MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

< Previous12...2627282930313233343536...6566Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015866	TAT	2	6	588489	588494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583822
15002	NC_015866	AGA	2	6	588528	588533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583822
15003	NC_015866	ATT	2	6	588637	588642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583822
15004	NC_015866	TGA	2	6	588645	588650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583822
15005	NC_015866	AGA	2	6	588675	588680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583822
15006	NC_015866	GTT	2	6	588691	588696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583822
15007	NC_015866	A	6	6	588706	588711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_015866	CAT	2	6	588712	588717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_015866	ATA	2	6	588754	588759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_015866	TCG	2	6	588779	588784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_015866	TAC	2	6	588788	588793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_015866	TTC	2	6	588798	588803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_015866	ATG	2	6	588809	588814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_015866	TAA	2	6	588818	588823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_015866	A	7	7	588841	588847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_015866	ATA	2	6	588902	588907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583823
15017	NC_015866	AG	3	6	588927	588932	50 %	0 %	50 %	0 %	341583823
15018	NC_015866	AGT	3	9	588997	589005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583823
15019	NC_015866	GAA	2	6	589015	589020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583823
15020	NC_015866	ATT	2	6	589026	589031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583823
15021	NC_015866	TAA	2	6	589056	589061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583823
15022	NC_015866	TAA	2	6	589073	589078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583823
15023	NC_015866	TCA	2	6	589087	589092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583823
15024	NC_015866	AAT	2	6	589093	589098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583823
15025	NC_015866	ACT	2	6	589099	589104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583823
15026	NC_015866	CCA	2	6	589165	589170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583823
15027	NC_015866	TAT	2	6	589242	589247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583823
15028	NC_015866	TGA	2	6	589287	589292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583823
15029	NC_015866	ATG	2	6	589415	589420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583823
15030	NC_015866	AGT	2	6	589422	589427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583823
15031	NC_015866	AT	3	6	589490	589495	50 %	50 %	0 %	0 %	341583823
15032	NC_015866	TAC	2	6	589562	589567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583823
15033	NC_015866	TA	3	6	589571	589576	50 %	50 %	0 %	0 %	341583823
15034	NC_015866	ATT	2	6	589581	589586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583823
15035	NC_015866	TCCGAT	2	12	589599	589610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341583823
15036	NC_015866	TGC	2	6	589617	589622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583823
15037	NC_015866	ATT	2	6	589625	589630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583823
15038	NC_015866	AAGC	2	8	589670	589677	50 %	0 %	25 %	25 %	341583823
15039	NC_015866	A	6	6	589687	589692	100 %	0 %	0 %	0 %	341583823
15040	NC_015866	CAT	2	6	589704	589709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583823
15041	NC_015866	CTAT	2	8	589717	589724	25 %	50 %	0 %	25 %	341583823
15042	NC_015866	ATT	2	6	589780	589785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583824
15043	NC_015866	GAA	2	6	589791	589796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583824
15044	NC_015866	GTATT	2	10	589810	589819	20 %	60 %	20 %	0 %	341583824
15045	NC_015866	AGA	2	6	589865	589870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583824
15046	NC_015866	ATT	2	6	589976	589981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583824
15047	NC_015866	TAGAAT	2	12	590015	590026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583824
15048	NC_015866	TAG	2	6	590041	590046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583824
15049	NC_015866	TAA	2	6	590063	590068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583824
15050	NC_015866	A	8	8	590067	590074	100 %	0 %	0 %	0 %	341583824
15051	NC_015866	AG	3	6	590127	590132	50 %	0 %	50 %	0 %	341583824
15052	NC_015866	TAA	2	6	590173	590178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583824
15053	NC_015866	A	6	6	590308	590313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_015866	GCA	2	6	590323	590328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583825
15055	NC_015866	TAT	2	6	590329	590334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583825
15056	NC_015866	AAT	2	6	590479	590484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15057	NC_015866	ATT	2	6	590490	590495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583825
15058	NC_015866	ATA	3	9	590513	590521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15059	NC_015866	TAA	2	6	590575	590580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15060	NC_015866	ATA	2	6	590592	590597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15061	NC_015866	AAT	2	6	590659	590664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15062	NC_015866	A	6	6	590696	590701	100 %	0 %	0 %	0 %	341583825
15063	NC_015866	ATT	2	6	590722	590727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583825
15064	NC_015866	AAAGTT	2	12	590741	590752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583825
15065	NC_015866	TAA	2	6	590862	590867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15066	NC_015866	ATT	2	6	590902	590907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583825
15067	NC_015866	GAA	2	6	590939	590944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583825
15068	NC_015866	TA	3	6	591029	591034	50 %	50 %	0 %	0 %	341583825
15069	NC_015866	ATT	2	6	591076	591081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583825
15070	NC_015866	TAA	2	6	591106	591111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583825
15071	NC_015866	TTG	2	6	591125	591130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_015866	TTG	2	6	591154	591159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_015866	ATC	2	6	591172	591177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_015866	TTAC	2	8	591237	591244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15075	NC_015866	CAA	2	6	591281	591286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_015866	TAG	2	6	591291	591296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_015866	TTTA	2	8	591331	591338	25 %	75 %	0 %	0 %	341583826
15078	NC_015866	TCC	2	6	591436	591441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583826
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15080	NC_015866	TCT	3	9	591554	591562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583826
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15082	NC_015866	TCA	2	6	591605	591610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583826
15083	NC_015866	CAA	2	6	591636	591641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583826
15084	NC_015866	AC	3	6	591677	591682	50 %	0 %	0 %	50 %	341583826
15085	NC_015866	CTG	2	6	591702	591707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583826
15086	NC_015866	ATA	2	6	591791	591796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583826
15087	NC_015866	TTCC	2	8	591906	591913	0 %	50 %	0 %	50 %	341583826
15088	NC_015866	TAC	3	9	591922	591930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583826
15089	NC_015866	AT	3	6	591988	591993	50 %	50 %	0 %	0 %	341583826
15090	NC_015866	TTTTGC	2	12	592015	592026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	341583826
15091	NC_015866	TAT	2	6	592038	592043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583826
15092	NC_015866	T	7	7	592179	592185	0 %	100 %	0 %	0 %	341583826
15093	NC_015866	TTA	2	6	592188	592193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583826
15094	NC_015866	AAT	2	6	592208	592213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_015866	TTTTA	2	10	592223	592232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_015866	T	6	6	592273	592278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_015866	T	6	6	592281	592286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_015866	ACA	2	6	592341	592346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_015866	TATTT	2	10	592397	592406	20 %	80 %	0 %	0 %	341583827
15100	NC_015866	TAT	2	6	592433	592438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583827
15101	NC_015866	TTC	2	6	592463	592468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583827
15102	NC_015866	ACT	2	6	592500	592505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583827
15103	NC_015866	AAT	2	6	592541	592546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583827
15104	NC_015866	CTT	2	6	592609	592614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583827
15105	NC_015866	ATT	2	6	592626	592631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583827
15106	NC_015866	CTT	2	6	592639	592644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583827
15107	NC_015866	CCA	2	6	592665	592670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583827
15108	NC_015866	TAA	2	6	592711	592716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583827
15109	NC_015866	TGC	2	6	592802	592807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583827
15110	NC_015866	TCT	2	6	592824	592829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583827
15111	NC_015866	TCA	2	6	592830	592835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583827
15112	NC_015866	TAA	2	6	592910	592915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583827
15113	NC_015866	TGC	2	6	592958	592963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583827
15114	NC_015866	TTTC	2	8	593002	593009	0 %	75 %	0 %	25 %	341583827
15115	NC_015866	TAA	2	6	593104	593109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583827
15116	NC_015866	T	6	6	593110	593115	0 %	100 %	0 %	0 %	341583827
15117	NC_015866	T	6	6	593122	593127	0 %	100 %	0 %	0 %	341583827
15118	NC_015866	CTT	2	6	593134	593139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583827
15119	NC_015866	CTC	2	6	593149	593154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583827
15120	NC_015866	ATACT	2	10	593200	593209	40 %	40 %	0 %	20 %	341583827
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15122	NC_015866	T	6	6	593327	593332	0 %	100 %	0 %	0 %	341583827
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