MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015866	AAGA	2	8	118046	118053	75 %	0 %	25 %	0 %	341583343
3002	NC_015866	TCT	2	6	118105	118110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583343
3003	NC_015866	AGT	2	6	118111	118116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583343
3004	NC_015866	TAA	2	6	118126	118131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583343
3005	NC_015866	AGT	2	6	118183	118188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583343
3006	NC_015866	ATG	2	6	118236	118241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583343
3007	NC_015866	GAA	2	6	118304	118309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583343
3008	NC_015866	TGA	2	6	118429	118434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583343
3009	NC_015866	AGCA	2	8	118455	118462	50 %	0 %	25 %	25 %	341583343
3010	NC_015866	ATG	2	6	118467	118472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583343
3011	NC_015866	GTT	2	6	118507	118512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015866	TTC	2	6	118636	118641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015866	ATA	2	6	118663	118668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015866	AAAT	2	8	118695	118702	75 %	25 %	0 %	0 %	341583344
3015	NC_015866	TGC	2	6	118708	118713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583344
3016	NC_015866	A	6	6	118734	118739	100 %	0 %	0 %	0 %	341583344
3017	NC_015866	ATG	2	6	118751	118756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583344
3018	NC_015866	A	6	6	118763	118768	100 %	0 %	0 %	0 %	341583344
3019	NC_015866	GAA	2	6	118796	118801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583344
3020	NC_015866	TTC	2	6	118812	118817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583344
3021	NC_015866	GCT	3	9	118832	118840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583344
3022	NC_015866	AAAG	2	8	118843	118850	75 %	0 %	25 %	0 %	341583344
3023	NC_015866	TTG	2	6	118938	118943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583344
3024	NC_015866	GAA	3	9	119054	119062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583344
3025	NC_015866	CGT	2	6	119105	119110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583344
3026	NC_015866	AT	3	6	119115	119120	50 %	50 %	0 %	0 %	341583344
3027	NC_015866	TAG	2	6	119196	119201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583344
3028	NC_015866	GAT	2	6	119294	119299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583344
3029	NC_015866	GA	3	6	119330	119335	50 %	0 %	50 %	0 %	341583344
3030	NC_015866	T	6	6	119342	119347	0 %	100 %	0 %	0 %	341583344
3031	NC_015866	AGA	2	6	119359	119364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583344
3032	NC_015866	ATA	2	6	119376	119381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583344
3033	NC_015866	A	6	6	119388	119393	100 %	0 %	0 %	0 %	341583344
3034	NC_015866	TTC	2	6	119417	119422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583344
3035	NC_015866	TTA	2	6	119535	119540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583344
3036	NC_015866	GAA	2	6	119570	119575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583344
3037	NC_015866	A	7	7	119574	119580	100 %	0 %	0 %	0 %	341583344
3038	NC_015866	TGT	3	9	119681	119689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015866	ACTAGT	2	12	119754	119765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3040	NC_015866	T	6	6	119813	119818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015866	AAT	2	6	119827	119832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015866	A	6	6	119866	119871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015866	ACTC	2	8	119881	119888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_015866	CAAA	2	8	119903	119910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_015866	TC	3	6	119956	119961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_015866	CTAT	2	8	119975	119982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_015866	TAA	2	6	119983	119988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015866	T	6	6	120000	120005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015866	TAA	2	6	120012	120017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015866	TTA	3	9	120061	120069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015866	TGC	2	6	120113	120118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583345
3052	NC_015866	ATG	2	6	120172	120177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583345
3053	NC_015866	TTA	2	6	120193	120198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583345
3054	NC_015866	TA	3	6	120345	120350	50 %	50 %	0 %	0 %	341583345
3055	NC_015866	A	7	7	120482	120488	100 %	0 %	0 %	0 %	341583346
3056	NC_015866	GTC	2	6	120561	120566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583346
3057	NC_015866	CTA	2	6	120622	120627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583346
3058	NC_015866	GTT	2	6	120636	120641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583346
3059	NC_015866	TAC	2	6	120779	120784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583346
3060	NC_015866	AGA	2	6	120785	120790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583346
3061	NC_015866	T	6	6	120866	120871	0 %	100 %	0 %	0 %	341583346
3062	NC_015866	AGT	2	6	120999	121004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583346
3063	NC_015866	TAT	2	6	121007	121012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583346
3064	NC_015866	ATT	2	6	121228	121233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583347
3065	NC_015866	GCT	2	6	121292	121297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583347
3066	NC_015866	ATA	2	6	121355	121360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3067	NC_015866	TGC	2	6	121375	121380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583347
3068	NC_015866	CCG	2	6	121415	121420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583347
3069	NC_015866	A	7	7	121443	121449	100 %	0 %	0 %	0 %	341583347
3070	NC_015866	TA	3	6	121477	121482	50 %	50 %	0 %	0 %	341583347
3071	NC_015866	ATC	2	6	121486	121491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583347
3072	NC_015866	TAGCGG	2	12	121521	121532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583347
3073	NC_015866	ATA	2	6	121598	121603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3074	NC_015866	CTT	2	6	121731	121736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583347
3075	NC_015866	CGCT	2	8	121826	121833	0 %	25 %	25 %	50 %	341583347
3076	NC_015866	A	6	6	121873	121878	100 %	0 %	0 %	0 %	341583347
3077	NC_015866	CTTTTT	2	12	121880	121891	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	341583347
3078	NC_015866	TAG	2	6	121933	121938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583347
3079	NC_015866	ATA	2	6	122045	122050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3080	NC_015866	AAG	2	6	122127	122132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583347
3081	NC_015866	AACG	2	8	122142	122149	50 %	0 %	25 %	25 %	341583347
3082	NC_015866	TAT	2	6	122169	122174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583347
3083	NC_015866	TGC	2	6	122212	122217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583347
3084	NC_015866	TTA	2	6	122348	122353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583347
3085	NC_015866	TAA	2	6	122374	122379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3086	NC_015866	TCT	2	6	122432	122437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583347
3087	NC_015866	TAA	2	6	122446	122451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3088	NC_015866	ATAAA	2	10	122468	122477	80 %	20 %	0 %	0 %	341583347
3089	NC_015866	TAA	2	6	122482	122487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3090	NC_015866	ATA	2	6	122503	122508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3091	NC_015866	TAA	2	6	122509	122514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583347
3092	NC_015866	CAT	2	6	122515	122520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583347
3093	NC_015866	CT	3	6	122530	122535	0 %	50 %	0 %	50 %	341583348
3094	NC_015866	TAT	2	6	122643	122648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583348
3095	NC_015866	TAA	2	6	122702	122707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583348
3096	NC_015866	TA	3	6	122756	122761	50 %	50 %	0 %	0 %	341583348
3097	NC_015866	TAT	2	6	122790	122795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583348
3098	NC_015866	TAG	2	6	122855	122860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583348
3099	NC_015866	CTA	2	6	122864	122869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583348
3100	NC_015866	CTA	2	6	122891	122896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583348
3101	NC_015866	AAGTA	2	10	123074	123083	60 %	20 %	20 %	0 %	341583348
3102	NC_015866	TATT	2	8	123133	123140	25 %	75 %	0 %	0 %	341583348
3103	NC_015866	T	6	6	123142	123147	0 %	100 %	0 %	0 %	341583348
3104	NC_015866	T	6	6	123153	123158	0 %	100 %	0 %	0 %	341583348
3105	NC_015866	ATT	2	6	123172	123177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583348
3106	NC_015866	T	7	7	123176	123182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015866	AAGT	2	8	123232	123239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015866	GCT	2	6	123287	123292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015866	TC	3	6	123348	123353	0 %	50 %	0 %	50 %	341583349
3110	NC_015866	TAC	2	6	123441	123446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583349
3111	NC_015866	CTT	2	6	123458	123463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583349
3112	NC_015866	AAT	2	6	123498	123503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583349
3113	NC_015866	T	7	7	123628	123634	0 %	100 %	0 %	0 %	341583349
3114	NC_015866	TA	3	6	123657	123662	50 %	50 %	0 %	0 %	341583349
3115	NC_015866	AAT	2	6	123738	123743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583349
3116	NC_015866	T	6	6	123844	123849	0 %	100 %	0 %	0 %	341583349
3117	NC_015866	ATC	2	6	123888	123893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583349
3118	NC_015866	ATC	2	6	123915	123920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583349
3119	NC_015866	TTC	2	6	123975	123980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583349
3120	NC_015866	TAA	3	9	124019	124027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583349
3121	NC_015866	AAT	2	6	124170	124175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583349
3122	NC_015866	TA	4	8	124214	124221	50 %	50 %	0 %	0 %	341583349
3123	NC_015866	CCG	2	6	124231	124236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583349
3124	NC_015866	TAT	2	6	124245	124250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583349
3125	NC_015866	TCA	2	6	124252	124257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583349
3126	NC_015866	TAT	2	6	124271	124276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583349
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3239	NC_015866	AAAG	2	8	128399	128406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_015866	GCA	2	6	128658	128663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3249	NC_015866	ATA	2	6	128809	128814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_015866	ATC	2	6	128827	128832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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