MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015061	GAT	2	6	948166	948171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831605
19502	NC_015061	GAA	2	6	948176	948181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831605
19503	NC_015061	AGA	2	6	948274	948279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831605
19504	NC_015061	GCC	2	6	948367	948372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831606
19505	NC_015061	CCA	2	6	948432	948437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831606
19506	NC_015061	CAT	2	6	948444	948449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831606
19507	NC_015061	ATT	2	6	948582	948587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831606
19508	NC_015061	GTC	2	6	948617	948622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831606
19509	NC_015061	A	6	6	948742	948747	100 %	0 %	0 %	0 %	322831606
19510	NC_015061	TTC	2	6	948754	948759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831606
19511	NC_015061	TTTC	2	8	948833	948840	0 %	75 %	0 %	25 %	322831607
19512	NC_015061	TGCGT	2	10	948881	948890	0 %	40 %	40 %	20 %	322831607
19513	NC_015061	GCG	2	6	948894	948899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831607
19514	NC_015061	TTC	2	6	948907	948912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831607
19515	NC_015061	CTG	2	6	948917	948922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19516	NC_015061	TGCAT	2	10	948973	948982	20 %	40 %	20 %	20 %	322831607
19517	NC_015061	CCA	2	6	948985	948990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831607
19518	NC_015061	CAG	2	6	949043	949048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19519	NC_015061	GCG	2	6	949109	949114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831607
19520	NC_015061	CTG	2	6	949155	949160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19521	NC_015061	TC	3	6	949246	949251	0 %	50 %	0 %	50 %	322831607
19522	NC_015061	AC	3	6	949274	949279	50 %	0 %	0 %	50 %	322831607
19523	NC_015061	AGC	2	6	949320	949325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19524	NC_015061	GAA	2	6	949328	949333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831607
19525	NC_015061	CTG	2	6	949354	949359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19526	NC_015061	GCT	2	6	949501	949506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19527	NC_015061	TC	3	6	949526	949531	0 %	50 %	0 %	50 %	322831607
19528	NC_015061	GCTG	2	8	949617	949624	0 %	25 %	50 %	25 %	322831607
19529	NC_015061	AAC	2	6	949656	949661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831607
19530	NC_015061	TGTA	2	8	949758	949765	25 %	50 %	25 %	0 %	322831607
19531	NC_015061	CTG	2	6	949801	949806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831607
19532	NC_015061	GCCA	2	8	949899	949906	25 %	0 %	25 %	50 %	322831607
19533	NC_015061	AT	3	6	949948	949953	50 %	50 %	0 %	0 %	322831607
19534	NC_015061	CGGG	2	8	949963	949970	0 %	0 %	75 %	25 %	322831607
19535	NC_015061	GC	3	6	949976	949981	0 %	0 %	50 %	50 %	322831607
19536	NC_015061	A	6	6	949988	949993	100 %	0 %	0 %	0 %	322831607
19537	NC_015061	GCC	2	6	950014	950019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831607
19538	NC_015061	TTA	2	6	950047	950052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831607
19539	NC_015061	GGTT	2	8	950078	950085	0 %	50 %	50 %	0 %	322831607
19540	NC_015061	AAT	2	6	950111	950116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831607
19541	NC_015061	ATC	2	6	950132	950137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831607
19542	NC_015061	TAA	2	6	950150	950155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831607
19543	NC_015061	GAA	2	6	950220	950225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831608
19544	NC_015061	G	6	6	950275	950280	0 %	0 %	100 %	0 %	322831608
19545	NC_015061	CAGC	2	8	950307	950314	25 %	0 %	25 %	50 %	322831608
19546	NC_015061	AAG	2	6	950417	950422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831608
19547	NC_015061	GA	3	6	950426	950431	50 %	0 %	50 %	0 %	322831608
19548	NC_015061	CGT	2	6	950523	950528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831608
19549	NC_015061	GAC	2	6	950615	950620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831609
19550	NC_015061	GTT	2	6	950677	950682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831609
19551	NC_015061	ACC	2	6	950697	950702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831609
19552	NC_015061	TCA	2	6	950823	950828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831609
19553	NC_015061	TCA	2	6	950847	950852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831609
19554	NC_015061	GCG	3	9	950884	950892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831610
19555	NC_015061	GCC	2	6	950896	950901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831610
19556	NC_015061	TGC	2	6	950934	950939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831610
19557	NC_015061	TTG	2	6	951042	951047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831610
19558	NC_015061	TTA	2	6	951140	951145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_015061	GCA	2	6	951215	951220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19560	NC_015061	TAT	2	6	951247	951252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19561	NC_015061	AGC	2	6	951292	951297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831611
19562	NC_015061	TTTC	2	8	951325	951332	0 %	75 %	0 %	25 %	322831611
19563	NC_015061	AAC	2	6	951375	951380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831611
19564	NC_015061	ATG	2	6	951383	951388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831611
19565	NC_015061	CTG	2	6	951395	951400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831611
19566	NC_015061	CGA	2	6	951418	951423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831611
19567	NC_015061	GACT	2	8	951426	951433	25 %	25 %	25 %	25 %	322831611
19568	NC_015061	TGA	2	6	951526	951531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831611
19569	NC_015061	A	6	6	951542	951547	100 %	0 %	0 %	0 %	322831611
19570	NC_015061	GGT	2	6	951568	951573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831611
19571	NC_015061	TGC	2	6	951595	951600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831611
19572	NC_015061	TGG	2	6	951608	951613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831611
19573	NC_015061	AGA	2	6	951667	951672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831611
19574	NC_015061	AAG	2	6	951813	951818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831611
19575	NC_015061	CGG	2	6	951906	951911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831612
19576	NC_015061	ATC	2	6	952010	952015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831612
19577	NC_015061	GTA	2	6	952129	952134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831612
19578	NC_015061	CCGCG	2	10	952141	952150	0 %	0 %	40 %	60 %	322831612
19579	NC_015061	CGA	2	6	952151	952156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831612
19580	NC_015061	TCG	2	6	952179	952184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831612
19581	NC_015061	AAAGT	2	10	952190	952199	60 %	20 %	20 %	0 %	322831612
19582	NC_015061	TGC	2	6	952254	952259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19583	NC_015061	A	7	7	952311	952317	100 %	0 %	0 %	0 %	322831613
19584	NC_015061	TCA	2	6	952318	952323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831613
19585	NC_015061	AGTGC	2	10	952326	952335	20 %	20 %	40 %	20 %	322831613
19586	NC_015061	CCG	2	6	952372	952377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831613
19587	NC_015061	GCA	2	6	952409	952414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831613
19588	NC_015061	ATT	2	6	952466	952471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831613
19589	NC_015061	AGG	2	6	952501	952506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831613
19590	NC_015061	GGC	2	6	952515	952520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831613
19591	NC_015061	GCA	2	6	952700	952705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831613
19592	NC_015061	ATG	2	6	952740	952745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831613
19593	NC_015061	TGC	2	6	952760	952765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831613
19594	NC_015061	AAAT	2	8	952811	952818	75 %	25 %	0 %	0 %	322831613
19595	NC_015061	GAA	2	6	952824	952829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831613
19596	NC_015061	GAA	2	6	952911	952916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831613
19597	NC_015061	ATC	2	6	953058	953063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19598	NC_015061	CAG	2	6	953090	953095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19599	NC_015061	TTTG	2	8	953113	953120	0 %	75 %	25 %	0 %	322831614
19600	NC_015061	ATC	2	6	953121	953126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831614
19601	NC_015061	CAC	2	6	953192	953197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831614
19602	NC_015061	TCG	2	6	953259	953264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19603	NC_015061	ATA	2	6	953394	953399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831614
19604	NC_015061	CGC	2	6	953426	953431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831614
19605	NC_015061	AAC	2	6	953461	953466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831614
19606	NC_015061	TCA	2	6	953473	953478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831614
19607	NC_015061	GCAGC	2	10	953647	953656	20 %	0 %	40 %	40 %	322831614
19608	NC_015061	GCA	2	6	953727	953732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19609	NC_015061	CGA	2	6	953746	953751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19610	NC_015061	TTGGCA	2	12	953752	953763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322831614
19611	NC_015061	CGA	2	6	953797	953802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19612	NC_015061	GTG	2	6	953836	953841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831614
19613	NC_015061	CAC	2	6	953890	953895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831614
19614	NC_015061	AGCAA	2	10	953901	953910	60 %	0 %	20 %	20 %	322831614
19615	NC_015061	TCT	2	6	954039	954044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831614
19616	NC_015061	TGC	2	6	954047	954052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831614
19617	NC_015061	GCG	2	6	954099	954104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831614
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19619	NC_015061	CAT	2	6	954130	954135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831614
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19990	NC_015061	AC	3	6	973701	973706	50 %	0 %	0 %	50 %	322831631
19991	NC_015061	CTGA	2	8	973715	973722	25 %	25 %	25 %	25 %	322831631
19992	NC_015061	CGG	2	6	973724	973729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831631
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19994	NC_015061	A	6	6	973766	973771	100 %	0 %	0 %	0 %	322831631
19995	NC_015061	GCT	2	6	973795	973800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831631
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19998	NC_015061	CTGGC	2	10	973985	973994	0 %	20 %	40 %	40 %	322831631
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20000	NC_015061	ATG	2	6	974076	974081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831631

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