MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 2070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015693	CGGC	2	8	102249	102256	0 %	0 %	50 %	50 %	338209454
2002	NC_015693	CCG	3	9	102260	102268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209454
2003	NC_015693	CTT	2	6	102318	102323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209454
2004	NC_015693	A	6	6	102406	102411	100 %	0 %	0 %	0 %	338209454
2005	NC_015693	AAG	2	6	102429	102434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209454
2006	NC_015693	TGG	2	6	102477	102482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209454
2007	NC_015693	GTA	2	6	102526	102531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209454
2008	NC_015693	TGG	2	6	102705	102710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209454
2009	NC_015693	GTA	2	6	102721	102726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209454
2010	NC_015693	TCA	2	6	102861	102866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209454
2011	NC_015693	ATTT	2	8	102902	102909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_015693	A	6	6	102932	102937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015693	TCA	2	6	102949	102954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209455
2014	NC_015693	TGA	2	6	102963	102968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209455
2015	NC_015693	TAA	2	6	103012	103017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209455
2016	NC_015693	TGT	2	6	103024	103029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209455
2017	NC_015693	GAT	2	6	103064	103069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209455
2018	NC_015693	AAG	2	6	103092	103097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209455
2019	NC_015693	CCT	2	6	103102	103107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209455
2020	NC_015693	TCG	2	6	103218	103223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2021	NC_015693	T	6	6	103237	103242	0 %	100 %	0 %	0 %	338209455
2022	NC_015693	TGC	2	6	103272	103277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2023	NC_015693	CGC	2	6	103279	103284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209455
2024	NC_015693	TGT	2	6	103335	103340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209455
2025	NC_015693	CGT	2	6	103408	103413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2026	NC_015693	ACCG	2	8	103466	103473	25 %	0 %	25 %	50 %	338209455
2027	NC_015693	GGTATC	2	12	103493	103504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209455
2028	NC_015693	GTC	2	6	103571	103576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2029	NC_015693	GCC	2	6	103614	103619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209455
2030	NC_015693	GTA	2	6	103689	103694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209455
2031	NC_015693	TCA	2	6	103803	103808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209455
2032	NC_015693	T	6	6	103921	103926	0 %	100 %	0 %	0 %	338209455
2033	NC_015693	GCA	2	6	104036	104041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2034	NC_015693	ACC	2	6	104111	104116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209455
2035	NC_015693	TGG	2	6	104287	104292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209455
2036	NC_015693	GC	3	6	104366	104371	0 %	0 %	50 %	50 %	338209455
2037	NC_015693	T	6	6	104410	104415	0 %	100 %	0 %	0 %	338209455
2038	NC_015693	TTC	2	6	104541	104546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209455
2039	NC_015693	GTC	2	6	104618	104623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2040	NC_015693	CTG	2	6	104684	104689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2041	NC_015693	TGT	2	6	104740	104745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209455
2042	NC_015693	CTG	2	6	104778	104783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2043	NC_015693	T	6	6	104906	104911	0 %	100 %	0 %	0 %	338209455
2044	NC_015693	CAT	2	6	104939	104944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209455
2045	NC_015693	TAAGG	2	10	105043	105052	40 %	20 %	40 %	0 %	338209455
2046	NC_015693	CAG	2	6	105056	105061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209455
2047	NC_015693	CCT	2	6	105139	105144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209455
2048	NC_015693	TTTTA	2	10	105239	105248	20 %	80 %	0 %	0 %	338209456
2049	NC_015693	TAT	2	6	105294	105299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209456
2050	NC_015693	T	6	6	105303	105308	0 %	100 %	0 %	0 %	338209456
2051	NC_015693	T	6	6	105520	105525	0 %	100 %	0 %	0 %	338209456
2052	NC_015693	CTT	2	6	105564	105569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209456
2053	NC_015693	CTTTT	2	10	105628	105637	0 %	80 %	0 %	20 %	338209456
2054	NC_015693	CTT	2	6	105891	105896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209456
2055	NC_015693	TTGGT	2	10	105902	105911	0 %	60 %	40 %	0 %	338209456
2056	NC_015693	ATC	2	6	105944	105949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209456
2057	NC_015693	TGC	2	6	106182	106187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209456
2058	NC_015693	TG	3	6	106266	106271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209456
2059	NC_015693	T	6	6	106291	106296	0 %	100 %	0 %	0 %	338209456
2060	NC_015693	T	7	7	106328	106334	0 %	100 %	0 %	0 %	338209456
2061	NC_015693	TAT	2	6	106407	106412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209456
2062	NC_015693	ATGG	2	8	106469	106476	25 %	25 %	50 %	0 %	338209456
2063	NC_015693	TGG	2	6	106533	106538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209456
2064	NC_015693	CGT	2	6	106557	106562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209456
2065	NC_015693	TAA	2	6	106586	106591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209456
2066	NC_015693	CGGT	2	8	106666	106673	0 %	25 %	50 %	25 %	338209456
2067	NC_015693	TAA	2	6	106766	106771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209456
2068	NC_015693	TCGGG	2	10	106794	106803	0 %	20 %	60 %	20 %	338209456
2069	NC_015693	AAGCA	2	10	106885	106894	60 %	0 %	20 %	20 %	338209456
2070	NC_015693	T	6	6	106904	106909	0 %	100 %	0 %	0 %	338209456

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.