MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 12411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015062	CTT	2	6	325469	325474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835437
6502	NC_015062	CAA	2	6	325475	325480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835437
6503	NC_015062	CGG	2	6	325493	325498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835437
6504	NC_015062	GCC	2	6	325537	325542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835437
6505	NC_015062	CA	3	6	325608	325613	50 %	0 %	0 %	50 %	322835437
6506	NC_015062	TTC	2	6	325615	325620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835437
6507	NC_015062	CAC	2	6	325649	325654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835437
6508	NC_015062	GCAC	2	8	325657	325664	25 %	0 %	25 %	50 %	322835437
6509	NC_015062	CAA	2	6	325685	325690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835437
6510	NC_015062	ATTA	2	8	325734	325741	50 %	50 %	0 %	0 %	322835437
6511	NC_015062	CCGCG	2	10	325862	325871	0 %	0 %	40 %	60 %	322835437
6512	NC_015062	TGG	2	6	325964	325969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835437
6513	NC_015062	GC	4	8	326041	326048	0 %	0 %	50 %	50 %	322835437
6514	NC_015062	GC	3	6	326143	326148	0 %	0 %	50 %	50 %	322835437
6515	NC_015062	TG	3	6	326194	326199	0 %	50 %	50 %	0 %	322835437
6516	NC_015062	TGCG	2	8	326277	326284	0 %	25 %	50 %	25 %	322835437
6517	NC_015062	CTC	2	6	326307	326312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_015062	GCC	3	9	326458	326466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835438
6519	NC_015062	ACA	2	6	326497	326502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835438
6520	NC_015062	ATT	2	6	326538	326543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835438
6521	NC_015062	CAG	2	6	326576	326581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835438
6522	NC_015062	ACA	2	6	326600	326605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835438
6523	NC_015062	GAA	2	6	326626	326631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835438
6524	NC_015062	GC	3	6	326681	326686	0 %	0 %	50 %	50 %	322835438
6525	NC_015062	TGC	2	6	326843	326848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835438
6526	NC_015062	AGA	2	6	326880	326885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835438
6527	NC_015062	AGG	2	6	326933	326938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835438
6528	NC_015062	TCG	2	6	326982	326987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835438
6529	NC_015062	GAT	2	6	327010	327015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835438
6530	NC_015062	TG	3	6	327070	327075	0 %	50 %	50 %	0 %	322835438
6531	NC_015062	GGC	2	6	327082	327087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835438
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6534	NC_015062	GGC	2	6	327197	327202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835438
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6536	NC_015062	AAT	2	6	327281	327286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835438
6537	NC_015062	CCAGT	2	10	327290	327299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6538	NC_015062	CA	3	6	327314	327319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_015062	TAAA	2	8	327357	327364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_015062	TG	3	6	327370	327375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_015062	TGC	2	6	327399	327404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_015062	T	6	6	327420	327425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_015062	AGA	2	6	327430	327435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_015062	TCG	2	6	327442	327447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_015062	AAAAG	2	10	327505	327514	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015062	ATA	2	6	327533	327538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_015062	AG	3	6	327575	327580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_015062	TAA	2	6	327593	327598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_015062	TTA	2	6	327649	327654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_015062	AAT	2	6	327665	327670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_015062	CAT	2	6	327827	327832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835439
6552	NC_015062	AAT	2	6	327855	327860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835439
6553	NC_015062	GAA	2	6	327909	327914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835439
6554	NC_015062	ACTG	2	8	327926	327933	25 %	25 %	25 %	25 %	322835439
6555	NC_015062	TTG	2	6	327937	327942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835439
6556	NC_015062	GC	3	6	327966	327971	0 %	0 %	50 %	50 %	322835439
6557	NC_015062	GCA	2	6	327977	327982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835439
6558	NC_015062	CGA	2	6	327992	327997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835439
6559	NC_015062	TGA	2	6	328046	328051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835439
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6561	NC_015062	GAAA	2	8	328073	328080	75 %	0 %	25 %	0 %	322835439
6562	NC_015062	A	7	7	328143	328149	100 %	0 %	0 %	0 %	322835439
6563	NC_015062	AGC	2	6	328187	328192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835439
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6565	NC_015062	CG	3	6	328229	328234	0 %	0 %	50 %	50 %	322835439
6566	NC_015062	TGC	2	6	328253	328258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_015062	CTG	2	6	328318	328323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_015062	T	6	6	328358	328363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_015062	TAAG	2	8	328413	328420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_015062	CTGG	2	8	328489	328496	0 %	25 %	50 %	25 %	322835440
6571	NC_015062	GGT	2	6	328542	328547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835440
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6575	NC_015062	ATGT	2	8	328649	328656	25 %	50 %	25 %	0 %	322835440
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6579	NC_015062	TTA	2	6	328771	328776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835440
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6583	NC_015062	ATG	2	6	329061	329066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_015062	TAA	2	6	329097	329102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015062	TAC	2	6	329266	329271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835441
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6589	NC_015062	GATA	3	12	329479	329490	50 %	25 %	25 %	0 %	322835441
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6595	NC_015062	CTA	2	6	329655	329660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835442
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6597	NC_015062	AG	3	6	329677	329682	50 %	0 %	50 %	0 %	322835442
6598	NC_015062	TGA	2	6	329727	329732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835442
6599	NC_015062	A	6	6	329759	329764	100 %	0 %	0 %	0 %	322835442
6600	NC_015062	T	6	6	329955	329960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6603	NC_015062	CAT	2	6	330163	330168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835443
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6605	NC_015062	ATT	2	6	330480	330485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_015062	TGT	2	6	330515	330520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_015062	TAT	2	6	330543	330548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_015062	TTC	2	6	330643	330648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835444
6609	NC_015062	AC	3	6	330655	330660	50 %	0 %	0 %	50 %	322835444
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6611	NC_015062	CAA	2	6	330681	330686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835444
6612	NC_015062	GC	3	6	330712	330717	0 %	0 %	50 %	50 %	322835444
6613	NC_015062	AAT	2	6	330732	330737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835444
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6615	NC_015062	CAT	2	6	330765	330770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835444
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6621	NC_015062	AGC	3	9	330985	330993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835444
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6623	NC_015062	AAT	2	6	331113	331118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835444
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6749	NC_015062	TGGT	2	8	336632	336639	0 %	50 %	50 %	0 %	322835449
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6767	NC_015062	TCA	2	6	337427	337432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6865	NC_015062	TC	3	6	342092	342097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6869	NC_015062	GTC	2	6	342568	342573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835454
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6992	NC_015062	CAC	2	6	348830	348835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835458
6993	NC_015062	CGC	2	6	348880	348885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835458
6994	NC_015062	CTT	2	6	348899	348904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835458
6995	NC_015062	CTG	2	6	348921	348926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
6996	NC_015062	CTG	2	6	348990	348995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
6997	NC_015062	TGC	2	6	349070	349075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835458
6998	NC_015062	CGG	2	6	349078	349083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835458
6999	NC_015062	GGCC	2	8	349114	349121	0 %	0 %	50 %	50 %	322835458
7000	NC_015062	CGC	2	6	349303	349308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835458

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