MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 86129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015730	GGTC	2	8	948885	948892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18002	NC_015730	ATC	2	6	948996	949001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_015730	TC	3	6	949148	949153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18004	NC_015730	AACA	2	8	949158	949165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18005	NC_015730	ATC	2	6	949206	949211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_015730	ATCA	2	8	949297	949304	50 %	25 %	0 %	25 %	339502459
18007	NC_015730	AAG	2	6	949312	949317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502459
18008	NC_015730	TGA	2	6	949340	949345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502459
18009	NC_015730	GCG	2	6	949503	949508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502459
18010	NC_015730	GGT	2	6	949607	949612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502459
18011	NC_015730	GCG	2	6	949620	949625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502459
18012	NC_015730	TTGCG	2	10	949747	949756	0 %	40 %	40 %	20 %	339502459
18013	NC_015730	AGA	2	6	949836	949841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502459
18014	NC_015730	GTG	2	6	949915	949920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502459
18015	NC_015730	GCG	2	6	949952	949957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502459
18016	NC_015730	AAT	2	6	950042	950047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339502459
18017	NC_015730	TCGT	2	8	950122	950129	0 %	50 %	25 %	25 %	339502459
18018	NC_015730	CAT	2	6	950175	950180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502459
18019	NC_015730	TGT	2	6	950225	950230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502459
18020	NC_015730	CGA	2	6	950262	950267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502459
18021	NC_015730	CGGCGT	2	12	950425	950436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339502459
18022	NC_015730	ACC	2	6	950598	950603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18023	NC_015730	TGC	2	6	950604	950609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_015730	CAG	2	6	950756	950761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_015730	AT	3	6	950815	950820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_015730	GAG	2	6	950834	950839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18027	NC_015730	AAC	2	6	950876	950881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_015730	TGG	2	6	950902	950907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_015730	GCC	2	6	950936	950941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_015730	G	6	6	950972	950977	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_015730	CGG	2	6	951270	951275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502460
18032	NC_015730	AAAC	2	8	951355	951362	75 %	0 %	0 %	25 %	339502460
18033	NC_015730	ATC	2	6	951400	951405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_015730	CAG	2	6	951471	951476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502461
18035	NC_015730	CGG	2	6	951485	951490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502461
18036	NC_015730	ATA	2	6	951511	951516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339502461
18037	NC_015730	ATT	2	6	951558	951563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339502461
18038	NC_015730	TGT	2	6	951593	951598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502461
18039	NC_015730	TG	3	6	951625	951630	0 %	50 %	50 %	0 %	339502461
18040	NC_015730	CGT	2	6	951645	951650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502461
18041	NC_015730	TGTT	2	8	951866	951873	0 %	75 %	25 %	0 %	339502461
18042	NC_015730	TCG	2	6	951967	951972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502461
18043	NC_015730	GCCT	2	8	952005	952012	0 %	25 %	25 %	50 %	339502461
18044	NC_015730	TAT	2	6	952086	952091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_015730	ACT	2	6	952138	952143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_015730	GTT	2	6	952168	952173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_015730	AGT	2	6	952178	952183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_015730	GCC	2	6	952344	952349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18049	NC_015730	TGC	2	6	952483	952488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502462
18050	NC_015730	A	8	8	952499	952506	100 %	0 %	0 %	0 %	339502462
18051	NC_015730	AGCT	2	8	952599	952606	25 %	25 %	25 %	25 %	339502462
18052	NC_015730	CGC	2	6	952638	952643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502462
18053	NC_015730	GTC	2	6	952644	952649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502462
18054	NC_015730	TGA	2	6	952664	952669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502462
18055	NC_015730	CCA	2	6	952715	952720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18056	NC_015730	ACCG	2	8	952731	952738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18057	NC_015730	GTT	2	6	952748	952753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_015730	TTGG	2	8	952850	952857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_015730	TGT	2	6	953036	953041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502463
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18061	NC_015730	CG	3	6	953278	953283	0 %	0 %	50 %	50 %	339502464
18062	NC_015730	ACT	2	6	953292	953297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502464
18063	NC_015730	GGC	2	6	953340	953345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502464
18064	NC_015730	GC	3	6	953372	953377	0 %	0 %	50 %	50 %	339502464
18065	NC_015730	GCC	2	6	953434	953439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502464
18066	NC_015730	TCT	2	6	953476	953481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339502464
18067	NC_015730	GTC	2	6	953519	953524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502464
18068	NC_015730	TGT	2	6	953550	953555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339502464
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18070	NC_015730	TGA	2	6	953577	953582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502464
18071	NC_015730	GCC	2	6	953585	953590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502464
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18073	NC_015730	AAC	2	6	953685	953690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18074	NC_015730	GC	3	6	953755	953760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18075	NC_015730	GCC	2	6	953903	953908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502465
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18078	NC_015730	CCA	2	6	953987	953992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18079	NC_015730	CAT	2	6	954049	954054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_015730	GC	3	6	954153	954158	0 %	0 %	50 %	50 %	339502466
18081	NC_015730	GC	4	8	954190	954197	0 %	0 %	50 %	50 %	339502466
18082	NC_015730	AGG	2	6	954226	954231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502466
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18086	NC_015730	ACC	2	6	954386	954391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339502466
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18088	NC_015730	AGGA	2	8	954482	954489	50 %	0 %	50 %	0 %	339502466
18089	NC_015730	CGG	2	6	954615	954620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502466
18090	NC_015730	TCGG	2	8	954626	954633	0 %	25 %	50 %	25 %	339502466
18091	NC_015730	CGA	2	6	954660	954665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502466
18092	NC_015730	ACA	2	6	954675	954680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339502466
18093	NC_015730	GC	4	8	954705	954712	0 %	0 %	50 %	50 %	339502466
18094	NC_015730	GCG	2	6	954736	954741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502466
18095	NC_015730	GAT	2	6	954772	954777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502466
18096	NC_015730	CAGTGC	2	12	954799	954810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339502466
18097	NC_015730	GATT	2	8	954882	954889	25 %	50 %	25 %	0 %	339502466
18098	NC_015730	GCC	2	6	954916	954921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502466
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18104	NC_015730	CAG	2	6	955153	955158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502466
18105	NC_015730	GACCA	2	10	955202	955211	40 %	0 %	20 %	40 %	339502466
18106	NC_015730	GAA	2	6	955246	955251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502466
18107	NC_015730	CAA	2	6	955270	955275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339502466
18108	NC_015730	AAG	2	6	955318	955323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339502466
18109	NC_015730	GGC	2	6	955400	955405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502467
18110	NC_015730	GC	3	6	955424	955429	0 %	0 %	50 %	50 %	339502467
18111	NC_015730	TGG	2	6	955442	955447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339502467
18112	NC_015730	CCAGA	2	10	955494	955503	40 %	0 %	20 %	40 %	339502467
18113	NC_015730	GATC	2	8	955542	955549	25 %	25 %	25 %	25 %	339502467
18114	NC_015730	TGA	3	9	955583	955591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502467
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18116	NC_015730	GC	3	6	955628	955633	0 %	0 %	50 %	50 %	339502467
18117	NC_015730	GCC	2	6	955755	955760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502467
18118	NC_015730	ATG	2	6	955783	955788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339502467
18119	NC_015730	CAG	2	6	955818	955823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502467
18120	NC_015730	TATC	2	8	955871	955878	25 %	50 %	0 %	25 %	339502467
18121	NC_015730	GCCC	2	8	955898	955905	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18122	NC_015730	GC	3	6	955985	955990	0 %	0 %	50 %	50 %	339502468
18123	NC_015730	TCG	2	6	956048	956053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502468
18124	NC_015730	TGATC	2	10	956181	956190	20 %	40 %	20 %	20 %	339502468
18125	NC_015730	C	6	6	956267	956272	0 %	0 %	0 %	100 %	339502468
18126	NC_015730	GCA	2	6	956283	956288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502468
18127	NC_015730	GAG	2	6	956294	956299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339502468
18128	NC_015730	ACCA	2	8	956307	956314	50 %	0 %	0 %	50 %	339502468
18129	NC_015730	AGC	2	6	956426	956431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502468
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18132	NC_015730	CGG	2	6	956619	956624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502468
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18140	NC_015730	GCG	2	6	957082	957087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502469
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18143	NC_015730	GCG	2	6	957227	957232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339502469
18144	NC_015730	GCC	2	6	957296	957301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339502469
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18152	NC_015730	TCGTT	2	10	957830	957839	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18153	NC_015730	CTG	2	6	957999	958004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339502470
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18155	NC_015730	ATC	2	6	958099	958104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339502470
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18160	NC_015730	CAAAT	2	10	958272	958281	60 %	20 %	0 %	20 %	339502470
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18171	NC_015730	GCC	2	6	958942	958947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18172	NC_015730	AGC	2	6	958974	958979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18175	NC_015730	GCG	2	6	959010	959015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18178	NC_015730	TCT	2	6	959188	959193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18179	NC_015730	GGCCA	2	10	959329	959338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18180	NC_015730	TGC	2	6	959427	959432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18182	NC_015730	CCA	2	6	959502	959507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18183	NC_015730	AG	3	6	959547	959552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18184	NC_015730	TCC	2	6	959707	959712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18185	NC_015730	TGC	2	6	959772	959777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18188	NC_015730	GCC	2	6	959841	959846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18189	NC_015730	TTG	2	6	959896	959901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18191	NC_015730	TGC	2	6	959994	959999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18197	NC_015730	CGG	2	6	960310	960315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18198	NC_015730	GA	3	6	960386	960391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18199	NC_015730	CATG	2	8	960426	960433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18200	NC_015730	ATG	2	6	960476	960481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18202	NC_015730	CCG	2	6	960513	960518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18203	NC_015730	GCA	2	6	960608	960613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18230	NC_015730	GC	3	6	961751	961756	0 %	0 %	50 %	50 %	339502471
18231	NC_015730	ATGTCT	2	12	961800	961811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	339502471
18232	NC_015730	GGCA	2	8	961816	961823	25 %	0 %	50 %	25 %	339502471
18233	NC_015730	AGC	2	6	961824	961829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502471
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18235	NC_015730	GCGT	2	8	961941	961948	0 %	25 %	50 %	25 %	339502471
18236	NC_015730	GCA	2	6	962022	962027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339502471
18237	NC_015730	AC	3	6	962075	962080	50 %	0 %	0 %	50 %	339502471
18238	NC_015730	ACA	2	6	962139	962144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339502471
18239	NC_015730	GCC	2	6	962265	962270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18240	NC_015730	AGT	2	6	962286	962291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18241	NC_015730	A	7	7	962321	962327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_015730	CA	3	6	962368	962373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18243	NC_015730	TG	3	6	962386	962391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18244	NC_015730	TTTTGC	2	12	962410	962421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18245	NC_015730	GCA	2	6	962451	962456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18246	NC_015730	TCA	2	6	962534	962539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18247	NC_015730	GT	3	6	962561	962566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18248	NC_015730	CGA	2	6	962586	962591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18368	NC_015730	GGA	2	6	968455	968460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18492	NC_015730	GGA	2	6	974119	974124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_015730	CGGCGC	2	12	974157	974168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18494	NC_015730	GGC	2	6	974175	974180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18495	NC_015730	CG	3	6	974249	974254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18496	NC_015730	CGC	2	6	974339	974344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18497	NC_015730	TCG	2	6	974382	974387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18498	NC_015730	AAT	2	6	974459	974464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18499	NC_015730	CAC	2	6	974503	974508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18500	NC_015730	GC	3	6	974616	974621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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