MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015061	GC	3	6	920787	920792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_015061	T	6	6	920825	920830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_015061	TCT	2	6	920840	920845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_015061	CAGAT	2	10	920882	920891	40 %	20 %	20 %	20 %	322831584
19005	NC_015061	TCA	2	6	921003	921008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831584
19006	NC_015061	A	6	6	921122	921127	100 %	0 %	0 %	0 %	322831584
19007	NC_015061	CCT	2	6	921175	921180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831584
19008	NC_015061	TCG	2	6	921204	921209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831584
19009	NC_015061	ATT	2	6	921212	921217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831584
19010	NC_015061	CATA	2	8	921241	921248	50 %	25 %	0 %	25 %	322831584
19011	NC_015061	ATG	2	6	921283	921288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_015061	CGG	2	6	921296	921301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_015061	AGA	2	6	921337	921342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_015061	A	7	7	921344	921350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_015061	T	6	6	921361	921366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_015061	CTT	2	6	921622	921627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831585
19017	NC_015061	CG	3	6	921657	921662	0 %	0 %	50 %	50 %	322831585
19018	NC_015061	GAT	2	6	921683	921688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831585
19019	NC_015061	CGC	2	6	921718	921723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831585
19020	NC_015061	TCA	2	6	921810	921815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831585
19021	NC_015061	AAG	2	6	921838	921843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831585
19022	NC_015061	AATG	2	8	921866	921873	50 %	25 %	25 %	0 %	322831585
19023	NC_015061	GCA	2	6	921888	921893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831585
19024	NC_015061	CAC	2	6	921899	921904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831585
19025	NC_015061	TTC	2	6	922035	922040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831585
19026	NC_015061	TCT	2	6	922072	922077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831585
19027	NC_015061	CGC	2	6	922093	922098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831585
19028	NC_015061	CG	3	6	922132	922137	0 %	0 %	50 %	50 %	322831585
19029	NC_015061	TGC	2	6	922209	922214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831585
19030	NC_015061	ACG	2	6	922338	922343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
19031	NC_015061	AATA	2	8	922359	922366	75 %	25 %	0 %	0 %	322831586
19032	NC_015061	GC	3	6	922398	922403	0 %	0 %	50 %	50 %	322831586
19033	NC_015061	AGA	2	6	922430	922435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831586
19034	NC_015061	CAG	2	6	922452	922457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
19035	NC_015061	CGG	2	6	922495	922500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831586
19036	NC_015061	CGG	2	6	922578	922583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831586
19037	NC_015061	CGGT	2	8	922779	922786	0 %	25 %	50 %	25 %	322831586
19038	NC_015061	CGC	2	6	922814	922819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831586
19039	NC_015061	ACCAGC	2	12	922837	922848	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322831586
19040	NC_015061	TGG	2	6	922853	922858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831586
19041	NC_015061	CAG	2	6	922869	922874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
19042	NC_015061	TGCCA	2	10	922885	922894	20 %	20 %	20 %	40 %	322831586
19043	NC_015061	AAT	2	6	922919	922924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831586
19044	NC_015061	CTT	2	6	922958	922963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831586
19045	NC_015061	TGA	2	6	923008	923013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831586
19046	NC_015061	TGG	2	6	923129	923134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831586
19047	NC_015061	GCG	2	6	923197	923202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831586
19048	NC_015061	CTG	2	6	923205	923210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831586
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19052	NC_015061	TTC	2	6	923475	923480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831586
19053	NC_015061	GCA	2	6	923504	923509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
19054	NC_015061	CGA	2	6	923567	923572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
19055	NC_015061	AT	3	6	923590	923595	50 %	50 %	0 %	0 %	322831586
19056	NC_015061	GC	3	6	923630	923635	0 %	0 %	50 %	50 %	322831586
19057	NC_015061	CG	3	6	923678	923683	0 %	0 %	50 %	50 %	322831586
19058	NC_015061	GCA	2	6	923732	923737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831586
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19061	NC_015061	CGG	2	6	923818	923823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831586
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19085	NC_015061	GCCA	2	8	924790	924797	25 %	0 %	25 %	50 %	322831586
19086	NC_015061	TCG	2	6	924844	924849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831586
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19088	NC_015061	GA	3	6	924974	924979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_015061	A	7	7	924998	925004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19092	NC_015061	CTC	2	6	925315	925320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831587
19093	NC_015061	TCG	2	6	925497	925502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831587
19094	NC_015061	CAC	2	6	925624	925629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831587
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19096	NC_015061	CAGG	2	8	925675	925682	25 %	0 %	50 %	25 %	322831587
19097	NC_015061	T	6	6	925815	925820	0 %	100 %	0 %	0 %	322831587
19098	NC_015061	TTGA	2	8	925838	925845	25 %	50 %	25 %	0 %	322831587
19099	NC_015061	TGT	2	6	925856	925861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19102	NC_015061	TGC	2	6	925950	925955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19104	NC_015061	TTAT	2	8	926010	926017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_015061	GC	3	6	926026	926031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19106	NC_015061	TTA	2	6	926094	926099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_015061	GTAA	2	8	926102	926109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_015061	AC	4	8	926112	926119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19109	NC_015061	ACT	2	6	926200	926205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19112	NC_015061	TCC	2	6	926402	926407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831588
19113	NC_015061	GCA	2	6	926444	926449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831588
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19115	NC_015061	CA	3	6	926472	926477	50 %	0 %	0 %	50 %	322831588
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19119	NC_015061	GGT	2	6	926666	926671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831588
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19122	NC_015061	TTG	2	6	926778	926783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831588
19123	NC_015061	TGC	2	6	926872	926877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831588
19124	NC_015061	AGA	2	6	926920	926925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831588
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19146	NC_015061	GACA	2	8	928097	928104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19242	NC_015061	GAT	2	6	933449	933454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831595
19243	NC_015061	AGG	2	6	933487	933492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831595
19244	NC_015061	GCGG	2	8	933638	933645	0 %	0 %	75 %	25 %	322831595
19245	NC_015061	TGA	2	6	933746	933751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831595
19246	NC_015061	TGA	2	6	933820	933825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831595
19247	NC_015061	ATC	2	6	933984	933989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831595
19248	NC_015061	TGG	2	6	934016	934021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831595
19249	NC_015061	CTG	2	6	934026	934031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831595
19250	NC_015061	CGAG	2	8	934070	934077	25 %	0 %	50 %	25 %	322831595
19251	NC_015061	GTT	2	6	934118	934123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831595
19252	NC_015061	TTAGG	2	10	934173	934182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19253	NC_015061	AAC	2	6	934193	934198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19254	NC_015061	GCT	2	6	934229	934234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831596
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19357	NC_015061	CTG	2	6	940654	940659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831601
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19360	NC_015061	TGC	2	6	940727	940732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831601
19361	NC_015061	TGG	2	6	940743	940748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831601
19362	NC_015061	CCG	2	6	940800	940805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831601
19363	NC_015061	GCT	2	6	940822	940827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831601
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