MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015061	TGG	2	6	724891	724896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831404
15002	NC_015061	GCA	2	6	724949	724954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831404
15003	NC_015061	CCGA	2	8	724959	724966	25 %	0 %	25 %	50 %	322831404
15004	NC_015061	ATT	2	6	725085	725090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831404
15005	NC_015061	GGGC	2	8	725284	725291	0 %	0 %	75 %	25 %	322831404
15006	NC_015061	AGA	2	6	725357	725362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831404
15007	NC_015061	TGTGG	2	10	725396	725405	0 %	40 %	60 %	0 %	322831404
15008	NC_015061	CGG	2	6	725453	725458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831404
15009	NC_015061	TGG	2	6	725560	725565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831404
15010	NC_015061	CGA	2	6	725576	725581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831404
15011	NC_015061	CGG	2	6	725621	725626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831404
15012	NC_015061	ATCG	2	8	725637	725644	25 %	25 %	25 %	25 %	322831404
15013	NC_015061	CTGGT	2	10	725668	725677	0 %	40 %	40 %	20 %	322831404
15014	NC_015061	GC	3	6	725778	725783	0 %	0 %	50 %	50 %	322831404
15015	NC_015061	CTG	2	6	725787	725792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831404
15016	NC_015061	T	6	6	725826	725831	0 %	100 %	0 %	0 %	322831405
15017	NC_015061	TGT	2	6	725844	725849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831405
15018	NC_015061	GTG	2	6	725903	725908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831405
15019	NC_015061	CGA	3	9	726057	726065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831405
15020	NC_015061	TGG	2	6	726110	726115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831405
15021	NC_015061	TCACC	2	10	726148	726157	20 %	20 %	0 %	60 %	322831405
15022	NC_015061	CGC	2	6	726224	726229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831405
15023	NC_015061	A	6	6	726268	726273	100 %	0 %	0 %	0 %	322831405
15024	NC_015061	ATT	2	6	726387	726392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831405
15025	NC_015061	GC	3	6	726408	726413	0 %	0 %	50 %	50 %	322831405
15026	NC_015061	TAT	2	6	726414	726419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831405
15027	NC_015061	ATC	2	6	726482	726487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_015061	C	6	6	726550	726555	0 %	0 %	0 %	100 %	322831406
15029	NC_015061	TCCT	2	8	726602	726609	0 %	50 %	0 %	50 %	322831406
15030	NC_015061	TCT	2	6	726640	726645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831406
15031	NC_015061	CTGG	2	8	726647	726654	0 %	25 %	50 %	25 %	322831406
15032	NC_015061	TTC	2	6	726720	726725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831406
15033	NC_015061	CT	3	6	726800	726805	0 %	50 %	0 %	50 %	322831406
15034	NC_015061	TCT	2	6	726844	726849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831406
15035	NC_015061	CTGG	2	8	726859	726866	0 %	25 %	50 %	25 %	322831406
15036	NC_015061	TGCG	2	8	726939	726946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_015061	GAT	2	6	727006	727011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_015061	T	6	6	727020	727025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_015061	TGGC	2	8	727072	727079	0 %	25 %	50 %	25 %	322831407
15040	NC_015061	CAA	2	6	727151	727156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831407
15041	NC_015061	TAA	2	6	727159	727164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831407
15042	NC_015061	CGA	2	6	727207	727212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831407
15043	NC_015061	CGG	2	6	727219	727224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831407
15044	NC_015061	GAA	2	6	727238	727243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831407
15045	NC_015061	CGCA	2	8	727246	727253	25 %	0 %	25 %	50 %	322831407
15046	NC_015061	ACA	2	6	727305	727310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831407
15047	NC_015061	AAC	2	6	727340	727345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831407
15048	NC_015061	GCAG	2	8	727431	727438	25 %	0 %	50 %	25 %	322831408
15049	NC_015061	TGC	2	6	727502	727507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831408
15050	NC_015061	AGTC	2	8	727518	727525	25 %	25 %	25 %	25 %	322831408
15051	NC_015061	AAC	2	6	727565	727570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831408
15052	NC_015061	ATG	2	6	727682	727687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831408
15053	NC_015061	GC	3	6	727690	727695	0 %	0 %	50 %	50 %	322831408
15054	NC_015061	CTG	2	6	727726	727731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831408
15055	NC_015061	CCA	3	9	727739	727747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831408
15056	NC_015061	GCC	2	6	727768	727773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831408
15057	NC_015061	GTG	2	6	727796	727801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831408
15058	NC_015061	CGC	2	6	727862	727867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831408
15059	NC_015061	CCTG	2	8	727895	727902	0 %	25 %	25 %	50 %	322831408
15060	NC_015061	GGT	2	6	727926	727931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831408
15061	NC_015061	ATA	2	6	727997	728002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831408
15062	NC_015061	AGA	2	6	728019	728024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831408
15063	NC_015061	AGG	2	6	728063	728068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831408
15064	NC_015061	GGT	2	6	728139	728144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831409
15065	NC_015061	CGCTG	2	10	728231	728240	0 %	20 %	40 %	40 %	322831409
15066	NC_015061	CTG	2	6	728304	728309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831409
15067	NC_015061	ATC	2	6	728370	728375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831409
15068	NC_015061	AGA	2	6	728429	728434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831409
15069	NC_015061	CTG	2	6	728535	728540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831409
15070	NC_015061	ATG	2	6	728549	728554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831409
15071	NC_015061	GATA	2	8	728574	728581	50 %	25 %	25 %	0 %	322831410
15072	NC_015061	CTG	2	6	728626	728631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15073	NC_015061	AAC	2	6	728750	728755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831410
15074	NC_015061	CG	3	6	728780	728785	0 %	0 %	50 %	50 %	322831410
15075	NC_015061	TGC	2	6	728972	728977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15076	NC_015061	A	6	6	729017	729022	100 %	0 %	0 %	0 %	322831410
15077	NC_015061	GTG	2	6	729071	729076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831410
15078	NC_015061	AAT	2	6	729079	729084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831410
15079	NC_015061	TCG	2	6	729185	729190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15080	NC_015061	CCAG	2	8	729191	729198	25 %	0 %	25 %	50 %	322831410
15081	NC_015061	GCT	2	6	729300	729305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15082	NC_015061	CG	3	6	729308	729313	0 %	0 %	50 %	50 %	322831410
15083	NC_015061	AGG	2	6	729416	729421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831410
15084	NC_015061	GCT	2	6	729432	729437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15085	NC_015061	CGT	2	6	729463	729468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15086	NC_015061	CAT	2	6	729471	729476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831410
15087	NC_015061	GAT	2	6	729511	729516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831410
15088	NC_015061	CCGG	2	8	729544	729551	0 %	0 %	50 %	50 %	322831410
15089	NC_015061	CCA	2	6	729560	729565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831410
15090	NC_015061	GTG	2	6	729568	729573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831410
15091	NC_015061	TGA	2	6	729581	729586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831410
15092	NC_015061	ACG	3	9	729621	729629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831410
15093	NC_015061	TGACG	2	10	729682	729691	20 %	20 %	40 %	20 %	322831411
15094	NC_015061	TGG	2	6	729693	729698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831411
15095	NC_015061	GCG	2	6	729717	729722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831411
15096	NC_015061	CCG	2	6	729783	729788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831411
15097	NC_015061	CCGA	2	8	729803	729810	25 %	0 %	25 %	50 %	322831411
15098	NC_015061	TG	3	6	729812	729817	0 %	50 %	50 %	0 %	322831411
15099	NC_015061	GAC	2	6	729896	729901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831411
15100	NC_015061	CGC	3	9	729922	729930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831411
15101	NC_015061	GCC	2	6	729939	729944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831411
15102	NC_015061	CGG	2	6	729999	730004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831411
15103	NC_015061	ATC	2	6	730007	730012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831411
15104	NC_015061	CAG	2	6	730163	730168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831411
15105	NC_015061	CCG	2	6	730202	730207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831411
15106	NC_015061	TGC	2	6	730243	730248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831411
15107	NC_015061	CTG	2	6	730380	730385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831412
15108	NC_015061	AAC	2	6	730387	730392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831412
15109	NC_015061	CAG	2	6	730398	730403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831412
15110	NC_015061	ATG	2	6	730411	730416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831412
15111	NC_015061	GCT	2	6	730562	730567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831412
15112	NC_015061	CGT	2	6	730579	730584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831412
15113	NC_015061	ATT	2	6	730788	730793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831412
15114	NC_015061	CTG	2	6	730798	730803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831412
15115	NC_015061	CCT	2	6	730806	730811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831412
15116	NC_015061	CAA	2	6	730833	730838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831412
15117	NC_015061	GAT	2	6	730842	730847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831412
15118	NC_015061	GGC	2	6	730848	730853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831412
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15120	NC_015061	ACG	2	6	730904	730909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831412
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15231	NC_015061	TGT	2	6	736267	736272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15242	NC_015061	TGCC	2	8	736777	736784	0 %	25 %	25 %	50 %	322831416
15243	NC_015061	GCG	2	6	736822	736827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
15244	NC_015061	GCA	2	6	736905	736910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
15245	NC_015061	GACA	2	8	736957	736964	50 %	0 %	25 %	25 %	322831416
15246	NC_015061	ACC	2	6	736989	736994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831416
15247	NC_015061	TGA	2	6	737237	737242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
15248	NC_015061	ACG	2	6	737245	737250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
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15250	NC_015061	GTG	2	6	737308	737313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831416
15251	NC_015061	TGC	2	6	737327	737332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831416
15252	NC_015061	GACA	2	8	737393	737400	50 %	0 %	25 %	25 %	322831416
15253	NC_015061	GCA	2	6	737452	737457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
15254	NC_015061	AGC	2	6	737461	737466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
15255	NC_015061	GAT	2	6	737688	737693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
15256	NC_015061	TGA	2	6	737735	737740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
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15259	NC_015061	ATT	2	6	737898	737903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831416
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15264	NC_015061	CG	3	6	738181	738186	0 %	0 %	50 %	50 %	322831416
15265	NC_015061	CGT	2	6	738200	738205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831416
15266	NC_015061	GAT	2	6	738273	738278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
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15268	NC_015061	TGA	2	6	738377	738382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
15269	NC_015061	AT	3	6	738389	738394	50 %	50 %	0 %	0 %	322831416
15270	NC_015061	GAT	2	6	738462	738467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831416
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15274	NC_015061	GCCA	2	8	738591	738598	25 %	0 %	25 %	50 %	322831416
15275	NC_015061	GCG	2	6	738655	738660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831416
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15277	NC_015061	CCT	2	6	738719	738724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831416
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15282	NC_015061	CAG	2	6	738905	738910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831416
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15284	NC_015061	AAT	2	6	739018	739023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831416
15285	NC_015061	GAT	2	6	739098	739103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15287	NC_015061	TAA	2	6	739122	739127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15288	NC_015061	TTC	2	6	739195	739200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831417
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15308	NC_015061	CTT	2	6	740322	740327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15309	NC_015061	AGG	2	6	740431	740436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15310	NC_015061	GCG	2	6	740483	740488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831418
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15312	NC_015061	AGTG	2	8	740671	740678	25 %	25 %	50 %	0 %	322831418
15313	NC_015061	GGT	2	6	740683	740688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831418
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15319	NC_015061	TTA	2	6	740922	740927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831418
15320	NC_015061	GAG	2	6	741032	741037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15321	NC_015061	TGA	2	6	741051	741056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831419
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15323	NC_015061	CAT	2	6	741120	741125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
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15326	NC_015061	GCT	2	6	741286	741291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
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15328	NC_015061	TCGATA	2	12	741371	741382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831419
15329	NC_015061	CTG	2	6	741385	741390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
15330	NC_015061	ATC	2	6	741466	741471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
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15332	NC_015061	CTG	2	6	741607	741612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
15333	NC_015061	TCA	2	6	741617	741622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831419
15334	NC_015061	ACC	3	9	741667	741675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831419
15335	NC_015061	CGT	2	6	741721	741726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
15336	NC_015061	AAG	2	6	741740	741745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831419
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15339	NC_015061	ATCAAC	2	12	741847	741858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	322831419
15340	NC_015061	TGC	2	6	741990	741995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
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15342	NC_015061	TGC	2	6	742022	742027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831419
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15344	NC_015061	GAC	2	6	742075	742080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831419
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15346	NC_015061	A	6	6	742253	742258	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
15347	NC_015061	TCG	2	6	742259	742264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831420
15348	NC_015061	A	6	6	742270	742275	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
15349	NC_015061	A	6	6	742327	742332	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
15350	NC_015061	CCA	2	6	742435	742440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831420
15351	NC_015061	TCA	2	6	742480	742485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831420
15352	NC_015061	A	6	6	742489	742494	100 %	0 %	0 %	0 %	322831420
15353	NC_015061	GAA	2	6	742516	742521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
15354	NC_015061	GGT	2	6	742524	742529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831420
15355	NC_015061	AGA	2	6	742560	742565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
15356	NC_015061	GAA	2	6	742573	742578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831420
15357	NC_015061	ACT	2	6	742598	742603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831420
15358	NC_015061	GAT	2	6	742624	742629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831420
15359	NC_015061	GCGCA	2	10	742681	742690	20 %	0 %	40 %	40 %	322831420
15360	NC_015061	GACT	2	8	742818	742825	25 %	25 %	25 %	25 %	322831420
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15362	NC_015061	CTT	2	6	742869	742874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831420
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15364	NC_015061	TTATC	2	10	742953	742962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15365	NC_015061	TCGT	2	8	742972	742979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15482	NC_015061	GTGA	2	8	749659	749666	25 %	25 %	50 %	0 %	322831425
15483	NC_015061	TAAGC	2	10	749751	749760	40 %	20 %	20 %	20 %	322831425
15484	NC_015061	GAA	2	6	749764	749769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831425
15485	NC_015061	GCAG	2	8	749785	749792	25 %	0 %	50 %	25 %	322831425
15486	NC_015061	AGAAA	2	10	749804	749813	80 %	0 %	20 %	0 %	322831425
15487	NC_015061	GAT	3	9	749858	749866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15488	NC_015061	A	8	8	749929	749936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_015061	ATTT	2	8	749940	749947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15490	NC_015061	GCA	2	6	750005	750010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831426
15491	NC_015061	CTG	2	6	750012	750017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831426
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15493	NC_015061	ATC	2	6	750159	750164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831426
15494	NC_015061	AACGGT	2	12	750167	750178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322831426
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15500	NC_015061	GCACA	2	10	750389	750398	40 %	0 %	20 %	40 %	322831426

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