MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015061	CTT	2	6	508179	508184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831204
10502	NC_015061	GCG	2	6	508195	508200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831204
10503	NC_015061	ATC	2	6	508240	508245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831204
10504	NC_015061	CAT	2	6	508303	508308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831204
10505	NC_015061	CAT	2	6	508356	508361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831204
10506	NC_015061	CTG	2	6	508372	508377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831204
10507	NC_015061	GA	3	6	508382	508387	50 %	0 %	50 %	0 %	322831204
10508	NC_015061	CGG	2	6	508439	508444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831204
10509	NC_015061	CGC	2	6	508589	508594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831204
10510	NC_015061	GCA	2	6	508602	508607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831204
10511	NC_015061	ACTG	2	8	508659	508666	25 %	25 %	25 %	25 %	322831204
10512	NC_015061	TCA	2	6	508763	508768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831204
10513	NC_015061	CAG	2	6	508780	508785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831204
10514	NC_015061	ATT	2	6	508815	508820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831205
10515	NC_015061	GCTG	2	8	508941	508948	0 %	25 %	50 %	25 %	322831205
10516	NC_015061	TGA	2	6	508952	508957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831205
10517	NC_015061	TA	3	6	508970	508975	50 %	50 %	0 %	0 %	322831205
10518	NC_015061	ACC	2	6	509034	509039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831205
10519	NC_015061	AT	3	6	509116	509121	50 %	50 %	0 %	0 %	322831205
10520	NC_015061	GCA	2	6	509123	509128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831205
10521	NC_015061	CAT	2	6	509133	509138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831205
10522	NC_015061	GCCC	2	8	509250	509257	0 %	0 %	25 %	75 %	322831205
10523	NC_015061	TGA	2	6	509284	509289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831205
10524	NC_015061	TGT	2	6	509321	509326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831205
10525	NC_015061	GCA	2	6	509348	509353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831205
10526	NC_015061	CTG	2	6	509396	509401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831205
10527	NC_015061	CTGC	2	8	509447	509454	0 %	25 %	25 %	50 %	322831205
10528	NC_015061	AGTG	2	8	509550	509557	25 %	25 %	50 %	0 %	322831205
10529	NC_015061	GAC	2	6	509580	509585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831205
10530	NC_015061	ATA	2	6	509658	509663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831205
10531	NC_015061	GC	3	6	509702	509707	0 %	0 %	50 %	50 %	322831205
10532	NC_015061	AG	3	6	509711	509716	50 %	0 %	50 %	0 %	322831205
10533	NC_015061	GCT	2	6	509749	509754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831205
10534	NC_015061	T	6	6	509871	509876	0 %	100 %	0 %	0 %	322831205
10535	NC_015061	GGGTC	2	10	509915	509924	0 %	20 %	60 %	20 %	322831205
10536	NC_015061	GTG	2	6	509995	510000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831205
10537	NC_015061	CAGC	2	8	510032	510039	25 %	0 %	25 %	50 %	322831205
10538	NC_015061	GGCA	2	8	510063	510070	25 %	0 %	50 %	25 %	322831205
10539	NC_015061	A	6	6	510235	510240	100 %	0 %	0 %	0 %	322831205
10540	NC_015061	ATT	2	6	510244	510249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831205
10541	NC_015061	TAC	2	6	510292	510297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_015061	GAT	2	6	510337	510342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_015061	CCTGG	2	10	510390	510399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10544	NC_015061	T	8	8	510418	510425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_015061	AG	3	6	510436	510441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_015061	AGA	2	6	510448	510453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_015061	TAA	2	6	510517	510522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_015061	AT	3	6	510523	510528	50 %	50 %	0 %	0 %	322831206
10549	NC_015061	GAA	2	6	510572	510577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831206
10550	NC_015061	CGTC	2	8	510595	510602	0 %	25 %	25 %	50 %	322831206
10551	NC_015061	TGC	2	6	510673	510678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831206
10552	NC_015061	CAG	2	6	510686	510691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831206
10553	NC_015061	AAGCT	2	10	510723	510732	40 %	20 %	20 %	20 %	322831206
10554	NC_015061	TGA	2	6	510807	510812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831206
10555	NC_015061	GAA	3	9	510824	510832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831206
10556	NC_015061	TGA	2	6	510853	510858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831206
10557	NC_015061	GAT	2	6	510932	510937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831206
10558	NC_015061	GTT	2	6	510938	510943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831206
10559	NC_015061	TCA	2	6	510945	510950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831206
10560	NC_015061	GGC	2	6	510959	510964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831206
10561	NC_015061	TTC	2	6	511316	511321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831207
10562	NC_015061	TCAG	2	8	511389	511396	25 %	25 %	25 %	25 %	322831207
10563	NC_015061	GTT	2	6	511400	511405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831207
10564	NC_015061	AAC	2	6	511415	511420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831207
10565	NC_015061	T	6	6	511485	511490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_015061	AAT	2	6	511568	511573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_015061	ATG	2	6	511595	511600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_015061	GGT	2	6	511632	511637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_015061	AAT	2	6	511659	511664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831208
10570	NC_015061	TAA	2	6	511668	511673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831208
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10572	NC_015061	TGA	2	6	511779	511784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831208
10573	NC_015061	GGT	2	6	511824	511829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831208
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10577	NC_015061	TTG	2	6	511931	511936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831208
10578	NC_015061	CTTC	2	8	511944	511951	0 %	50 %	0 %	50 %	322831208
10579	NC_015061	TGA	2	6	511965	511970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831208
10580	NC_015061	GCT	2	6	511986	511991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831208
10581	NC_015061	GGT	2	6	512019	512024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831208
10582	NC_015061	TGA	2	6	512175	512180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831208
10583	NC_015061	TGTT	2	8	512304	512311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_015061	GAA	2	6	512354	512359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831209
10585	NC_015061	A	6	6	512526	512531	100 %	0 %	0 %	0 %	322831209
10586	NC_015061	CAG	2	6	512534	512539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831209
10587	NC_015061	GCT	2	6	512588	512593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831209
10588	NC_015061	GTT	2	6	512610	512615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831209
10589	NC_015061	CAG	2	6	512631	512636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831209
10590	NC_015061	TTCAT	2	10	512655	512664	20 %	60 %	0 %	20 %	322831209
10591	NC_015061	TGC	2	6	512674	512679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831209
10592	NC_015061	GGTGGC	2	12	512721	512732	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322831209
10593	NC_015061	AAAGC	2	10	512755	512764	60 %	0 %	20 %	20 %	322831209
10594	NC_015061	CGAAG	2	10	512822	512831	40 %	0 %	40 %	20 %	322831209
10595	NC_015061	GAGC	2	8	512840	512847	25 %	0 %	50 %	25 %	322831209
10596	NC_015061	TGG	2	6	512917	512922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831209
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10598	NC_015061	TCG	2	6	513022	513027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831209
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10602	NC_015061	GGT	2	6	513144	513149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831209
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10604	NC_015061	GATG	2	8	513191	513198	25 %	25 %	50 %	0 %	322831209
10605	NC_015061	TAT	2	6	513218	513223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831209
10606	NC_015061	TGC	2	6	513268	513273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831209
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10611	NC_015061	CAT	2	6	513605	513610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831209
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10616	NC_015061	TGA	2	6	513962	513967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831209
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10618	NC_015061	TTCA	2	8	514060	514067	25 %	50 %	0 %	25 %	322831209
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10620	NC_015061	TGA	2	6	514115	514120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831209
10621	NC_015061	TGA	2	6	514123	514128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831209
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10741	NC_015061	CGC	2	6	520113	520118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831214
10742	NC_015061	ACCA	2	8	520186	520193	50 %	0 %	0 %	50 %	322831214
10743	NC_015061	TGAAGC	2	12	520242	520253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322831214
10744	NC_015061	GAA	3	9	520276	520284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
10745	NC_015061	GAA	2	6	520300	520305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
10746	NC_015061	AGA	2	6	520323	520328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
10747	NC_015061	CTG	2	6	520391	520396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831214
10748	NC_015061	CAC	2	6	520407	520412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831214
10749	NC_015061	TGC	2	6	520428	520433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831214
10750	NC_015061	CGT	2	6	520468	520473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831214
10751	NC_015061	A	6	6	520507	520512	100 %	0 %	0 %	0 %	322831214
10752	NC_015061	CAA	2	6	520515	520520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831214
10753	NC_015061	GAA	2	6	520546	520551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
10754	NC_015061	GTAAGC	2	12	520580	520591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322831214
10755	NC_015061	CAG	2	6	520603	520608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831214
10756	NC_015061	TGT	2	6	520623	520628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831214
10757	NC_015061	TGT	2	6	520644	520649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831214
10758	NC_015061	CAAA	2	8	520682	520689	75 %	0 %	0 %	25 %	322831214
10759	NC_015061	TCA	2	6	520712	520717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831214
10760	NC_015061	ATG	2	6	520723	520728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831214
10761	NC_015061	CCA	2	6	520745	520750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831214
10762	NC_015061	AGA	2	6	520791	520796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
10763	NC_015061	CGT	2	6	520819	520824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831214
10764	NC_015061	GAA	2	6	520837	520842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831214
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10766	NC_015061	CAT	2	6	520908	520913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831214
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10769	NC_015061	CGC	2	6	521067	521072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831214
10770	NC_015061	GTG	2	6	521093	521098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831214
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10777	NC_015061	GCG	2	6	521420	521425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831214
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10794	NC_015061	GTGAT	2	10	522344	522353	20 %	40 %	40 %	0 %	322831214
10795	NC_015061	ATC	2	6	522367	522372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831214
10796	NC_015061	G	6	6	522424	522429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10797	NC_015061	GAG	2	6	522461	522466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10798	NC_015061	CAT	2	6	522472	522477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831215
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10800	NC_015061	GAC	2	6	522652	522657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831215
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10805	NC_015061	CAG	2	6	523201	523206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831216
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10820	NC_015061	CTG	2	6	524046	524051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831217
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10824	NC_015061	CTG	2	6	524121	524126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831217
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10827	NC_015061	CAGT	2	8	524266	524273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10828	NC_015061	TTC	2	6	524350	524355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10829	NC_015061	CG	3	6	524511	524516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10830	NC_015061	GA	3	6	524523	524528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10831	NC_015061	CTG	2	6	524613	524618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10832	NC_015061	GC	3	6	524630	524635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10833	NC_015061	A	6	6	524639	524644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10834	NC_015061	ATG	2	6	524718	524723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831218
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10852	NC_015061	GAA	2	6	525557	525562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831218
10853	NC_015061	TGC	2	6	525580	525585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831218
10854	NC_015061	AC	3	6	525663	525668	50 %	0 %	0 %	50 %	322831218
10855	NC_015061	GTG	2	6	525688	525693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831218
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10857	NC_015061	CGT	2	6	525846	525851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831218
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10861	NC_015061	ATC	2	6	526111	526116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831218
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10977	NC_015061	CAG	2	6	531691	531696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831222
10978	NC_015061	GCC	2	6	531766	531771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831222
10979	NC_015061	GAA	2	6	531787	531792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831222
10980	NC_015061	CTG	2	6	531796	531801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831222
10981	NC_015061	GAT	2	6	531820	531825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831222
10982	NC_015061	GGCG	2	8	531969	531976	0 %	0 %	75 %	25 %	322831222
10983	NC_015061	GAT	2	6	532026	532031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831222
10984	NC_015061	TGC	2	6	532333	532338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
10985	NC_015061	TCA	2	6	532348	532353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831223
10986	NC_015061	GCA	2	6	532354	532359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831223
10987	NC_015061	G	8	8	532482	532489	0 %	0 %	100 %	0 %	322831223
10988	NC_015061	GCTG	2	8	532571	532578	0 %	25 %	50 %	25 %	322831223
10989	NC_015061	ATT	2	6	532692	532697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831223
10990	NC_015061	CTG	2	6	532815	532820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
10991	NC_015061	GC	3	6	532857	532862	0 %	0 %	50 %	50 %	322831223
10992	NC_015061	GC	3	6	532879	532884	0 %	0 %	50 %	50 %	322831223
10993	NC_015061	CTT	2	6	532885	532890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831223
10994	NC_015061	CAC	2	6	532937	532942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831223
10995	NC_015061	TGG	2	6	532951	532956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831223
10996	NC_015061	TA	3	6	533008	533013	50 %	50 %	0 %	0 %	322831223
10997	NC_015061	TGC	2	6	533014	533019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223
10998	NC_015061	T	6	6	533027	533032	0 %	100 %	0 %	0 %	322831223
10999	NC_015061	CGC	2	6	533042	533047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831223
11000	NC_015061	TGC	2	6	533062	533067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831223

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