MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015061	GCGG	2	8	605199	605206	0 %	0 %	75 %	25 %	322831284
12502	NC_015061	ACG	2	6	605242	605247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831284
12503	NC_015061	ACA	2	6	605298	605303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831284
12504	NC_015061	TTAT	2	8	605306	605313	25 %	75 %	0 %	0 %	322831284
12505	NC_015061	TG	3	6	605314	605319	0 %	50 %	50 %	0 %	322831284
12506	NC_015061	TTA	2	6	605410	605415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831284
12507	NC_015061	CATCC	2	10	605481	605490	20 %	20 %	0 %	60 %	322831284
12508	NC_015061	GGC	2	6	605514	605519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831284
12509	NC_015061	ATG	2	6	605521	605526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831284
12510	NC_015061	ACC	2	6	605547	605552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831284
12511	NC_015061	TTA	2	6	605579	605584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831284
12512	NC_015061	GC	3	6	605592	605597	0 %	0 %	50 %	50 %	322831284
12513	NC_015061	GCC	2	6	605602	605607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831284
12514	NC_015061	CCA	2	6	605653	605658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831284
12515	NC_015061	CGA	2	6	605690	605695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831284
12516	NC_015061	AGGGA	2	10	605702	605711	40 %	0 %	60 %	0 %	322831284
12517	NC_015061	AC	3	6	605766	605771	50 %	0 %	0 %	50 %	322831285
12518	NC_015061	TGAAA	2	10	605917	605926	60 %	20 %	20 %	0 %	322831285
12519	NC_015061	CGG	2	6	605952	605957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831285
12520	NC_015061	AGC	2	6	605966	605971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831285
12521	NC_015061	CTG	2	6	605984	605989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831285
12522	NC_015061	TGA	2	6	606016	606021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831285
12523	NC_015061	GC	3	6	606026	606031	0 %	0 %	50 %	50 %	322831285
12524	NC_015061	TGGC	2	8	606032	606039	0 %	25 %	50 %	25 %	322831285
12525	NC_015061	GGC	2	6	606110	606115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831285
12526	NC_015061	ATC	2	6	606125	606130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831285
12527	NC_015061	GGC	2	6	606137	606142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831285
12528	NC_015061	GCG	2	6	606180	606185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831285
12529	NC_015061	AAT	2	6	606221	606226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831285
12530	NC_015061	CAA	2	6	606243	606248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831285
12531	NC_015061	T	6	6	606339	606344	0 %	100 %	0 %	0 %	322831285
12532	NC_015061	ATT	2	6	606409	606414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831286
12533	NC_015061	T	8	8	606541	606548	0 %	100 %	0 %	0 %	322831286
12534	NC_015061	CCA	2	6	606550	606555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831286
12535	NC_015061	GGC	2	6	606605	606610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831286
12536	NC_015061	TGTT	2	8	606635	606642	0 %	75 %	25 %	0 %	322831286
12537	NC_015061	TCC	2	6	606653	606658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831286
12538	NC_015061	TGG	2	6	606726	606731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_015061	CCA	2	6	606748	606753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12540	NC_015061	AAT	2	6	606799	606804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_015061	A	6	6	606858	606863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_015061	GTCC	2	8	606873	606880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_015061	TGGA	2	8	606887	606894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_015061	GGAC	2	8	606902	606909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12545	NC_015061	T	6	6	606976	606981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_015061	TTG	2	6	606994	606999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_015061	AGC	2	6	607143	607148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_015061	AG	3	6	607170	607175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_015061	ACTA	2	8	607245	607252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12550	NC_015061	GGC	2	6	607333	607338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831287
12551	NC_015061	CATGGG	2	12	607360	607371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831287
12552	NC_015061	GTG	2	6	607396	607401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831287
12553	NC_015061	GAA	2	6	607419	607424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831287
12554	NC_015061	GAT	2	6	607468	607473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_015061	CCA	2	6	607543	607548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_015061	TCA	3	9	607661	607669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831288
12557	NC_015061	CCA	2	6	607706	607711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831288
12558	NC_015061	TCA	3	9	607748	607756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831288
12559	NC_015061	A	6	6	607756	607761	100 %	0 %	0 %	0 %	322831288
12560	NC_015061	CTG	2	6	607849	607854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831288
12561	NC_015061	GA	3	6	607911	607916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_015061	AAC	2	6	607941	607946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_015061	A	7	7	607984	607990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_015061	TGG	2	6	608030	608035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_015061	TTAT	2	8	608101	608108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_015061	TA	3	6	608109	608114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_015061	TA	3	6	608155	608160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_015061	TTA	2	6	608232	608237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_015061	AGTT	2	8	608328	608335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_015061	ATT	2	6	608354	608359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_015061	GACG	2	8	608360	608367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12572	NC_015061	GTA	2	6	608368	608373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_015061	GGA	2	6	608388	608393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831289
12574	NC_015061	CAAGTT	2	12	608530	608541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831289
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12576	NC_015061	A	7	7	608652	608658	100 %	0 %	0 %	0 %	322831289
12577	NC_015061	TGTA	2	8	608680	608687	25 %	50 %	25 %	0 %	322831289
12578	NC_015061	CA	3	6	608827	608832	50 %	0 %	0 %	50 %	322831289
12579	NC_015061	AGC	2	6	608972	608977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831289
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12581	NC_015061	CT	3	6	609113	609118	0 %	50 %	0 %	50 %	322831289
12582	NC_015061	ATT	2	6	609200	609205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831289
12583	NC_015061	TA	3	6	609235	609240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12587	NC_015061	ATTA	2	8	609512	609519	50 %	50 %	0 %	0 %	322831290
12588	NC_015061	GAT	2	6	609549	609554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831290
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12591	NC_015061	CTT	2	6	609703	609708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831290
12592	NC_015061	TTTC	2	8	609759	609766	0 %	75 %	0 %	25 %	322831290
12593	NC_015061	AAAAT	2	10	609779	609788	80 %	20 %	0 %	0 %	322831290
12594	NC_015061	GAT	2	6	609870	609875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831290
12595	NC_015061	TA	3	6	609914	609919	50 %	50 %	0 %	0 %	322831290
12596	NC_015061	TAA	2	6	609968	609973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831290
12597	NC_015061	TC	3	6	609998	610003	0 %	50 %	0 %	50 %	322831290
12598	NC_015061	ATC	2	6	610017	610022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831290
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12602	NC_015061	TATC	2	8	610315	610322	25 %	50 %	0 %	25 %	322831290
12603	NC_015061	ATT	2	6	610347	610352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831290
12604	NC_015061	TAT	2	6	610451	610456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831290
12605	NC_015061	CTC	2	6	610549	610554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12606	NC_015061	T	6	6	610559	610564	0 %	100 %	0 %	0 %	322831291
12607	NC_015061	TCT	2	6	610597	610602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831291
12608	NC_015061	TG	3	6	610650	610655	0 %	50 %	50 %	0 %	322831291
12609	NC_015061	ACC	2	6	610686	610691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831291
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12611	NC_015061	GT	3	6	610717	610722	0 %	50 %	50 %	0 %	322831291
12612	NC_015061	CCTT	2	8	610812	610819	0 %	50 %	0 %	50 %	322831291
12613	NC_015061	T	6	6	610818	610823	0 %	100 %	0 %	0 %	322831291
12614	NC_015061	TTC	2	6	610848	610853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831291
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12622	NC_015061	TTC	2	6	611412	611417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831291
12623	NC_015061	TG	3	6	611436	611441	0 %	50 %	50 %	0 %	322831291
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12625	NC_015061	TGGAG	2	10	611790	611799	20 %	20 %	60 %	0 %	322831292
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12635	NC_015061	AAT	2	6	612272	612277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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