MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015061	CCG	2	6	822814	822819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831496
17002	NC_015061	GGT	2	6	822842	822847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831496
17003	NC_015061	TTA	2	6	822916	822921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831496
17004	NC_015061	TAC	2	6	822927	822932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831496
17005	NC_015061	GCG	2	6	822949	822954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831496
17006	NC_015061	GC	3	6	822996	823001	0 %	0 %	50 %	50 %	322831496
17007	NC_015061	CGG	2	6	823031	823036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831496
17008	NC_015061	TGA	2	6	823084	823089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831496
17009	NC_015061	CTGG	2	8	823091	823098	0 %	25 %	50 %	25 %	322831496
17010	NC_015061	ACCGG	2	10	823263	823272	20 %	0 %	40 %	40 %	322831496
17011	NC_015061	ATT	2	6	823284	823289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831496
17012	NC_015061	GCG	2	6	823320	823325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831496
17013	NC_015061	TGG	2	6	823333	823338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831496
17014	NC_015061	GCT	2	6	823349	823354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831496
17015	NC_015061	CTG	2	6	823393	823398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831496
17016	NC_015061	GAG	2	6	823519	823524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_015061	TGA	2	6	823595	823600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831497
17018	NC_015061	CCG	2	6	823616	823621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831497
17019	NC_015061	TGTA	2	8	823636	823643	25 %	50 %	25 %	0 %	322831497
17020	NC_015061	GCA	2	6	823738	823743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831497
17021	NC_015061	AACAGA	2	12	823877	823888	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17022	NC_015061	CAA	2	6	823942	823947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831498
17023	NC_015061	TGC	2	6	823958	823963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831498
17024	NC_015061	ATA	2	6	824062	824067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831498
17025	NC_015061	ACC	2	6	824108	824113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831498
17026	NC_015061	CGC	2	6	824196	824201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831498
17027	NC_015061	TG	3	6	824273	824278	0 %	50 %	50 %	0 %	322831498
17028	NC_015061	CTG	2	6	824422	824427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831498
17029	NC_015061	GCTGAC	2	12	824647	824658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831498
17030	NC_015061	GTGAAA	2	12	824683	824694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322831498
17031	NC_015061	TA	3	6	824758	824763	50 %	50 %	0 %	0 %	322831498
17032	NC_015061	CTG	2	6	824773	824778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831498
17033	NC_015061	CCG	2	6	824846	824851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17034	NC_015061	CTGA	2	8	824866	824873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17035	NC_015061	GCA	2	6	824889	824894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_015061	GAAAA	2	10	824895	824904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_015061	GCT	2	6	825058	825063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831499
17038	NC_015061	GGC	2	6	825071	825076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831499
17039	NC_015061	GC	4	8	825081	825088	0 %	0 %	50 %	50 %	322831499
17040	NC_015061	TAA	2	6	825135	825140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831499
17041	NC_015061	ATAA	2	8	825148	825155	75 %	25 %	0 %	0 %	322831499
17042	NC_015061	ACA	2	6	825158	825163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831499
17043	NC_015061	AGC	2	6	825166	825171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831499
17044	NC_015061	TTC	2	6	825181	825186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831499
17045	NC_015061	GA	3	6	825292	825297	50 %	0 %	50 %	0 %	322831499
17046	NC_015061	CTG	2	6	825318	825323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831499
17047	NC_015061	CAA	2	6	825354	825359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831499
17048	NC_015061	GCA	2	6	825362	825367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831499
17049	NC_015061	TGCA	2	8	825428	825435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17050	NC_015061	TGC	2	6	825444	825449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17051	NC_015061	CGG	2	6	825642	825647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831500
17052	NC_015061	T	7	7	825744	825750	0 %	100 %	0 %	0 %	322831500
17053	NC_015061	CGG	2	6	825754	825759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831500
17054	NC_015061	CAC	2	6	825837	825842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831500
17055	NC_015061	CCG	2	6	825950	825955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
17056	NC_015061	TGA	2	6	826080	826085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831500
17057	NC_015061	TCG	2	6	826262	826267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831500
17058	NC_015061	GCA	2	6	826269	826274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831500
17059	NC_015061	AAT	2	6	826313	826318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831500
17060	NC_015061	GCC	2	6	826330	826335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
17061	NC_015061	CCG	3	9	826370	826378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831500
17062	NC_015061	AGTGTG	2	12	826463	826474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322831500
17063	NC_015061	GCA	2	6	826546	826551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_015061	CG	3	6	826569	826574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17065	NC_015061	GAT	2	6	826705	826710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831501
17066	NC_015061	A	6	6	826727	826732	100 %	0 %	0 %	0 %	322831501
17067	NC_015061	GCT	2	6	826737	826742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831501
17068	NC_015061	CAT	2	6	826761	826766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831501
17069	NC_015061	GAC	2	6	826774	826779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831501
17070	NC_015061	T	6	6	826782	826787	0 %	100 %	0 %	0 %	322831501
17071	NC_015061	GT	3	6	826789	826794	0 %	50 %	50 %	0 %	322831501
17072	NC_015061	TCA	2	6	826967	826972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831501
17073	NC_015061	GAT	2	6	827068	827073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831501
17074	NC_015061	AGA	2	6	827103	827108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831501
17075	NC_015061	TGG	2	6	827144	827149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831501
17076	NC_015061	GGC	2	6	827232	827237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_015061	TTC	2	6	827260	827265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831502
17078	NC_015061	CTGG	2	8	827296	827303	0 %	25 %	50 %	25 %	322831502
17079	NC_015061	GCTGA	2	10	827383	827392	20 %	20 %	40 %	20 %	322831502
17080	NC_015061	CCG	2	6	827454	827459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831502
17081	NC_015061	GGCA	2	8	827461	827468	25 %	0 %	50 %	25 %	322831502
17082	NC_015061	TGCC	2	8	827481	827488	0 %	25 %	25 %	50 %	322831502
17083	NC_015061	CCA	2	6	827535	827540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831502
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17085	NC_015061	TGG	2	6	827598	827603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831502
17086	NC_015061	ATCA	2	8	827635	827642	50 %	25 %	0 %	25 %	322831502
17087	NC_015061	GCCA	2	8	827669	827676	25 %	0 %	25 %	50 %	322831502
17088	NC_015061	GCTG	2	8	827679	827686	0 %	25 %	50 %	25 %	322831502
17089	NC_015061	CGTTG	2	10	827688	827697	0 %	40 %	40 %	20 %	322831502
17090	NC_015061	TTC	2	6	827713	827718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831502
17091	NC_015061	CAC	2	6	827719	827724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831502
17092	NC_015061	GCA	2	6	827784	827789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831502
17093	NC_015061	TTG	2	6	827803	827808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831502
17094	NC_015061	CTG	2	6	827815	827820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831502
17095	NC_015061	A	6	6	827841	827846	100 %	0 %	0 %	0 %	322831502
17096	NC_015061	AGC	2	6	827857	827862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831502
17097	NC_015061	TG	3	6	827960	827965	0 %	50 %	50 %	0 %	322831502
17098	NC_015061	GCG	2	6	827977	827982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831502
17099	NC_015061	CAGC	2	8	828081	828088	25 %	0 %	25 %	50 %	322831502
17100	NC_015061	TA	3	6	828459	828464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_015061	A	6	6	828488	828493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_015061	TAA	2	6	828530	828535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831503
17103	NC_015061	CGT	2	6	828561	828566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831503
17104	NC_015061	CAT	2	6	828590	828595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831503
17105	NC_015061	TTC	2	6	828600	828605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831503
17106	NC_015061	GAATAT	2	12	828606	828617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	322831503
17107	NC_015061	AAG	2	6	828640	828645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831503
17108	NC_015061	TGA	2	6	828668	828673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831503
17109	NC_015061	TGA	2	6	828694	828699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831503
17110	NC_015061	GTT	2	6	828915	828920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831504
17111	NC_015061	CAGC	2	8	828933	828940	25 %	0 %	25 %	50 %	322831504
17112	NC_015061	GCAC	2	8	828952	828959	25 %	0 %	25 %	50 %	322831504
17113	NC_015061	GAT	2	6	829035	829040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831504
17114	NC_015061	TCG	2	6	829065	829070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831504
17115	NC_015061	TGGC	2	8	829126	829133	0 %	25 %	50 %	25 %	322831504
17116	NC_015061	GGC	2	6	829160	829165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831504
17117	NC_015061	TGC	2	6	829260	829265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17118	NC_015061	CAG	2	6	829288	829293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831505
17119	NC_015061	TTG	2	6	829309	829314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831505
17120	NC_015061	CAT	2	6	829347	829352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831505
17121	NC_015061	AGCC	2	8	829357	829364	25 %	0 %	25 %	50 %	322831505
17122	NC_015061	CGA	2	6	829365	829370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831505
17123	NC_015061	TGA	2	6	829466	829471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831505
17124	NC_015061	CGA	2	6	829539	829544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831505
17125	NC_015061	CAGGAT	2	12	829633	829644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322831505
17126	NC_015061	TTATG	2	10	829680	829689	20 %	60 %	20 %	0 %	322831505
17127	NC_015061	TTC	2	6	829702	829707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831505
17128	NC_015061	T	6	6	829725	829730	0 %	100 %	0 %	0 %	322831505
17129	NC_015061	TGC	2	6	829789	829794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17130	NC_015061	CGT	2	6	829862	829867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17131	NC_015061	CTGA	2	8	829966	829973	25 %	25 %	25 %	25 %	322831506
17132	NC_015061	GCTGG	2	10	830055	830064	0 %	20 %	60 %	20 %	322831506
17133	NC_015061	CAT	2	6	830068	830073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831506
17134	NC_015061	GTT	2	6	830115	830120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831506
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17136	NC_015061	TGT	2	6	830243	830248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831506
17137	NC_015061	GCT	2	6	830367	830372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831506
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17140	NC_015061	ATT	2	6	830519	830524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831506
17141	NC_015061	GCT	2	6	830544	830549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831506
17142	NC_015061	GCA	2	6	830592	830597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831506
17143	NC_015061	GCATC	2	10	830619	830628	20 %	20 %	20 %	40 %	322831506
17144	NC_015061	CCAC	2	8	830699	830706	25 %	0 %	0 %	75 %	322831506
17145	NC_015061	CGT	2	6	830733	830738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831506
17146	NC_015061	TGT	2	6	830744	830749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831506
17147	NC_015061	CA	3	6	830772	830777	50 %	0 %	0 %	50 %	322831506
17148	NC_015061	CAA	2	6	830821	830826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831506
17149	NC_015061	CAT	2	6	830827	830832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831506
17150	NC_015061	GAC	2	6	830861	830866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17151	NC_015061	ATG	2	6	830867	830872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831507
17152	NC_015061	A	6	6	830873	830878	100 %	0 %	0 %	0 %	322831507
17153	NC_015061	TGC	2	6	830886	830891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831507
17154	NC_015061	TGA	2	6	830932	830937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831507
17155	NC_015061	AGC	2	6	830938	830943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831507
17156	NC_015061	CGA	2	6	831052	831057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831507
17157	NC_015061	CAA	2	6	831121	831126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831507
17158	NC_015061	GAA	2	6	831136	831141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831507
17159	NC_015061	GATG	2	8	831142	831149	25 %	25 %	50 %	0 %	322831507
17160	NC_015061	GAT	2	6	831163	831168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831507
17161	NC_015061	CAG	2	6	831248	831253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831507
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17180	NC_015061	TCT	2	6	832016	832021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831508
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17190	NC_015061	GCGCTG	2	12	832613	832624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322831508
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17202	NC_015061	TGA	2	6	833151	833156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831508
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17206	NC_015061	A	7	7	833357	833363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17207	NC_015061	TTC	2	6	833518	833523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831509
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17228	NC_015061	GGT	2	6	834208	834213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831509
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17230	NC_015061	TGCG	2	8	834332	834339	0 %	25 %	50 %	25 %	322831509
17231	NC_015061	TATGAG	2	12	834346	834357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831509
17232	NC_015061	CAG	2	6	834382	834387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831509
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17234	NC_015061	CAG	2	6	834584	834589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831510
17235	NC_015061	AAC	2	6	834619	834624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831510
17236	NC_015061	TCG	2	6	834636	834641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831510
17237	NC_015061	CGT	2	6	834694	834699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831510
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17482	NC_015061	TGA	2	6	846373	846378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831521
17483	NC_015061	TCA	2	6	846411	846416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831521
17484	NC_015061	GCG	2	6	846498	846503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831521
17485	NC_015061	TGG	2	6	846592	846597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831521
17486	NC_015061	TCA	2	6	846641	846646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831522
17487	NC_015061	CGG	2	6	846733	846738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831522
17488	NC_015061	TCG	2	6	846792	846797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831522
17489	NC_015061	GCG	2	6	846853	846858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831522
17490	NC_015061	TGCC	2	8	846889	846896	0 %	25 %	25 %	50 %	322831522
17491	NC_015061	GTT	2	6	846898	846903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831522
17492	NC_015061	GGC	2	6	847004	847009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831522
17493	NC_015061	CCA	2	6	847066	847071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831522
17494	NC_015061	ACTT	2	8	847082	847089	25 %	50 %	0 %	25 %	322831522
17495	NC_015061	CCG	2	6	847123	847128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831522
17496	NC_015061	GCC	2	6	847176	847181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831522
17497	NC_015061	CAT	2	6	847218	847223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831523
17498	NC_015061	CTG	2	6	847248	847253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831523
17499	NC_015061	CTG	2	6	847264	847269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831523
17500	NC_015061	CAA	3	9	847284	847292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831523

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