MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015061	TTCACC	2	12	533070	533081	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322831223
11002	NC_015061	ATG	2	6	533106	533111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831223
11003	NC_015061	CGGTAC	2	12	533152	533163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322831223
11004	NC_015061	GCCC	2	8	533177	533184	0 %	0 %	25 %	75 %	322831223
11005	NC_015061	TAT	2	6	533186	533191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831223
11006	NC_015061	GCC	2	6	533223	533228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831223
11007	NC_015061	TGC	2	6	533280	533285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
11008	NC_015061	CTG	2	6	533289	533294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
11009	NC_015061	GCT	2	6	533303	533308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
11010	NC_015061	ACA	2	6	533351	533356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831223
11011	NC_015061	TGG	2	6	533396	533401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831224
11012	NC_015061	GAT	2	6	533449	533454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831224
11013	NC_015061	TGC	2	6	533457	533462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11014	NC_015061	TGA	2	6	533475	533480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831224
11015	NC_015061	GCGGAA	2	12	533618	533629	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322831224
11016	NC_015061	ATC	2	6	533663	533668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831224
11017	NC_015061	GAA	2	6	533686	533691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831224
11018	NC_015061	CAG	2	6	533765	533770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11019	NC_015061	TGC	2	6	533820	533825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11020	NC_015061	GTG	2	6	533858	533863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831224
11021	NC_015061	ATT	2	6	533924	533929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831224
11022	NC_015061	GCA	2	6	533956	533961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11023	NC_015061	GCT	2	6	533965	533970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11024	NC_015061	GCGT	2	8	533979	533986	0 %	25 %	50 %	25 %	322831224
11025	NC_015061	G	7	7	534043	534049	0 %	0 %	100 %	0 %	322831224
11026	NC_015061	TTGT	2	8	534092	534099	0 %	75 %	25 %	0 %	322831224
11027	NC_015061	CCA	2	6	534135	534140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831224
11028	NC_015061	TGC	2	6	534153	534158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11029	NC_015061	CTG	2	6	534173	534178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11030	NC_015061	TTC	2	6	534328	534333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831224
11031	NC_015061	CGG	2	6	534406	534411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831224
11032	NC_015061	ATG	2	6	534419	534424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831224
11033	NC_015061	CTG	2	6	534425	534430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11034	NC_015061	TGC	2	6	534474	534479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831224
11035	NC_015061	GC	3	6	534496	534501	0 %	0 %	50 %	50 %	322831224
11036	NC_015061	A	6	6	534531	534536	100 %	0 %	0 %	0 %	322831224
11037	NC_015061	CGTT	2	8	534670	534677	0 %	50 %	25 %	25 %	322831225
11038	NC_015061	CCA	2	6	534740	534745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831225
11039	NC_015061	CTG	2	6	534825	534830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11040	NC_015061	GCA	2	6	534873	534878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11041	NC_015061	GC	3	6	534927	534932	0 %	0 %	50 %	50 %	322831225
11042	NC_015061	ACA	2	6	534962	534967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831225
11043	NC_015061	CAG	2	6	535014	535019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11044	NC_015061	CCAG	2	8	535025	535032	25 %	0 %	25 %	50 %	322831225
11045	NC_015061	CGA	2	6	535127	535132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11046	NC_015061	GCC	2	6	535153	535158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831225
11047	NC_015061	AAC	2	6	535249	535254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831225
11048	NC_015061	CAC	2	6	535269	535274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831225
11049	NC_015061	TGC	2	6	535287	535292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11050	NC_015061	CCAG	2	8	535310	535317	25 %	0 %	25 %	50 %	322831225
11051	NC_015061	TTTCA	2	10	535326	535335	20 %	60 %	0 %	20 %	322831225
11052	NC_015061	TACA	2	8	535346	535353	50 %	25 %	0 %	25 %	322831225
11053	NC_015061	GCT	2	6	535380	535385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831225
11054	NC_015061	GCC	2	6	535387	535392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831225
11055	NC_015061	TAA	2	6	535432	535437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831225
11056	NC_015061	TCA	2	6	535460	535465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831225
11057	NC_015061	CGT	2	6	535508	535513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831226
11058	NC_015061	TG	3	6	535515	535520	0 %	50 %	50 %	0 %	322831226
11059	NC_015061	CG	4	8	535615	535622	0 %	0 %	50 %	50 %	322831226
11060	NC_015061	TAA	2	6	535700	535705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831226
11061	NC_015061	TTC	2	6	535730	535735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831226
11062	NC_015061	CCA	2	6	535759	535764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831226
11063	NC_015061	CTT	2	6	535807	535812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831226
11064	NC_015061	CAT	2	6	535831	535836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831226
11065	NC_015061	AGC	2	6	535945	535950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831226
11066	NC_015061	GTA	2	6	536007	536012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831226
11067	NC_015061	TGG	2	6	536110	536115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831226
11068	NC_015061	CGC	2	6	536162	536167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831226
11069	NC_015061	GCC	2	6	536220	536225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831226
11070	NC_015061	CG	3	6	536234	536239	0 %	0 %	50 %	50 %	322831226
11071	NC_015061	CGG	2	6	536298	536303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831226
11072	NC_015061	GGC	2	6	536321	536326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831226
11073	NC_015061	T	7	7	536337	536343	0 %	100 %	0 %	0 %	322831226
11074	NC_015061	GC	3	6	536369	536374	0 %	0 %	50 %	50 %	322831226
11075	NC_015061	TGA	2	6	536521	536526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_015061	TCAT	3	12	536544	536555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11077	NC_015061	TTTGA	2	10	536608	536617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_015061	GCG	2	6	536628	536633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_015061	CCG	2	6	536646	536651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_015061	TATT	2	8	536687	536694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_015061	AGT	2	6	536779	536784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_015061	GCTG	2	8	536920	536927	0 %	25 %	50 %	25 %	322831227
11083	NC_015061	ATCTGA	2	12	536979	536990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322831227
11084	NC_015061	GCTG	2	8	536991	536998	0 %	25 %	50 %	25 %	322831227
11085	NC_015061	CCTGAT	2	12	537076	537087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322831227
11086	NC_015061	CGC	2	6	537088	537093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831227
11087	NC_015061	AGA	2	6	537100	537105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831227
11088	NC_015061	TTC	2	6	537119	537124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831227
11089	NC_015061	CTG	2	6	537230	537235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831227
11090	NC_015061	TCG	2	6	537249	537254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831227
11091	NC_015061	AGG	2	6	537267	537272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831227
11092	NC_015061	TGC	2	6	537333	537338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831228
11093	NC_015061	CTG	2	6	537352	537357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831228
11094	NC_015061	CGAC	2	8	537440	537447	25 %	0 %	25 %	50 %	322831228
11095	NC_015061	GTG	2	6	537460	537465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831228
11096	NC_015061	TGG	2	6	537533	537538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831228
11097	NC_015061	TGAA	2	8	537602	537609	50 %	25 %	25 %	0 %	322831228
11098	NC_015061	CGC	2	6	537618	537623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831228
11099	NC_015061	CGT	2	6	537624	537629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831228
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11101	NC_015061	GCG	2	6	537718	537723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831228
11102	NC_015061	GTT	2	6	537729	537734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831228
11103	NC_015061	T	6	6	537844	537849	0 %	100 %	0 %	0 %	322831229
11104	NC_015061	CAG	2	6	537908	537913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831229
11105	NC_015061	T	6	6	537935	537940	0 %	100 %	0 %	0 %	322831229
11106	NC_015061	AGCG	2	8	537966	537973	25 %	0 %	50 %	25 %	322831229
11107	NC_015061	CGC	2	6	538062	538067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831229
11108	NC_015061	ACA	2	6	538093	538098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831229
11109	NC_015061	AT	3	6	538119	538124	50 %	50 %	0 %	0 %	322831229
11110	NC_015061	GGC	2	6	538136	538141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831229
11111	NC_015061	GAAA	2	8	538165	538172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_015061	TGA	2	6	538277	538282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831230
11113	NC_015061	TG	3	6	538330	538335	0 %	50 %	50 %	0 %	322831230
11114	NC_015061	CTG	2	6	538339	538344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831230
11115	NC_015061	GAG	2	6	538548	538553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831230
11116	NC_015061	CTG	2	6	538680	538685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831230
11117	NC_015061	CAG	2	6	538711	538716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_015061	CTG	2	6	538821	538826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831231
11119	NC_015061	CGGG	2	8	538844	538851	0 %	0 %	75 %	25 %	322831231
11120	NC_015061	CTG	2	6	538863	538868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831231
11121	NC_015061	GCC	2	6	538906	538911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831231
11122	NC_015061	ACC	2	6	538919	538924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831231
11123	NC_015061	CTG	2	6	539006	539011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831231
11124	NC_015061	TGG	2	6	539074	539079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831231
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11134	NC_015061	CTGC	2	8	539509	539516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11135	NC_015061	CTTT	2	8	539595	539602	0 %	75 %	0 %	25 %	322831232
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11165	NC_015061	CTG	2	6	540799	540804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11228	NC_015061	GGC	2	6	543174	543179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831236
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11230	NC_015061	CAGT	2	8	543215	543222	25 %	25 %	25 %	25 %	322831236
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11232	NC_015061	GGC	3	9	543231	543239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831236
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11234	NC_015061	TCCT	2	8	543304	543311	0 %	50 %	0 %	50 %	322831236
11235	NC_015061	GCG	2	6	543312	543317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831236
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11239	NC_015061	CTG	2	6	543540	543545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831237
11240	NC_015061	TCG	2	6	543592	543597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831237
11241	NC_015061	CAC	2	6	543600	543605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831237
11242	NC_015061	GAT	2	6	543674	543679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831237
11243	NC_015061	CGG	2	6	543711	543716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831237
11244	NC_015061	CAT	2	6	543768	543773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831237
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11246	NC_015061	TTC	2	6	543918	543923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831237
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11250	NC_015061	TGG	2	6	544133	544138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831237
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11322	NC_015061	ATG	2	6	547275	547280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11325	NC_015061	AGG	2	6	547410	547415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11326	NC_015061	CGGCG	2	10	547430	547439	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11327	NC_015061	TAT	2	6	547473	547478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11328	NC_015061	TTCA	2	8	547495	547502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11329	NC_015061	ATG	2	6	547510	547515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831242
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11339	NC_015061	ATTA	2	8	548224	548231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11340	NC_015061	ATAA	2	8	548351	548358	75 %	25 %	0 %	0 %	322831244
11341	NC_015061	GAA	2	6	548366	548371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831244
11342	NC_015061	AAT	2	6	548420	548425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11343	NC_015061	AAT	2	6	548450	548455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831245
11344	NC_015061	TGCCGC	2	12	548468	548479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322831245
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11351	NC_015061	GTCTTC	2	12	548748	548759	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322831245
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11353	NC_015061	ATA	2	6	548886	548891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831245
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11355	NC_015061	CGG	2	6	549017	549022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831246
11356	NC_015061	CA	3	6	549176	549181	50 %	0 %	0 %	50 %	322831246
11357	NC_015061	TGC	2	6	549203	549208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831246
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11359	NC_015061	TCT	2	6	549300	549305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831246
11360	NC_015061	TAA	2	6	549332	549337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831246
11361	NC_015061	CCA	2	6	549357	549362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831246
11362	NC_015061	GAC	2	6	549384	549389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831246
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11365	NC_015061	ACTG	2	8	549513	549520	25 %	25 %	25 %	25 %	322831246
11366	NC_015061	TCG	3	9	549629	549637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831246
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11369	NC_015061	TCG	2	6	549755	549760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831246
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11380	NC_015061	TCG	2	6	550361	550366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831246
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11395	NC_015061	TG	3	6	551147	551152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11396	NC_015061	TA	3	6	551171	551176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11397	NC_015061	TTGGG	2	10	551177	551186	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11398	NC_015061	AC	3	6	551197	551202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11399	NC_015061	T	6	6	551259	551264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11400	NC_015061	CGG	2	6	551265	551270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11401	NC_015061	TGA	2	6	551277	551282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11402	NC_015061	TGT	2	6	551313	551318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11403	NC_015061	GACC	2	8	551364	551371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11404	NC_015061	AGGCG	2	10	551447	551456	20 %	0 %	60 %	20 %	322831247
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11432	NC_015061	CGG	2	6	553081	553086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831248
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11474	NC_015061	CAG	2	6	555068	555073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831249
11475	NC_015061	GCACC	2	10	555091	555100	20 %	0 %	20 %	60 %	322831249
11476	NC_015061	AC	3	6	555113	555118	50 %	0 %	0 %	50 %	322831249
11477	NC_015061	CAC	2	6	555149	555154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831249
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11479	NC_015061	TGT	2	6	555444	555449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831249
11480	NC_015061	GAT	2	6	555656	555661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11481	NC_015061	TGC	3	9	555809	555817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11482	NC_015061	GGCA	2	8	555835	555842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11483	NC_015061	GTG	2	6	555843	555848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11484	NC_015061	TTCG	2	8	555857	555864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11485	NC_015061	AAC	2	6	555875	555880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11486	NC_015061	GGC	2	6	555898	555903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_015061	CAA	2	6	555917	555922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11488	NC_015061	ATG	2	6	555931	555936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831250
11489	NC_015061	GCT	2	6	555957	555962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831250
11490	NC_015061	CGC	2	6	555988	555993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831250
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