MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_015061	TGC	2	6	999392	999397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20502	NC_015061	TGA	2	6	999572	999577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831657
20503	NC_015061	CGC	2	6	999607	999612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
20504	NC_015061	GAC	2	6	999651	999656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831657
20505	NC_015061	TGA	2	6	999658	999663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831657
20506	NC_015061	GCG	2	6	999694	999699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831657
20507	NC_015061	GCC	2	6	999718	999723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
20508	NC_015061	CGC	2	6	999923	999928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
20509	NC_015061	GC	3	6	1000016	1000021	0 %	0 %	50 %	50 %	322831657
20510	NC_015061	GAA	2	6	1000062	1000067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831657
20511	NC_015061	TGG	2	6	1000069	1000074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831657
20512	NC_015061	GTG	2	6	1000092	1000097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831657
20513	NC_015061	TCG	2	6	1000102	1000107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
20514	NC_015061	CCG	2	6	1000112	1000117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
20515	NC_015061	GCT	2	6	1000233	1000238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
20516	NC_015061	TTC	2	6	1000271	1000276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831657
20517	NC_015061	TGC	2	6	1000312	1000317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831657
20518	NC_015061	GCC	2	6	1000336	1000341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831657
20519	NC_015061	TCA	2	6	1000349	1000354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831657
20520	NC_015061	AGC	2	6	1000390	1000395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831657
20521	NC_015061	GAA	2	6	1000410	1000415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20522	NC_015061	CAT	2	6	1000457	1000462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20523	NC_015061	A	7	7	1000502	1000508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20524	NC_015061	CTG	2	6	1000574	1000579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20525	NC_015061	ATGAAC	2	12	1000659	1000670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322831658
20526	NC_015061	GCA	2	6	1000695	1000700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831658
20527	NC_015061	TGC	2	6	1000765	1000770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831658
20528	NC_015061	CCG	2	6	1000794	1000799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831658
20529	NC_015061	TTC	2	6	1001019	1001024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831658
20530	NC_015061	ACA	3	9	1001170	1001178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831658
20531	NC_015061	TGG	2	6	1001233	1001238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831658
20532	NC_015061	CGC	2	6	1001240	1001245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831658
20533	NC_015061	TGAA	2	8	1001353	1001360	50 %	25 %	25 %	0 %	322831658
20534	NC_015061	AAGAC	2	10	1001380	1001389	60 %	0 %	20 %	20 %	322831658
20535	NC_015061	GC	3	6	1001497	1001502	0 %	0 %	50 %	50 %	322831659
20536	NC_015061	CTG	2	6	1001523	1001528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
20537	NC_015061	ACC	2	6	1001541	1001546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831659
20538	NC_015061	GCG	2	6	1001596	1001601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831659
20539	NC_015061	TGCG	2	8	1001632	1001639	0 %	25 %	50 %	25 %	322831659
20540	NC_015061	GCCA	2	8	1001714	1001721	25 %	0 %	25 %	50 %	322831659
20541	NC_015061	GCG	2	6	1001748	1001753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831659
20542	NC_015061	CTG	2	6	1001754	1001759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
20543	NC_015061	TGC	2	6	1001890	1001895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
20544	NC_015061	GAA	2	6	1001985	1001990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831659
20545	NC_015061	CAC	2	6	1002053	1002058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831659
20546	NC_015061	GTT	2	6	1002059	1002064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831659
20547	NC_015061	TTAT	2	8	1002065	1002072	25 %	75 %	0 %	0 %	322831659
20548	NC_015061	TGC	3	9	1002097	1002105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831659
20549	NC_015061	TGA	3	9	1002138	1002146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831659
20550	NC_015061	CTG	2	6	1002179	1002184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831660
20551	NC_015061	GCG	2	6	1002185	1002190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831660
20552	NC_015061	TTG	2	6	1002203	1002208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831660
20553	NC_015061	CGG	2	6	1002226	1002231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831660
20554	NC_015061	CGTTGC	2	12	1002243	1002254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831660
20555	NC_015061	CGC	2	6	1002275	1002280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831660
20556	NC_015061	CGC	2	6	1002327	1002332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831660
20557	NC_015061	CTT	2	6	1002355	1002360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831660
20558	NC_015061	CCG	3	9	1002399	1002407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831660
20559	NC_015061	TGG	2	6	1002441	1002446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831660
20560	NC_015061	GGT	2	6	1002598	1002603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831660
20561	NC_015061	AAC	2	6	1002668	1002673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831660
20562	NC_015061	CAGC	2	8	1002751	1002758	25 %	0 %	25 %	50 %	322831660
20563	NC_015061	GA	3	6	1002780	1002785	50 %	0 %	50 %	0 %	322831660
20564	NC_015061	GCG	2	6	1002875	1002880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831661
20565	NC_015061	ATC	2	6	1002892	1002897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831661
20566	NC_015061	GCA	2	6	1002965	1002970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831661
20567	NC_015061	CGG	2	6	1002978	1002983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831661
20568	NC_015061	ACCG	2	8	1002994	1003001	25 %	0 %	25 %	50 %	322831661
20569	NC_015061	CGC	2	6	1003105	1003110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831661
20570	NC_015061	ATT	2	6	1003190	1003195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831661
20571	NC_015061	CGG	2	6	1003212	1003217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831661
20572	NC_015061	CAG	2	6	1003219	1003224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831661
20573	NC_015061	TGC	2	6	1003268	1003273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831661
20574	NC_015061	TG	3	6	1003274	1003279	0 %	50 %	50 %	0 %	322831661
20575	NC_015061	AAG	2	6	1003349	1003354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831661
20576	NC_015061	GCTGGT	2	12	1003362	1003373	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322831661
20577	NC_015061	AC	3	6	1003375	1003380	50 %	0 %	0 %	50 %	322831661
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20579	NC_015061	TC	3	6	1003577	1003582	0 %	50 %	0 %	50 %	322831662
20580	NC_015061	CTG	2	6	1003609	1003614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831662
20581	NC_015061	CG	3	6	1003643	1003648	0 %	0 %	50 %	50 %	322831662
20582	NC_015061	TGA	2	6	1003694	1003699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831662
20583	NC_015061	CG	3	6	1003784	1003789	0 %	0 %	50 %	50 %	322831662
20584	NC_015061	TGC	2	6	1003805	1003810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831662
20585	NC_015061	TCCG	2	8	1003820	1003827	0 %	25 %	25 %	50 %	322831662
20586	NC_015061	CTG	2	6	1003870	1003875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831662
20587	NC_015061	CGT	2	6	1003888	1003893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831662
20588	NC_015061	GCA	2	6	1003947	1003952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831662
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20600	NC_015061	GC	3	6	1004404	1004409	0 %	0 %	50 %	50 %	322831662
20601	NC_015061	GAA	2	6	1004419	1004424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831662
20602	NC_015061	CGG	2	6	1004460	1004465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831662
20603	NC_015061	GGCA	2	8	1004475	1004482	25 %	0 %	50 %	25 %	322831662
20604	NC_015061	GAT	2	6	1004586	1004591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831662
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20606	NC_015061	TGG	2	6	1004705	1004710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831662
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20610	NC_015061	GCC	2	6	1004979	1004984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831663
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20969	NC_015061	CTGT	2	8	1022694	1022701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20970	NC_015061	AAT	2	6	1022756	1022761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20973	NC_015061	ATTA	2	8	1022804	1022811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20974	NC_015061	TCAT	2	8	1022902	1022909	25 %	50 %	0 %	25 %	322831681
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