MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015062	GT	3	6	349411	349416	0 %	50 %	50 %	0 %	322835458
7002	NC_015062	CTG	2	6	349435	349440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7003	NC_015062	CTG	2	6	349471	349476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7004	NC_015062	CGT	2	6	349485	349490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7005	NC_015062	AAC	2	6	349566	349571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835458
7006	NC_015062	ATC	2	6	349641	349646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835458
7007	NC_015062	ATC	2	6	349659	349664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835458
7008	NC_015062	ACT	2	6	349687	349692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835458
7009	NC_015062	CTG	2	6	349746	349751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7010	NC_015062	CAAA	2	8	349780	349787	75 %	0 %	0 %	25 %	322835458
7011	NC_015062	ATG	2	6	349849	349854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835458
7012	NC_015062	GGC	2	6	349908	349913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835458
7013	NC_015062	CTG	2	6	349950	349955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7014	NC_015062	ACC	2	6	349968	349973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835458
7015	NC_015062	TCA	2	6	350003	350008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835458
7016	NC_015062	GCTG	2	8	350045	350052	0 %	25 %	50 %	25 %	322835458
7017	NC_015062	CAA	2	6	350072	350077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835458
7018	NC_015062	TTG	2	6	350149	350154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835458
7019	NC_015062	TCCG	2	8	350236	350243	0 %	25 %	25 %	50 %	322835458
7020	NC_015062	ACCG	2	8	350421	350428	25 %	0 %	25 %	50 %	322835458
7021	NC_015062	GGT	2	6	350526	350531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835458
7022	NC_015062	AAC	2	6	350623	350628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835458
7023	NC_015062	A	6	6	350682	350687	100 %	0 %	0 %	0 %	322835458
7024	NC_015062	CGTG	2	8	350699	350706	0 %	25 %	50 %	25 %	322835458
7025	NC_015062	CCG	2	6	350770	350775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835458
7026	NC_015062	TTC	2	6	350784	350789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835458
7027	NC_015062	CAG	2	6	350866	350871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7028	NC_015062	GTT	2	6	350919	350924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835458
7029	NC_015062	GCA	2	6	350928	350933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7030	NC_015062	GTTC	2	8	350944	350951	0 %	50 %	25 %	25 %	322835458
7031	NC_015062	CAT	2	6	350972	350977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835458
7032	NC_015062	GACGCT	2	12	350994	351005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835458
7033	NC_015062	AAT	2	6	351007	351012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835458
7034	NC_015062	T	6	6	351057	351062	0 %	100 %	0 %	0 %	322835459
7035	NC_015062	TCA	2	6	351216	351221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835459
7036	NC_015062	CAC	2	6	351260	351265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835459
7037	NC_015062	TGA	2	6	351305	351310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835460
7038	NC_015062	CAA	2	6	351410	351415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835460
7039	NC_015062	TGCC	2	8	351430	351437	0 %	25 %	25 %	50 %	322835460
7040	NC_015062	TAA	2	6	351438	351443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835460
7041	NC_015062	TCG	2	6	351733	351738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835460
7042	NC_015062	TCA	2	6	351746	351751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835460
7043	NC_015062	GCA	2	6	351755	351760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835460
7044	NC_015062	AAG	2	6	351777	351782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835460
7045	NC_015062	AGC	2	6	351861	351866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835460
7046	NC_015062	ACTT	2	8	352016	352023	25 %	50 %	0 %	25 %	322835460
7047	NC_015062	TCA	2	6	352162	352167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835460
7048	NC_015062	CAT	3	9	352179	352187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835460
7049	NC_015062	CTTAC	2	10	352276	352285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7050	NC_015062	CAT	2	6	352318	352323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835461
7051	NC_015062	ATC	2	6	352422	352427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835461
7052	NC_015062	CAAA	2	8	352450	352457	75 %	0 %	0 %	25 %	322835461
7053	NC_015062	TAC	2	6	352548	352553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835461
7054	NC_015062	CAA	2	6	352591	352596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835461
7055	NC_015062	TTC	2	6	352682	352687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835461
7056	NC_015062	G	6	6	352721	352726	0 %	0 %	100 %	0 %	322835461
7057	NC_015062	AGG	2	6	352798	352803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835461
7058	NC_015062	GCG	2	6	352899	352904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835461
7059	NC_015062	ATG	2	6	352911	352916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835461
7060	NC_015062	TGGC	2	8	353043	353050	0 %	25 %	50 %	25 %	322835461
7061	NC_015062	ATG	2	6	353065	353070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835461
7062	NC_015062	AGG	2	6	353073	353078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_015062	GATC	2	8	353085	353092	25 %	25 %	25 %	25 %	322835462
7064	NC_015062	ATG	2	6	353192	353197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835462
7065	NC_015062	GCC	2	6	353199	353204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835462
7066	NC_015062	CACG	2	8	353286	353293	25 %	0 %	25 %	50 %	322835462
7067	NC_015062	AAAG	2	8	353314	353321	75 %	0 %	25 %	0 %	322835462
7068	NC_015062	TGA	2	6	353325	353330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835462
7069	NC_015062	GCA	2	6	353341	353346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835462
7070	NC_015062	TAT	2	6	353392	353397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835462
7071	NC_015062	TTA	2	6	353406	353411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835462
7072	NC_015062	GCA	2	6	353469	353474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835462
7073	NC_015062	TCA	2	6	353479	353484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835462
7074	NC_015062	GAT	2	6	353646	353651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835463
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7077	NC_015062	TGGGA	2	10	353860	353869	20 %	20 %	60 %	0 %	322835463
7078	NC_015062	TGT	2	6	353870	353875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835463
7079	NC_015062	GA	3	6	353989	353994	50 %	0 %	50 %	0 %	322835463
7080	NC_015062	GAC	2	6	354035	354040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835463
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7082	NC_015062	CT	3	6	354102	354107	0 %	50 %	0 %	50 %	322835463
7083	NC_015062	ATGT	2	8	354159	354166	25 %	50 %	25 %	0 %	322835463
7084	NC_015062	GC	3	6	354236	354241	0 %	0 %	50 %	50 %	322835463
7085	NC_015062	GCC	2	6	354354	354359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835463
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7087	NC_015062	GT	3	6	354475	354480	0 %	50 %	50 %	0 %	322835464
7088	NC_015062	CAGT	2	8	354504	354511	25 %	25 %	25 %	25 %	322835464
7089	NC_015062	GCC	2	6	354573	354578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835464
7090	NC_015062	CGA	2	6	354719	354724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835464
7091	NC_015062	GC	4	8	354811	354818	0 %	0 %	50 %	50 %	322835464
7092	NC_015062	CA	3	6	354869	354874	50 %	0 %	0 %	50 %	322835464
7093	NC_015062	GACA	2	8	354905	354912	50 %	0 %	25 %	25 %	322835464
7094	NC_015062	TCC	2	6	354960	354965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835464
7095	NC_015062	A	6	6	355064	355069	100 %	0 %	0 %	0 %	322835464
7096	NC_015062	GCC	2	6	355201	355206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835464
7097	NC_015062	TTTGCA	2	12	355225	355236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322835464
7098	NC_015062	TGG	2	6	355256	355261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_015062	TGA	2	6	355327	355332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_015062	TTG	2	6	355345	355350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_015062	GCAT	2	8	355476	355483	25 %	25 %	25 %	25 %	322835465
7102	NC_015062	CAT	2	6	355561	355566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835465
7103	NC_015062	TGA	2	6	355635	355640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835465
7104	NC_015062	CTGA	2	8	355723	355730	25 %	25 %	25 %	25 %	322835465
7105	NC_015062	TGT	2	6	355742	355747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835465
7106	NC_015062	GCAG	2	8	355756	355763	25 %	0 %	50 %	25 %	322835465
7107	NC_015062	GTA	2	6	355774	355779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835465
7108	NC_015062	AAG	2	6	355863	355868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835465
7109	NC_015062	CGC	2	6	355890	355895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835465
7110	NC_015062	CG	3	6	355913	355918	0 %	0 %	50 %	50 %	322835465
7111	NC_015062	TGC	2	6	355929	355934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835465
7112	NC_015062	ACCGA	2	10	355991	356000	40 %	0 %	20 %	40 %	322835465
7113	NC_015062	GAA	2	6	356012	356017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835465
7114	NC_015062	TAA	3	9	356053	356061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_015062	GTT	2	6	356182	356187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_015062	AAG	2	6	356241	356246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835466
7117	NC_015062	ATT	2	6	356287	356292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835466
7118	NC_015062	CAG	3	9	356421	356429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835466
7119	NC_015062	G	6	6	356429	356434	0 %	0 %	100 %	0 %	322835466
7120	NC_015062	AG	4	8	356810	356817	50 %	0 %	50 %	0 %	322835467
7121	NC_015062	AG	3	6	356819	356824	50 %	0 %	50 %	0 %	322835467
7122	NC_015062	CAG	2	6	356846	356851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835467
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7241	NC_015062	A	6	6	362572	362577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_015062	TAA	2	6	362578	362583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7243	NC_015062	CAT	2	6	362608	362613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835473
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7245	NC_015062	GGCT	2	8	362665	362672	0 %	25 %	50 %	25 %	322835473
7246	NC_015062	CGC	2	6	362691	362696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835473
7247	NC_015062	ATC	2	6	362708	362713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835473
7248	NC_015062	CATGAA	2	12	362716	362727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322835473
7249	NC_015062	CAA	2	6	362822	362827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835473
7250	NC_015062	ACG	2	6	362871	362876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7251	NC_015062	TCA	2	6	362886	362891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835473
7252	NC_015062	CTG	2	6	362940	362945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7253	NC_015062	TGTGG	2	10	362950	362959	0 %	40 %	60 %	0 %	322835473
7254	NC_015062	TCG	2	6	363069	363074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7255	NC_015062	ACCCAA	2	12	363085	363096	50 %	0 %	0 %	50 %	322835473
7256	NC_015062	GTG	2	6	363140	363145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835473
7257	NC_015062	GCTG	2	8	363201	363208	0 %	25 %	50 %	25 %	322835473
7258	NC_015062	CAAC	2	8	363210	363217	50 %	0 %	0 %	50 %	322835473
7259	NC_015062	TGA	2	6	363363	363368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835473
7260	NC_015062	A	6	6	363461	363466	100 %	0 %	0 %	0 %	322835473
7261	NC_015062	TTA	2	6	363475	363480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835473
7262	NC_015062	TGAT	2	8	363546	363553	25 %	50 %	25 %	0 %	322835473
7263	NC_015062	TGCC	2	8	363624	363631	0 %	25 %	25 %	50 %	322835473
7264	NC_015062	TAC	2	6	363715	363720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835473
7265	NC_015062	TACCGG	2	12	363811	363822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7266	NC_015062	GCG	2	6	363876	363881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835473
7267	NC_015062	GCG	2	6	363885	363890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835473
7268	NC_015062	CCGCAT	2	12	363896	363907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322835473
7269	NC_015062	GCT	2	6	364027	364032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7270	NC_015062	GAAACA	2	12	364048	364059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	322835473
7271	NC_015062	ACG	2	6	364086	364091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7272	NC_015062	CCA	2	6	364182	364187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835473
7273	NC_015062	CTG	2	6	364218	364223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835473
7274	NC_015062	CTG	4	12	364360	364371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835474
7275	NC_015062	T	6	6	364375	364380	0 %	100 %	0 %	0 %	322835474
7276	NC_015062	CGGAC	2	10	364422	364431	20 %	0 %	40 %	40 %	322835474
7277	NC_015062	GCT	2	6	364545	364550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835474
7278	NC_015062	CCA	2	6	364595	364600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835474
7279	NC_015062	GGC	3	9	364662	364670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835474
7280	NC_015062	CAT	2	6	364704	364709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835474
7281	NC_015062	ATG	2	6	364750	364755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835474
7282	NC_015062	CTGG	2	8	364776	364783	0 %	25 %	50 %	25 %	322835474
7283	NC_015062	CGG	2	6	364791	364796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835474
7284	NC_015062	ATC	2	6	364907	364912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835474
7285	NC_015062	ATC	2	6	365008	365013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835474
7286	NC_015062	CCGC	2	8	365015	365022	0 %	0 %	25 %	75 %	322835474
7287	NC_015062	TGG	2	6	365096	365101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835474
7288	NC_015062	GCT	2	6	365118	365123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835474
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7292	NC_015062	CT	3	6	365266	365271	0 %	50 %	0 %	50 %	322835474
7293	NC_015062	CTG	2	6	365275	365280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835474
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7295	NC_015062	CGGG	2	8	365385	365392	0 %	0 %	75 %	25 %	322835475
7296	NC_015062	TGA	2	6	365458	365463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835475
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7299	NC_015062	CGG	2	6	365693	365698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835475
7300	NC_015062	GCTGGC	2	12	365759	365770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835475
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7303	NC_015062	ATC	2	6	365973	365978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835475
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7305	NC_015062	CGTA	2	8	366090	366097	25 %	25 %	25 %	25 %	322835475
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7310	NC_015062	GCAG	2	8	366279	366286	25 %	0 %	50 %	25 %	322835476
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7321	NC_015062	TGA	2	6	366804	366809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835476
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7330	NC_015062	TCCGGT	2	12	367195	367206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835477
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7335	NC_015062	CAGCGC	2	12	367504	367515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322835477
7336	NC_015062	CTG	2	6	367555	367560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835477
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7341	NC_015062	AGGA	2	8	367847	367854	50 %	0 %	50 %	0 %	322835477
7342	NC_015062	CAC	2	6	367974	367979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835478
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7344	NC_015062	GCA	2	6	368087	368092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835478
7345	NC_015062	CCG	2	6	368119	368124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835478
7346	NC_015062	CAGC	2	8	368127	368134	25 %	0 %	25 %	50 %	322835478
7347	NC_015062	AGT	2	6	368180	368185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835478
7348	NC_015062	GCTGA	2	10	368234	368243	20 %	20 %	40 %	20 %	322835478
7349	NC_015062	CGG	2	6	368267	368272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
7350	NC_015062	CCG	2	6	368351	368356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835478
7351	NC_015062	CGC	2	6	368414	368419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835478
7352	NC_015062	TCA	2	6	368528	368533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
7353	NC_015062	GGT	2	6	368537	368542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835478
7354	NC_015062	CGC	2	6	368584	368589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835478
7355	NC_015062	GCG	2	6	368621	368626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
7356	NC_015062	GGT	2	6	368652	368657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835478
7357	NC_015062	CGG	2	6	368667	368672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835478
7358	NC_015062	TTC	2	6	368685	368690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835478
7359	NC_015062	TGC	2	6	368780	368785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835478
7360	NC_015062	TAT	2	6	368795	368800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835478
7361	NC_015062	CAG	2	6	368817	368822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835478
7362	NC_015062	TCTT	2	8	368902	368909	0 %	75 %	0 %	25 %	322835478
7363	NC_015062	T	6	6	368908	368913	0 %	100 %	0 %	0 %	322835478
7364	NC_015062	TCA	2	6	368920	368925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
7365	NC_015062	ATC	2	6	368928	368933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835478
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7486	NC_015062	GTT	3	9	374609	374617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835482
7487	NC_015062	CAG	2	6	374619	374624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835482
7488	NC_015062	ACC	3	9	374698	374706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835482
7489	NC_015062	CCG	2	6	374710	374715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835482
7490	NC_015062	GCA	2	6	374726	374731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835482
7491	NC_015062	CGG	2	6	374753	374758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835482
7492	NC_015062	GCA	2	6	374851	374856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835482
7493	NC_015062	GCTGA	2	10	374865	374874	20 %	20 %	40 %	20 %	322835482
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7500	NC_015062	CGG	2	6	375131	375136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835482

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