MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 76787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_015966	CGT	2	6	2135834	2135839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303718
50502	NC_015966	CCGCC	2	10	2135852	2135861	0 %	0 %	20 %	80 %	345303718
50503	NC_015966	TTC	2	6	2135905	2135910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303718
50504	NC_015966	CCA	2	6	2135972	2135977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303718
50505	NC_015966	CG	3	6	2135981	2135986	0 %	0 %	50 %	50 %	345303718
50506	NC_015966	GCC	2	6	2136046	2136051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303718
50507	NC_015966	TCCA	2	8	2136115	2136122	25 %	25 %	0 %	50 %	345303718
50508	NC_015966	CGT	2	6	2136149	2136154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303718
50509	NC_015966	CGT	2	6	2136164	2136169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303718
50510	NC_015966	TCGA	2	8	2136175	2136182	25 %	25 %	25 %	25 %	345303718
50511	NC_015966	GCC	2	6	2136204	2136209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303718
50512	NC_015966	CAG	2	6	2136216	2136221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303718
50513	NC_015966	TCC	2	6	2136264	2136269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303718
50514	NC_015966	GC	3	6	2136294	2136299	0 %	0 %	50 %	50 %	345303718
50515	NC_015966	CAA	2	6	2136333	2136338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50516	NC_015966	CCA	2	6	2136385	2136390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303719
50517	NC_015966	GCC	2	6	2136443	2136448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303719
50518	NC_015966	CAT	2	6	2136476	2136481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303719
50519	NC_015966	CCCG	2	8	2136498	2136505	0 %	0 %	25 %	75 %	345303719
50520	NC_015966	ATC	2	6	2136519	2136524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303719
50521	NC_015966	GCG	2	6	2136528	2136533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303719
50522	NC_015966	GAT	2	6	2136569	2136574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303719
50523	NC_015966	CAG	2	6	2136575	2136580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303719
50524	NC_015966	GCG	2	6	2136652	2136657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303719
50525	NC_015966	GCC	2	6	2136694	2136699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303719
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50533	NC_015966	CCG	2	6	2137044	2137049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303719
50534	NC_015966	CAG	3	9	2137058	2137066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303719
50535	NC_015966	GCG	2	6	2137120	2137125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303719
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50541	NC_015966	GCGTGT	2	12	2137273	2137284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345303719
50542	NC_015966	GTA	2	6	2137289	2137294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303719
50543	NC_015966	CGT	2	6	2137318	2137323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303719
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50545	NC_015966	CGT	2	6	2137525	2137530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303719
50546	NC_015966	GGTACA	2	12	2137534	2137545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345303719
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50549	NC_015966	GGCC	2	8	2137612	2137619	0 %	0 %	50 %	50 %	345303719
50550	NC_015966	TGG	2	6	2137693	2137698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303719
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50553	NC_015966	GGC	2	6	2137765	2137770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303719
50554	NC_015966	CGC	2	6	2137819	2137824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303719
50555	NC_015966	GGTATC	2	12	2137835	2137846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345303719
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50598	NC_015966	T	7	7	2139869	2139875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50599	NC_015966	GCG	2	6	2139891	2139896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50600	NC_015966	GCA	2	6	2139906	2139911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50601	NC_015966	TG	3	6	2140197	2140202	0 %	50 %	50 %	0 %	345303721
50602	NC_015966	TCG	2	6	2140227	2140232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303721
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50604	NC_015966	CGG	2	6	2140266	2140271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303721
50605	NC_015966	GGA	2	6	2140334	2140339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303721
50606	NC_015966	GCTG	2	8	2140357	2140364	0 %	25 %	50 %	25 %	345303721
50607	NC_015966	GCAC	2	8	2140399	2140406	25 %	0 %	25 %	50 %	345303721
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50612	NC_015966	GCC	2	6	2140584	2140589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303721
50613	NC_015966	CGTAC	2	10	2140677	2140686	20 %	20 %	20 %	40 %	345303721
50614	NC_015966	CAC	2	6	2140694	2140699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303721
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50966	NC_015966	CGT	2	6	2155576	2155581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303734
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50971	NC_015966	GCC	2	6	2155947	2155952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303735
50972	NC_015966	TCC	2	6	2155971	2155976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303735
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50977	NC_015966	TGCG	2	8	2156094	2156101	0 %	25 %	50 %	25 %	345303735
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50982	NC_015966	ACGT	2	8	2156276	2156283	25 %	25 %	25 %	25 %	345303735
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50989	NC_015966	TGC	2	6	2156718	2156723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303735
50990	NC_015966	GTA	2	6	2156771	2156776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303735
50991	NC_015966	GTGC	2	8	2156777	2156784	0 %	25 %	50 %	25 %	345303735
50992	NC_015966	CGGG	2	8	2156833	2156840	0 %	0 %	75 %	25 %	345303735
50993	NC_015966	C	6	6	2156892	2156897	0 %	0 %	0 %	100 %	345303735
50994	NC_015966	GCA	2	6	2156905	2156910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303735
50995	NC_015966	TCC	2	6	2156933	2156938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303735
50996	NC_015966	TCC	2	6	2156961	2156966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303735
50997	NC_015966	ACGCA	2	10	2157046	2157055	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50998	NC_015966	GCG	2	6	2157056	2157061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50999	NC_015966	GC	3	6	2157067	2157072	0 %	0 %	50 %	50 %	345303736
51000	NC_015966	C	6	6	2157121	2157126	0 %	0 %	0 %	100 %	345303736

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