MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015062	TCCG	2	8	521683	521690	0 %	25 %	25 %	50 %	322835607
10502	NC_015062	ATC	2	6	521754	521759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835607
10503	NC_015062	TCC	2	6	521814	521819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835607
10504	NC_015062	GTG	2	6	521838	521843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835607
10505	NC_015062	GC	3	6	521883	521888	0 %	0 %	50 %	50 %	322835607
10506	NC_015062	CTG	2	6	521916	521921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835607
10507	NC_015062	GACC	2	8	521930	521937	25 %	0 %	25 %	50 %	322835607
10508	NC_015062	CTG	2	6	521940	521945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835607
10509	NC_015062	AAAGC	2	10	521953	521962	60 %	0 %	20 %	20 %	322835607
10510	NC_015062	AAC	2	6	522043	522048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835607
10511	NC_015062	GC	3	6	522097	522102	0 %	0 %	50 %	50 %	322835608
10512	NC_015062	GACTG	2	10	522195	522204	20 %	20 %	40 %	20 %	322835608
10513	NC_015062	GAA	2	6	522215	522220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835608
10514	NC_015062	TCA	2	6	522282	522287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835608
10515	NC_015062	GCTGGC	2	12	522313	522324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835608
10516	NC_015062	CAGC	2	8	522358	522365	25 %	0 %	25 %	50 %	322835608
10517	NC_015062	GCT	2	6	522366	522371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10518	NC_015062	GCC	2	6	522373	522378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835608
10519	NC_015062	GCC	2	6	522383	522388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835608
10520	NC_015062	CAG	2	6	522392	522397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10521	NC_015062	CAG	2	6	522401	522406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10522	NC_015062	AGAA	2	8	522493	522500	75 %	0 %	25 %	0 %	322835608
10523	NC_015062	CA	3	6	522517	522522	50 %	0 %	0 %	50 %	322835608
10524	NC_015062	ATT	2	6	522570	522575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835608
10525	NC_015062	CTC	2	6	522657	522662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835608
10526	NC_015062	TGAG	2	8	522669	522676	25 %	25 %	50 %	0 %	322835608
10527	NC_015062	CTG	2	6	522692	522697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10528	NC_015062	GCT	2	6	522788	522793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10529	NC_015062	GCG	2	6	522818	522823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835608
10530	NC_015062	AAAT	2	8	522903	522910	75 %	25 %	0 %	0 %	322835608
10531	NC_015062	GGC	2	6	522973	522978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835608
10532	NC_015062	AAC	2	6	523002	523007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835608
10533	NC_015062	TGC	2	6	523020	523025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835608
10534	NC_015062	ATC	2	6	523047	523052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835608
10535	NC_015062	TGCT	2	8	523146	523153	0 %	50 %	25 %	25 %	322835608
10536	NC_015062	TGA	2	6	523165	523170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835608
10537	NC_015062	AT	3	6	523213	523218	50 %	50 %	0 %	0 %	322835608
10538	NC_015062	TCAG	2	8	523308	523315	25 %	25 %	25 %	25 %	322835608
10539	NC_015062	ATT	2	6	523348	523353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835608
10540	NC_015062	TATT	2	8	523403	523410	25 %	75 %	0 %	0 %	322835608
10541	NC_015062	GAA	2	6	523425	523430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835608
10542	NC_015062	TTA	2	6	523432	523437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_015062	A	6	6	523474	523479	100 %	0 %	0 %	0 %	322835609
10544	NC_015062	GAA	2	6	523518	523523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835609
10545	NC_015062	A	7	7	523540	523546	100 %	0 %	0 %	0 %	322835609
10546	NC_015062	CTG	2	6	523552	523557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835609
10547	NC_015062	ATT	2	6	523636	523641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835609
10548	NC_015062	TTCA	2	8	523647	523654	25 %	50 %	0 %	25 %	322835609
10549	NC_015062	ATT	2	6	523722	523727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835609
10550	NC_015062	ATGGT	2	10	523823	523832	20 %	40 %	40 %	0 %	322835609
10551	NC_015062	AGAA	2	8	523883	523890	75 %	0 %	25 %	0 %	322835609
10552	NC_015062	GGT	2	6	523903	523908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835609
10553	NC_015062	GTC	2	6	523985	523990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835609
10554	NC_015062	AGTT	2	8	524117	524124	25 %	50 %	25 %	0 %	322835609
10555	NC_015062	A	6	6	524134	524139	100 %	0 %	0 %	0 %	322835609
10556	NC_015062	AAT	2	6	524277	524282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_015062	GAC	2	6	524337	524342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_015062	ATC	2	6	524394	524399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835610
10559	NC_015062	GCT	2	6	524400	524405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10560	NC_015062	GC	3	6	524516	524521	0 %	0 %	50 %	50 %	322835610
10561	NC_015062	ACG	2	6	524606	524611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10562	NC_015062	GGC	2	6	524617	524622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835610
10563	NC_015062	CGG	2	6	524700	524705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835610
10564	NC_015062	CTT	2	6	524709	524714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835610
10565	NC_015062	GCT	2	6	524832	524837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10566	NC_015062	T	6	6	524839	524844	0 %	100 %	0 %	0 %	322835610
10567	NC_015062	AGA	2	6	524849	524854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835610
10568	NC_015062	TGG	2	6	524894	524899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835610
10569	NC_015062	GC	3	6	524918	524923	0 %	0 %	50 %	50 %	322835610
10570	NC_015062	CGG	2	6	524931	524936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835610
10571	NC_015062	TGG	2	6	525035	525040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835610
10572	NC_015062	TGA	2	6	525143	525148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835610
10573	NC_015062	ATT	2	6	525149	525154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835610
10574	NC_015062	GTT	2	6	525168	525173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835610
10575	NC_015062	CAGC	2	8	525177	525184	25 %	0 %	25 %	50 %	322835610
10576	NC_015062	CTG	2	6	525211	525216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10577	NC_015062	GCT	2	6	525240	525245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10578	NC_015062	TC	3	6	525302	525307	0 %	50 %	0 %	50 %	322835610
10579	NC_015062	GCC	2	6	525339	525344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835610
10580	NC_015062	ATT	2	6	525352	525357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835610
10581	NC_015062	GTC	2	6	525397	525402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10582	NC_015062	GCT	2	6	525408	525413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10583	NC_015062	TGA	2	6	525530	525535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835610
10584	NC_015062	GCTGG	2	10	525557	525566	0 %	20 %	60 %	20 %	322835610
10585	NC_015062	TGAT	2	8	525593	525600	25 %	50 %	25 %	0 %	322835610
10586	NC_015062	GTT	2	6	525606	525611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835610
10587	NC_015062	GGC	2	6	525640	525645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835610
10588	NC_015062	TGC	2	6	525716	525721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835610
10589	NC_015062	GCC	2	6	525780	525785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835610
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10591	NC_015062	CG	3	6	525818	525823	0 %	0 %	50 %	50 %	322835610
10592	NC_015062	GTT	2	6	525846	525851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835610
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10594	NC_015062	GTG	2	6	525889	525894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835610
10595	NC_015062	TGGC	2	8	525996	526003	0 %	25 %	50 %	25 %	322835610
10596	NC_015062	ATGA	2	8	526066	526073	50 %	25 %	25 %	0 %	322835610
10597	NC_015062	T	6	6	526081	526086	0 %	100 %	0 %	0 %	322835610
10598	NC_015062	CG	3	6	526091	526096	0 %	0 %	50 %	50 %	322835610
10599	NC_015062	TGCG	2	8	526178	526185	0 %	25 %	50 %	25 %	322835610
10600	NC_015062	CCA	2	6	526204	526209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835610
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10602	NC_015062	CCG	2	6	526265	526270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_015062	CGG	2	6	526284	526289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_015062	GCGGA	2	10	526308	526317	20 %	0 %	60 %	20 %	322835611
10605	NC_015062	GCT	2	6	526343	526348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835611
10606	NC_015062	GTTTGC	2	12	526445	526456	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322835611
10607	NC_015062	CG	3	6	526746	526751	0 %	0 %	50 %	50 %	322835611
10608	NC_015062	CAA	2	6	526788	526793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835611
10609	NC_015062	GCC	2	6	526807	526812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835611
10610	NC_015062	CGT	2	6	526911	526916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835611
10611	NC_015062	CGG	2	6	526983	526988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835611
10612	NC_015062	GCT	2	6	527024	527029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835611
10613	NC_015062	GA	3	6	527121	527126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_015062	TTC	2	6	527170	527175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_015062	TTTC	2	8	527188	527195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10616	NC_015062	GAA	2	6	527252	527257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835612
10617	NC_015062	GC	3	6	527325	527330	0 %	0 %	50 %	50 %	322835612
10618	NC_015062	CCG	2	6	527415	527420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835612
10619	NC_015062	ACG	2	6	527454	527459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835612
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10864	NC_015062	TGC	2	6	538948	538953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10986	NC_015062	GAT	2	6	544164	544169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835631
10987	NC_015062	GAAT	2	8	544325	544332	50 %	25 %	25 %	0 %	322835631
10988	NC_015062	CAA	2	6	544388	544393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835631
10989	NC_015062	GCT	2	6	544594	544599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835631
10990	NC_015062	ATC	2	6	544614	544619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835631
10991	NC_015062	AGC	2	6	544623	544628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835631
10992	NC_015062	T	6	6	544676	544681	0 %	100 %	0 %	0 %	322835631
10993	NC_015062	TTG	2	6	544709	544714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835631
10994	NC_015062	TCA	2	6	544774	544779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835631
10995	NC_015062	TAA	2	6	544802	544807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835631
10996	NC_015062	CGGT	2	8	544816	544823	0 %	25 %	50 %	25 %	322835631
10997	NC_015062	TGA	2	6	544864	544869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835631
10998	NC_015062	GC	3	6	544944	544949	0 %	0 %	50 %	50 %	322835631
10999	NC_015062	CAG	2	6	544968	544973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835631
11000	NC_015062	TTC	2	6	545055	545060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835631

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