MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 98898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_015061	GC	3	6	3840769	3840774	0 %	0 %	50 %	50 %	322834245
78002	NC_015061	AGT	2	6	3840804	3840809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834245
78003	NC_015061	TGA	2	6	3840831	3840836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834245
78004	NC_015061	CGT	2	6	3840837	3840842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834245
78005	NC_015061	TCA	2	6	3840864	3840869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834245
78006	NC_015061	CGC	2	6	3840880	3840885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834245
78007	NC_015061	CAC	2	6	3840964	3840969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834245
78008	NC_015061	GCA	2	6	3841008	3841013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834245
78009	NC_015061	ACC	2	6	3841022	3841027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834245
78010	NC_015061	TGA	2	6	3841041	3841046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834245
78011	NC_015061	AC	3	6	3841252	3841257	50 %	0 %	0 %	50 %	322834245
78012	NC_015061	AAGT	2	8	3841518	3841525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78013	NC_015061	CCA	2	6	3841588	3841593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322834246
78014	NC_015061	TCT	2	6	3841637	3841642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834246
78015	NC_015061	T	6	6	3841648	3841653	0 %	100 %	0 %	0 %	322834246
78016	NC_015061	GTT	2	6	3841665	3841670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322834246
78017	NC_015061	CTT	2	6	3841873	3841878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322834246
78018	NC_015061	ACG	2	6	3841885	3841890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834246
78019	NC_015061	ATT	2	6	3841907	3841912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834246
78020	NC_015061	CGGG	2	8	3841983	3841990	0 %	0 %	75 %	25 %	322834247
78021	NC_015061	CCT	2	6	3842015	3842020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322834247
78022	NC_015061	T	6	6	3842124	3842129	0 %	100 %	0 %	0 %	322834247
78023	NC_015061	TTA	2	6	3842170	3842175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834247
78024	NC_015061	T	6	6	3842243	3842248	0 %	100 %	0 %	0 %	322834247
78025	NC_015061	CGG	2	6	3842551	3842556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834247
78026	NC_015061	CG	3	6	3842580	3842585	0 %	0 %	50 %	50 %	322834247
78027	NC_015061	TCG	2	6	3842593	3842598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834247
78028	NC_015061	CGT	2	6	3842615	3842620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322834247
78029	NC_015061	CG	4	8	3842662	3842669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78030	NC_015061	GGC	2	6	3842742	3842747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78031	NC_015061	TGTGA	2	10	3842801	3842810	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78032	NC_015061	ATG	2	6	3842851	3842856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834248
78033	NC_015061	CGC	2	6	3842891	3842896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834248
78034	NC_015061	GCA	2	6	3842991	3842996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834248
78035	NC_015061	CGC	3	9	3843066	3843074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834248
78036	NC_015061	TAC	2	6	3843115	3843120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834248
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78038	NC_015061	GCG	2	6	3843173	3843178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322834248
78039	NC_015061	CAA	2	6	3843185	3843190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834248
78040	NC_015061	TGA	2	6	3843195	3843200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834248
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78043	NC_015061	ATG	2	6	3843421	3843426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834248
78044	NC_015061	GT	3	6	3843442	3843447	0 %	50 %	50 %	0 %	322834248
78045	NC_015061	A	6	6	3843535	3843540	100 %	0 %	0 %	0 %	322834248
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78048	NC_015061	TGA	2	6	3843578	3843583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322834248
78049	NC_015061	CAG	2	6	3843586	3843591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834248
78050	NC_015061	CTGG	2	8	3843603	3843610	0 %	25 %	50 %	25 %	322834248
78051	NC_015061	AGC	2	6	3843611	3843616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834248
78052	NC_015061	GTCC	2	8	3843617	3843624	0 %	25 %	25 %	50 %	322834248
78053	NC_015061	GCA	3	9	3843723	3843731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834248
78054	NC_015061	GCTG	2	8	3843867	3843874	0 %	25 %	50 %	25 %	322834248
78055	NC_015061	CGAT	2	8	3843942	3843949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78056	NC_015061	T	6	6	3843974	3843979	0 %	100 %	0 %	0 %	322834249
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78059	NC_015061	AAT	2	6	3844229	3844234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834249
78060	NC_015061	AGGC	2	8	3844261	3844268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78061	NC_015061	CTT	2	6	3844283	3844288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78062	NC_015061	CAG	2	6	3844290	3844295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78063	NC_015061	GAA	2	6	3844312	3844317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322834250
78064	NC_015061	GCC	2	6	3844592	3844597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322834250
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78084	NC_015061	GCC	2	6	3845429	3845434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78085	NC_015061	CA	3	6	3845608	3845613	50 %	0 %	0 %	50 %	322834251
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78089	NC_015061	CAA	2	6	3845876	3845881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322834251
78090	NC_015061	CAT	2	6	3845992	3845997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322834251
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78101	NC_015061	GCA	2	6	3846698	3846703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322834252
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78352	NC_015061	A	6	6	3858282	3858287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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78475	NC_015061	TAA	2	6	3863474	3863479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834264
78476	NC_015061	TC	3	6	3863512	3863517	0 %	50 %	0 %	50 %	322834264
78477	NC_015061	AAT	2	6	3863539	3863544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322834264
78478	NC_015061	TATATT	2	12	3863550	3863561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322834264
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