MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 127899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	CT	3	6	75	80	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015703	T	6	6	96	101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015703	T	7	7	131	137	0 %	100 %	0 %	0 %	338209546
4	NC_015703	TGT	2	6	152	157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209546
5	NC_015703	TTC	2	6	282	287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
6	NC_015703	GAA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209546
7	NC_015703	TGC	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209546
8	NC_015703	CAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
9	NC_015703	GGT	2	6	390	395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209546
10	NC_015703	ACC	2	6	429	434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209546
11	NC_015703	GCC	2	6	447	452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
12	NC_015703	A	7	7	482	488	100 %	0 %	0 %	0 %	338209546
13	NC_015703	TCG	2	6	519	524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209546
14	NC_015703	CCTA	2	8	546	553	25 %	25 %	0 %	50 %	338209546
15	NC_015703	CGGC	2	8	601	608	0 %	0 %	50 %	50 %	338209546
16	NC_015703	CCT	2	6	637	642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209546
17	NC_015703	GTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209546
18	NC_015703	CGG	2	6	662	667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209546
19	NC_015703	CCA	3	9	722	730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209546
20	NC_015703	TTC	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
21	NC_015703	GAAAA	2	10	874	883	80 %	0 %	20 %	0 %	338209546
22	NC_015703	A	6	6	880	885	100 %	0 %	0 %	0 %	338209546
23	NC_015703	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209546
24	NC_015703	ATC	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
25	NC_015703	CCG	2	6	956	961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
26	NC_015703	GAGT	2	8	965	972	25 %	25 %	50 %	0 %	338209546
27	NC_015703	CAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
28	NC_015703	ATC	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209546
29	NC_015703	CGC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
30	NC_015703	TGA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209546
31	NC_015703	CCG	2	6	1252	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209546
32	NC_015703	TAT	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209546
33	NC_015703	AAGA	2	8	1347	1354	75 %	0 %	25 %	0 %	338209546
34	NC_015703	TCAT	2	8	1459	1466	25 %	50 %	0 %	25 %	338209546
35	NC_015703	GAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209546
36	NC_015703	A	6	6	1525	1530	100 %	0 %	0 %	0 %	338209546
37	NC_015703	TCA	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015703	CGC	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
39	NC_015703	CGC	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
40	NC_015703	TC	3	6	1682	1687	0 %	50 %	0 %	50 %	338209547
41	NC_015703	GGCA	2	8	1694	1701	25 %	0 %	50 %	25 %	338209547
42	NC_015703	GAAA	2	8	1754	1761	75 %	0 %	25 %	0 %	338209547
43	NC_015703	ACA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
44	NC_015703	GCT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209547
45	NC_015703	CATC	2	8	1819	1826	25 %	25 %	0 %	50 %	338209547
46	NC_015703	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209547
47	NC_015703	CCA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209547
48	NC_015703	TCAAC	2	10	2022	2031	40 %	20 %	0 %	40 %	338209547
49	NC_015703	CAA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
50	NC_015703	AGG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209547
51	NC_015703	GGCA	2	8	2139	2146	25 %	0 %	50 %	25 %	338209547
52	NC_015703	A	8	8	2189	2196	100 %	0 %	0 %	0 %	338209547
53	NC_015703	GA	3	6	2220	2225	50 %	0 %	50 %	0 %	338209547
54	NC_015703	GTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209547
55	NC_015703	GCC	2	6	2290	2295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209547
56	NC_015703	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209547
57	NC_015703	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	338209547
58	NC_015703	TCA	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209548
59	NC_015703	ATA	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209548
60	NC_015703	CTTT	2	8	2736	2743	0 %	75 %	0 %	25 %	338209548
61	NC_015703	TGT	3	9	2787	2795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209548
62	NC_015703	CAAT	2	8	2904	2911	50 %	25 %	0 %	25 %	338209548
63	NC_015703	TTG	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209548
64	NC_015703	CGGT	2	8	2991	2998	0 %	25 %	50 %	25 %	338209548
65	NC_015703	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	338209548
66	NC_015703	T	8	8	3116	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015703	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015703	ATC	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015703	CTT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209549
70	NC_015703	TCGC	2	8	3241	3248	0 %	25 %	25 %	50 %	338209549
71	NC_015703	TTA	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209549
72	NC_015703	GTT	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209549
73	NC_015703	A	6	6	3386	3391	100 %	0 %	0 %	0 %	338209549
74	NC_015703	TGCGC	2	10	3409	3418	0 %	20 %	40 %	40 %	338209549
75	NC_015703	CAA	2	6	3425	3430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209549
76	NC_015703	GGC	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209549
77	NC_015703	GGT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209549
78	NC_015703	TCA	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
79	NC_015703	GGGAA	2	10	3571	3580	40 %	0 %	60 %	0 %	338209549
80	NC_015703	GTG	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209549
81	NC_015703	CCTGA	2	10	3723	3732	20 %	20 %	20 %	40 %	338209549
82	NC_015703	TGAA	2	8	3760	3767	50 %	25 %	25 %	0 %	338209549
83	NC_015703	AACC	2	8	3818	3825	50 %	0 %	0 %	50 %	338209549
84	NC_015703	CAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
85	NC_015703	CTT	2	6	4079	4084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209549
86	NC_015703	ACT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209549
87	NC_015703	ACG	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209550
88	NC_015703	CCG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209550
89	NC_015703	AAAG	2	8	4379	4386	75 %	0 %	25 %	0 %	338209550
90	NC_015703	GGGCA	2	10	4430	4439	20 %	0 %	60 %	20 %	338209550
91	NC_015703	ACA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209550
92	NC_015703	ACA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209550
93	NC_015703	A	7	7	4614	4620	100 %	0 %	0 %	0 %	338209550
94	NC_015703	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	338209551
95	NC_015703	TCA	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209551
96	NC_015703	AAG	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209551
97	NC_015703	TCG	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209551
98	NC_015703	GTT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209551
99	NC_015703	ACG	3	9	5009	5017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209551
100	NC_015703	GGT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209551
101	NC_015703	GGCG	2	8	5124	5131	0 %	0 %	75 %	25 %	338209551
102	NC_015703	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209551
103	NC_015703	GAT	2	6	5274	5279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209551
104	NC_015703	GCC	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209551
105	NC_015703	C	6	6	5447	5452	0 %	0 %	0 %	100 %	338209551
106	NC_015703	ACA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209551
107	NC_015703	CGA	2	6	5493	5498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209551
108	NC_015703	CAA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209551
109	NC_015703	ATT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209551
110	NC_015703	GCC	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209551
111	NC_015703	TAA	2	6	5632	5637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209551
112	NC_015703	TTCC	2	8	5797	5804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015703	CTC	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015703	A	6	6	5826	5831	100 %	0 %	0 %	0 %	338209552
115	NC_015703	TATG	2	8	5835	5842	25 %	50 %	25 %	0 %	338209552
116	NC_015703	TCTT	2	8	5845	5852	0 %	75 %	0 %	25 %	338209552
117	NC_015703	CGG	2	6	5914	5919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209552
118	NC_015703	CAT	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
119	NC_015703	CCGA	2	8	6210	6217	25 %	0 %	25 %	50 %	338209552
120	NC_015703	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209552
121	NC_015703	GC	3	6	6256	6261	0 %	0 %	50 %	50 %	338209552
122	NC_015703	GC	3	6	6296	6301	0 %	0 %	50 %	50 %	338209552
123	NC_015703	A	6	6	6327	6332	100 %	0 %	0 %	0 %	338209552
124	NC_015703	ATG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209552
125	NC_015703	AGC	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
126	NC_015703	TGC	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209552
127	NC_015703	GAC	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
128	NC_015703	AGA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209552
129	NC_015703	GCC	2	6	6549	6554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209552
130	NC_015703	ACCGC	2	10	6595	6604	20 %	0 %	20 %	60 %	338209552
131	NC_015703	GCA	3	9	6625	6633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
132	NC_015703	GCC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209552
133	NC_015703	TCA	2	6	6823	6828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
134	NC_015703	CAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209552
135	NC_015703	TTTCC	2	10	6878	6887	0 %	60 %	0 %	40 %	338209552
136	NC_015703	CGA	3	9	6899	6907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
137	NC_015703	CAA	2	6	6923	6928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209552
138	NC_015703	ACG	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209552
139	NC_015703	TGAT	2	8	7132	7139	25 %	50 %	25 %	0 %	338209553
140	NC_015703	AAC	2	6	7165	7170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209553
141	NC_015703	CTT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209553
142	NC_015703	AAG	2	6	7450	7455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
143	NC_015703	GAA	3	9	7551	7559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
144	NC_015703	TGTA	2	8	7585	7592	25 %	50 %	25 %	0 %	338209553
145	NC_015703	TTGCCG	2	12	7660	7671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209553
146	NC_015703	ATGAA	2	10	7693	7702	60 %	20 %	20 %	0 %	338209553
147	NC_015703	GAA	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
148	NC_015703	GGAG	2	8	7790	7797	25 %	0 %	75 %	0 %	338209553
149	NC_015703	GGAA	2	8	7814	7821	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
150	NC_015703	GGAA	2	8	7826	7833	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
151	NC_015703	GGAA	2	8	7838	7845	50 %	0 %	50 %	0 %	338209553
152	NC_015703	GAA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209553
153	NC_015703	TGC	2	6	7945	7950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209553
154	NC_015703	GTCAGG	2	12	7989	8000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209554
155	NC_015703	TAA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
156	NC_015703	GCC	2	6	8024	8029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
157	NC_015703	ATA	2	6	8042	8047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
158	NC_015703	GCC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
159	NC_015703	TTG	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209554
160	NC_015703	CATC	2	8	8252	8259	25 %	25 %	0 %	50 %	338209554
161	NC_015703	CAT	2	6	8287	8292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209554
162	NC_015703	CTT	2	6	8296	8301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209554
163	NC_015703	GCT	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209554
164	NC_015703	GTA	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
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167	NC_015703	GCC	2	6	8786	8791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
168	NC_015703	CGC	2	6	8806	8811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
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170	NC_015703	CCG	2	6	8905	8910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
171	NC_015703	AAT	2	6	8938	8943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
172	NC_015703	CCCG	2	8	9017	9024	0 %	0 %	25 %	75 %	338209554
173	NC_015703	AAT	2	6	9070	9075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209554
174	NC_015703	CTGC	3	12	9133	9144	0 %	25 %	25 %	50 %	338209554
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176	NC_015703	GCC	2	6	9276	9281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209554
177	NC_015703	GTT	2	6	9523	9528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209554
178	NC_015703	TAG	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209554
179	NC_015703	ATT	2	6	9575	9580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209554
180	NC_015703	AACTC	2	10	9604	9613	40 %	20 %	0 %	40 %	338209554
181	NC_015703	GC	3	6	9704	9709	0 %	0 %	50 %	50 %	338209554
182	NC_015703	ACG	2	6	9743	9748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209554
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185	NC_015703	A	7	7	10310	10316	100 %	0 %	0 %	0 %	338209554
186	NC_015703	ACC	2	6	10413	10418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209554
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188	NC_015703	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_015703	CG	3	6	10609	10614	0 %	0 %	50 %	50 %	338209555
190	NC_015703	AAC	2	6	10626	10631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209555
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196	NC_015703	GGGCGA	2	12	10876	10887	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	338209555
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223	NC_015703	CAC	2	6	12224	12229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209555
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228	NC_015703	CAA	2	6	12454	12459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_015703	GAAA	2	8	12475	12482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
230	NC_015703	AACTA	2	10	12494	12503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
231	NC_015703	T	7	7	12504	12510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_015703	GAC	2	6	12514	12519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_015703	AAT	2	6	12565	12570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_015703	A	6	6	12610	12615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_015703	CTT	2	6	12652	12657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209556
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239	NC_015703	GAA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_015703	TCG	2	6	12840	12845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_015703	CAT	2	6	12905	12910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_015703	CAA	2	6	12925	12930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_015703	TA	3	6	13016	13021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_015703	A	6	6	13021	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_015703	A	6	6	13055	13060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_015703	TTG	2	6	13310	13315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_015703	A	6	6	13348	13353	100 %	0 %	0 %	0 %	338209557
248	NC_015703	GT	3	6	13451	13456	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
249	NC_015703	CGGA	2	8	13520	13527	25 %	0 %	50 %	25 %	338209557
250	NC_015703	CCAAC	2	10	13565	13574	40 %	0 %	0 %	60 %	338209557
251	NC_015703	ATCGAC	2	12	13579	13590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338209557
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254	NC_015703	TG	3	6	13809	13814	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
255	NC_015703	GAC	2	6	13837	13842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209557
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261	NC_015703	ACG	4	12	14156	14167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209557
262	NC_015703	CAA	2	6	14169	14174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209557
263	NC_015703	CGA	2	6	14223	14228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209557
264	NC_015703	TGC	2	6	14381	14386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209557
265	NC_015703	GAT	2	6	14406	14411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209557
266	NC_015703	TG	3	6	14535	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	338209557
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394	NC_015703	AATG	2	8	20517	20524	50 %	25 %	25 %	0 %	338209561
395	NC_015703	CAC	2	6	20544	20549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209561
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398	NC_015703	CGG	2	6	20952	20957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209561
399	NC_015703	ACG	3	9	20981	20989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209561
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