MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015061	CGT	2	6	386919	386924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831088
8002	NC_015061	CGC	2	6	386937	386942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831088
8003	NC_015061	TGG	2	6	386971	386976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831088
8004	NC_015061	TGC	2	6	387041	387046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831088
8005	NC_015061	A	6	6	387058	387063	100 %	0 %	0 %	0 %	322831088
8006	NC_015061	CAA	2	6	387092	387097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831088
8007	NC_015061	TGC	2	6	387101	387106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831088
8008	NC_015061	CTG	2	6	387109	387114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831088
8009	NC_015061	TGC	2	6	387218	387223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831088
8010	NC_015061	GTT	2	6	387374	387379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831089
8011	NC_015061	ATG	2	6	387473	387478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831089
8012	NC_015061	GCA	2	6	387505	387510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831089
8013	NC_015061	GT	3	6	387540	387545	0 %	50 %	50 %	0 %	322831089
8014	NC_015061	TAT	2	6	387574	387579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831089
8015	NC_015061	GGT	2	6	387584	387589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831089
8016	NC_015061	GC	3	6	387595	387600	0 %	0 %	50 %	50 %	322831089
8017	NC_015061	CCA	2	6	387651	387656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831089
8018	NC_015061	GAA	2	6	387746	387751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831089
8019	NC_015061	CTG	2	6	387839	387844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831090
8020	NC_015061	CGT	2	6	387857	387862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831090
8021	NC_015061	CTG	2	6	387894	387899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831090
8022	NC_015061	GAG	2	6	387941	387946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831090
8023	NC_015061	CGG	2	6	388042	388047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831091
8024	NC_015061	TGG	3	9	388078	388086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831091
8025	NC_015061	CGT	2	6	388091	388096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831091
8026	NC_015061	GGT	2	6	388106	388111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831091
8027	NC_015061	TCG	2	6	388126	388131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831091
8028	NC_015061	GTCT	2	8	388185	388192	0 %	50 %	25 %	25 %	322831091
8029	NC_015061	TGG	2	6	388203	388208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831091
8030	NC_015061	TGGT	2	8	388251	388258	0 %	50 %	50 %	0 %	322831091
8031	NC_015061	GTCG	2	8	388298	388305	0 %	25 %	50 %	25 %	322831091
8032	NC_015061	GCT	2	6	388361	388366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831091
8033	NC_015061	TGTT	2	8	388465	388472	0 %	75 %	25 %	0 %	322831092
8034	NC_015061	AGC	2	6	388555	388560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8035	NC_015061	CAT	2	6	388571	388576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831092
8036	NC_015061	TGG	2	6	388598	388603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831092
8037	NC_015061	GGT	2	6	388682	388687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831092
8038	NC_015061	AAAG	2	8	388709	388716	75 %	0 %	25 %	0 %	322831092
8039	NC_015061	CGT	2	6	388731	388736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8040	NC_015061	CAT	2	6	388958	388963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831092
8041	NC_015061	CCG	2	6	388992	388997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831092
8042	NC_015061	TCC	2	6	389044	389049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831092
8043	NC_015061	GTTG	2	8	389057	389064	0 %	50 %	50 %	0 %	322831092
8044	NC_015061	CTTT	2	8	389086	389093	0 %	75 %	0 %	25 %	322831092
8045	NC_015061	GTG	2	6	389094	389099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831092
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8047	NC_015061	CGT	2	6	389118	389123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8048	NC_015061	TCG	2	6	389125	389130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831092
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8050	NC_015061	GTC	2	6	389155	389160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8051	NC_015061	GCA	2	6	389169	389174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8052	NC_015061	GCAC	2	8	389179	389186	25 %	0 %	25 %	50 %	322831092
8053	NC_015061	ATT	2	6	389241	389246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831092
8054	NC_015061	CAT	2	6	389266	389271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831092
8055	NC_015061	ATC	2	6	389367	389372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831092
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8057	NC_015061	CAG	2	6	389419	389424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831092
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8059	NC_015061	TGG	2	6	389597	389602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831092
8060	NC_015061	GTC	2	6	389622	389627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831092
8061	NC_015061	TGA	2	6	389662	389667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831092
8062	NC_015061	GAA	2	6	389693	389698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831092
8063	NC_015061	TGCAG	2	10	389838	389847	20 %	20 %	40 %	20 %	322831093
8064	NC_015061	AGCC	2	8	389924	389931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_015061	TGTA	2	8	389939	389946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_015061	AGC	2	6	389947	389952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_015061	TA	3	6	390002	390007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_015061	TAG	2	6	390010	390015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_015061	TGC	2	6	390126	390131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831094
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8072	NC_015061	TCG	2	6	390297	390302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831094
8073	NC_015061	AAT	2	6	390377	390382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831094
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8077	NC_015061	TGG	2	6	390539	390544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831095
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8079	NC_015061	GCGCT	2	10	390602	390611	0 %	20 %	40 %	40 %	322831095
8080	NC_015061	CCTGGT	2	12	390663	390674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831095
8081	NC_015061	CTA	2	6	390682	390687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831095
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8084	NC_015061	GA	4	8	390809	390816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_015061	CGT	2	6	390855	390860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831096
8086	NC_015061	CG	3	6	390894	390899	0 %	0 %	50 %	50 %	322831096
8087	NC_015061	GTCT	2	8	390958	390965	0 %	50 %	25 %	25 %	322831096
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8091	NC_015061	TAT	2	6	391184	391189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322831096
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8101	NC_015061	ATTC	2	8	391939	391946	25 %	50 %	0 %	25 %	322831097
8102	NC_015061	GAA	2	6	391948	391953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831097
8103	NC_015061	GTC	2	6	391970	391975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831097
8104	NC_015061	TAG	2	6	391979	391984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831097
8105	NC_015061	AGC	2	6	392028	392033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831097
8106	NC_015061	CGAT	2	8	392093	392100	25 %	25 %	25 %	25 %	322831097
8107	NC_015061	TCG	2	6	392115	392120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831097
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8111	NC_015061	A	6	6	392353	392358	100 %	0 %	0 %	0 %	322831097
8112	NC_015061	CCA	2	6	392428	392433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831097
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8116	NC_015061	GAC	2	6	392599	392604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831098
8117	NC_015061	CGAAAG	2	12	392610	392621	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322831098
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8119	NC_015061	TCG	2	6	392680	392685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831098
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8121	NC_015061	CTG	2	6	392874	392879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831098
8122	NC_015061	AAT	2	6	392880	392885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831098
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8124	NC_015061	T	7	7	392921	392927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8244	NC_015061	TGA	2	6	398751	398756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831106
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8366	NC_015061	GTAG	2	8	405245	405252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8496	NC_015061	CAT	2	6	412574	412579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831115
8497	NC_015061	TCT	2	6	412696	412701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831115
8498	NC_015061	TTC	2	6	412710	412715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831115
8499	NC_015061	CAT	2	6	412748	412753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831115
8500	NC_015061	CCA	2	6	412755	412760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831115

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