MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015061	GCT	2	6	362072	362077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831053
7502	NC_015061	TGA	2	6	362086	362091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831053
7503	NC_015061	TGG	2	6	362110	362115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831053
7504	NC_015061	CTGA	2	8	362123	362130	25 %	25 %	25 %	25 %	322831053
7505	NC_015061	AGA	2	6	362131	362136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
7506	NC_015061	AAC	2	6	362168	362173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831053
7507	NC_015061	ATC	2	6	362177	362182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831053
7508	NC_015061	TGT	2	6	362239	362244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831053
7509	NC_015061	GAC	2	6	362294	362299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831053
7510	NC_015061	TTC	2	6	362399	362404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831053
7511	NC_015061	GAA	2	6	362510	362515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
7512	NC_015061	AAG	2	6	362520	362525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
7513	NC_015061	GCT	2	6	362543	362548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831053
7514	NC_015061	TG	3	6	362586	362591	0 %	50 %	50 %	0 %	322831053
7515	NC_015061	A	6	6	362682	362687	100 %	0 %	0 %	0 %	322831053
7516	NC_015061	AGA	2	6	362716	362721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831053
7517	NC_015061	CAT	2	6	362724	362729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831053
7518	NC_015061	TGA	2	6	362743	362748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831053
7519	NC_015061	ATC	2	6	362765	362770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831053
7520	NC_015061	CGT	2	6	362816	362821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831053
7521	NC_015061	TGG	2	6	362923	362928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831053
7522	NC_015061	GGT	2	6	363020	363025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831053
7523	NC_015061	GCGT	2	8	363120	363127	0 %	25 %	50 %	25 %	322831053
7524	NC_015061	CTC	2	6	363157	363162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831053
7525	NC_015061	GCC	2	6	363303	363308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322831053
7526	NC_015061	GAT	2	6	363458	363463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831053
7527	NC_015061	CT	4	8	363541	363548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_015061	GCA	2	6	363670	363675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7529	NC_015061	CGG	2	6	363702	363707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831054
7530	NC_015061	AGA	2	6	363744	363749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831054
7531	NC_015061	TGC	2	6	363867	363872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7532	NC_015061	GTT	2	6	363895	363900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831054
7533	NC_015061	CTG	2	6	363943	363948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7534	NC_015061	GAA	2	6	364012	364017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831054
7535	NC_015061	CTG	2	6	364018	364023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7536	NC_015061	TCTG	2	8	364053	364060	0 %	50 %	25 %	25 %	322831054
7537	NC_015061	CGA	2	6	364077	364082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7538	NC_015061	TCA	2	6	364091	364096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831054
7539	NC_015061	ATC	2	6	364147	364152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831054
7540	NC_015061	CTG	2	6	364216	364221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7541	NC_015061	GTT	2	6	364261	364266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831054
7542	NC_015061	GAA	2	6	364303	364308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831054
7543	NC_015061	TCG	2	6	364316	364321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7544	NC_015061	CTG	2	6	364375	364380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7545	NC_015061	CTG	2	6	364414	364419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831054
7546	NC_015061	TCAA	2	8	364474	364481	50 %	25 %	0 %	25 %	322831054
7547	NC_015061	CA	3	6	364484	364489	50 %	0 %	0 %	50 %	322831054
7548	NC_015061	GGT	2	6	364531	364536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831054
7549	NC_015061	TTC	2	6	364549	364554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831054
7550	NC_015061	GTT	2	6	364660	364665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831054
7551	NC_015061	GATG	2	8	364686	364693	25 %	25 %	50 %	0 %	322831054
7552	NC_015061	GGC	2	6	364720	364725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831054
7553	NC_015061	GTT	2	6	364744	364749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831054
7554	NC_015061	A	7	7	364786	364792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_015061	T	6	6	364809	364814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_015061	TG	3	6	364828	364833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_015061	AAT	2	6	364858	364863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_015061	AGTT	2	8	364880	364887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_015061	GT	3	6	364920	364925	0 %	50 %	50 %	0 %	322831055
7560	NC_015061	TCAG	2	8	364935	364942	25 %	25 %	25 %	25 %	322831055
7561	NC_015061	GAG	2	6	365000	365005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322831055
7562	NC_015061	AAT	2	6	365057	365062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831055
7563	NC_015061	T	8	8	365133	365140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_015061	GGA	2	6	365181	365186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_015061	A	6	6	365206	365211	100 %	0 %	0 %	0 %	322831056
7566	NC_015061	CTT	2	6	365233	365238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831056
7567	NC_015061	ATCA	2	8	365257	365264	50 %	25 %	0 %	25 %	322831056
7568	NC_015061	TGA	2	6	365340	365345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831056
7569	NC_015061	TGC	2	6	365465	365470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831056
7570	NC_015061	CTGG	2	8	365589	365596	0 %	25 %	50 %	25 %	322831056
7571	NC_015061	AGA	2	6	365658	365663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831056
7572	NC_015061	CTG	2	6	365677	365682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_015061	CCAG	2	8	365740	365747	25 %	0 %	25 %	50 %	322831057
7574	NC_015061	CAGG	2	8	365751	365758	25 %	0 %	50 %	25 %	322831057
7575	NC_015061	CTTACC	2	12	365794	365805	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322831057
7576	NC_015061	GCG	2	6	365830	365835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322831057
7577	NC_015061	CCCA	2	8	365866	365873	25 %	0 %	0 %	75 %	322831057
7578	NC_015061	TGC	2	6	365883	365888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831057
7579	NC_015061	AG	3	6	366022	366027	50 %	0 %	50 %	0 %	322831057
7580	NC_015061	ATCA	2	8	366093	366100	50 %	25 %	0 %	25 %	322831057
7581	NC_015061	AGA	2	6	366112	366117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831057
7582	NC_015061	TAA	2	6	366129	366134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831057
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7584	NC_015061	AAT	2	6	366242	366247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322831057
7585	NC_015061	AAC	3	9	366262	366270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322831057
7586	NC_015061	ATC	2	6	366385	366390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831057
7587	NC_015061	ACG	2	6	366406	366411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831057
7588	NC_015061	CAG	2	6	366429	366434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831057
7589	NC_015061	ATG	2	6	366479	366484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831057
7590	NC_015061	TGC	2	6	366499	366504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831057
7591	NC_015061	TCC	2	6	366507	366512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322831057
7592	NC_015061	GTG	2	6	366673	366678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322831058
7593	NC_015061	AGT	2	6	366723	366728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831058
7594	NC_015061	ATC	2	6	366838	366843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831058
7595	NC_015061	GTT	2	6	366897	366902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322831058
7596	NC_015061	TGA	2	6	367049	367054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831059
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7601	NC_015061	GAA	2	6	367240	367245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322831059
7602	NC_015061	T	6	6	367259	367264	0 %	100 %	0 %	0 %	322831059
7603	NC_015061	GT	3	6	367299	367304	0 %	50 %	50 %	0 %	322831059
7604	NC_015061	TGA	2	6	367326	367331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831059
7605	NC_015061	T	6	6	367346	367351	0 %	100 %	0 %	0 %	322831059
7606	NC_015061	CCA	2	6	367379	367384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322831059
7607	NC_015061	TTC	2	6	367472	367477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831059
7608	NC_015061	GCA	2	6	367501	367506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322831059
7609	NC_015061	CTG	2	6	367513	367518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322831059
7610	NC_015061	TTC	2	6	367530	367535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831059
7611	NC_015061	GC	3	6	367566	367571	0 %	0 %	50 %	50 %	322831059
7612	NC_015061	CAGC	2	8	367575	367582	25 %	0 %	25 %	50 %	322831059
7613	NC_015061	GTA	2	6	367604	367609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322831059
7614	NC_015061	CTT	2	6	367732	367737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831059
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7617	NC_015061	TTC	2	6	367913	367918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322831059
7618	NC_015061	ATC	2	6	367932	367937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322831059
7619	NC_015061	TTTG	2	8	367949	367956	0 %	75 %	25 %	0 %	322831059
7620	NC_015061	TG	3	6	368034	368039	0 %	50 %	50 %	0 %	322831059
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7622	NC_015061	AGTG	2	8	368118	368125	25 %	25 %	50 %	0 %	322831059
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