MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015061	GTG	2	6	677554	677559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831367
14002	NC_015061	GTC	2	6	677654	677659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831367
14003	NC_015061	CGTC	2	8	677774	677781	0 %	25 %	25 %	50 %	322831367
14004	NC_015061	A	7	7	677809	677815	100 %	0 %	0 %	0 %	322831367
14005	NC_015061	GCCTG	2	10	677816	677825	0 %	20 %	40 %	40 %	322831367
14006	NC_015061	CTG	2	6	677866	677871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831367
14007	NC_015061	GGT	2	6	677916	677921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831367
14008	NC_015061	CGTGGT	2	12	677980	677991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322831367
14009	NC_015061	GCG	2	6	678022	678027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831367
14010	NC_015061	TGC	2	6	678030	678035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831367
14011	NC_015061	CAA	2	6	678075	678080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831367
14012	NC_015061	GCC	2	6	678247	678252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831367
14013	NC_015061	A	7	7	678255	678261	100 %	0 %	0 %	0 %	322831367
14014	NC_015061	AAT	2	6	678285	678290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_015061	TTC	2	6	678332	678337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_015061	GGC	3	9	678352	678360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_015061	GTC	2	6	678409	678414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831368
14018	NC_015061	CGC	2	6	678525	678530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831368
14019	NC_015061	G	6	6	678578	678583	0 %	0 %	100 %	0 %	322831368
14020	NC_015061	GCG	2	6	678646	678651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831368
14021	NC_015061	GCA	2	6	678744	678749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831368
14022	NC_015061	GGC	3	9	678800	678808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831368
14023	NC_015061	CTG	2	6	678812	678817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831368
14024	NC_015061	TTG	2	6	678883	678888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831368
14025	NC_015061	GAT	2	6	678936	678941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831368
14026	NC_015061	TTC	2	6	679017	679022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831368
14027	NC_015061	CTG	2	6	679095	679100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831368
14028	NC_015061	CCG	2	6	679115	679120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831368
14029	NC_015061	CG	3	6	679146	679151	0 %	0 %	50 %	50 %	322831368
14030	NC_015061	CGT	2	6	679157	679162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831368
14031	NC_015061	CTGC	2	8	679182	679189	0 %	25 %	25 %	50 %	322831368
14032	NC_015061	CGC	2	6	679230	679235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831368
14033	NC_015061	TGG	2	6	679243	679248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831368
14034	NC_015061	GAA	2	6	679263	679268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831368
14035	NC_015061	CGA	2	6	679348	679353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831368
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14037	NC_015061	TTG	2	6	679380	679385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831368
14038	NC_015061	TCCT	2	8	679605	679612	0 %	50 %	0 %	50 %	322831368
14039	NC_015061	TGG	2	6	679642	679647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831368
14040	NC_015061	GTT	2	6	679816	679821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_015061	A	7	7	679831	679837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_015061	TTC	2	6	679947	679952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831369
14043	NC_015061	CGC	2	6	680126	680131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831369
14044	NC_015061	GTGG	2	8	680169	680176	0 %	25 %	75 %	0 %	322831369
14045	NC_015061	GTT	2	6	680198	680203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831369
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14047	NC_015061	CAG	2	6	680334	680339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831369
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14050	NC_015061	GGC	2	6	680559	680564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831369
14051	NC_015061	TGG	2	6	680612	680617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831369
14052	NC_015061	TGA	2	6	680684	680689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831369
14053	NC_015061	GTTGC	2	10	680693	680702	0 %	40 %	40 %	20 %	322831369
14054	NC_015061	CCG	2	6	680732	680737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14055	NC_015061	A	6	6	680823	680828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_015061	GCAT	2	8	680836	680843	25 %	25 %	25 %	25 %	322831370
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14058	NC_015061	CGGT	2	8	680990	680997	0 %	25 %	50 %	25 %	322831370
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14064	NC_015061	TGA	2	6	681249	681254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831370
14065	NC_015061	AGCGC	2	10	681293	681302	20 %	0 %	40 %	40 %	322831370
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14069	NC_015061	GCC	2	6	681483	681488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831370
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14079	NC_015061	CGAA	2	8	681943	681950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14081	NC_015061	GAT	2	6	682069	682074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14083	NC_015061	AATG	2	8	682156	682163	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_015061	TG	3	6	682162	682167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_015061	ATG	2	6	682175	682180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831371
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14091	NC_015061	TG	3	6	682599	682604	0 %	50 %	50 %	0 %	322831371
14092	NC_015061	CTG	2	6	682616	682621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831371
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14105	NC_015061	GCA	2	6	683365	683370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831372
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14108	NC_015061	TGA	2	6	683448	683453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831372
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14118	NC_015061	ATT	2	6	683925	683930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_015061	CGAA	2	8	683940	683947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14120	NC_015061	CA	3	6	683955	683960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_015061	GT	3	6	683978	683983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_015061	GTC	2	6	684047	684052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
14123	NC_015061	CTG	2	6	684109	684114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
14124	NC_015061	TTC	2	6	684131	684136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831373
14125	NC_015061	TGC	2	6	684310	684315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831373
14126	NC_015061	ACC	2	6	684336	684341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831373
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14152	NC_015061	CCG	2	6	685236	685241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14153	NC_015061	TTAAC	2	10	685250	685259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14154	NC_015061	ATG	2	6	685260	685265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14157	NC_015061	CGT	2	6	685332	685337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14225	NC_015061	T	8	8	688522	688529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14229	NC_015061	AC	3	6	688696	688701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14230	NC_015061	CTGG	2	8	688707	688714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14231	NC_015061	GTTG	2	8	688780	688787	0 %	50 %	50 %	0 %	322831377
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14244	NC_015061	TCG	2	6	689355	689360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831377
14245	NC_015061	CAT	2	6	689383	689388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831377
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14262	NC_015061	A	6	6	690133	690138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_015061	TGG	2	6	690309	690314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831379
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14293	NC_015061	A	6	6	691786	691791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14294	NC_015061	AAT	2	6	691821	691826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14295	NC_015061	TG	3	6	691936	691941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14296	NC_015061	TTTGA	2	10	691976	691985	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14299	NC_015061	CAAT	2	8	692055	692062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14361	NC_015061	GCG	2	6	695404	695409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14362	NC_015061	CG	3	6	695412	695417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14363	NC_015061	TGAA	2	8	695422	695429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14365	NC_015061	GC	3	6	695438	695443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14366	NC_015061	CAGG	2	8	695451	695458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14367	NC_015061	AAAG	2	8	695551	695558	75 %	0 %	25 %	0 %	322831383
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14485	NC_015061	GCG	2	6	701262	701267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831386
14486	NC_015061	TTA	2	6	701268	701273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831386
14487	NC_015061	CCG	2	6	701345	701350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831386
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14489	NC_015061	TGC	2	6	701482	701487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831386
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