MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015061	AAG	2	6	847300	847305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831523
17502	NC_015061	ACG	2	6	847469	847474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831523
17503	NC_015061	CAA	2	6	847515	847520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831523
17504	NC_015061	T	6	6	847543	847548	0 %	100 %	0 %	0 %	322831523
17505	NC_015061	GCC	2	6	847549	847554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831523
17506	NC_015061	GTGCT	2	10	847577	847586	0 %	40 %	40 %	20 %	322831523
17507	NC_015061	GCC	2	6	847630	847635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831523
17508	NC_015061	GCC	2	6	847660	847665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831523
17509	NC_015061	AGC	2	6	847676	847681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831523
17510	NC_015061	GCGG	2	8	847732	847739	0 %	0 %	75 %	25 %	322831523
17511	NC_015061	TTG	2	6	847765	847770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831523
17512	NC_015061	CCG	2	6	847805	847810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831523
17513	NC_015061	ACC	2	6	847951	847956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831523
17514	NC_015061	T	6	6	848229	848234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_015061	ATTC	2	8	848250	848257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17516	NC_015061	CTG	2	6	848316	848321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17517	NC_015061	ATAGAA	2	12	848322	848333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_015061	T	6	6	848403	848408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_015061	TGC	2	6	848489	848494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831524
17520	NC_015061	CTCGT	2	10	848502	848511	0 %	40 %	20 %	40 %	322831524
17521	NC_015061	A	6	6	848515	848520	100 %	0 %	0 %	0 %	322831524
17522	NC_015061	CTGGT	2	10	848566	848575	0 %	40 %	40 %	20 %	322831524
17523	NC_015061	T	6	6	848575	848580	0 %	100 %	0 %	0 %	322831524
17524	NC_015061	CCA	2	6	848586	848591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831524
17525	NC_015061	A	6	6	848617	848622	100 %	0 %	0 %	0 %	322831524
17526	NC_015061	GC	3	6	848640	848645	0 %	0 %	50 %	50 %	322831524
17527	NC_015061	GAT	2	6	848658	848663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831524
17528	NC_015061	GCAG	2	8	848685	848692	25 %	0 %	50 %	25 %	322831524
17529	NC_015061	CA	3	6	848700	848705	50 %	0 %	0 %	50 %	322831524
17530	NC_015061	TGCG	2	8	848726	848733	0 %	25 %	50 %	25 %	322831524
17531	NC_015061	GGT	2	6	848742	848747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831524
17532	NC_015061	GACGGT	2	12	848757	848768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831524
17533	NC_015061	TGA	2	6	848792	848797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831524
17534	NC_015061	CCG	2	6	849011	849016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831524
17535	NC_015061	CGC	3	9	849057	849065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831524
17536	NC_015061	TGG	2	6	849128	849133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831524
17537	NC_015061	CAG	2	6	849153	849158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831524
17538	NC_015061	ACC	2	6	849163	849168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831524
17539	NC_015061	GCG	2	6	849257	849262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831524
17540	NC_015061	GTT	2	6	849381	849386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831524
17541	NC_015061	CGG	3	9	849473	849481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831524
17542	NC_015061	AGC	2	6	849493	849498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831524
17543	NC_015061	TGA	2	6	849576	849581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831524
17544	NC_015061	GGT	2	6	849621	849626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831524
17545	NC_015061	CAC	2	6	849627	849632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831524
17546	NC_015061	AAC	2	6	849649	849654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831524
17547	NC_015061	GCA	3	9	849697	849705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831524
17548	NC_015061	CAG	2	6	849727	849732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831524
17549	NC_015061	GCG	2	6	849734	849739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831524
17550	NC_015061	CCA	2	6	849752	849757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831524
17551	NC_015061	CCGG	2	8	849854	849861	0 %	0 %	50 %	50 %	322831525
17552	NC_015061	CTG	2	6	849873	849878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
17553	NC_015061	TGT	2	6	849892	849897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831525
17554	NC_015061	ACA	2	6	849913	849918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831525
17555	NC_015061	CGC	2	6	850021	850026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831525
17556	NC_015061	CCA	2	6	850072	850077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831525
17557	NC_015061	CTC	2	6	850088	850093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831525
17558	NC_015061	ATT	2	6	850095	850100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831525
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17560	NC_015061	CTG	2	6	850179	850184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
17561	NC_015061	CCG	2	6	850203	850208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831525
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17563	NC_015061	CGG	2	6	850228	850233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
17564	NC_015061	GGCG	2	8	850358	850365	0 %	0 %	75 %	25 %	322831525
17565	NC_015061	GGC	2	6	850409	850414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
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17571	NC_015061	GGT	2	6	850712	850717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831525
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17586	NC_015061	T	6	6	851349	851354	0 %	100 %	0 %	0 %	322831525
17587	NC_015061	GCT	2	6	851417	851422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831525
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17591	NC_015061	TAA	2	6	851639	851644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831525
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17599	NC_015061	CAA	2	6	852152	852157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831525
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17601	NC_015061	CAC	2	6	852197	852202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831525
17602	NC_015061	TCT	2	6	852204	852209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831525
17603	NC_015061	ACC	4	12	852234	852245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831525
17604	NC_015061	TTG	2	6	852315	852320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831525
17605	NC_015061	GC	3	6	852324	852329	0 %	0 %	50 %	50 %	322831525
17606	NC_015061	CGG	2	6	852343	852348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
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17610	NC_015061	ATGT	2	8	852531	852538	25 %	50 %	25 %	0 %	322831525
17611	NC_015061	ATCC	2	8	852567	852574	25 %	25 %	0 %	50 %	322831525
17612	NC_015061	CGG	3	9	852601	852609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831525
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17615	NC_015061	CGC	2	6	852757	852762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831525
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17620	NC_015061	GTT	2	6	852935	852940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831525
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17983	NC_015061	GGC	2	6	868605	868610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831536
17984	NC_015061	TCGG	2	8	868612	868619	0 %	25 %	50 %	25 %	322831536
17985	NC_015061	T	6	6	868655	868660	0 %	100 %	0 %	0 %	322831536
17986	NC_015061	TGC	2	6	868669	868674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831536
17987	NC_015061	GCG	2	6	868691	868696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831536
17988	NC_015061	AAT	2	6	868759	868764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17989	NC_015061	AGC	2	6	868784	868789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17990	NC_015061	CA	4	8	868829	868836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17991	NC_015061	A	6	6	868836	868841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17992	NC_015061	CAG	2	6	868969	868974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831537
17993	NC_015061	CAG	3	9	869043	869051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831537
17994	NC_015061	TGT	2	6	869062	869067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831537
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17998	NC_015061	ATC	2	6	869196	869201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831537
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