	345303854
54626	NC_015966	CTC	2	6	2313058	2313063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303854
54627	NC_015966	GCT	2	6	2313243	2313248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303855
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54629	NC_015966	TTG	2	6	2313266	2313271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303855
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54632	NC_015966	ATG	2	6	2313347	2313352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303855
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54634	NC_015966	TTTA	2	8	2313431	2313438	25 %	75 %	0 %	0 %	345303856
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54638	NC_015966	GCC	2	6	2313894	2313899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303857
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54647	NC_015966	GCGT	2	8	2314392	2314399	0 %	25 %	50 %	25 %	345303857
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54650	NC_015966	CG	3	6	2314492	2314497	0 %	0 %	50 %	50 %	345303858
54651	NC_015966	CAG	2	6	2314529	2314534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303858
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54657	NC_015966	CG	3	6	2314792	2314797	0 %	0 %	50 %	50 %	345303858
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54681	NC_015966	TGGGC	2	10	2315799	2315808	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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54719	NC_015966	CG	3	6	2317474	2317479	0 %	0 %	50 %	50 %	345303862
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54723	NC_015966	CGGC	2	8	2317592	2317599	0 %	0 %	50 %	50 %	345303863
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54727	NC_015966	CGG	2	6	2317786	2317791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303863
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54729	NC_015966	CG	3	6	2317951	2317956	0 %	0 %	50 %	50 %	345303863
54730	NC_015966	GCA	2	6	2318034	2318039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303863
54731	NC_015966	CAC	2	6	2318068	2318073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303863
54732	NC_015966	CGC	2	6	2318206	2318211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303864
54733	NC_015966	GC	3	6	2318225	2318230	0 %	0 %	50 %	50 %	345303864
54734	NC_015966	TCA	2	6	2318242	2318247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303864
54735	NC_015966	GGC	2	6	2318323	2318328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303864
54736	NC_015966	GCA	2	6	2318401	2318406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303864
54737	NC_015966	CCA	2	6	2318458	2318463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303864
54738	NC_015966	CCCGT	2	10	2318710	2318719	0 %	20 %	20 %	60 %	345303865
54739	NC_015966	CTT	2	6	2318794	2318799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303865
54740	NC_015966	CGC	2	6	2318808	2318813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303865
54741	NC_015966	CG	3	6	2318854	2318859	0 %	0 %	50 %	50 %	345303865
54742	NC_015966	T	7	7	2318869	2318875	0 %	100 %	0 %	0 %	345303865
54743	NC_015966	TGC	2	6	2318892	2318897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303866
54744	NC_015966	TTC	2	6	2318910	2318915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303866
54745	NC_015966	GCG	2	6	2318916	2318921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303866
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54747	NC_015966	CAG	2	6	2318946	2318951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303866
54748	NC_015966	CGTC	2	8	2318966	2318973	0 %	25 %	25 %	50 %	345303866
54749	NC_015966	AAT	2	6	2319045	2319050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303866
54750	NC_015966	GAA	2	6	2319156	2319161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303866
54751	NC_015966	CGC	2	6	2319176	2319181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303866
54752	NC_015966	GGCGC	2	10	2319246	2319255	0 %	0 %	60 %	40 %	345303866
54753	NC_015966	TTC	2	6	2319288	2319293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303866
54754	NC_015966	CGT	2	6	2319299	2319304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303866
54755	NC_015966	T	6	6	2319312	2319317	0 %	100 %	0 %	0 %	345303866
54756	NC_015966	GCC	2	6	2319325	2319330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303866
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54758	NC_015966	TCA	2	6	2319404	2319409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303866
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54761	NC_015966	ATTC	2	8	2319473	2319480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54762	NC_015966	GC	3	6	2319492	2319497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54763	NC_015966	CTC	2	6	2319518	2319523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303867
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54766	NC_015966	CCAC	2	8	2319577	2319584	25 %	0 %	0 %	75 %	345303867
54767	NC_015966	CGAC	2	8	2319588	2319595	25 %	0 %	25 %	50 %	345303867
54768	NC_015966	GCC	2	6	2319604	2319609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303867
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54771	NC_015966	GCT	2	6	2319739	2319744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303867
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54773	NC_015966	GTT	2	6	2319838	2319843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303867
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54775	NC_015966	GCG	2	6	2319887	2319892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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54784	NC_015966	CGA	2	6	2320143	2320148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303868
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54796	NC_015966	CTTT	2	8	2320568	2320575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54797	NC_015966	CTG	2	6	2320631	2320636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303870
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54810	NC_015966	CGCTT	2	10	2321297	2321306	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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54831	NC_015966	CGC	3	9	2322123	2322131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54846	NC_015966	GCCG	2	8	2322624	2322631	0 %	0 %	50 %	50 %	345303874
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54848	NC_015966	CTT	2	6	2322703	2322708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303874
54849	NC_015966	CTC	2	6	2322727	2322732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303874
54850	NC_015966	CTT	2	6	2322736	2322741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303874
54851	NC_015966	T	6	6	2322769	2322774	0 %	100 %	0 %	0 %	345303874
54852	NC_015966	CGT	2	6	2322818	2322823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54853	NC_015966	CGA	2	6	2322843	2322848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303875
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