MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
95501	NC_015061	GCC	2	6	4690914	4690919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95502	NC_015061	CAA	2	6	4690973	4690978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95503	NC_015061	TAA	2	6	4691006	4691011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95504	NC_015061	T	6	6	4691055	4691060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95505	NC_015061	CA	3	6	4691096	4691101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95506	NC_015061	GCG	2	6	4691154	4691159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95507	NC_015061	ATT	2	6	4691201	4691206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95508	NC_015061	TTC	2	6	4691217	4691222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95509	NC_015061	GTT	2	6	4691256	4691261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95510	NC_015061	ACCG	2	8	4691329	4691336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95511	NC_015061	TCA	2	6	4691346	4691351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95512	NC_015061	ATG	2	6	4691353	4691358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95513	NC_015061	GCA	2	6	4691410	4691415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834972
95514	NC_015061	AC	3	6	4691454	4691459	50 %	0 %	0 %	50 %	322834972
95515	NC_015061	TTTC	2	8	4691478	4691485	0 %	75 %	0 %	25 %	322834972
95516	NC_015061	AGC	2	6	4691598	4691603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834972
95517	NC_015061	ACC	2	6	4691625	4691630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834972
95518	NC_015061	CGC	2	6	4691681	4691686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834972
95519	NC_015061	GCTTC	2	10	4691710	4691719	0 %	40 %	20 %	40 %	322834972
95520	NC_015061	CCG	2	6	4691737	4691742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834972
95521	NC_015061	ACA	2	6	4691892	4691897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834972
95522	NC_015061	GA	3	6	4691927	4691932	50 %	0 %	50 %	0 %	322834972
95523	NC_015061	AAT	2	6	4691963	4691968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834972
95524	NC_015061	CCA	2	6	4692007	4692012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834972
95525	NC_015061	AT	4	8	4692074	4692081	50 %	50 %	0 %	0 %	322834972
95526	NC_015061	TCA	2	6	4692111	4692116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834972
95527	NC_015061	CCG	2	6	4692129	4692134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834972
95528	NC_015061	TGT	2	6	4692179	4692184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834972
95529	NC_015061	CAC	2	6	4692341	4692346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834973
95530	NC_015061	TATCG	2	10	4692380	4692389	20 %	40 %	20 %	20 %	322834973
95531	NC_015061	CAGTC	2	10	4692434	4692443	20 %	20 %	20 %	40 %	322834973
95532	NC_015061	TGT	2	6	4692460	4692465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834973
95533	NC_015061	TAA	2	6	4692477	4692482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834973
95534	NC_015061	TTG	2	6	4692584	4692589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834973
95535	NC_015061	TAA	2	6	4692604	4692609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834973
95536	NC_015061	ATC	2	6	4692634	4692639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834973
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95538	NC_015061	GCA	2	6	4692841	4692846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834973
95539	NC_015061	CAGCGC	2	12	4693022	4693033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322834973
95540	NC_015061	GT	3	6	4693241	4693246	0 %	50 %	50 %	0 %	322834973
95541	NC_015061	TG	3	6	4693262	4693267	0 %	50 %	50 %	0 %	322834973
95542	NC_015061	CCA	2	6	4693445	4693450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834973
95543	NC_015061	GTATAG	2	12	4693465	4693476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834973
95544	NC_015061	CTG	2	6	4693515	4693520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834973
95545	NC_015061	ATG	2	6	4693600	4693605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834973
95546	NC_015061	CCTG	2	8	4693723	4693730	0 %	25 %	25 %	50 %	322834973
95547	NC_015061	CCAT	2	8	4693744	4693751	25 %	25 %	0 %	50 %	322834973
95548	NC_015061	TG	3	6	4693761	4693766	0 %	50 %	50 %	0 %	322834973
95549	NC_015061	AAT	2	6	4693789	4693794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834973
95550	NC_015061	CTG	2	6	4693800	4693805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834973
95551	NC_015061	ACG	2	6	4693845	4693850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834973
95552	NC_015061	GC	3	6	4693894	4693899	0 %	0 %	50 %	50 %	322834973
95553	NC_015061	AAC	2	6	4693959	4693964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834973
95554	NC_015061	ATC	2	6	4693968	4693973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834973
95555	NC_015061	CAG	2	6	4694037	4694042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834973
95556	NC_015061	CGA	3	9	4694122	4694130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95557	NC_015061	TAAT	2	8	4694182	4694189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95558	NC_015061	CGT	2	6	4694192	4694197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95559	NC_015061	AATT	2	8	4694198	4694205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95560	NC_015061	TC	3	6	4694245	4694250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95561	NC_015061	TA	3	6	4694258	4694263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95562	NC_015061	GAAAGA	2	12	4694270	4694281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95563	NC_015061	ATA	2	6	4694297	4694302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95564	NC_015061	GC	3	6	4694337	4694342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95565	NC_015061	GAA	2	6	4694458	4694463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95566	NC_015061	GAC	2	6	4694583	4694588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834974
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95568	NC_015061	GC	3	6	4694687	4694692	0 %	0 %	50 %	50 %	322834974
95569	NC_015061	CAT	2	6	4694732	4694737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834974
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95571	NC_015061	CGTGTG	2	12	4694760	4694771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322834974
95572	NC_015061	GCT	2	6	4694912	4694917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834974
95573	NC_015061	TGA	2	6	4694933	4694938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834974
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95576	NC_015061	GC	3	6	4694978	4694983	0 %	0 %	50 %	50 %	322834974
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95582	NC_015061	CCG	2	6	4695389	4695394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834974
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95587	NC_015061	A	6	6	4695640	4695645	100 %	0 %	0 %	0 %	322834974
95588	NC_015061	A	6	6	4695660	4695665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95589	NC_015061	TAC	2	6	4695719	4695724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834975
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95592	NC_015061	CGG	2	6	4695972	4695977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834975
95593	NC_015061	AAGAT	2	10	4695991	4696000	60 %	20 %	20 %	0 %	322834975
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95597	NC_015061	AATA	2	8	4696085	4696092	75 %	25 %	0 %	0 %	322834975
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95602	NC_015061	CAG	2	6	4696312	4696317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834975
95603	NC_015061	TCA	3	9	4696347	4696355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834975
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95606	NC_015061	CG	3	6	4696571	4696576	0 %	0 %	50 %	50 %	322834975
95607	NC_015061	GTC	2	6	4696585	4696590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834975
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95609	NC_015061	T	6	6	4696605	4696610	0 %	100 %	0 %	0 %	322834975
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