MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_015966	GCC	2	6	2157175	2157180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303736
51002	NC_015966	CTG	2	6	2157181	2157186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303736
51003	NC_015966	TGCG	2	8	2157194	2157201	0 %	25 %	50 %	25 %	345303736
51004	NC_015966	GTC	2	6	2157220	2157225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303736
51005	NC_015966	GCCA	2	8	2157269	2157276	25 %	0 %	25 %	50 %	345303736
51006	NC_015966	CTC	2	6	2157358	2157363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303736
51007	NC_015966	TCGG	2	8	2157419	2157426	0 %	25 %	50 %	25 %	345303736
51008	NC_015966	TGA	2	6	2157444	2157449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303736
51009	NC_015966	GGC	2	6	2157462	2157467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303736
51010	NC_015966	CGG	2	6	2157576	2157581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303736
51011	NC_015966	CAG	2	6	2157583	2157588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303736
51012	NC_015966	CCGCAC	2	12	2157634	2157645	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345303736
51013	NC_015966	GCG	2	6	2157657	2157662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303736
51014	NC_015966	GTA	2	6	2157670	2157675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303736
51015	NC_015966	ACC	2	6	2157708	2157713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303736
51016	NC_015966	CGCACC	2	12	2157764	2157775	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345303736
51017	NC_015966	GCC	2	6	2157908	2157913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303736
51018	NC_015966	CCAG	2	8	2157936	2157943	25 %	0 %	25 %	50 %	345303736
51019	NC_015966	GC	4	8	2157945	2157952	0 %	0 %	50 %	50 %	345303736
51020	NC_015966	TTCC	2	8	2158032	2158039	0 %	50 %	0 %	50 %	345303737
51021	NC_015966	GAA	2	6	2158051	2158056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303737
51022	NC_015966	TTG	2	6	2158187	2158192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303737
51023	NC_015966	CGTG	2	8	2158239	2158246	0 %	25 %	50 %	25 %	345303737
51024	NC_015966	GCC	2	6	2158311	2158316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303737
51025	NC_015966	GAC	2	6	2158339	2158344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51026	NC_015966	GCGG	2	8	2158389	2158396	0 %	0 %	75 %	25 %	345303737
51027	NC_015966	GCG	3	9	2158426	2158434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303737
51028	NC_015966	CAG	2	6	2158456	2158461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51029	NC_015966	TCGAAC	2	12	2158577	2158588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345303737
51030	NC_015966	GTA	2	6	2158606	2158611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303737
51031	NC_015966	GGCC	2	8	2158681	2158688	0 %	0 %	50 %	50 %	345303737
51032	NC_015966	TAG	2	6	2158763	2158768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303737
51033	NC_015966	GC	3	6	2158799	2158804	0 %	0 %	50 %	50 %	345303737
51034	NC_015966	GCA	2	6	2158884	2158889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51035	NC_015966	ATCG	2	8	2158945	2158952	25 %	25 %	25 %	25 %	345303737
51036	NC_015966	CTT	3	9	2158965	2158973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303737
51037	NC_015966	GCGAAA	2	12	2158993	2159004	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345303737
51038	NC_015966	GCCC	2	8	2159007	2159014	0 %	0 %	25 %	75 %	345303737
51039	NC_015966	AGT	2	6	2159142	2159147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303737
51040	NC_015966	CCG	2	6	2159205	2159210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303737
51041	NC_015966	GTAGAA	2	12	2159350	2159361	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345303737
51042	NC_015966	CAG	2	6	2159404	2159409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51043	NC_015966	TCG	2	6	2159418	2159423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51044	NC_015966	TCG	2	6	2159425	2159430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51045	NC_015966	ATC	2	6	2159438	2159443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303737
51046	NC_015966	GGTTGC	2	12	2159520	2159531	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345303737
51047	NC_015966	TTG	2	6	2159537	2159542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303737
51048	NC_015966	GGC	2	6	2159565	2159570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303737
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51050	NC_015966	AAG	2	6	2159642	2159647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303737
51051	NC_015966	CGTG	2	8	2159655	2159662	0 %	25 %	50 %	25 %	345303737
51052	NC_015966	GTG	2	6	2159675	2159680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303737
51053	NC_015966	GGC	2	6	2159749	2159754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303737
51054	NC_015966	GCA	2	6	2159766	2159771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51055	NC_015966	GGC	2	6	2159803	2159808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303737
51056	NC_015966	CTT	2	6	2159862	2159867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303737
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51058	NC_015966	GCCG	2	8	2159899	2159906	0 %	0 %	50 %	50 %	345303737
51059	NC_015966	CGGCTC	2	12	2159911	2159922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303737
51060	NC_015966	TGG	2	6	2160060	2160065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303737
51061	NC_015966	ACG	2	6	2160092	2160097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51062	NC_015966	CAG	3	9	2160181	2160189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51063	NC_015966	CAG	2	6	2160206	2160211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303737
51064	NC_015966	CAG	2	6	2160239	2160244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51065	NC_015966	T	7	7	2160333	2160339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51066	NC_015966	CGC	2	6	2160389	2160394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
51067	NC_015966	TCG	2	6	2160403	2160408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51068	NC_015966	GCC	2	6	2160436	2160441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
51069	NC_015966	GAG	2	6	2160477	2160482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303738
51070	NC_015966	CTTC	2	8	2160490	2160497	0 %	50 %	0 %	50 %	345303738
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51072	NC_015966	CAG	2	6	2160570	2160575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51073	NC_015966	GAG	3	9	2160648	2160656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303738
51074	NC_015966	AGC	2	6	2160718	2160723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303738
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51077	NC_015966	GGGCT	2	10	2160804	2160813	0 %	20 %	60 %	20 %	345303738
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51082	NC_015966	GC	4	8	2161109	2161116	0 %	0 %	50 %	50 %	345303738
51083	NC_015966	GAA	2	6	2161119	2161124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303738
51084	NC_015966	TGG	2	6	2161132	2161137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303738
51085	NC_015966	GTG	2	6	2161185	2161190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303738
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51087	NC_015966	GCT	2	6	2161229	2161234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303738
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51089	NC_015966	CGTC	2	8	2161244	2161251	0 %	25 %	25 %	50 %	345303738
51090	NC_015966	GTG	2	6	2161254	2161259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303738
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51092	NC_015966	GGCC	2	8	2161280	2161287	0 %	0 %	50 %	50 %	345303738
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51097	NC_015966	TCGT	2	8	2161377	2161384	0 %	50 %	25 %	25 %	345303738
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51100	NC_015966	GAC	2	6	2161477	2161482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51101	NC_015966	GC	3	6	2161536	2161541	0 %	0 %	50 %	50 %	345303738
51102	NC_015966	GCT	2	6	2161553	2161558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51103	NC_015966	CG	3	6	2161578	2161583	0 %	0 %	50 %	50 %	345303738
51104	NC_015966	CAG	2	6	2161602	2161607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303738
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51107	NC_015966	GCC	3	9	2161661	2161669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
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51109	NC_015966	GGCC	2	8	2161755	2161762	0 %	0 %	50 %	50 %	345303738
51110	NC_015966	GGA	2	6	2161796	2161801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303738
51111	NC_015966	CGC	2	6	2161816	2161821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
51112	NC_015966	CTG	2	6	2161839	2161844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51113	NC_015966	GGC	3	9	2162012	2162020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303738
51114	NC_015966	CGA	2	6	2162054	2162059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51115	NC_015966	GAT	2	6	2162060	2162065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303738
51116	NC_015966	GAA	2	6	2162106	2162111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303738
51117	NC_015966	ATC	2	6	2162124	2162129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303738
51118	NC_015966	CCG	2	6	2162156	2162161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
51119	NC_015966	CGC	2	6	2162172	2162177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303738
51120	NC_015966	GCT	2	6	2162195	2162200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303738
51121	NC_015966	T	6	6	2162237	2162242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51122	NC_015966	CTGG	2	8	2162284	2162291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51123	NC_015966	AGA	2	6	2162325	2162330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51124	NC_015966	GAT	2	6	2162373	2162378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303739
51125	NC_015966	TCCTGC	2	12	2162408	2162419	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345303739
51126	NC_015966	CGA	2	6	2162481	2162486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303739
51127	NC_015966	TCG	2	6	2162495	2162500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303739
51128	NC_015966	CTCG	2	8	2162592	2162599	0 %	25 %	25 %	50 %	345303739
51129	NC_015966	CTA	2	6	2162640	2162645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303739
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51131	NC_015966	CCA	2	6	2162747	2162752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303739
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51134	NC_015966	GCTC	2	8	2162957	2162964	0 %	25 %	25 %	50 %	345303739
51135	NC_015966	TGG	2	6	2163020	2163025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303739
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51142	NC_015966	CG	3	6	2163349	2163354	0 %	0 %	50 %	50 %	345303739
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51144	NC_015966	CTG	2	6	2163409	2163414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303739
51145	NC_015966	GCCG	2	8	2163450	2163457	0 %	0 %	50 %	50 %	345303739
51146	NC_015966	CA	3	6	2163459	2163464	50 %	0 %	0 %	50 %	345303739
51147	NC_015966	ACCT	2	8	2163502	2163509	25 %	25 %	0 %	50 %	345303739
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51155	NC_015966	GCC	2	6	2163848	2163853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51156	NC_015966	AAT	2	6	2163898	2163903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51157	NC_015966	TGG	2	6	2163923	2163928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51158	NC_015966	CCG	2	6	2163929	2163934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51159	NC_015966	GGGC	2	8	2163957	2163964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51160	NC_015966	GGT	2	6	2163967	2163972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51163	NC_015966	G	6	6	2164061	2164066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51164	NC_015966	CA	3	6	2164104	2164109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51165	NC_015966	C	6	6	2164189	2164194	0 %	0 %	0 %	100 %	345303741
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51178	NC_015966	ACACC	2	10	2165092	2165101	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
51179	NC_015966	CTT	2	6	2165104	2165109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51181	NC_015966	TTG	2	6	2165184	2165189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51182	NC_015966	TCGCC	2	10	2165298	2165307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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51187	NC_015966	CGA	2	6	2165512	2165517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51190	NC_015966	TATC	2	8	2165671	2165678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51191	NC_015966	CGCA	2	8	2165804	2165811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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51193	NC_015966	CG	3	6	2165844	2165849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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51204	NC_015966	GT	3	6	2166321	2166326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51205	NC_015966	TCG	2	6	2166418	2166423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303743
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51221	NC_015966	TCG	2	6	2166997	2167002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303743
51222	NC_015966	CAG	2	6	2167020	2167025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303743
51223	NC_015966	TGA	2	6	2167028	2167033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303743
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51225	NC_015966	GGA	2	6	2167109	2167114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303743
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51227	NC_015966	GCC	2	6	2167175	2167180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303743
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51231	NC_015966	GGCCC	2	10	2167374	2167383	0 %	0 %	40 %	60 %	345303743
51232	NC_015966	CAG	2	6	2167413	2167418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303743
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51234	NC_015966	GGC	2	6	2167454	2167459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303743
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51343	NC_015966	ACC	2	6	2172160	2172165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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51467	NC_015966	AGC	2	6	2176953	2176958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303752
51468	NC_015966	CCG	2	6	2176974	2176979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303752
51469	NC_015966	CGGCCA	2	12	2177035	2177046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303752
51470	NC_015966	CCA	3	9	2177050	2177058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303752
51471	NC_015966	CAG	2	6	2177099	2177104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303752
51472	NC_015966	CCA	2	6	2177113	2177118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303752
51473	NC_015966	GCGCT	2	10	2177154	2177163	0 %	20 %	40 %	40 %	345303752
51474	NC_015966	CGG	2	6	2177172	2177177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303752
51475	NC_015966	TTC	2	6	2177178	2177183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303752
51476	NC_015966	TCG	2	6	2177185	2177190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303752
51477	NC_015966	GAT	2	6	2177207	2177212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303753
51478	NC_015966	GCC	2	6	2177284	2177289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303753
51479	NC_015966	TCG	2	6	2177302	2177307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303753
51480	NC_015966	GGC	2	6	2177327	2177332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303753
51481	NC_015966	GCC	2	6	2177335	2177340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303753
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51483	NC_015966	GAC	2	6	2177424	2177429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303753
51484	NC_015966	CATGG	2	10	2177535	2177544	20 %	20 %	40 %	20 %	345303753
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51490	NC_015966	TTG	2	6	2177718	2177723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303754
51491	NC_015966	GCAC	2	8	2177794	2177801	25 %	0 %	25 %	50 %	345303754
51492	NC_015966	GGT	2	6	2177827	2177832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303754
51493	NC_015966	CCG	2	6	2177865	2177870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303754
51494	NC_015966	CTGC	2	8	2177890	2177897	0 %	25 %	25 %	50 %	345303754
51495	NC_015966	CAG	2	6	2177918	2177923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303754
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51497	NC_015966	CCAGCA	2	12	2177950	2177961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345303754
51498	NC_015966	GCC	2	6	2177994	2177999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303754
51499	NC_015966	GCAGCG	2	12	2178046	2178057	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345303754
51500	NC_015966	CAC	2	6	2178083	2178088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303754

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