MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 32706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015866	ATA	2	6	219627	219632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583433
5503	NC_015866	AAT	2	6	219634	219639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583433
5504	NC_015866	T	6	6	219683	219688	0 %	100 %	0 %	0 %	341583433
5505	NC_015866	T	6	6	219698	219703	0 %	100 %	0 %	0 %	341583433
5506	NC_015866	GAA	2	6	219716	219721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583433
5507	NC_015866	ATT	2	6	219725	219730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583433
5508	NC_015866	ATT	2	6	219916	219921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583433
5509	NC_015866	TAAAG	2	10	219925	219934	60 %	20 %	20 %	0 %	341583433
5510	NC_015866	AAT	2	6	220020	220025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583433
5511	NC_015866	TAT	2	6	220064	220069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015866	AT	3	6	220068	220073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015866	T	7	7	220078	220084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_015866	GAT	2	6	220107	220112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583434
5515	NC_015866	TGT	2	6	220129	220134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583434
5516	NC_015866	ATT	2	6	220174	220179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
5517	NC_015866	GTTTCA	2	12	220205	220216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583434
5518	NC_015866	TA	3	6	220227	220232	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
5519	NC_015866	ATT	2	6	220234	220239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
5520	NC_015866	T	6	6	220238	220243	0 %	100 %	0 %	0 %	341583434
5521	NC_015866	TGC	2	6	220276	220281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583434
5522	NC_015866	ATC	2	6	220288	220293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583434
5523	NC_015866	TTC	2	6	220366	220371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583434
5524	NC_015866	TTTG	2	8	220416	220423	0 %	75 %	25 %	0 %	341583434
5525	NC_015866	TA	3	6	220431	220436	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
5526	NC_015866	ATG	2	6	220440	220445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583434
5527	NC_015866	TTC	2	6	220450	220455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583434
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5530	NC_015866	TTA	2	6	220514	220519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
5531	NC_015866	TAA	2	6	220527	220532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583434
5532	NC_015866	TA	3	6	220548	220553	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
5533	NC_015866	TAGC	2	8	220566	220573	25 %	25 %	25 %	25 %	341583434
5534	NC_015866	GTT	2	6	220586	220591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583434
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5536	NC_015866	T	7	7	220610	220616	0 %	100 %	0 %	0 %	341583434
5537	NC_015866	TTA	2	6	220670	220675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
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5541	NC_015866	ATT	2	6	220796	220801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583434
5542	NC_015866	AGTT	2	8	220825	220832	25 %	50 %	25 %	0 %	341583434
5543	NC_015866	TAG	2	6	220833	220838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583434
5544	NC_015866	GTC	2	6	220864	220869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583434
5545	NC_015866	TAA	2	6	220870	220875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583434
5546	NC_015866	AT	4	8	220879	220886	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
5547	NC_015866	CTT	2	6	220917	220922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583434
5548	NC_015866	TTTA	2	8	220930	220937	25 %	75 %	0 %	0 %	341583434
5549	NC_015866	CAGT	2	8	220992	220999	25 %	25 %	25 %	25 %	341583434
5550	NC_015866	ATC	2	6	221065	221070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583434
5551	NC_015866	TA	3	6	221095	221100	50 %	50 %	0 %	0 %	341583434
5552	NC_015866	T	6	6	221187	221192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015866	A	6	6	221195	221200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015866	GTCAA	2	10	221202	221211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5555	NC_015866	TTA	2	6	221222	221227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015866	TAT	2	6	221231	221236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015866	TAAA	2	8	221237	221244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015866	TGT	2	6	221266	221271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015866	ATT	2	6	221331	221336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583435
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5562	NC_015866	AAAAGC	2	12	221391	221402	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341583435
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5564	NC_015866	AGT	2	6	221455	221460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583435
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5566	NC_015866	TAG	2	6	221472	221477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583435
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5571	NC_015866	TAG	2	6	221798	221803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583435
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5594	NC_015866	AAGGC	2	10	222755	222764	40 %	0 %	40 %	20 %	341583436
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5599	NC_015866	CT	3	6	222997	223002	0 %	50 %	0 %	50 %	341583437
5600	NC_015866	TAT	2	6	223026	223031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583437
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5609	NC_015866	GGT	2	6	223394	223399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583438
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5615	NC_015866	GGAG	2	8	223632	223639	25 %	0 %	75 %	0 %	341583438
5616	NC_015866	ATG	2	6	223649	223654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583438
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5621	NC_015866	GTC	2	6	223766	223771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583438
5622	NC_015866	CTG	2	6	223851	223856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015866	TA	3	6	223961	223966	50 %	50 %	0 %	0 %	341583439
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