MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

< Previous12...3233343536373839404142...197198Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015061	CGCA	2	8	869412	869419	25 %	0 %	25 %	50 %	322831537
18003	NC_015061	GCA	2	6	869482	869487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831537
18004	NC_015061	CG	3	6	869582	869587	0 %	0 %	50 %	50 %	322831537
18005	NC_015061	CCA	2	6	869774	869779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831537
18006	NC_015061	ACC	2	6	869855	869860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831537
18007	NC_015061	T	7	7	869908	869914	0 %	100 %	0 %	0 %	322831537
18008	NC_015061	GGC	2	6	870054	870059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831537
18009	NC_015061	AGC	2	6	870064	870069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831537
18010	NC_015061	AAAT	2	8	870149	870156	75 %	25 %	0 %	0 %	322831537
18011	NC_015061	CAC	2	6	870174	870179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831537
18012	NC_015061	CAG	2	6	870186	870191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831537
18013	NC_015061	TAA	2	6	870286	870291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831537
18014	NC_015061	GCC	2	6	870341	870346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831537
18015	NC_015061	AAC	2	6	870400	870405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831537
18016	NC_015061	GCCA	2	8	870409	870416	25 %	0 %	25 %	50 %	322831537
18017	NC_015061	AC	3	6	870515	870520	50 %	0 %	0 %	50 %	322831537
18018	NC_015061	GAT	3	9	870534	870542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831537
18019	NC_015061	TCT	2	6	870574	870579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831537
18020	NC_015061	TTAA	2	8	870595	870602	50 %	50 %	0 %	0 %	322831537
18021	NC_015061	T	6	6	870639	870644	0 %	100 %	0 %	0 %	322831537
18022	NC_015061	ATA	2	6	870649	870654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831537
18023	NC_015061	TGT	2	6	870672	870677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_015061	ATC	2	6	870685	870690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_015061	TGA	2	6	870787	870792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831538
18026	NC_015061	CTG	2	6	870810	870815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831538
18027	NC_015061	TGA	2	6	870857	870862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831538
18028	NC_015061	CAG	2	6	870927	870932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831538
18029	NC_015061	ACA	3	9	871024	871032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831538
18030	NC_015061	CTG	2	6	871096	871101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831538
18031	NC_015061	A	6	6	871104	871109	100 %	0 %	0 %	0 %	322831538
18032	NC_015061	GCC	2	6	871154	871159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831538
18033	NC_015061	GAA	2	6	871233	871238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831538
18034	NC_015061	GGT	2	6	871319	871324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831538
18035	NC_015061	GAT	2	6	871365	871370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831538
18036	NC_015061	CCG	2	6	871375	871380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831538
18037	NC_015061	GGC	2	6	871383	871388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831538
18038	NC_015061	CAC	2	6	871436	871441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831538
18039	NC_015061	TGC	2	6	871576	871581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_015061	CCT	2	6	871597	871602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18041	NC_015061	GGGA	2	8	871610	871617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18042	NC_015061	GAA	2	6	871720	871725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831539
18043	NC_015061	T	6	6	871749	871754	0 %	100 %	0 %	0 %	322831539
18044	NC_015061	CTTTCG	2	12	871781	871792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322831539
18045	NC_015061	CAG	2	6	871812	871817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831539
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18047	NC_015061	CTG	2	6	871961	871966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831539
18048	NC_015061	CATG	2	8	871973	871980	25 %	25 %	25 %	25 %	322831539
18049	NC_015061	CGC	2	6	872000	872005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831539
18050	NC_015061	TGATC	2	10	872192	872201	20 %	40 %	20 %	20 %	322831539
18051	NC_015061	TGG	2	6	872204	872209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831539
18052	NC_015061	AGT	2	6	872267	872272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831539
18053	NC_015061	CGT	2	6	872301	872306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831539
18054	NC_015061	CCA	2	6	872336	872341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831539
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18058	NC_015061	GGC	2	6	872472	872477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831539
18059	NC_015061	GCT	2	6	872490	872495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831539
18060	NC_015061	CAG	2	6	872499	872504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831539
18061	NC_015061	GGC	2	6	872505	872510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831539
18062	NC_015061	AAT	2	6	872558	872563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_015061	TGTT	2	8	872627	872634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_015061	TTG	2	6	872681	872686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831540
18065	NC_015061	TTG	2	6	872690	872695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831540
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18068	NC_015061	CTG	2	6	872794	872799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831540
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18074	NC_015061	GATC	2	8	873066	873073	25 %	25 %	25 %	25 %	322831540
18075	NC_015061	GTCG	2	8	873138	873145	0 %	25 %	50 %	25 %	322831540
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18088	NC_015061	TCA	2	6	873764	873769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_015061	TCA	2	6	873852	873857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831541
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18091	NC_015061	CTG	4	12	874001	874012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831541
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18093	NC_015061	GC	3	6	874044	874049	0 %	0 %	50 %	50 %	322831541
18094	NC_015061	GC	3	6	874079	874084	0 %	0 %	50 %	50 %	322831541
18095	NC_015061	CTT	2	6	874111	874116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831541
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18100	NC_015061	AAGA	2	8	874331	874338	75 %	0 %	25 %	0 %	322831541
18101	NC_015061	AGA	3	9	874336	874344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831541
18102	NC_015061	GCTGTC	2	12	874396	874407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831541
18103	NC_015061	TGC	2	6	874423	874428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831541
18104	NC_015061	GCT	3	9	874510	874518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831541
18105	NC_015061	GGGC	2	8	874552	874559	0 %	0 %	75 %	25 %	322831541
18106	NC_015061	TGA	2	6	874605	874610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831541
18107	NC_015061	TGG	2	6	874653	874658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831541
18108	NC_015061	CGG	2	6	874659	874664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831541
18109	NC_015061	TGCC	2	8	874707	874714	0 %	25 %	25 %	50 %	322831541
18110	NC_015061	GTG	2	6	874727	874732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831541
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18112	NC_015061	TGGG	2	8	874811	874818	0 %	25 %	75 %	0 %	322831541
18113	NC_015061	GGC	2	6	874864	874869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831541
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18115	NC_015061	CCG	2	6	874915	874920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831541
18116	NC_015061	GCG	2	6	874922	874927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831541
18117	NC_015061	A	7	7	874965	874971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_015061	T	7	7	875008	875014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18120	NC_015061	AAT	2	6	875189	875194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831542
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18132	NC_015061	GCAG	2	8	875611	875618	25 %	0 %	50 %	25 %	322831542
18133	NC_015061	GACT	2	8	875623	875630	25 %	25 %	25 %	25 %	322831542
18134	NC_015061	GGCA	2	8	875638	875645	25 %	0 %	50 %	25 %	322831542
18135	NC_015061	CGCTG	2	10	875688	875697	0 %	20 %	40 %	40 %	322831542
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18238	NC_015061	AGA	2	6	880821	880826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831546
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18243	NC_015061	TGG	2	6	881168	881173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831547
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18361	NC_015061	GTG	2	6	887935	887940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831552
18362	NC_015061	GTC	2	6	888041	888046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831552
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18367	NC_015061	CGG	2	6	888586	888591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831553
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18398	NC_015061	AAAAG	2	10	889760	889769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18399	NC_015061	T	6	6	889784	889789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18472	NC_015061	CCG	2	6	893927	893932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831558
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18482	NC_015061	CAGC	2	8	894395	894402	25 %	0 %	25 %	50 %	322831558
18483	NC_015061	CTG	2	6	894435	894440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18484	NC_015061	GAA	2	6	894489	894494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831558
18485	NC_015061	GAT	2	6	894519	894524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831558
18486	NC_015061	GAA	2	6	894684	894689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831558
18487	NC_015061	GTT	2	6	894722	894727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831558
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18489	NC_015061	TGC	2	6	894883	894888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18490	NC_015061	TGC	2	6	894896	894901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18491	NC_015061	CTG	2	6	894921	894926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831558
18492	NC_015061	TGA	2	6	894953	894958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831558
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18498	NC_015061	CAA	2	6	895151	895156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831558
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