MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015062	GGCA	2	8	571384	571391	25 %	0 %	50 %	25 %	322835678
11502	NC_015062	ATT	2	6	571410	571415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835678
11503	NC_015062	GA	3	6	571446	571451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_015062	GAC	2	6	571585	571590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835679
11505	NC_015062	TGCA	2	8	571620	571627	25 %	25 %	25 %	25 %	322835679
11506	NC_015062	TTG	2	6	571655	571660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835679
11507	NC_015062	A	6	6	571679	571684	100 %	0 %	0 %	0 %	322835679
11508	NC_015062	TCT	2	6	571715	571720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835679
11509	NC_015062	A	7	7	572034	572040	100 %	0 %	0 %	0 %	322835680
11510	NC_015062	CAT	2	6	572053	572058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835680
11511	NC_015062	GGC	2	6	572146	572151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835680
11512	NC_015062	GAT	2	6	572207	572212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835680
11513	NC_015062	TGC	2	6	572229	572234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835680
11514	NC_015062	T	6	6	572272	572277	0 %	100 %	0 %	0 %	322835680
11515	NC_015062	AGG	2	6	572307	572312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835680
11516	NC_015062	GGA	2	6	572317	572322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835680
11517	NC_015062	ACTCA	2	10	572328	572337	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11518	NC_015062	ATG	2	6	572437	572442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_015062	GAT	2	6	572555	572560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835681
11520	NC_015062	GTC	2	6	572585	572590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11521	NC_015062	GCT	2	6	572636	572641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11522	NC_015062	ACC	2	6	572663	572668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835681
11523	NC_015062	GCC	2	6	572675	572680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835681
11524	NC_015062	GCA	3	9	572753	572761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11525	NC_015062	CG	4	8	572785	572792	0 %	0 %	50 %	50 %	322835681
11526	NC_015062	GC	3	6	572810	572815	0 %	0 %	50 %	50 %	322835681
11527	NC_015062	TAA	2	6	572824	572829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835681
11528	NC_015062	TGA	2	6	572986	572991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835681
11529	NC_015062	GCT	2	6	573083	573088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11530	NC_015062	GGC	2	6	573136	573141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835681
11531	NC_015062	CTGG	2	8	573182	573189	0 %	25 %	50 %	25 %	322835681
11532	NC_015062	TCGA	2	8	573191	573198	25 %	25 %	25 %	25 %	322835681
11533	NC_015062	CG	3	6	573252	573257	0 %	0 %	50 %	50 %	322835681
11534	NC_015062	TGGC	2	8	573275	573282	0 %	25 %	50 %	25 %	322835681
11535	NC_015062	GTG	2	6	573340	573345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835681
11536	NC_015062	CAG	2	6	573368	573373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11537	NC_015062	TCT	2	6	573412	573417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835681
11538	NC_015062	ATT	2	6	573449	573454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835681
11539	NC_015062	TTC	2	6	573477	573482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835681
11540	NC_015062	GGAA	2	8	573504	573511	50 %	0 %	50 %	0 %	322835681
11541	NC_015062	A	6	6	573566	573571	100 %	0 %	0 %	0 %	322835681
11542	NC_015062	ATG	2	6	573687	573692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835681
11543	NC_015062	CAT	2	6	573790	573795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835681
11544	NC_015062	CTT	2	6	573826	573831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835681
11545	NC_015062	GCTGG	2	10	573916	573925	0 %	20 %	60 %	20 %	322835681
11546	NC_015062	GGC	3	9	574129	574137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835681
11547	NC_015062	CGG	2	6	574168	574173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835681
11548	NC_015062	GCA	2	6	574281	574286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11549	NC_015062	CAG	2	6	574310	574315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835681
11550	NC_015062	CG	3	6	574353	574358	0 %	0 %	50 %	50 %	322835681
11551	NC_015062	CAA	2	6	574412	574417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835681
11552	NC_015062	TC	3	6	574446	574451	0 %	50 %	0 %	50 %	322835682
11553	NC_015062	TTA	2	6	574505	574510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835682
11554	NC_015062	CCG	2	6	574623	574628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835682
11555	NC_015062	GTG	2	6	574639	574644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835682
11556	NC_015062	GAAA	2	8	574728	574735	75 %	0 %	25 %	0 %	322835682
11557	NC_015062	CAC	2	6	574836	574841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835682
11558	NC_015062	ACCCTC	2	12	574873	574884	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	322835682
11559	NC_015062	CA	3	6	574899	574904	50 %	0 %	0 %	50 %	322835682
11560	NC_015062	GCC	2	6	574924	574929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835682
11561	NC_015062	AGT	2	6	575017	575022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835682
11562	NC_015062	CAG	2	6	575063	575068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835683
11563	NC_015062	CAG	2	6	575163	575168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835683
11564	NC_015062	CTG	2	6	575215	575220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835683
11565	NC_015062	TGCG	2	8	575262	575269	0 %	25 %	50 %	25 %	322835683
11566	NC_015062	AAC	2	6	575310	575315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835683
11567	NC_015062	GAT	2	6	575388	575393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835684
11568	NC_015062	CT	3	6	575412	575417	0 %	50 %	0 %	50 %	322835684
11569	NC_015062	A	6	6	575443	575448	100 %	0 %	0 %	0 %	322835684
11570	NC_015062	GCCA	2	8	575450	575457	25 %	0 %	25 %	50 %	322835684
11571	NC_015062	TTG	2	6	575473	575478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835684
11572	NC_015062	ACAGA	2	10	575513	575522	60 %	0 %	20 %	20 %	322835684
11573	NC_015062	GAT	2	6	575615	575620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835684
11574	NC_015062	CCG	2	6	575809	575814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835684
11575	NC_015062	AAC	2	6	575868	575873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835684
11576	NC_015062	TGG	2	6	575919	575924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835684
11577	NC_015062	GTT	2	6	575979	575984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835684
11578	NC_015062	CAG	2	6	576018	576023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835684
11579	NC_015062	G	6	6	576078	576083	0 %	0 %	100 %	0 %	322835684
11580	NC_015062	TCAA	2	8	576225	576232	50 %	25 %	0 %	25 %	322835684
11581	NC_015062	ATGG	2	8	576234	576241	25 %	25 %	50 %	0 %	322835684
11582	NC_015062	ATAA	2	8	576354	576361	75 %	25 %	0 %	0 %	322835684
11583	NC_015062	TAACAA	2	12	576387	576398	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	322835685
11584	NC_015062	CTTT	2	8	576447	576454	0 %	75 %	0 %	25 %	322835685
11585	NC_015062	A	6	6	576510	576515	100 %	0 %	0 %	0 %	322835685
11586	NC_015062	ATG	2	6	576554	576559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835685
11587	NC_015062	A	6	6	576623	576628	100 %	0 %	0 %	0 %	322835685
11588	NC_015062	AGT	2	6	576646	576651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835685
11589	NC_015062	AAT	2	6	576724	576729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_015062	GCG	2	6	576797	576802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835686
11591	NC_015062	GAT	2	6	576851	576856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835686
11592	NC_015062	A	6	6	576901	576906	100 %	0 %	0 %	0 %	322835686
11593	NC_015062	TAA	2	6	576942	576947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835686
11594	NC_015062	TCA	2	6	577059	577064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835686
11595	NC_015062	TCT	2	6	577150	577155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_015062	CGC	2	6	577163	577168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_015062	T	6	6	577176	577181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_015062	CGC	2	6	577246	577251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835687
11599	NC_015062	ATC	2	6	577298	577303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835687
11600	NC_015062	TGA	2	6	577366	577371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835687
11601	NC_015062	CTG	2	6	577403	577408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835687
11602	NC_015062	GCG	3	9	577434	577442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835687
11603	NC_015062	TGG	2	6	577517	577522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835687
11604	NC_015062	GAC	2	6	577655	577660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835687
11605	NC_015062	CA	3	6	577690	577695	50 %	0 %	0 %	50 %	322835687
11606	NC_015062	TCG	2	6	577707	577712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835687
11607	NC_015062	CGG	2	6	577755	577760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835687
11608	NC_015062	ATGG	2	8	577786	577793	25 %	25 %	50 %	0 %	322835687
11609	NC_015062	GGC	2	6	577907	577912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835687
11610	NC_015062	CTT	2	6	578060	578065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835688
11611	NC_015062	CCG	2	6	578098	578103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835688
11612	NC_015062	CAGT	2	8	578118	578125	25 %	25 %	25 %	25 %	322835688
11613	NC_015062	AAAGC	2	10	578132	578141	60 %	0 %	20 %	20 %	322835688
11614	NC_015062	AC	3	6	578322	578327	50 %	0 %	0 %	50 %	322835689
11615	NC_015062	GC	3	6	578364	578369	0 %	0 %	50 %	50 %	322835689
11616	NC_015062	TGG	2	6	578466	578471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835689
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11619	NC_015062	TC	3	6	578532	578537	0 %	50 %	0 %	50 %	322835689
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11986	NC_015062	TAA	2	6	597122	597127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835706
11987	NC_015062	TGA	2	6	597156	597161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835706
11988	NC_015062	GGT	2	6	597262	597267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835706
11989	NC_015062	GTG	2	6	597275	597280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835706
11990	NC_015062	GCA	2	6	597297	597302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835706
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12000	NC_015062	CAG	3	9	597598	597606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835706

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