MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015061	CAG	2	6	1024574	1024579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21002	NC_015061	CCA	2	6	1024639	1024644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831682
21003	NC_015061	TCT	2	6	1024657	1024662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
21004	NC_015061	TGC	2	6	1024706	1024711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21005	NC_015061	CAG	2	6	1024735	1024740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21006	NC_015061	GCC	2	6	1024790	1024795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831682
21007	NC_015061	CAG	2	6	1024853	1024858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21008	NC_015061	CCGG	2	8	1024947	1024954	0 %	0 %	50 %	50 %	322831682
21009	NC_015061	AATC	2	8	1024990	1024997	50 %	25 %	0 %	25 %	322831682
21010	NC_015061	TTC	2	6	1025108	1025113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
21011	NC_015061	CAG	2	6	1025123	1025128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21012	NC_015061	TCA	2	6	1025157	1025162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
21013	NC_015061	ATACCG	2	12	1025187	1025198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322831682
21014	NC_015061	GTG	2	6	1025214	1025219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831682
21015	NC_015061	GGATC	2	10	1025257	1025266	20 %	20 %	40 %	20 %	322831682
21016	NC_015061	GTT	2	6	1025291	1025296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831682
21017	NC_015061	TGG	2	6	1025359	1025364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831682
21018	NC_015061	GCA	2	6	1025374	1025379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831682
21019	NC_015061	TCA	2	6	1025394	1025399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831682
21020	NC_015061	CTT	2	6	1025455	1025460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831682
21021	NC_015061	ACTG	2	8	1025595	1025602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21022	NC_015061	TG	3	6	1025642	1025647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_015061	CGGGGA	2	12	1025690	1025701	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21024	NC_015061	GGC	2	6	1025720	1025725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21025	NC_015061	T	6	6	1025783	1025788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_015061	C	6	6	1025789	1025794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21027	NC_015061	ATT	2	6	1025795	1025800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_015061	T	7	7	1025799	1025805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21029	NC_015061	CTGG	2	8	1025822	1025829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21030	NC_015061	TGC	2	6	1025870	1025875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831683
21031	NC_015061	CG	3	6	1025883	1025888	0 %	0 %	50 %	50 %	322831683
21032	NC_015061	CTG	2	6	1025905	1025910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831683
21033	NC_015061	ATT	2	6	1025932	1025937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831683
21034	NC_015061	GTG	2	6	1025948	1025953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831683
21035	NC_015061	GTAT	2	8	1026010	1026017	25 %	50 %	25 %	0 %	322831683
21036	NC_015061	CGA	2	6	1026099	1026104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831683
21037	NC_015061	TGG	2	6	1026107	1026112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831683
21038	NC_015061	CGG	2	6	1026117	1026122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831683
21039	NC_015061	TCA	2	6	1026164	1026169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831683
21040	NC_015061	TGA	2	6	1026204	1026209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831683
21041	NC_015061	TCC	2	6	1026298	1026303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21042	NC_015061	TTA	2	6	1026357	1026362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_015061	CTG	2	6	1026454	1026459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21044	NC_015061	GGA	2	6	1026469	1026474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_015061	CAT	2	6	1026480	1026485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831684
21046	NC_015061	CCTT	2	8	1026520	1026527	0 %	50 %	0 %	50 %	322831684
21047	NC_015061	TCA	2	6	1026564	1026569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831684
21048	NC_015061	ATA	2	6	1026572	1026577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831684
21049	NC_015061	CCG	2	6	1026583	1026588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831684
21050	NC_015061	GATGTG	2	12	1026648	1026659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831684
21051	NC_015061	TGGAAG	2	12	1026677	1026688	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	322831684
21052	NC_015061	TGC	2	6	1026737	1026742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831684
21053	NC_015061	GCA	2	6	1026810	1026815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831684
21054	NC_015061	GCGA	2	8	1026847	1026854	25 %	0 %	50 %	25 %	322831684
21055	NC_015061	GCC	2	6	1026868	1026873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831684
21056	NC_015061	CGG	2	6	1027014	1027019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831684
21057	NC_015061	GT	3	6	1027084	1027089	0 %	50 %	50 %	0 %	322831684
21058	NC_015061	CAG	2	6	1027237	1027242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831684
21059	NC_015061	CCGCG	2	10	1027348	1027357	0 %	0 %	40 %	60 %	322831684
21060	NC_015061	GCT	2	6	1027395	1027400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831684
21061	NC_015061	TA	3	6	1027438	1027443	50 %	50 %	0 %	0 %	322831684
21062	NC_015061	AT	3	6	1027586	1027591	50 %	50 %	0 %	0 %	322831684
21063	NC_015061	AAGCT	2	10	1027607	1027616	40 %	20 %	20 %	20 %	322831684
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21066	NC_015061	CTGT	2	8	1027913	1027920	0 %	50 %	25 %	25 %	322831685
21067	NC_015061	TGG	2	6	1027963	1027968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831685
21068	NC_015061	GA	3	6	1028075	1028080	50 %	0 %	50 %	0 %	322831685
21069	NC_015061	GAC	2	6	1028088	1028093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831685
21070	NC_015061	CTG	2	6	1028156	1028161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831685
21071	NC_015061	GAA	2	6	1028173	1028178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831685
21072	NC_015061	TAC	2	6	1028207	1028212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21073	NC_015061	CAT	2	6	1028220	1028225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21074	NC_015061	TGC	2	6	1028229	1028234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21075	NC_015061	TAT	2	6	1028235	1028240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21076	NC_015061	CTG	2	6	1028270	1028275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21077	NC_015061	ACAAAG	2	12	1028278	1028289	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21078	NC_015061	CTT	2	6	1028295	1028300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21079	NC_015061	GGC	2	6	1028373	1028378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831686
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21083	NC_015061	GATTGT	2	12	1028453	1028464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322831686
21084	NC_015061	TGC	2	6	1028480	1028485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
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21086	NC_015061	CTG	2	6	1028541	1028546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21087	NC_015061	TGC	2	6	1028623	1028628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21088	NC_015061	GCT	2	6	1028690	1028695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21089	NC_015061	TTGCTG	2	12	1028814	1028825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322831686
21090	NC_015061	TGA	3	9	1028903	1028911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831686
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21099	NC_015061	ATG	2	6	1029183	1029188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831686
21100	NC_015061	GCT	2	6	1029203	1029208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21101	NC_015061	ATCCGC	2	12	1029258	1029269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322831686
21102	NC_015061	GCGAT	2	10	1029316	1029325	20 %	20 %	40 %	20 %	322831686
21103	NC_015061	TCA	2	6	1029341	1029346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831686
21104	NC_015061	CAG	2	6	1029351	1029356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21105	NC_015061	GAC	2	6	1029405	1029410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831686
21106	NC_015061	GCTGAT	2	12	1029516	1029527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322831687
21107	NC_015061	ATT	2	6	1029559	1029564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831687
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21117	NC_015061	CAC	2	6	1029880	1029885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831687
21118	NC_015061	GGA	2	6	1029924	1029929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831687
21119	NC_015061	GCC	2	6	1029946	1029951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831687
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21218	NC_015061	AAT	2	6	1035305	1035310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21219	NC_015061	ATA	2	6	1035358	1035363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21220	NC_015061	TAT	2	6	1035381	1035386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21221	NC_015061	TA	3	6	1035468	1035473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21222	NC_015061	TATT	2	8	1035504	1035511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21223	NC_015061	AAAT	2	8	1035575	1035582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21224	NC_015061	TCA	2	6	1035629	1035634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831694
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21232	NC_015061	GCA	2	6	1035953	1035958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831694
21233	NC_015061	CGC	2	6	1035989	1035994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831694
21234	NC_015061	CT	3	6	1036152	1036157	0 %	50 %	0 %	50 %	322831695
21235	NC_015061	CGAC	2	8	1036208	1036215	25 %	0 %	25 %	50 %	322831695
21236	NC_015061	GTC	2	6	1036229	1036234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831695
21237	NC_015061	CCG	2	6	1036321	1036326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831695
21238	NC_015061	AAG	2	6	1036448	1036453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831695
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21240	NC_015061	CAT	2	6	1036546	1036551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831695
21241	NC_015061	AGC	2	6	1036613	1036618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831695
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21243	NC_015061	AAG	2	6	1036639	1036644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831695
21244	NC_015061	CAGC	2	8	1036902	1036909	25 %	0 %	25 %	50 %	322831695
21245	NC_015061	GCG	2	6	1036912	1036917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831695
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21247	NC_015061	CAT	2	6	1037106	1037111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831695
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21251	NC_015061	GCA	2	6	1037225	1037230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831695
21252	NC_015061	TGA	2	6	1037268	1037273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831695
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21271	NC_015061	GAA	2	6	1038107	1038112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21272	NC_015061	GCA	2	6	1038117	1038122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21274	NC_015061	GCC	2	6	1038196	1038201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21277	NC_015061	A	6	6	1038278	1038283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21278	NC_015061	A	6	6	1038314	1038319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21279	NC_015061	GGC	2	6	1038333	1038338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21290	NC_015061	ACA	2	6	1038939	1038944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21291	NC_015061	ATT	2	6	1038954	1038959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21292	NC_015061	G	6	6	1039016	1039021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21293	NC_015061	AG	3	6	1039094	1039099	50 %	0 %	50 %	0 %	322831699
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21307	NC_015061	TAC	2	6	1039868	1039873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831699
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21335	NC_015061	TGAA	2	8	1040964	1040971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21336	NC_015061	GA	3	6	1041043	1041048	50 %	0 %	50 %	0 %	322831701
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21341	NC_015061	TGGA	2	8	1041425	1041432	25 %	25 %	50 %	0 %	322831701
21342	NC_015061	TGCC	2	8	1041460	1041467	0 %	25 %	25 %	50 %	322831701
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21346	NC_015061	AC	3	6	1041784	1041789	50 %	0 %	0 %	50 %	322831701
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21349	NC_015061	TGT	2	6	1041858	1041863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21350	NC_015061	TTA	2	6	1041922	1041927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21351	NC_015061	CAG	2	6	1041972	1041977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21352	NC_015061	GT	3	6	1042005	1042010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21353	NC_015061	T	6	6	1042010	1042015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21354	NC_015061	CCGT	2	8	1042033	1042040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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21362	NC_015061	T	7	7	1042421	1042427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21475	NC_015061	CGG	2	6	1047860	1047865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831708
21476	NC_015061	GGC	2	6	1047887	1047892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831708
21477	NC_015061	TCGGA	2	10	1047923	1047932	20 %	20 %	40 %	20 %	322831708
21478	NC_015061	TCT	2	6	1048018	1048023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831708
21479	NC_015061	ATC	2	6	1048051	1048056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831708
21480	NC_015061	TGGC	2	8	1048096	1048103	0 %	25 %	50 %	25 %	322831708
21481	NC_015061	CTGT	2	8	1048123	1048130	0 %	50 %	25 %	25 %	322831708
21482	NC_015061	TGT	2	6	1048139	1048144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831708
21483	NC_015061	TTG	2	6	1048147	1048152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831708
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21485	NC_015061	AGGGA	2	10	1048289	1048298	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21486	NC_015061	A	6	6	1048318	1048323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21487	NC_015061	GCT	2	6	1048397	1048402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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