MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015061	GCT	2	6	652991	652996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831345
13502	NC_015061	TCAAA	2	10	653006	653015	60 %	20 %	0 %	20 %	322831345
13503	NC_015061	GTT	2	6	653018	653023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831345
13504	NC_015061	TGG	2	6	653050	653055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831345
13505	NC_015061	CGG	2	6	653057	653062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831345
13506	NC_015061	TGC	2	6	653075	653080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831345
13507	NC_015061	A	6	6	653097	653102	100 %	0 %	0 %	0 %	322831345
13508	NC_015061	G	6	6	653214	653219	0 %	0 %	100 %	0 %	322831345
13509	NC_015061	CTG	2	6	653265	653270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831345
13510	NC_015061	GAT	3	9	653279	653287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831345
13511	NC_015061	TTG	2	6	653380	653385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831345
13512	NC_015061	TTC	2	6	653457	653462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831345
13513	NC_015061	CGG	2	6	653544	653549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_015061	GTTT	2	8	653596	653603	0 %	75 %	25 %	0 %	322831346
13515	NC_015061	TTC	2	6	653632	653637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831346
13516	NC_015061	TCA	2	6	653641	653646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831346
13517	NC_015061	GCT	2	6	653697	653702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831346
13518	NC_015061	ATT	2	6	653748	653753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831346
13519	NC_015061	CG	3	6	653771	653776	0 %	0 %	50 %	50 %	322831346
13520	NC_015061	ATC	2	6	653797	653802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831346
13521	NC_015061	TCC	2	6	653965	653970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831346
13522	NC_015061	CGCC	2	8	653981	653988	0 %	0 %	25 %	75 %	322831346
13523	NC_015061	GCG	3	9	654020	654028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831346
13524	NC_015061	TCA	2	6	654110	654115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831346
13525	NC_015061	GTAT	2	8	654118	654125	25 %	50 %	25 %	0 %	322831346
13526	NC_015061	AAT	2	6	654172	654177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831346
13527	NC_015061	GCA	2	6	654221	654226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831346
13528	NC_015061	TTTC	2	8	654272	654279	0 %	75 %	0 %	25 %	322831346
13529	NC_015061	CA	3	6	654280	654285	50 %	0 %	0 %	50 %	322831346
13530	NC_015061	GCA	2	6	654385	654390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831346
13531	NC_015061	GTT	2	6	654458	654463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831346
13532	NC_015061	GTGA	2	8	654648	654655	25 %	25 %	50 %	0 %	322831346
13533	NC_015061	CTG	2	6	654690	654695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831346
13534	NC_015061	AT	3	6	654712	654717	50 %	50 %	0 %	0 %	322831346
13535	NC_015061	ACC	2	6	654736	654741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831346
13536	NC_015061	CAGG	2	8	654758	654765	25 %	0 %	50 %	25 %	322831346
13537	NC_015061	TAA	2	6	654768	654773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831346
13538	NC_015061	GCC	2	6	654789	654794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831346
13539	NC_015061	TCA	2	6	654849	654854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_015061	CTGA	2	8	654879	654886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13541	NC_015061	T	6	6	654961	654966	0 %	100 %	0 %	0 %	322831347
13542	NC_015061	CAG	2	6	654994	654999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831347
13543	NC_015061	CCG	2	6	655028	655033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831347
13544	NC_015061	CATA	2	8	655035	655042	50 %	25 %	0 %	25 %	322831347
13545	NC_015061	TTTG	2	8	655065	655072	0 %	75 %	25 %	0 %	322831347
13546	NC_015061	TCG	2	6	655073	655078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831347
13547	NC_015061	CTT	3	9	655102	655110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831347
13548	NC_015061	TCTT	2	8	655145	655152	0 %	75 %	0 %	25 %	322831347
13549	NC_015061	TGA	2	6	655161	655166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831347
13550	NC_015061	TGT	2	6	655262	655267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831347
13551	NC_015061	CAA	2	6	655350	655355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831347
13552	NC_015061	CTT	2	6	655398	655403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831347
13553	NC_015061	TCG	2	6	655472	655477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831347
13554	NC_015061	TCA	2	6	655493	655498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831347
13555	NC_015061	ATT	2	6	655562	655567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831347
13556	NC_015061	TCT	2	6	655627	655632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_015061	GAC	2	6	655708	655713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_015061	GC	3	6	655767	655772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_015061	GCA	2	6	655816	655821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_015061	GTG	2	6	656063	656068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831348
13561	NC_015061	G	7	7	656068	656074	0 %	0 %	100 %	0 %	322831348
13562	NC_015061	AGAA	2	8	656181	656188	75 %	0 %	25 %	0 %	322831348
13563	NC_015061	CGCTC	2	10	656191	656200	0 %	20 %	20 %	60 %	322831348
13564	NC_015061	GTG	2	6	656282	656287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831348
13565	NC_015061	A	6	6	656333	656338	100 %	0 %	0 %	0 %	322831348
13566	NC_015061	CCG	2	6	656346	656351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831348
13567	NC_015061	CTGGCG	2	12	656357	656368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322831348
13568	NC_015061	GC	3	6	656379	656384	0 %	0 %	50 %	50 %	322831348
13569	NC_015061	CGG	2	6	656386	656391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831348
13570	NC_015061	GGT	2	6	656402	656407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831348
13571	NC_015061	GGC	2	6	656416	656421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831348
13572	NC_015061	ATC	2	6	656430	656435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831348
13573	NC_015061	GAA	2	6	656561	656566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831348
13574	NC_015061	GC	3	6	656591	656596	0 %	0 %	50 %	50 %	322831348
13575	NC_015061	CGG	2	6	656647	656652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831348
13576	NC_015061	CTTA	2	8	656689	656696	25 %	50 %	0 %	25 %	322831348
13577	NC_015061	CGG	2	6	656727	656732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831348
13578	NC_015061	CTGG	2	8	656791	656798	0 %	25 %	50 %	25 %	322831348
13579	NC_015061	TGA	2	6	656824	656829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831348
13580	NC_015061	A	7	7	656840	656846	100 %	0 %	0 %	0 %	322831348
13581	NC_015061	CAT	2	6	656875	656880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831348
13582	NC_015061	GCC	2	6	656894	656899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831348
13583	NC_015061	AAG	2	6	656907	656912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831348
13584	NC_015061	GAA	2	6	656933	656938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831348
13585	NC_015061	GC	3	6	656957	656962	0 %	0 %	50 %	50 %	322831348
13586	NC_015061	CAG	2	6	657068	657073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831348
13587	NC_015061	GGA	2	6	657085	657090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831348
13588	NC_015061	TGA	2	6	657111	657116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831348
13589	NC_015061	T	8	8	657184	657191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_015061	TCT	2	6	657221	657226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831349
13591	NC_015061	GAT	2	6	657296	657301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
13592	NC_015061	AGC	2	6	657320	657325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13593	NC_015061	GTG	2	6	657364	657369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831349
13594	NC_015061	GGA	2	6	657430	657435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831349
13595	NC_015061	TGA	2	6	657468	657473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
13596	NC_015061	TCG	3	9	657490	657498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13597	NC_015061	ATT	2	6	657583	657588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831349
13598	NC_015061	ACG	2	6	657615	657620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13599	NC_015061	TGC	2	6	657652	657657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13600	NC_015061	GCG	3	9	657702	657710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
13601	NC_015061	CGG	2	6	657772	657777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
13602	NC_015061	GCG	2	6	657778	657783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
13603	NC_015061	TGA	2	6	657918	657923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
13604	NC_015061	GGA	2	6	657937	657942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831349
13605	NC_015061	TTA	2	6	657943	657948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831349
13606	NC_015061	GCG	2	6	658005	658010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831349
13607	NC_015061	GGA	2	6	658012	658017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831349
13608	NC_015061	CAG	2	6	658021	658026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13609	NC_015061	CCG	2	6	658063	658068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831349
13610	NC_015061	CGC	2	6	658133	658138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831349
13611	NC_015061	ACA	2	6	658152	658157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831349
13612	NC_015061	GGCG	2	8	658223	658230	0 %	0 %	75 %	25 %	322831349
13613	NC_015061	GCA	2	6	658243	658248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13614	NC_015061	GCGT	2	8	658249	658256	0 %	25 %	50 %	25 %	322831349
13615	NC_015061	TGC	2	6	658257	658262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13616	NC_015061	TGA	2	6	658522	658527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
13617	NC_015061	GAT	2	6	658544	658549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
13618	NC_015061	CAG	2	6	658567	658572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13619	NC_015061	CCG	2	6	658672	658677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831349
13620	NC_015061	TGC	2	6	658803	658808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13621	NC_015061	ACG	2	6	658826	658831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13622	NC_015061	GCT	2	6	658840	658845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831349
13623	NC_015061	CGC	2	6	658888	658893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831349
13624	NC_015061	CGCC	2	8	658918	658925	0 %	0 %	25 %	75 %	322831349
13625	NC_015061	AC	3	6	658953	658958	50 %	0 %	0 %	50 %	322831349
13626	NC_015061	CGA	2	6	658996	659001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831349
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13631	NC_015061	CAGC	2	8	659222	659229	25 %	0 %	25 %	50 %	322831349
13632	NC_015061	GGATCT	2	12	659311	659322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322831349
13633	NC_015061	TGA	2	6	659352	659357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831349
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13644	NC_015061	GAA	2	6	659891	659896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831349
13645	NC_015061	TCA	2	6	659944	659949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831349
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13647	NC_015061	GC	4	8	660004	660011	0 %	0 %	50 %	50 %	322831349
13648	NC_015061	CTGG	2	8	660034	660041	0 %	25 %	50 %	25 %	322831349
13649	NC_015061	GATTT	2	10	660104	660113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13650	NC_015061	CG	3	6	660161	660166	0 %	0 %	50 %	50 %	322831350
13651	NC_015061	GCCGGT	2	12	660241	660252	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322831350
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13654	NC_015061	CTT	2	6	660327	660332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831350
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13658	NC_015061	ACTG	2	8	660601	660608	25 %	25 %	25 %	25 %	322831350
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13680	NC_015061	ATC	2	6	661532	661537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831350
13681	NC_015061	TCC	2	6	661564	661569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13682	NC_015061	CTTTT	2	10	661614	661623	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13683	NC_015061	TCAA	2	8	661631	661638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13684	NC_015061	TGT	2	6	661661	661666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831351
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13692	NC_015061	CGC	2	6	661967	661972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831351
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13698	NC_015061	TGG	3	9	662137	662145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831351
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13720	NC_015061	TCAG	2	8	663009	663016	25 %	25 %	25 %	25 %	322831352
13721	NC_015061	GCA	2	6	663030	663035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831352
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13724	NC_015061	T	7	7	663235	663241	0 %	100 %	0 %	0 %	322831352
13725	NC_015061	AGG	2	6	663272	663277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13726	NC_015061	TGCTC	2	10	663352	663361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13727	NC_015061	GTT	2	6	663378	663383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13728	NC_015061	CGG	2	6	663418	663423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13729	NC_015061	CAG	2	6	663503	663508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13731	NC_015061	T	6	6	663595	663600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13732	NC_015061	GGC	2	6	663621	663626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13733	NC_015061	CCT	2	6	663636	663641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13734	NC_015061	GT	3	6	663777	663782	0 %	50 %	50 %	0 %	322831353
13735	NC_015061	ATG	2	6	663938	663943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831353
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13981	NC_015061	GAA	2	6	676497	676502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831366
13982	NC_015061	GAGC	2	8	676514	676521	25 %	0 %	50 %	25 %	322831366
13983	NC_015061	TCCG	2	8	676532	676539	0 %	25 %	25 %	50 %	322831366
13984	NC_015061	GTG	2	6	676674	676679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831366
13985	NC_015061	GC	3	6	676734	676739	0 %	0 %	50 %	50 %	322831366
13986	NC_015061	ACC	2	6	676772	676777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831366
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13991	NC_015061	TGT	2	6	676975	676980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831366
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13993	NC_015061	TCCG	2	8	677173	677180	0 %	25 %	25 %	50 %	322831366
13994	NC_015061	CG	3	6	677233	677238	0 %	0 %	50 %	50 %	322831366
13995	NC_015061	ATCG	2	8	677250	677257	25 %	25 %	25 %	25 %	322831366
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13997	NC_015061	GAA	2	6	677301	677306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831366
13998	NC_015061	TAA	2	6	677417	677422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_015061	ATGTT	2	10	677522	677531	20 %	60 %	20 %	0 %	322831367
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