MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015061	ATT	2	6	459458	459463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831155
9502	NC_015061	TGT	2	6	459496	459501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831155
9503	NC_015061	TG	3	6	459576	459581	0 %	50 %	50 %	0 %	322831155
9504	NC_015061	GTG	2	6	459643	459648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831155
9505	NC_015061	CGACA	2	10	459655	459664	40 %	0 %	20 %	40 %	322831155
9506	NC_015061	AGA	2	6	459734	459739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831155
9507	NC_015061	GTT	2	6	459762	459767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831155
9508	NC_015061	GC	3	6	459810	459815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9509	NC_015061	T	6	6	459819	459824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_015061	ATTT	2	8	459830	459837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_015061	ACAA	2	8	459860	459867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9512	NC_015061	TAA	2	6	459873	459878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_015061	CGT	2	6	459936	459941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831156
9514	NC_015061	A	6	6	460028	460033	100 %	0 %	0 %	0 %	322831156
9515	NC_015061	CCCG	2	8	460084	460091	0 %	0 %	25 %	75 %	322831156
9516	NC_015061	AAT	2	6	460107	460112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831156
9517	NC_015061	GCA	2	6	460123	460128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831156
9518	NC_015061	CAA	2	6	460130	460135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831156
9519	NC_015061	GCA	2	6	460172	460177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831156
9520	NC_015061	TTATGC	2	12	460244	460255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9521	NC_015061	TCT	2	6	460400	460405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831157
9522	NC_015061	GTC	2	6	460427	460432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
9523	NC_015061	GCACC	2	10	460448	460457	20 %	0 %	20 %	60 %	322831157
9524	NC_015061	GAAA	2	8	460562	460569	75 %	0 %	25 %	0 %	322831157
9525	NC_015061	GCG	2	6	460737	460742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831157
9526	NC_015061	GC	3	6	460749	460754	0 %	0 %	50 %	50 %	322831157
9527	NC_015061	CCG	2	6	460786	460791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831157
9528	NC_015061	TGC	2	6	460794	460799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
9529	NC_015061	AGC	2	6	460845	460850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831157
9530	NC_015061	GTC	2	6	460860	460865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831157
9531	NC_015061	TTGG	2	8	460901	460908	0 %	50 %	50 %	0 %	322831157
9532	NC_015061	GTT	2	6	460978	460983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831157
9533	NC_015061	TAT	2	6	461011	461016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831157
9534	NC_015061	TGAT	2	8	461145	461152	25 %	50 %	25 %	0 %	322831157
9535	NC_015061	TGA	2	6	461241	461246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831157
9536	NC_015061	GAG	2	6	461294	461299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831157
9537	NC_015061	CT	3	6	461378	461383	0 %	50 %	0 %	50 %	322831157
9538	NC_015061	GCA	2	6	461395	461400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831157
9539	NC_015061	CCG	2	6	461414	461419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831157
9540	NC_015061	GTCT	2	8	461583	461590	0 %	50 %	25 %	25 %	322831157
9541	NC_015061	GAA	2	6	461601	461606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831157
9542	NC_015061	AAT	2	6	461619	461624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_015061	TAA	2	6	461656	461661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831158
9544	NC_015061	GCA	3	9	461685	461693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
9545	NC_015061	ATA	3	9	461694	461702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831158
9546	NC_015061	TGG	2	6	461713	461718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
9547	NC_015061	TGG	2	6	461725	461730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
9548	NC_015061	ACA	2	6	461739	461744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
9549	NC_015061	GAT	2	6	461777	461782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831158
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9551	NC_015061	CAA	3	9	461836	461844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
9552	NC_015061	CAA	2	6	461851	461856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831158
9553	NC_015061	GTG	2	6	461889	461894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
9554	NC_015061	TTG	2	6	461901	461906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831158
9555	NC_015061	GGT	3	9	461923	461931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831158
9556	NC_015061	GCA	2	6	461939	461944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831158
9557	NC_015061	AAG	2	6	461964	461969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831158
9558	NC_015061	GCCTG	2	10	462019	462028	0 %	20 %	40 %	40 %	322831158
9559	NC_015061	TGC	2	6	462091	462096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831158
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9563	NC_015061	GAA	2	6	462323	462328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831158
9564	NC_015061	CG	3	6	462382	462387	0 %	0 %	50 %	50 %	322831158
9565	NC_015061	CCG	2	6	462389	462394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831158
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9581	NC_015061	TGC	2	6	463028	463033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
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9588	NC_015061	CTG	2	6	463288	463293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
9589	NC_015061	GTC	2	6	463331	463336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831159
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9598	NC_015061	AGA	2	6	463662	463667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831159
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9603	NC_015061	A	7	7	463922	463928	100 %	0 %	0 %	0 %	322831159
9604	NC_015061	AAT	2	6	463931	463936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831159
9605	NC_015061	CTT	2	6	463991	463996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9606	NC_015061	TCA	2	6	464028	464033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831160
9607	NC_015061	CTGG	2	8	464047	464054	0 %	25 %	50 %	25 %	322831160
9608	NC_015061	TGG	2	6	464167	464172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831160
9609	NC_015061	TAC	2	6	464201	464206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831160
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9611	NC_015061	T	6	6	464350	464355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_015061	CGT	3	9	464389	464397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831161
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9620	NC_015061	CAC	2	6	464761	464766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831161
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9991	NC_015061	CTG	2	6	481945	481950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831178
9992	NC_015061	TCC	2	6	481955	481960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831178
9993	NC_015061	ACC	3	9	482012	482020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831178
9994	NC_015061	CACCG	2	10	482056	482065	20 %	0 %	20 %	60 %	322831178
9995	NC_015061	ATA	2	6	482147	482152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831178
9996	NC_015061	CGT	2	6	482154	482159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831178
9997	NC_015061	GTTC	2	8	482232	482239	0 %	50 %	25 %	25 %	322831178
9998	NC_015061	GCT	2	6	482251	482256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831178
9999	NC_015061	TGC	2	6	482270	482275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831178
10000	NC_015061	ATC	2	6	482359	482364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831178

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