MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 2631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015063	CAT	2	6	76247	76252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_015063	A	6	6	76280	76285	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
1503	NC_015063	ACC	2	6	76304	76309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836439
1504	NC_015063	AGA	2	6	76316	76321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836439
1505	NC_015063	TA	3	6	76339	76344	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
1506	NC_015063	AAT	2	6	76352	76357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836439
1507	NC_015063	TGAAA	2	10	76360	76369	60 %	20 %	20 %	0 %	322836439
1508	NC_015063	AT	3	6	76384	76389	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
1509	NC_015063	A	6	6	76408	76413	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
1510	NC_015063	A	6	6	76416	76421	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
1511	NC_015063	GTT	2	6	76427	76432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836439
1512	NC_015063	TCA	2	6	76454	76459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836439
1513	NC_015063	TTA	2	6	76473	76478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836439
1514	NC_015063	A	8	8	76498	76505	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
1515	NC_015063	CCT	2	6	76506	76511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836439
1516	NC_015063	G	8	8	76561	76568	0 %	0 %	100 %	0 %	322836439
1517	NC_015063	AAAATT	2	12	76672	76683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836439
1518	NC_015063	T	7	7	76696	76702	0 %	100 %	0 %	0 %	322836439
1519	NC_015063	GCG	2	6	76724	76729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836439
1520	NC_015063	ATT	2	6	76757	76762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836439
1521	NC_015063	ATC	2	6	76765	76770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836439
1522	NC_015063	A	6	6	76784	76789	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
1523	NC_015063	TAAA	2	8	76815	76822	75 %	25 %	0 %	0 %	322836439
1524	NC_015063	ATG	2	6	76835	76840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836439
1525	NC_015063	T	8	8	76859	76866	0 %	100 %	0 %	0 %	322836439
1526	NC_015063	ATT	2	6	76892	76897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836439
1527	NC_015063	CAT	2	6	76928	76933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015063	CTTAAA	2	12	76958	76969	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1529	NC_015063	ATT	2	6	76970	76975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015063	AATG	2	8	76994	77001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015063	GAG	2	6	77096	77101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015063	ATA	2	6	77188	77193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015063	CTA	2	6	77200	77205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_015063	T	6	6	77219	77224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015063	TAATA	2	10	77254	77263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015063	AAC	2	6	77328	77333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_015063	ATA	2	6	77350	77355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015063	TGAA	2	8	77438	77445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015063	TCT	2	6	77451	77456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_015063	ACT	2	6	77550	77555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_015063	CAT	2	6	77686	77691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836440
1542	NC_015063	GCC	2	6	77758	77763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836440
1543	NC_015063	GCA	2	6	77831	77836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836440
1544	NC_015063	GT	3	6	77890	77895	0 %	50 %	50 %	0 %	322836440
1545	NC_015063	CGGT	2	8	77974	77981	0 %	25 %	50 %	25 %	322836440
1546	NC_015063	GC	3	6	77994	77999	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
1547	NC_015063	CGT	2	6	78028	78033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836440
1548	NC_015063	CCA	2	6	78056	78061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836440
1549	NC_015063	ACTG	2	8	78071	78078	25 %	25 %	25 %	25 %	322836440
1550	NC_015063	CGG	2	6	78125	78130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836440
1551	NC_015063	CGC	2	6	78150	78155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836440
1552	NC_015063	GTT	2	6	78167	78172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836440
1553	NC_015063	AGC	2	6	78316	78321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836440
1554	NC_015063	GC	3	6	78320	78325	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
1555	NC_015063	CAG	2	6	78339	78344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836440
1556	NC_015063	GCC	2	6	78394	78399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836440
1557	NC_015063	TGA	2	6	78433	78438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836440
1558	NC_015063	AGG	2	6	78441	78446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836440
1559	NC_015063	ATG	2	6	78651	78656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836441
1560	NC_015063	GTCATA	2	12	78719	78730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322836441
1561	NC_015063	TG	3	6	78739	78744	0 %	50 %	50 %	0 %	322836441
1562	NC_015063	CT	4	8	78761	78768	0 %	50 %	0 %	50 %	322836441
1563	NC_015063	GGGT	2	8	78877	78884	0 %	25 %	75 %	0 %	322836441
1564	NC_015063	ATT	2	6	78896	78901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836441
1565	NC_015063	ACA	2	6	78918	78923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836441
1566	NC_015063	CAG	2	6	78950	78955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836441
1567	NC_015063	T	6	6	78997	79002	0 %	100 %	0 %	0 %	322836441
1568	NC_015063	CTT	2	6	79012	79017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836441
1569	NC_015063	CCA	2	6	79194	79199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_015063	AAC	2	6	79266	79271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_015063	AGC	2	6	79300	79305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015063	A	6	6	79426	79431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015063	CG	3	6	79523	79528	0 %	0 %	50 %	50 %	322836442
1574	NC_015063	ATG	2	6	79573	79578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836442
1575	NC_015063	GTTC	2	8	79621	79628	0 %	50 %	25 %	25 %	322836442
1576	NC_015063	AAG	2	6	79631	79636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836442
1577	NC_015063	TGA	2	6	79655	79660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836442
1578	NC_015063	CCT	2	6	79732	79737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836442
1579	NC_015063	TTA	2	6	79933	79938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836442
1580	NC_015063	TAT	2	6	79965	79970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836442
1581	NC_015063	GACAGA	2	12	80019	80030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322836442
1582	NC_015063	GCG	2	6	80099	80104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836442
1583	NC_015063	CTG	2	6	80133	80138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836442
1584	NC_015063	CCT	2	6	80173	80178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836442
1585	NC_015063	CT	3	6	80282	80287	0 %	50 %	0 %	50 %	322836442
1586	NC_015063	ATA	2	6	80368	80373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836442
1587	NC_015063	GT	3	6	80509	80514	0 %	50 %	50 %	0 %	322836443
1588	NC_015063	A	6	6	80525	80530	100 %	0 %	0 %	0 %	322836443
1589	NC_015063	CAT	2	6	80558	80563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836443
1590	NC_015063	TGT	2	6	80629	80634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836443
1591	NC_015063	GGA	2	6	80783	80788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836443
1592	NC_015063	ATC	2	6	80805	80810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836443
1593	NC_015063	A	6	6	80933	80938	100 %	0 %	0 %	0 %	322836443
1594	NC_015063	TGC	2	6	80968	80973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836443
1595	NC_015063	CATT	2	8	80992	80999	25 %	50 %	0 %	25 %	322836443
1596	NC_015063	TCGC	2	8	81161	81168	0 %	25 %	25 %	50 %	322836444
1597	NC_015063	CAGC	2	8	81182	81189	25 %	0 %	25 %	50 %	322836444
1598	NC_015063	GAC	2	6	81437	81442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836444
1599	NC_015063	ATC	2	6	81497	81502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836444
1600	NC_015063	GAC	2	6	81503	81508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836444
1601	NC_015063	CGT	2	6	81544	81549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836444
1602	NC_015063	TTGA	2	8	81572	81579	25 %	50 %	25 %	0 %	322836444
1603	NC_015063	GTT	2	6	81625	81630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836444
1604	NC_015063	CGA	2	6	81639	81644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836444
1605	NC_015063	ACAG	2	8	81658	81665	50 %	0 %	25 %	25 %	322836444
1606	NC_015063	CTGC	2	8	81704	81711	0 %	25 %	25 %	50 %	322836444
1607	NC_015063	CTT	2	6	81728	81733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836444
1608	NC_015063	TCAG	2	8	81765	81772	25 %	25 %	25 %	25 %	322836444
1609	NC_015063	TCA	2	6	81789	81794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836444
1610	NC_015063	CGT	2	6	81795	81800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836444
1611	NC_015063	T	7	7	81926	81932	0 %	100 %	0 %	0 %	322836445
1612	NC_015063	GAC	2	6	81990	81995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836445
1613	NC_015063	TAA	2	6	82070	82075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836445
1614	NC_015063	GAT	2	6	82150	82155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836445
1615	NC_015063	GAATC	2	10	82168	82177	40 %	20 %	20 %	20 %	322836445
1616	NC_015063	GCA	2	6	82335	82340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836446
1617	NC_015063	AAG	2	6	82348	82353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836446
1618	NC_015063	A	6	6	82364	82369	100 %	0 %	0 %	0 %	322836446
1619	NC_015063	AGA	3	9	82414	82422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836446
1620	NC_015063	AAT	2	6	82584	82589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836446
1621	NC_015063	CCT	2	6	82591	82596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_015063	GGA	2	6	82656	82661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015063	ATTG	2	8	82663	82670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015063	AG	3	6	82683	82688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015063	TGT	2	6	82737	82742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015063	A	7	7	82800	82806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015063	TGG	2	6	82844	82849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015063	TCG	2	6	82876	82881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_015063	CTT	2	6	82988	82993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836447
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