MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_015061	GCG	2	6	895261	895266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831558
18503	NC_015061	ATG	2	6	895384	895389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831558
18504	NC_015061	TGC	2	6	895411	895416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18505	NC_015061	ACG	2	6	895428	895433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18506	NC_015061	GCT	2	6	895452	895457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18507	NC_015061	GGC	2	6	895479	895484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831558
18508	NC_015061	GTG	2	6	895492	895497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831558
18509	NC_015061	GATGA	2	10	895564	895573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_015061	T	6	6	895574	895579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_015061	CTA	2	6	895626	895631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18512	NC_015061	CTG	2	6	895640	895645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_015061	AAT	2	6	895660	895665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_015061	TC	3	6	895751	895756	0 %	50 %	0 %	50 %	322831559
18515	NC_015061	TGGC	2	8	895802	895809	0 %	25 %	50 %	25 %	322831559
18516	NC_015061	GGT	2	6	895898	895903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831559
18517	NC_015061	TCT	2	6	895920	895925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831559
18518	NC_015061	GGC	2	6	895979	895984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831559
18519	NC_015061	TTC	2	6	896057	896062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831559
18520	NC_015061	TGC	2	6	896215	896220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831559
18521	NC_015061	TTG	2	6	896243	896248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831559
18522	NC_015061	CTG	2	6	896294	896299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831559
18523	NC_015061	TCA	2	6	896319	896324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831559
18524	NC_015061	TAT	2	6	896404	896409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831559
18525	NC_015061	ATC	2	6	896459	896464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831559
18526	NC_015061	TCA	2	6	896656	896661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831560
18527	NC_015061	CAC	2	6	896698	896703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831560
18528	NC_015061	TCAT	2	8	896727	896734	25 %	50 %	0 %	25 %	322831560
18529	NC_015061	AAT	2	6	896786	896791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831560
18530	NC_015061	GCAA	2	8	896847	896854	50 %	0 %	25 %	25 %	322831560
18531	NC_015061	GGCA	2	8	896879	896886	25 %	0 %	50 %	25 %	322831560
18532	NC_015061	GTT	2	6	896906	896911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831560
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18534	NC_015061	CGC	2	6	896939	896944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831560
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18536	NC_015061	GCT	2	6	897109	897114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831560
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18540	NC_015061	GGC	2	6	897391	897396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_015061	A	6	6	897555	897560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_015061	A	6	6	897579	897584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_015061	ATG	2	6	897655	897660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831561
18544	NC_015061	GTT	2	6	897661	897666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831561
18545	NC_015061	CAG	2	6	897721	897726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831561
18546	NC_015061	GCA	2	6	897750	897755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831561
18547	NC_015061	TTTGTA	2	12	897762	897773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	322831561
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18549	NC_015061	CTG	2	6	897809	897814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831561
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18551	NC_015061	A	6	6	897941	897946	100 %	0 %	0 %	0 %	322831561
18552	NC_015061	A	6	6	897999	898004	100 %	0 %	0 %	0 %	322831561
18553	NC_015061	TACG	2	8	898049	898056	25 %	25 %	25 %	25 %	322831561
18554	NC_015061	GCA	2	6	898159	898164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831562
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18558	NC_015061	TCA	2	6	898330	898335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831562
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18560	NC_015061	GCGGG	2	10	898480	898489	0 %	0 %	80 %	20 %	322831562
18561	NC_015061	GCA	2	6	898495	898500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831562
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18564	NC_015061	GCA	2	6	898569	898574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831562
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18582	NC_015061	CGATT	2	10	899656	899665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18583	NC_015061	T	7	7	899664	899670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_015061	TTG	2	6	899724	899729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_015061	TATT	2	8	899754	899761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18598	NC_015061	TAA	2	6	900514	900519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831565
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18602	NC_015061	ATA	3	9	900693	900701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831565
18603	NC_015061	CTGA	2	8	900872	900879	25 %	25 %	25 %	25 %	322831565
18604	NC_015061	A	7	7	900956	900962	100 %	0 %	0 %	0 %	322831565
18605	NC_015061	TGA	2	6	900970	900975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831565
18606	NC_015061	TGG	2	6	901047	901052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831565
18607	NC_015061	CTGA	2	8	901100	901107	25 %	25 %	25 %	25 %	322831565
18608	NC_015061	CGC	2	6	901152	901157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831565
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18613	NC_015061	TGA	2	6	901432	901437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831565
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18615	NC_015061	CAG	2	6	901743	901748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831565
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18987	NC_015061	GCA	2	6	920066	920071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831582
18988	NC_015061	TGC	2	6	920092	920097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831582
18989	NC_015061	GC	3	6	920154	920159	0 %	0 %	50 %	50 %	322831582
18990	NC_015061	ATC	2	6	920164	920169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831582
18991	NC_015061	TGGC	2	8	920195	920202	0 %	25 %	50 %	25 %	322831582
18992	NC_015061	TTGA	2	8	920279	920286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18993	NC_015061	CA	3	6	920298	920303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18994	NC_015061	CGGTA	2	10	920339	920348	20 %	20 %	40 %	20 %	322831583
18995	NC_015061	TGG	2	6	920365	920370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831583
18996	NC_015061	GAA	2	6	920424	920429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831583
18997	NC_015061	TCA	2	6	920459	920464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831583
18998	NC_015061	GGC	3	9	920619	920627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831583
18999	NC_015061	GAT	2	6	920637	920642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831583
19000	NC_015061	GTGG	2	8	920732	920739	0 %	25 %	75 %	0 %	322831583

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