MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015061	GCC	3	9	23176	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830753
502	NC_015061	CTG	2	6	23204	23209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830753
503	NC_015061	GC	3	6	23231	23236	0 %	0 %	50 %	50 %	322830753
504	NC_015061	GGT	2	6	23244	23249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830753
505	NC_015061	GAG	2	6	23313	23318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830753
506	NC_015061	TGA	2	6	23372	23377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015061	ACG	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830754
508	NC_015061	GGT	2	6	23491	23496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830754
509	NC_015061	GT	3	6	23495	23500	0 %	50 %	50 %	0 %	322830754
510	NC_015061	TGC	2	6	23558	23563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830754
511	NC_015061	GC	3	6	23580	23585	0 %	0 %	50 %	50 %	322830754
512	NC_015061	CGG	2	6	23622	23627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830754
513	NC_015061	TGC	2	6	23694	23699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830754
514	NC_015061	TAA	2	6	23819	23824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830754
515	NC_015061	CCG	2	6	23831	23836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830754
516	NC_015061	GC	3	6	23868	23873	0 %	0 %	50 %	50 %	322830754
517	NC_015061	TAT	2	6	24078	24083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015061	GGA	2	6	24168	24173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015061	GCG	2	6	24184	24189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015061	GAT	2	6	24293	24298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830755
521	NC_015061	TTG	2	6	24399	24404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830755
522	NC_015061	CAG	3	9	24414	24422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830755
523	NC_015061	TCC	2	6	24433	24438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830755
524	NC_015061	GCC	3	9	24442	24450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830755
525	NC_015061	CTG	2	6	24513	24518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830755
526	NC_015061	TCA	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830755
527	NC_015061	ATC	2	6	24549	24554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830755
528	NC_015061	TCG	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830755
529	NC_015061	TCT	2	6	24595	24600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830755
530	NC_015061	CGG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830755
531	NC_015061	TGA	2	6	24759	24764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830756
532	NC_015061	CTGC	2	8	24781	24788	0 %	25 %	25 %	50 %	322830756
533	NC_015061	CTTT	2	8	24829	24836	0 %	75 %	0 %	25 %	322830756
534	NC_015061	GGT	2	6	24869	24874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830756
535	NC_015061	ATT	2	6	24902	24907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830756
536	NC_015061	GCC	2	6	24920	24925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830756
537	NC_015061	CGT	2	6	25060	25065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830756
538	NC_015061	TGA	2	6	25101	25106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830756
539	NC_015061	CTG	2	6	25163	25168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830756
540	NC_015061	GGT	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830756
541	NC_015061	GT	3	6	25331	25336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015061	AC	3	6	25370	25375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015061	ATT	2	6	25461	25466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015061	GGCA	2	8	25485	25492	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
545	NC_015061	TCG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830757
546	NC_015061	CT	3	6	25513	25518	0 %	50 %	0 %	50 %	322830757
547	NC_015061	CAG	2	6	25641	25646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
548	NC_015061	AAC	2	6	25678	25683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830757
549	NC_015061	CTT	2	6	25703	25708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830757
550	NC_015061	GGC	2	6	25714	25719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
551	NC_015061	CGG	2	6	25812	25817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
552	NC_015061	GGC	2	6	25855	25860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
553	NC_015061	GCG	2	6	25876	25881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
554	NC_015061	CGG	2	6	25901	25906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
555	NC_015061	CCA	2	6	25916	25921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
556	NC_015061	GGC	2	6	25935	25940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
557	NC_015061	TGC	2	6	26051	26056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830757
558	NC_015061	GCA	2	6	26061	26066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
559	NC_015061	GCG	2	6	26080	26085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
560	NC_015061	GATGCC	2	12	26116	26127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830757
561	NC_015061	GGC	2	6	26154	26159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
562	NC_015061	GCG	2	6	26164	26169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
563	NC_015061	GGC	2	6	26217	26222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
564	NC_015061	GGCG	2	8	26247	26254	0 %	0 %	75 %	25 %	322830757
565	NC_015061	ACA	2	6	26270	26275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830757
566	NC_015061	CGG	2	6	26304	26309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
567	NC_015061	GC	3	6	26317	26322	0 %	0 %	50 %	50 %	322830757
568	NC_015061	CAG	2	6	26454	26459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
569	NC_015061	AT	3	6	26523	26528	50 %	50 %	0 %	0 %	322830757
570	NC_015061	CTGGCG	2	12	26581	26592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322830757
571	NC_015061	CAG	2	6	26626	26631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
572	NC_015061	GAT	2	6	26793	26798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830757
573	NC_015061	GAT	2	6	26821	26826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830757
574	NC_015061	CG	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	322830757
575	NC_015061	GCTC	2	8	26939	26946	0 %	25 %	25 %	50 %	322830757
576	NC_015061	CGC	2	6	26965	26970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830757
577	NC_015061	ACC	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
578	NC_015061	CGGA	2	8	26992	26999	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
579	NC_015061	ACGG	2	8	27010	27017	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
580	NC_015061	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
581	NC_015061	CAG	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
582	NC_015061	AAC	2	6	27142	27147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830757
583	NC_015061	ACC	3	9	27286	27294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
584	NC_015061	CAC	2	6	27330	27335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
585	NC_015061	GAC	3	9	27346	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
586	NC_015061	ACC	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
587	NC_015061	CCT	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830757
588	NC_015061	ATT	2	6	27495	27500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015061	ATG	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015061	A	6	6	27551	27556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015061	GCC	2	6	27595	27600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830758
592	NC_015061	AGGCGA	2	12	27645	27656	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322830758
593	NC_015061	AGA	2	6	27738	27743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830758
594	NC_015061	TTGAA	2	10	27746	27755	40 %	40 %	20 %	0 %	322830758
595	NC_015061	GAA	2	6	27781	27786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830758
596	NC_015061	T	6	6	27823	27828	0 %	100 %	0 %	0 %	322830759
597	NC_015061	AGA	2	6	28006	28011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830759
598	NC_015061	ATC	2	6	28019	28024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830759
599	NC_015061	CT	3	6	28175	28180	0 %	50 %	0 %	50 %	322830760
600	NC_015061	ATT	2	6	28264	28269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830760
601	NC_015061	GCA	2	6	28274	28279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
602	NC_015061	GC	3	6	28349	28354	0 %	0 %	50 %	50 %	322830760
603	NC_015061	CCGA	2	8	28404	28411	25 %	0 %	25 %	50 %	322830760
604	NC_015061	GCA	2	6	28442	28447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
605	NC_015061	TAT	2	6	28449	28454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830760
606	NC_015061	TGA	2	6	28465	28470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830760
607	NC_015061	ACTT	2	8	28647	28654	25 %	50 %	0 %	25 %	322830760
608	NC_015061	CAG	2	6	28656	28661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
609	NC_015061	CGG	2	6	28664	28669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830760
610	NC_015061	ACC	2	6	28788	28793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830760
611	NC_015061	AAG	2	6	28894	28899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830760
612	NC_015061	CTG	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830760
613	NC_015061	CTGC	2	8	28935	28942	0 %	25 %	25 %	50 %	322830760
614	NC_015061	CG	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	322830760
615	NC_015061	A	6	6	29143	29148	100 %	0 %	0 %	0 %	322830761
616	NC_015061	TGG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
617	NC_015061	GAA	2	6	29172	29177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
618	NC_015061	GCG	2	6	29244	29249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830761
619	NC_015061	GC	3	6	29512	29517	0 %	0 %	50 %	50 %	322830761
620	NC_015061	AAC	2	6	29518	29523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830761
621	NC_015061	TGC	2	6	29524	29529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
622	NC_015061	GAT	2	6	29534	29539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830761
623	NC_015061	CTG	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
624	NC_015061	CTG	2	6	29760	29765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
625	NC_015061	AGC	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
626	NC_015061	CTG	2	6	29874	29879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
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628	NC_015061	GGT	2	6	29909	29914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
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754	NC_015061	TTTCC	2	10	35171	35180	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
755	NC_015061	AAT	2	6	35318	35323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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