MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_015730	GAT	2	6	1307610	1307615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502816
25004	NC_015730	GC	3	6	1307637	1307642	0 %	0 %	50 %	50 %	339502816
25005	NC_015730	GTT	2	6	1307663	1307668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502816
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25009	NC_015730	CGC	2	6	1307804	1307809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502816
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25039	NC_015730	GATTTC	2	12	1309327	1309338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339502817
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25053	NC_015730	GAA	2	6	1309844	1309849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_015730	CGGG	2	8	1309923	1309930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25055	NC_015730	GCA	2	6	1310040	1310045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502818
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25107	NC_015730	TAAGG	2	10	1312683	1312692	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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25117	NC_015730	TTC	2	6	1313293	1313298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339502821
25118	NC_015730	CTT	2	6	1313304	1313309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339502821
25119	NC_015730	ATC	2	6	1313341	1313346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502821
25120	NC_015730	GGC	2	6	1313424	1313429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502821
25121	NC_015730	CTT	2	6	1313472	1313477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339502821
25122	NC_015730	CCG	2	6	1313524	1313529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25123	NC_015730	GC	3	6	1313550	1313555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25124	NC_015730	CG	3	6	1313562	1313567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25125	NC_015730	GCA	2	6	1313584	1313589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25126	NC_015730	TGG	2	6	1313613	1313618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502822
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25128	NC_015730	CG	5	10	1313759	1313768	0 %	0 %	50 %	50 %	339502822
25129	NC_015730	GC	3	6	1313803	1313808	0 %	0 %	50 %	50 %	339502822
25130	NC_015730	A	6	6	1313834	1313839	100 %	0 %	0 %	0 %	339502822
25131	NC_015730	ATC	2	6	1313861	1313866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502822
25132	NC_015730	TGAT	2	8	1313898	1313905	25 %	50 %	25 %	0 %	339502822
25133	NC_015730	CGC	2	6	1313958	1313963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502822
25134	NC_015730	GCA	2	6	1314068	1314073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502822
25135	NC_015730	CG	3	6	1314156	1314161	0 %	0 %	50 %	50 %	339502822
25136	NC_015730	CGA	2	6	1314210	1314215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502822
25137	NC_015730	TGA	2	6	1314225	1314230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502822
25138	NC_015730	TCT	2	6	1314234	1314239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339502822
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25140	NC_015730	CACGGA	2	12	1314480	1314491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502823
25141	NC_015730	ATC	2	6	1314502	1314507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502823
25142	NC_015730	CG	4	8	1314537	1314544	0 %	0 %	50 %	50 %	339502823
25143	NC_015730	CTG	2	6	1314577	1314582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502823
25144	NC_015730	GAAC	2	8	1314669	1314676	50 %	0 %	25 %	25 %	339502823
25145	NC_015730	TCA	2	6	1314761	1314766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502823
25146	NC_015730	GCC	2	6	1314800	1314805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502823
25147	NC_015730	CCGA	2	8	1314817	1314824	25 %	0 %	25 %	50 %	339502823
25148	NC_015730	GAC	2	6	1314862	1314867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502823
25149	NC_015730	GGT	2	6	1314969	1314974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502823
25150	NC_015730	TAT	2	6	1314976	1314981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339502823
25151	NC_015730	CAC	2	6	1315007	1315012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502823
25152	NC_015730	TGG	3	9	1315106	1315114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502823
25153	NC_015730	CCA	2	6	1315115	1315120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502823
25154	NC_015730	ATT	2	6	1315236	1315241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339502823
25155	NC_015730	GC	5	10	1315393	1315402	0 %	0 %	50 %	50 %	339502823
25156	NC_015730	GCG	2	6	1315412	1315417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502823
25157	NC_015730	GGC	2	6	1315536	1315541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502823
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25160	NC_015730	GGC	2	6	1315881	1315886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502824
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25162	NC_015730	ATG	2	6	1315945	1315950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502824
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25164	NC_015730	AAG	2	6	1316095	1316100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502824
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25166	NC_015730	GAT	2	6	1316216	1316221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502824
25167	NC_015730	CTG	2	6	1316227	1316232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502824
25168	NC_015730	GGC	2	6	1316283	1316288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502824
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25175	NC_015730	CGA	2	6	1316612	1316617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502824
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25182	NC_015730	TGC	2	6	1316897	1316902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502824
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25186	NC_015730	GC	4	8	1317019	1317026	0 %	0 %	50 %	50 %	339502825
25187	NC_015730	AAC	2	6	1317174	1317179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339502825
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25189	NC_015730	CG	3	6	1317372	1317377	0 %	0 %	50 %	50 %	339502825
25190	NC_015730	GCG	2	6	1317467	1317472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502825
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25193	NC_015730	GC	3	6	1317566	1317571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25194	NC_015730	GACAT	2	10	1317623	1317632	40 %	20 %	20 %	20 %	339502826
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25198	NC_015730	TCTTTG	2	12	1318097	1318108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	339502826
25199	NC_015730	CAC	2	6	1318147	1318152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502826
25200	NC_015730	CGA	2	6	1318238	1318243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502826
25201	NC_015730	TGT	2	6	1318275	1318280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502826
25202	NC_015730	GAT	2	6	1318315	1318320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502826
25203	NC_015730	GGTG	2	8	1318359	1318366	0 %	25 %	75 %	0 %	339502826
25204	NC_015730	TGC	2	6	1318421	1318426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502826
25205	NC_015730	GC	3	6	1318452	1318457	0 %	0 %	50 %	50 %	339502826
25206	NC_015730	ATG	2	6	1318494	1318499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502827
25207	NC_015730	TGC	2	6	1318558	1318563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25208	NC_015730	GAG	2	6	1318587	1318592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502827
25209	NC_015730	GCG	2	6	1318629	1318634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
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25212	NC_015730	CGG	3	9	1318706	1318714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25213	NC_015730	TGG	2	6	1318723	1318728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502827
25214	NC_015730	CGC	2	6	1318756	1318761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502827
25215	NC_015730	GGA	2	6	1318808	1318813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502827
25216	NC_015730	GCA	2	6	1318856	1318861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25217	NC_015730	GCA	2	6	1318866	1318871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25218	NC_015730	GCG	2	6	1318872	1318877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25219	NC_015730	GGC	2	6	1318879	1318884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25220	NC_015730	GGC	2	6	1318901	1318906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25221	NC_015730	CGA	2	6	1318939	1318944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25222	NC_015730	CTG	2	6	1319085	1319090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25223	NC_015730	CGG	2	6	1319122	1319127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25224	NC_015730	CGC	2	6	1319188	1319193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502827
25225	NC_015730	GC	5	10	1319220	1319229	0 %	0 %	50 %	50 %	339502827
25226	NC_015730	T	6	6	1319282	1319287	0 %	100 %	0 %	0 %	339502827
25227	NC_015730	GGA	2	6	1319393	1319398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502827
25228	NC_015730	CT	3	6	1319413	1319418	0 %	50 %	0 %	50 %	339502827
25229	NC_015730	CAG	2	6	1319460	1319465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25230	NC_015730	GCT	2	6	1319466	1319471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502827
25231	NC_015730	ATG	2	6	1319536	1319541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502827
25232	NC_015730	G	6	6	1319678	1319683	0 %	0 %	100 %	0 %	339502827
25233	NC_015730	ACC	2	6	1319695	1319700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502827
25234	NC_015730	GC	3	6	1319708	1319713	0 %	0 %	50 %	50 %	339502827
25235	NC_015730	GGT	2	6	1319754	1319759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502827
25236	NC_015730	GGC	2	6	1319785	1319790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25237	NC_015730	GAT	2	6	1319799	1319804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502827
25238	NC_015730	GGC	2	6	1319834	1319839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502827
25239	NC_015730	TGCG	2	8	1319842	1319849	0 %	25 %	50 %	25 %	339502827
25240	NC_015730	CAT	2	6	1319876	1319881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502827
25241	NC_015730	GTT	2	6	1319950	1319955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25242	NC_015730	CTG	2	6	1319959	1319964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25243	NC_015730	GCA	2	6	1320053	1320058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502828
25244	NC_015730	CAG	2	6	1320082	1320087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502828
25245	NC_015730	GC	3	6	1320177	1320182	0 %	0 %	50 %	50 %	339502828
25246	NC_015730	GAA	2	6	1320245	1320250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502828
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25249	NC_015730	ACGTG	2	10	1320421	1320430	20 %	20 %	40 %	20 %	339502828
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25253	NC_015730	ATG	2	6	1320567	1320572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502829
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25256	NC_015730	CTCCC	2	10	1320590	1320599	0 %	20 %	0 %	80 %	339502829
25257	NC_015730	CGG	2	6	1320628	1320633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502829
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25262	NC_015730	CAT	2	6	1320691	1320696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502829
25263	NC_015730	TCGCC	2	10	1320712	1320721	0 %	20 %	20 %	60 %	339502829
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25265	NC_015730	ATG	2	6	1320954	1320959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502829
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25272	NC_015730	CCAGA	2	10	1321390	1321399	40 %	0 %	20 %	40 %	339502830
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25287	NC_015730	CGA	2	6	1322222	1322227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502831
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25293	NC_015730	TCA	2	6	1322678	1322683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25295	NC_015730	GC	4	8	1322758	1322765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25296	NC_015730	GAC	2	6	1322780	1322785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25297	NC_015730	GC	4	8	1322811	1322818	0 %	0 %	50 %	50 %	339502832
25298	NC_015730	TGA	2	6	1322873	1322878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502832
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25304	NC_015730	TGG	2	6	1323100	1323105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502832
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25330	NC_015730	CTG	2	6	1324332	1324337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502832
25331	NC_015730	TGG	2	6	1324357	1324362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502832
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25333	NC_015730	GGC	2	6	1324443	1324448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25334	NC_015730	CACC	2	8	1324475	1324482	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25335	NC_015730	GTC	2	6	1324538	1324543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502833
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25341	NC_015730	GC	3	6	1324699	1324704	0 %	0 %	50 %	50 %	339502833
25342	NC_015730	CG	3	6	1324764	1324769	0 %	0 %	50 %	50 %	339502833
25343	NC_015730	TCA	2	6	1324818	1324823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502833
25344	NC_015730	CG	4	8	1324828	1324835	0 %	0 %	50 %	50 %	339502833
25345	NC_015730	TGA	2	6	1324844	1324849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502833
25346	NC_015730	TCA	2	6	1324855	1324860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502833
25347	NC_015730	CGA	2	6	1324879	1324884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502833
25348	NC_015730	AGA	2	6	1324894	1324899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502833
25349	NC_015730	GTC	2	6	1324937	1324942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502833
25350	NC_015730	A	6	6	1325006	1325011	100 %	0 %	0 %	0 %	339502833
25351	NC_015730	GTT	2	6	1325027	1325032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502833
25352	NC_015730	CGC	2	6	1325039	1325044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502833
25353	NC_015730	CG	3	6	1325047	1325052	0 %	0 %	50 %	50 %	339502833
25354	NC_015730	ATCC	2	8	1325058	1325065	25 %	25 %	0 %	50 %	339502833
25355	NC_015730	GCG	2	6	1325074	1325079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502833
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25358	NC_015730	ACC	2	6	1325190	1325195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502834
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25373	NC_015730	GGC	2	6	1325846	1325851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502835
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25384	NC_015730	TGC	2	6	1326340	1326345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502835
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25388	NC_015730	TGT	2	6	1326622	1326627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25389	NC_015730	T	6	6	1326652	1326657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25390	NC_015730	CA	3	6	1326670	1326675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25424	NC_015730	G	6	6	1328424	1328429	0 %	0 %	100 %	0 %	339502839
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25449	NC_015730	GAAG	2	8	1329671	1329678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25450	NC_015730	GCGAT	2	10	1329733	1329742	20 %	20 %	40 %	20 %	339502840
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25458	NC_015730	GAT	2	6	1330385	1330390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502840
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25466	NC_015730	GTC	2	6	1330782	1330787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502840
25467	NC_015730	ATCAT	2	10	1330855	1330864	40 %	40 %	0 %	20 %	339502840
25468	NC_015730	CGG	2	6	1330948	1330953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502840
25469	NC_015730	CCT	2	6	1331053	1331058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339502840
25470	NC_015730	ACG	2	6	1331132	1331137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502840
25471	NC_015730	CGT	2	6	1331192	1331197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502840
25472	NC_015730	TGC	2	6	1331230	1331235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502840
25473	NC_015730	GGA	2	6	1331396	1331401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502840
25474	NC_015730	CAA	2	6	1331525	1331530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339502840
25475	NC_015730	G	6	6	1331562	1331567	0 %	0 %	100 %	0 %	339502840
25476	NC_015730	CCG	2	6	1331618	1331623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502840
25477	NC_015730	TGCGA	2	10	1331682	1331691	20 %	20 %	40 %	20 %	339502840
25478	NC_015730	GCCT	2	8	1331786	1331793	0 %	25 %	25 %	50 %	339502840
25479	NC_015730	GTG	2	6	1331872	1331877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502840
25480	NC_015730	TGC	2	6	1332023	1332028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502841
25481	NC_015730	TA	3	6	1332031	1332036	50 %	50 %	0 %	0 %	339502841
25482	NC_015730	CTTTGC	2	12	1332042	1332053	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339502841
25483	NC_015730	GCCT	2	8	1332121	1332128	0 %	25 %	25 %	50 %	339502841
25484	NC_015730	GGC	3	9	1332129	1332137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502841
25485	NC_015730	GC	3	6	1332156	1332161	0 %	0 %	50 %	50 %	339502841
25486	NC_015730	TGC	2	6	1332177	1332182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502841
25487	NC_015730	CTG	2	6	1332265	1332270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502841
25488	NC_015730	TGA	2	6	1332281	1332286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502841
25489	NC_015730	TGT	2	6	1332289	1332294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502841
25490	NC_015730	GAG	2	6	1332403	1332408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502841
25491	NC_015730	GGT	2	6	1332412	1332417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502841
25492	NC_015730	ACGCG	2	10	1332443	1332452	20 %	0 %	40 %	40 %	339502841
25493	NC_015730	CTTT	2	8	1332480	1332487	0 %	75 %	0 %	25 %	339502841
25494	NC_015730	GC	3	6	1332527	1332532	0 %	0 %	50 %	50 %	339502841
25495	NC_015730	GCG	2	6	1332580	1332585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502841
25496	NC_015730	GGT	2	6	1332590	1332595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502841
25497	NC_015730	TTG	2	6	1332608	1332613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502841
25498	NC_015730	GAT	2	6	1332642	1332647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502841
25499	NC_015730	T	6	6	1332721	1332726	0 %	100 %	0 %	0 %	339502841
25500	NC_015730	GCG	2	6	1332777	1332782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502841

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