MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_015966	GACC	2	8	2242423	2242430	25 %	0 %	25 %	50 %	345303801
53002	NC_015966	GCC	2	6	2242451	2242456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53003	NC_015966	CGG	2	6	2242511	2242516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303801
53004	NC_015966	CGT	2	6	2242543	2242548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53005	NC_015966	C	7	7	2242564	2242570	0 %	0 %	0 %	100 %	345303801
53006	NC_015966	CCGG	2	8	2242594	2242601	0 %	0 %	50 %	50 %	345303801
53007	NC_015966	TGG	2	6	2242623	2242628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303801
53008	NC_015966	TCGA	2	8	2242650	2242657	25 %	25 %	25 %	25 %	345303801
53009	NC_015966	GCC	2	6	2242670	2242675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53010	NC_015966	GTC	2	6	2242676	2242681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53011	NC_015966	ATG	2	6	2242704	2242709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303801
53012	NC_015966	TAG	2	6	2242755	2242760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303801
53013	NC_015966	CGTG	2	8	2242795	2242802	0 %	25 %	50 %	25 %	345303801
53014	NC_015966	GCC	2	6	2242817	2242822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53015	NC_015966	GTC	2	6	2242823	2242828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53016	NC_015966	CGC	2	6	2242926	2242931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53017	NC_015966	TTTC	2	8	2242936	2242943	0 %	75 %	0 %	25 %	345303801
53018	NC_015966	CG	3	6	2242945	2242950	0 %	0 %	50 %	50 %	345303801
53019	NC_015966	CG	3	6	2242963	2242968	0 %	0 %	50 %	50 %	345303801
53020	NC_015966	GAAG	2	8	2242984	2242991	50 %	0 %	50 %	0 %	345303801
53021	NC_015966	GTC	2	6	2243003	2243008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53022	NC_015966	CTT	2	6	2243077	2243082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303801
53023	NC_015966	GGT	2	6	2243092	2243097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303801
53024	NC_015966	TTC	2	6	2243133	2243138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303801
53025	NC_015966	CGC	2	6	2243221	2243226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53026	NC_015966	GTCG	2	8	2243228	2243235	0 %	25 %	50 %	25 %	345303801
53027	NC_015966	CGA	2	6	2243266	2243271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53028	NC_015966	GGCGC	2	10	2243279	2243288	0 %	0 %	60 %	40 %	345303801
53029	NC_015966	CGC	2	6	2243303	2243308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53030	NC_015966	GTC	2	6	2243363	2243368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53031	NC_015966	GCC	2	6	2243396	2243401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53032	NC_015966	GGAT	2	8	2243487	2243494	25 %	25 %	50 %	0 %	345303801
53033	NC_015966	CCG	2	6	2243550	2243555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53034	NC_015966	CCCA	2	8	2243619	2243626	25 %	0 %	0 %	75 %	345303801
53035	NC_015966	GGAA	2	8	2243701	2243708	50 %	0 %	50 %	0 %	345303801
53036	NC_015966	GTT	2	6	2243714	2243719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303801
53037	NC_015966	GCC	2	6	2243735	2243740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303801
53038	NC_015966	TCGG	2	8	2243763	2243770	0 %	25 %	50 %	25 %	345303801
53039	NC_015966	GTC	2	6	2243771	2243776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53040	NC_015966	ACGTCC	2	12	2243784	2243795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345303801
53041	NC_015966	ATG	2	6	2243811	2243816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303801
53042	NC_015966	CGAG	2	8	2243851	2243858	25 %	0 %	50 %	25 %	345303801
53043	NC_015966	CGGC	2	8	2243905	2243912	0 %	0 %	50 %	50 %	345303801
53044	NC_015966	CAG	2	6	2243969	2243974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53045	NC_015966	GCT	2	6	2243984	2243989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53046	NC_015966	TGC	2	6	2244001	2244006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
53047	NC_015966	CAG	2	6	2244046	2244051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53048	NC_015966	T	6	6	2244071	2244076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53049	NC_015966	GCCG	2	8	2244129	2244136	0 %	0 %	50 %	50 %	345303802
53050	NC_015966	TGC	2	6	2244219	2244224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303802
53051	NC_015966	CGA	2	6	2244274	2244279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303802
53052	NC_015966	GCT	2	6	2244289	2244294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303802
53053	NC_015966	GCT	2	6	2244349	2244354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303802
53054	NC_015966	GGC	2	6	2244364	2244369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303802
53055	NC_015966	CTG	2	6	2244413	2244418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303802
53056	NC_015966	GCC	2	6	2244452	2244457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303802
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53058	NC_015966	GCG	2	6	2244566	2244571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303803
53059	NC_015966	GGTCT	2	10	2244604	2244613	0 %	40 %	40 %	20 %	345303803
53060	NC_015966	CTGG	2	8	2244618	2244625	0 %	25 %	50 %	25 %	345303803
53061	NC_015966	TGG	2	6	2244650	2244655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303803
53062	NC_015966	GCT	2	6	2244668	2244673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303803
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53066	NC_015966	CTG	2	6	2244841	2244846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303803
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53069	NC_015966	CCGC	2	8	2244893	2244900	0 %	0 %	25 %	75 %	345303803
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53073	NC_015966	CGGC	2	8	2244992	2244999	0 %	0 %	50 %	50 %	345303804
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53083	NC_015966	GGAGC	2	10	2245374	2245383	20 %	0 %	60 %	20 %	345303805
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53086	NC_015966	CGGG	2	8	2245533	2245540	0 %	0 %	75 %	25 %	345303805
53087	NC_015966	CAC	2	6	2245552	2245557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303805
53088	NC_015966	GC	3	6	2245560	2245565	0 %	0 %	50 %	50 %	345303805
53089	NC_015966	GCC	2	6	2245687	2245692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303805
53090	NC_015966	TGC	2	6	2245721	2245726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303805
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53108	NC_015966	TCTA	2	8	2246537	2246544	25 %	50 %	0 %	25 %	345303805
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53113	NC_015966	ACC	2	6	2246696	2246701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303805
53114	NC_015966	GCACGC	2	12	2246711	2246722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303805
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53116	NC_015966	GCC	2	6	2246776	2246781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303805
53117	NC_015966	ATC	2	6	2246785	2246790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303805
53118	NC_015966	GCC	2	6	2246791	2246796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303805
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53152	NC_015966	TTG	2	6	2248320	2248325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53172	NC_015966	TGG	2	6	2249005	2249010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53231	NC_015966	CGGC	2	8	2251959	2251966	0 %	0 %	50 %	50 %	345303809
53232	NC_015966	GCC	2	6	2251993	2251998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303809
53233	NC_015966	CCA	2	6	2252001	2252006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
53234	NC_015966	GCCA	2	8	2252021	2252028	25 %	0 %	25 %	50 %	345303809
53235	NC_015966	CCG	3	9	2252029	2252037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303809
53236	NC_015966	AGCG	2	8	2252051	2252058	25 %	0 %	50 %	25 %	345303809
53237	NC_015966	GAA	2	6	2252083	2252088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303809
53238	NC_015966	TGG	2	6	2252123	2252128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303809
53239	NC_015966	GCA	2	6	2252133	2252138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303809
53240	NC_015966	ACA	2	6	2252148	2252153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303809
53241	NC_015966	GCGTCA	2	12	2252157	2252168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345303809
53242	NC_015966	CAC	2	6	2252188	2252193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
53243	NC_015966	AGC	2	6	2252255	2252260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303809
53244	NC_015966	CCA	2	6	2252274	2252279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
53245	NC_015966	CGT	2	6	2252287	2252292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303809
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53250	NC_015966	ACC	2	6	2252405	2252410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
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53252	NC_015966	GAT	2	6	2252521	2252526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303809
53253	NC_015966	GTG	2	6	2252528	2252533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303809
53254	NC_015966	GAT	2	6	2252557	2252562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303809
53255	NC_015966	ACG	2	6	2252567	2252572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303809
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53259	NC_015966	TCG	2	6	2252708	2252713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303809
53260	NC_015966	GCGATG	2	12	2252714	2252725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303809
53261	NC_015966	GCA	2	6	2252748	2252753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303809
53262	NC_015966	CCA	2	6	2252760	2252765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
53263	NC_015966	CGTT	2	8	2252795	2252802	0 %	50 %	25 %	25 %	345303809
53264	NC_015966	GGC	2	6	2252847	2252852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
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53272	NC_015966	CTC	2	6	2253124	2253129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303809
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53274	NC_015966	GC	3	6	2253257	2253262	0 %	0 %	50 %	50 %	345303809
53275	NC_015966	CGT	2	6	2253279	2253284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303809
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53278	NC_015966	CGAA	2	8	2253364	2253371	50 %	0 %	25 %	25 %	345303809
53279	NC_015966	CGG	2	6	2253472	2253477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
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53282	NC_015966	ACG	2	6	2253745	2253750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
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53284	NC_015966	TTC	2	6	2253849	2253854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303810
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53291	NC_015966	CGC	2	6	2254277	2254282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303810
53292	NC_015966	GC	4	8	2254313	2254320	0 %	0 %	50 %	50 %	345303810
53293	NC_015966	AGC	2	6	2254321	2254326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
53294	NC_015966	TCG	2	6	2254366	2254371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303810
53295	NC_015966	CTT	2	6	2254415	2254420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303810
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53297	NC_015966	CGCC	2	8	2254475	2254482	0 %	0 %	25 %	75 %	345303810
53298	NC_015966	GAC	2	6	2254497	2254502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
53299	NC_015966	CAC	2	6	2254530	2254535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303810
53300	NC_015966	CCG	2	6	2254574	2254579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303810
53301	NC_015966	CCCG	2	8	2254586	2254593	0 %	0 %	25 %	75 %	345303810
53302	NC_015966	GAT	2	6	2254626	2254631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303810
53303	NC_015966	CGA	2	6	2254660	2254665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
53304	NC_015966	GCCGT	2	10	2254675	2254684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53305	NC_015966	ACG	2	6	2254720	2254725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53306	NC_015966	CCG	2	6	2254743	2254748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53307	NC_015966	CGC	2	6	2254749	2254754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53308	NC_015966	CGA	2	6	2254830	2254835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53309	NC_015966	GCT	2	6	2254836	2254841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53310	NC_015966	TCA	2	6	2254941	2254946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303811
53311	NC_015966	CGT	2	6	2254960	2254965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53312	NC_015966	CTG	2	6	2254987	2254992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53313	NC_015966	GGT	2	6	2255025	2255030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303811
53314	NC_015966	GCT	2	6	2255058	2255063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53315	NC_015966	GCC	2	6	2255078	2255083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
53316	NC_015966	GGT	2	6	2255125	2255130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303811
53317	NC_015966	CGG	2	6	2255147	2255152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303811
53318	NC_015966	CTGCG	2	10	2255158	2255167	0 %	20 %	40 %	40 %	345303811
53319	NC_015966	CGC	3	9	2255168	2255176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
53320	NC_015966	CTG	2	6	2255224	2255229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
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53323	NC_015966	GGC	2	6	2255331	2255336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303811
53324	NC_015966	CG	3	6	2255395	2255400	0 %	0 %	50 %	50 %	345303811
53325	NC_015966	TCC	2	6	2255432	2255437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303811
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53327	NC_015966	CCAG	2	8	2255472	2255479	25 %	0 %	25 %	50 %	345303811
53328	NC_015966	GC	3	6	2255487	2255492	0 %	0 %	50 %	50 %	345303811
53329	NC_015966	TCG	2	6	2255534	2255539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53330	NC_015966	TCG	2	6	2255621	2255626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53331	NC_015966	GGAA	2	8	2255641	2255648	50 %	0 %	50 %	0 %	345303811
53332	NC_015966	CCGTT	2	10	2255721	2255730	0 %	40 %	20 %	40 %	345303811
53333	NC_015966	GCC	2	6	2255761	2255766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
53334	NC_015966	GCC	2	6	2255923	2255928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
53335	NC_015966	CGG	2	6	2256012	2256017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303811
53336	NC_015966	GCG	2	6	2256029	2256034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303811
53337	NC_015966	AGC	2	6	2256054	2256059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53338	NC_015966	ATG	2	6	2256122	2256127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303811
53339	NC_015966	AAC	2	6	2256143	2256148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303811
53340	NC_015966	TCG	2	6	2256149	2256154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
53341	NC_015966	ACC	2	6	2256181	2256186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303811
53342	NC_015966	G	6	6	2256231	2256236	0 %	0 %	100 %	0 %	345303811
53343	NC_015966	TGT	2	6	2256240	2256245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303811
53344	NC_015966	GA	3	6	2256260	2256265	50 %	0 %	50 %	0 %	345303811
53345	NC_015966	TGG	2	6	2256270	2256275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303811
53346	NC_015966	GTC	2	6	2256298	2256303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
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53464	NC_015966	CCA	2	6	2261300	2261305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303815
53465	NC_015966	GTC	2	6	2261306	2261311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303815
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53475	NC_015966	GAA	2	6	2261690	2261695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303815
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53492	NC_015966	CGT	2	6	2262448	2262453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303816
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53499	NC_015966	GGTG	2	8	2262966	2262973	0 %	25 %	75 %	0 %	345303816
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