MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015061	TGC	2	6	581833	581838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12002	NC_015061	ACCG	2	8	581841	581848	25 %	0 %	25 %	50 %	322831265
12003	NC_015061	GCA	2	6	581873	581878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12004	NC_015061	ACG	2	6	581882	581887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12005	NC_015061	GCA	2	6	581960	581965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12006	NC_015061	TGCC	2	8	581979	581986	0 %	25 %	25 %	50 %	322831265
12007	NC_015061	CAGCG	2	10	582003	582012	20 %	0 %	40 %	40 %	322831265
12008	NC_015061	CTT	2	6	582014	582019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831265
12009	NC_015061	GCC	2	6	582078	582083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265
12010	NC_015061	CGC	2	6	582101	582106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265
12011	NC_015061	CCA	2	6	582170	582175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831265
12012	NC_015061	CCG	2	6	582185	582190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831265
12013	NC_015061	AGC	2	6	582220	582225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12014	NC_015061	GGT	2	6	582270	582275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831265
12015	NC_015061	CGA	2	6	582284	582289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12016	NC_015061	CGG	2	6	582296	582301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831265
12017	NC_015061	CCACAG	2	12	582327	582338	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322831265
12018	NC_015061	CGG	2	6	582351	582356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831265
12019	NC_015061	TGT	2	6	582377	582382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831265
12020	NC_015061	CAG	2	6	582528	582533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831265
12021	NC_015061	GT	3	6	582534	582539	0 %	50 %	50 %	0 %	322831265
12022	NC_015061	TTGT	2	8	582584	582591	0 %	75 %	25 %	0 %	322831265
12023	NC_015061	CAGC	2	8	582636	582643	25 %	0 %	25 %	50 %	322831266
12024	NC_015061	CAG	2	6	582652	582657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12025	NC_015061	GCC	2	6	582680	582685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831266
12026	NC_015061	CGC	3	9	582702	582710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831266
12027	NC_015061	GCGAT	2	10	582719	582728	20 %	20 %	40 %	20 %	322831266
12028	NC_015061	GTG	3	9	582767	582775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831266
12029	NC_015061	CCG	2	6	582791	582796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831266
12030	NC_015061	TTA	2	6	582824	582829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831266
12031	NC_015061	ATC	2	6	582851	582856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831266
12032	NC_015061	GAA	2	6	582898	582903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831266
12033	NC_015061	CAG	2	6	582967	582972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12034	NC_015061	ATC	2	6	582986	582991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831266
12035	NC_015061	GAT	3	9	583021	583029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831266
12036	NC_015061	GC	3	6	583083	583088	0 %	0 %	50 %	50 %	322831266
12037	NC_015061	CAG	2	6	583180	583185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12038	NC_015061	CGC	2	6	583195	583200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831266
12039	NC_015061	TTC	2	6	583213	583218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831266
12040	NC_015061	CAC	2	6	583225	583230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831266
12041	NC_015061	CAC	2	6	583264	583269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831266
12042	NC_015061	CAG	2	6	583273	583278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12043	NC_015061	GAAG	2	8	583347	583354	50 %	0 %	50 %	0 %	322831266
12044	NC_015061	CTGC	2	8	583398	583405	0 %	25 %	25 %	50 %	322831266
12045	NC_015061	GCT	2	6	583488	583493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12046	NC_015061	GCA	2	6	583662	583667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12047	NC_015061	GCG	2	6	583680	583685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831266
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12049	NC_015061	GCC	2	6	583798	583803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831266
12050	NC_015061	TGGT	2	8	583853	583860	0 %	50 %	50 %	0 %	322831266
12051	NC_015061	GCT	2	6	583861	583866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831266
12052	NC_015061	TAGT	2	8	583868	583875	25 %	50 %	25 %	0 %	322831266
12053	NC_015061	ACA	2	6	583908	583913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831266
12054	NC_015061	CG	3	6	583963	583968	0 %	0 %	50 %	50 %	322831266
12055	NC_015061	GAT	2	6	584089	584094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831266
12056	NC_015061	T	7	7	584124	584130	0 %	100 %	0 %	0 %	322831266
12057	NC_015061	TGA	2	6	584282	584287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831267
12058	NC_015061	TTC	2	6	584350	584355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831267
12059	NC_015061	TGG	2	6	584366	584371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831267
12060	NC_015061	ACG	2	6	584449	584454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831267
12061	NC_015061	CGT	2	6	584462	584467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831267
12062	NC_015061	GGC	2	6	584520	584525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831267
12063	NC_015061	CGA	2	6	584549	584554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831267
12064	NC_015061	GCA	2	6	584585	584590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831267
12065	NC_015061	GGC	2	6	584679	584684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831267
12066	NC_015061	TGTT	2	8	584719	584726	0 %	75 %	25 %	0 %	322831267
12067	NC_015061	GAT	2	6	584739	584744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831267
12068	NC_015061	TGT	2	6	584795	584800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831267
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12070	NC_015061	GCG	2	6	584839	584844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831267
12071	NC_015061	ATG	2	6	584884	584889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831267
12072	NC_015061	GC	3	6	584905	584910	0 %	0 %	50 %	50 %	322831267
12073	NC_015061	TTC	2	6	584934	584939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831267
12074	NC_015061	CTT	2	6	584954	584959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831267
12075	NC_015061	ATG	2	6	584962	584967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831267
12076	NC_015061	CAGC	2	8	585095	585102	25 %	0 %	25 %	50 %	322831267
12077	NC_015061	GCC	2	6	585120	585125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831267
12078	NC_015061	AGA	2	6	585143	585148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831267
12079	NC_015061	GCC	3	9	585159	585167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831267
12080	NC_015061	TTC	2	6	585192	585197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831267
12081	NC_015061	CTT	2	6	585314	585319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831267
12082	NC_015061	ACA	2	6	585344	585349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831267
12083	NC_015061	GT	4	8	585377	585384	0 %	50 %	50 %	0 %	322831267
12084	NC_015061	AATCC	2	10	585414	585423	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12085	NC_015061	T	7	7	585436	585442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12086	NC_015061	ACG	2	6	585469	585474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12087	NC_015061	TCA	2	6	585502	585507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12088	NC_015061	C	7	7	585509	585515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12089	NC_015061	TCA	2	6	585573	585578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_015061	T	6	6	585596	585601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_015061	TCC	2	6	585664	585669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12092	NC_015061	CTC	2	6	585673	585678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12093	NC_015061	GAT	2	6	585701	585706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12094	NC_015061	GCA	2	6	585758	585763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12095	NC_015061	AGA	2	6	585857	585862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831268
12096	NC_015061	TCG	2	6	585880	585885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12097	NC_015061	CTG	2	6	585912	585917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12098	NC_015061	ATGA	2	8	585978	585985	50 %	25 %	25 %	0 %	322831268
12099	NC_015061	GCC	2	6	585989	585994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831268
12100	NC_015061	TCTG	2	8	586046	586053	0 %	50 %	25 %	25 %	322831268
12101	NC_015061	A	6	6	586095	586100	100 %	0 %	0 %	0 %	322831268
12102	NC_015061	ATCA	2	8	586107	586114	50 %	25 %	0 %	25 %	322831268
12103	NC_015061	CGG	2	6	586184	586189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831268
12104	NC_015061	GCCGA	2	10	586227	586236	20 %	0 %	40 %	40 %	322831268
12105	NC_015061	TGC	2	6	586274	586279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12106	NC_015061	GCT	2	6	586521	586526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12107	NC_015061	GC	3	6	586533	586538	0 %	0 %	50 %	50 %	322831268
12108	NC_015061	GCA	2	6	586606	586611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12109	NC_015061	TCT	2	6	586640	586645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831268
12110	NC_015061	GTC	2	6	586689	586694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12111	NC_015061	ACG	2	6	586768	586773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831268
12112	NC_015061	AGA	2	6	586784	586789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831268
12113	NC_015061	GCC	2	6	586814	586819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831268
12114	NC_015061	ATG	2	6	586916	586921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831269
12115	NC_015061	TTC	2	6	586936	586941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831269
12116	NC_015061	GCT	2	6	586958	586963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831269
12117	NC_015061	GCG	3	9	587037	587045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831269
12118	NC_015061	AGC	2	6	587046	587051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831269
12119	NC_015061	AAG	2	6	587145	587150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831269
12120	NC_015061	CTA	2	6	587341	587346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831269
12121	NC_015061	GCG	2	6	587436	587441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831269
12122	NC_015061	ACG	2	6	587490	587495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831269
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12124	NC_015061	TGC	2	6	587676	587681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831269
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12126	NC_015061	TGC	2	6	587743	587748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831269
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12134	NC_015061	GCG	2	6	588108	588113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831269
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12139	NC_015061	GCC	2	6	588308	588313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12140	NC_015061	A	7	7	588359	588365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12141	NC_015061	AGA	2	6	588374	588379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12142	NC_015061	GCTG	2	8	588383	588390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12143	NC_015061	TGA	2	6	588403	588408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12165	NC_015061	CTC	2	6	589386	589391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12224	NC_015061	A	6	6	592281	592286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12225	NC_015061	TAAA	2	8	592294	592301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12226	NC_015061	A	6	6	592299	592304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_015061	ACA	2	6	592306	592311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12228	NC_015061	CCG	2	6	592472	592477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831275
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12231	NC_015061	CAGGTG	2	12	592554	592565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322831275
12232	NC_015061	TGGC	2	8	592571	592578	0 %	25 %	50 %	25 %	322831275
12233	NC_015061	GGC	2	6	592614	592619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831275
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12238	NC_015061	A	6	6	592887	592892	100 %	0 %	0 %	0 %	322831275
12239	NC_015061	CAA	2	6	592898	592903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831275
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12487	NC_015061	CGAT	2	8	604521	604528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12488	NC_015061	TAA	3	9	604641	604649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12489	NC_015061	CAG	2	6	604662	604667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12490	NC_015061	T	6	6	604693	604698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_015061	GTA	2	6	604706	604711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12492	NC_015061	T	6	6	604712	604717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12493	NC_015061	GAA	2	6	604752	604757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831283
12494	NC_015061	AAAG	2	8	604760	604767	75 %	0 %	25 %	0 %	322831283
12495	NC_015061	GCG	3	9	604813	604821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831283
12496	NC_015061	GGAT	2	8	604910	604917	25 %	25 %	50 %	0 %	322831283
12497	NC_015061	CTG	2	6	604972	604977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831283
12498	NC_015061	GCA	2	6	605040	605045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831283
12499	NC_015061	GAG	2	6	605061	605066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831283
12500	NC_015061	ACT	2	6	605193	605198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831284

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