MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_015061	CTGG	2	8	4150697	4150704	0 %	25 %	50 %	25 %	322834499
84502	NC_015061	TCT	2	6	4150737	4150742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834499
84503	NC_015061	CGT	2	6	4150752	4150757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84504	NC_015061	AGGCA	2	10	4150817	4150826	40 %	0 %	40 %	20 %	322834499
84505	NC_015061	AAC	2	6	4150851	4150856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834499
84506	NC_015061	CGA	2	6	4150976	4150981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84507	NC_015061	TCG	2	6	4151011	4151016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84508	NC_015061	ATG	2	6	4151061	4151066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834499
84509	NC_015061	TCAGG	2	10	4151067	4151076	20 %	20 %	40 %	20 %	322834499
84510	NC_015061	AAG	2	6	4151077	4151082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834499
84511	NC_015061	CGG	2	6	4151087	4151092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834499
84512	NC_015061	GAA	2	6	4151175	4151180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834499
84513	NC_015061	GGT	2	6	4151187	4151192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834499
84514	NC_015061	CAT	2	6	4151198	4151203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834499
84515	NC_015061	CAC	2	6	4151213	4151218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834499
84516	NC_015061	CTTCAA	2	12	4151249	4151260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834499
84517	NC_015061	GGT	2	6	4151298	4151303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834499
84518	NC_015061	GTC	2	6	4151311	4151316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84519	NC_015061	CTG	2	6	4151331	4151336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84520	NC_015061	TGC	2	6	4151356	4151361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834499
84521	NC_015061	GC	4	8	4151399	4151406	0 %	0 %	50 %	50 %	322834499
84522	NC_015061	TTC	2	6	4151523	4151528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834499
84523	NC_015061	GAA	2	6	4151550	4151555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834499
84524	NC_015061	A	6	6	4151559	4151564	100 %	0 %	0 %	0 %	322834499
84525	NC_015061	GAT	2	6	4151615	4151620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834499
84526	NC_015061	ATC	2	6	4151627	4151632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834499
84527	NC_015061	T	6	6	4151665	4151670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84528	NC_015061	TTC	2	6	4151734	4151739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834500
84529	NC_015061	GC	3	6	4151916	4151921	0 %	0 %	50 %	50 %	322834500
84530	NC_015061	ACA	2	6	4151934	4151939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834500
84531	NC_015061	GGT	2	6	4151947	4151952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322834500
84532	NC_015061	GCAG	2	8	4151960	4151967	25 %	0 %	50 %	25 %	322834500
84533	NC_015061	CAGC	2	8	4151968	4151975	25 %	0 %	25 %	50 %	322834500
84534	NC_015061	CGC	2	6	4151988	4151993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834500
84535	NC_015061	TGC	2	6	4152050	4152055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834500
84536	NC_015061	TGC	2	6	4152074	4152079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834500
84537	NC_015061	CAG	2	6	4152100	4152105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834500
84538	NC_015061	GC	3	6	4152271	4152276	0 %	0 %	50 %	50 %	322834500
84539	NC_015061	CGG	2	6	4152344	4152349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834500
84540	NC_015061	CAT	2	6	4152379	4152384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834500
84541	NC_015061	CGT	2	6	4152439	4152444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834500
84542	NC_015061	TGAC	2	8	4152494	4152501	25 %	25 %	25 %	25 %	322834500
84543	NC_015061	TG	3	6	4152536	4152541	0 %	50 %	50 %	0 %	322834500
84544	NC_015061	CCA	2	6	4152558	4152563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834500
84545	NC_015061	GTTA	2	8	4152627	4152634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84546	NC_015061	GGA	2	6	4152660	4152665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84547	NC_015061	CTGT	2	8	4152671	4152678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84548	NC_015061	GA	5	10	4152689	4152698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84549	NC_015061	CTG	2	6	4152791	4152796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834501
84550	NC_015061	A	6	6	4152855	4152860	100 %	0 %	0 %	0 %	322834501
84551	NC_015061	GCTGG	2	10	4152883	4152892	0 %	20 %	60 %	20 %	322834501
84552	NC_015061	TGA	2	6	4152949	4152954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834501
84553	NC_015061	GCA	2	6	4152987	4152992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834501
84554	NC_015061	AAC	2	6	4153002	4153007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834501
84555	NC_015061	CTG	2	6	4153148	4153153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834501
84556	NC_015061	ATC	2	6	4153154	4153159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834501
84557	NC_015061	GCA	2	6	4153209	4153214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834501
84558	NC_015061	TCTGA	2	10	4153391	4153400	20 %	40 %	20 %	20 %	322834501
84559	NC_015061	GCACT	2	10	4153481	4153490	20 %	20 %	20 %	40 %	322834501
84560	NC_015061	GCA	2	6	4153509	4153514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834501
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84562	NC_015061	GTC	3	9	4153685	4153693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834501
84563	NC_015061	AAAAG	2	10	4153718	4153727	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84564	NC_015061	TTCA	2	8	4153754	4153761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84565	NC_015061	CTG	2	6	4153862	4153867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834502
84566	NC_015061	CTG	2	6	4153880	4153885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834502
84567	NC_015061	CCG	2	6	4153924	4153929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834502
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84569	NC_015061	CTG	2	6	4154177	4154182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834502
84570	NC_015061	TGC	2	6	4154190	4154195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834502
84571	NC_015061	CGG	2	6	4154266	4154271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834502
84572	NC_015061	GGC	2	6	4154276	4154281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834502
84573	NC_015061	GT	3	6	4154307	4154312	0 %	50 %	50 %	0 %	322834502
84574	NC_015061	GGC	2	6	4154445	4154450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834502
84575	NC_015061	CAT	2	6	4154494	4154499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834502
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84582	NC_015061	ACG	2	6	4154751	4154756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834503
84583	NC_015061	TGC	2	6	4154787	4154792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834503
84584	NC_015061	CTGG	2	8	4154838	4154845	0 %	25 %	50 %	25 %	322834503
84585	NC_015061	TGC	2	6	4154876	4154881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834503
84586	NC_015061	GAC	2	6	4154889	4154894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834503
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84588	NC_015061	TCA	2	6	4154988	4154993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834503
84589	NC_015061	GCC	2	6	4154999	4155004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834503
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84598	NC_015061	ACC	2	6	4155289	4155294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834503
84599	NC_015061	TGA	2	6	4155296	4155301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834503
84600	NC_015061	ATC	2	6	4155307	4155312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834503
84601	NC_015061	TGA	3	9	4155314	4155322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834503
84602	NC_015061	TCA	2	6	4155323	4155328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834503
84603	NC_015061	TAC	2	6	4155342	4155347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834503
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84722	NC_015061	AGC	2	6	4160502	4160507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834507
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